FNBP1

FNBP1
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	2EFL
Идентификаторы
Псевдонимы	FNBP1 , FBP17, Formin Blinding Bletin 1
Внешние идентификаторы	Омим : 606191 ; MGI : 109606 ; Гомологен : 100983 ; GeneCards : FNBP1 ; OMA : FNBP1 - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 9 (human)
End	130,043,194 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 2 (mouse)
End	31,032,020 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	corpus callosum; ; gastric mucosa; ; cerebellar hemisphere; ; saphenous vein; ; right hemisphere of cerebellum; ; inferior ganglion of vagus nerve; ; paraflocculus of cerebellum; ; thymus; ; epithelium of colon; ; sural nerve;
	Top expressed in
	cerebellar cortex; ; cerebellar vermis; ; lobe of cerebellum; ; pontine nuclei; ; deep cerebellar nuclei; ; ventral tegmental area; ; medial geniculate nucleus; ; lateral geniculate nucleus; ; medial dorsal nucleus; ; globus pallidus;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	protein binding; identical protein binding; lipid binding;
Cellular component	cytoplasm; plasma membrane; clathrin-coated pit; lysosome; cell cortex; cytoskeleton; membrane; cytoplasmic vesicle; cytosol;
Biological process	endocytosis; membrane organization;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	23048
	14269
	ENSG00000187239
	EMSMUSM00000075415
	Q96RU3
	Q80Ty0
	NM_015033 ; NM_001363755
showNM_001038700 ; NM_001177648 ; NM_001177649 ; NM_001177650 ; NM_019406 ;
	NM_001355105; NM_001355106
	NP_055848 ; NP_001350684
showNP_001033789 ; NP_001171119 ; NP_001171120 ; NP_001171121 ; NP_062279 ;
	NP_001342034; NP_001342035
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Связывающий форман белок 1 является белком , который у людей кодируется FNBP1 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства Formin-связывания белков. Белок содержит N-концевой домен гомологии FER/CDC42-взаимодействующего белка 4 (CIP4) (FCH) с последующим доменом с спиральной катушкой, богатым пролином мотивом, вторым доменом из спиральной камеры, белковым доменом семейства RHO, связывающего белка RHO, связывающего домена RHO-RHO, связывающего домена RHO-RHO, связывающего белка RHO-RHO, связывающего домена RHO-rho, семейства RHO, семейства RHO. (RBD) и C-терминальный домен SH3. Этот белок связывает сортировку nexin 2 (snx2), танкаразы (TNK) и динамин; Взаимодействие между этим белком и форманом еще не было продемонстрировано у человека. ^{[ 7 ]}

Взаимодействия

Было показано, что FNBP1 взаимодействует :

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000187239 - ENSEMBL , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000075415 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Нагасе Т., Ишикава К., Мияджима Н., Танака А., Котани Х, Номура Н., Охара О (август 1998 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. IX. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать для крупных белков in vitro» . ДНК Res . 5 (1): 31–9. doi : 10.1093/dnares/5.1.31 . PMID 9628581 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Fuchs U, Rehkamp G, Haas Oa, Slany R, Kōnig M, Bojesen S, Bohle RM, Damm-Welk C, Ludwig WD, Harbott J, Borkhardt A (Jul 2001). «Связывающий лифрамный белок человека 17 (FBP17) взаимодействует с сортировкой Nexin, SNX2 и является партнером MLL-фьюжн при остром миелогенном лейкозе» . Proc Natl Acad Sci USA . 98 (15): 8756–61. Bibcode : 2001pnas ... 98.8756f . doi : 10.1073/pnas.121433898 . PMC 37508 . PMID 11438682 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: FNBP1 -связывающий белок 1» .
^ Larocca MC, Shanks RA, Tian L, Nelson DL, Stewart DM, Goldingring Jr (Jun 2004). «Взаимодействие AKAP350 с CDC42 взаимодействующим белком 4 на аппарате Гольджи» . Мол Биол. Клетка . 15 (6): 2771–81. doi : 10.1091/mbc.e03-10-0757 . PMC 420101 . PMID 15047863 .
^ Kamioka Y, Fukuhara S, Sawa H, Nagashima K, Masuda M, Matsuda M, Mochizuki N (сентябрь 2004 г.). «Новая динамин-ассоциационная молекула, Formin-связывающий белок 17, индуцирует инвагинации трубной мембраны и участвует в эндоцитозе» . Дж. Биол. Химический 279 (38): 40091–9. doi : 10.1074/jbc.m404899200 . PMID 15252009 .
^ Гадими М.П., Санзенбахер Р., Тиде Б., Венцель Дж., Цзин К., Пломанн М., Боркхардт А., Кабелиц Д., Янссен О (май 2002). «Идентификация партнеров по взаимодействию цитозольной полипролиновой области лиганда CD95 (CD178)». Фебс Летт . 519 (1–3): 50–8. doi : 10.1016/s0014-5793 (02) 02709-6 . PMID 12023017 . S2CID 26765451 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Fuchs U, Rehkamp GF, Slany R, Follo M, Borkhardt A (ноябрь 2003 г.). «Связывающий форман белок 17, FBP17, связывается через мотиву связывания TNKS с танковой картой, белок, участвующий в поддержании теломер». Фебс Летт . 554 (1–2): 10–6. doi : 10.1016/s0014-5793 (03) 01063-9 . PMID 14596906 . S2CID 19552309 .

Дальнейшее чтение

Richnau N, Asspenström P (2001). «Rich, активирующий белок-домен Rho GTPase белок, участвующий в передаче сигналов CDC42 и RAC1» . Дж. Биол. Химический 276 (37): 35060–70. doi : 10.1074/jbc.m103540200 . PMID 11431473 .
Гадими М.П., Санзенбахер Р., Тиде Б., Венцель Дж., Цзин К., Пломанн М., Боркхардт А., Кабелиц Д., Янссен О (2002). «Идентификация партнеров по взаимодействию цитозольной полипролиновой области лиганда CD95 (CD178)». Фебс Летт . 519 (1–3): 50–8. doi : 10.1016/s0014-5793 (02) 02709-6 . PMID 12023017 . S2CID 26765451 .
Fujita H, Katoh H, Ishikawa Y, Mori K, Negishi M (2003). «Ростлин - это новый эффектор RND2 GTPase, индуцирующего разветвление нейритов » Дж. Биол. химический 277 (47): 45428–3 Doi : 10.1074/ jbc.m2080 PMID 122444061
Като М., Като М. (2004). «Ген FNBP2 на хромосоме человека 1q32.1 кодирует белок семейства ARHGAP с доменами FCH, FBH, RHOGAP и SH3». Инт. J. Mol. Медик 11 (6): 791–7. doi : 10.3892/ijmm.11.6.791 . PMID 12736724 .
Fuchs U, Rehkamp GF, Slany R, Follo M, Borkhardt A (2003). «Связывающий форман белок 17, FBP17, связывается через мотиву связывания TNKS с танковой картой, белок, участвующий в поддержании теломер». Фебс Летт . 554 (1–2): 10–6. doi : 10.1016/s0014-5793 (03) 01063-9 . PMID 14596906 . S2CID 19552309 .
Larocca MC, Shanks RA, Tian L, Nelson DL, Stewart DM, Golding Jr (2004). «Взаимодействие AKAP350 с CDC42 взаимодействующим белком 4 на аппарате Гольджи» . Мол Биол. Клетка . 15 (6): 2771–81. doi : 10.1091/mbc.e03-10-0757 . PMC 420101 . PMID 15047863 .
Brill LM, Salomon AR, Ficarro SB, Mukherji M, Stettler-Gill M, Peters EC (2004). «Надежное фосфопротеомное профилирование сайтов фосфорилирования тирозина из Т -клеток человека с использованием иммобилизованной аффинной хроматографии металлов и тандемной масс -спектрометрии». Анальный. Химический 76 (10): 2763–72. doi : 10.1021/ac035352d . PMID 15144186 .
Kamioka Y, Fukuhara S, Sawa H, Nagashima K, Masuda M, Matsuda M, Mochizuki N (2004). «Новая динамин-ассоциационная молекула, Formin-связывающий белок 17, индуцирует инвагинации трубной мембраны и участвует в эндоцитозе» . Дж. Биол. Химический 279 (38): 40091–9. doi : 10.1074/jbc.m404899200 . PMID 15252009 .
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (2004). «Крупномасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 101 (33): 12130–5. Bibcode : 2004pnas..10112130B . doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC 514446 . PMID 15302935 .
Раш Дж., Мориц А., Ли Ка, Го А., Госс В.Л., Спек Э.Дж., Чжан Х., Чжа XM, Полакевич Р.Д., Комп М.Дж. (2005). «Иммуноаффиническое профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках». НАТ Биотехнол . 23 (1): 94–101. doi : 10.1038/nbt1046 . PMID 15592455 . S2CID 7200157 .
Zhou FL, Zhang WG, Chen G, Zhao WH, Cao XM, Chen YX, Tian W, Liu J, Liu SH (2006). «Серологическая идентификация и биоинформатический анализ иммуногенных антигенов при множественной миеломе» . Рак Иммунол. Иммунотер . 55 (8): 910–7. doi : 10.1007/s00262-005-0074-x . PMC 11030602 . PMID 16193335 . S2CID 24083118 .
Qian J, Chen W, Lettau M, Podda G, Zörnig M, Kabelitz D, Janssen O (2006). «Регуляция экспрессии FASL: домен SH3, содержащий семейство белков, участвуя в лизосомальной ассоциации FASL». Клетка. Сигнал 18 (8): 1327–37. doi : 10.1016/j.cellsig.2005.10.015 . PMID 16318909 .
Itoh T, Erdmann KS, Roux A, Habermann B, Werner H, De Camilli P (2006). «Динамин и актиновый цитоскелет совместно регулируют инваганцию плазматической мембраны с помощью белков BAR и F-BAR» . Девчонка Клетка . 9 (6): 791–804. doi : 10.1016/j.devcel.2005.11.005 . PMID 16326391 .
Цудзита К., Суэцугу С., Сасаки Н., Фурутани М., Оикава Т., Таудава Т. (2006). «Координация между актиновым цитоскелетом и деформацией мембраны с помощью нового мембранного трубного домена белков PCH участвует в эндоцитозе» . J. Cell Biol . 172 (2): 269–79. doi : 10.1083/jcb.200508091 . PMC 2063556 . PMID 16418535 .

Эта статья о гене на хромосоме человека 9 является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000187239 - ENSEMBL , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000075415 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid9628581-5] Нагасе Т., Ишикава К., Мияджима Н., Танака А., Котани Х, Номура Н., Охара О (август 1998 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. IX. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать для крупных белков in vitro» . ДНК Res . 5 (1): 31–9. doi : 10.1093/dnares/5.1.31 . PMID 9628581 .

[pmid11438682-6] Jump up to: ^а ^{беременный} Fuchs U, Rehkamp G, Haas Oa, Slany R, Kōnig M, Bojesen S, Bohle RM, Damm-Welk C, Ludwig WD, Harbott J, Borkhardt A (Jul 2001). «Связывающий лифрамный белок человека 17 (FBP17) взаимодействует с сортировкой Nexin, SNX2 и является партнером MLL-фьюжн при остром миелогенном лейкозе» . Proc Natl Acad Sci USA . 98 (15): 8756–61. Bibcode : 2001pnas ... 98.8756f . doi : 10.1073/pnas.121433898 . PMC 37508 . PMID 11438682 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: FNBP1 -связывающий белок 1» .

[pmid15047863-8] Larocca MC, Shanks RA, Tian L, Nelson DL, Stewart DM, Goldingring Jr (Jun 2004). «Взаимодействие AKAP350 с CDC42 взаимодействующим белком 4 на аппарате Гольджи» . Мол Биол. Клетка . 15 (6): 2771–81. doi : 10.1091/mbc.e03-10-0757 . PMC 420101 . PMID 15047863 .

[pmid15252009-9] Kamioka Y, Fukuhara S, Sawa H, Nagashima K, Masuda M, Matsuda M, Mochizuki N (сентябрь 2004 г.). «Новая динамин-ассоциационная молекула, Formin-связывающий белок 17, индуцирует инвагинации трубной мембраны и участвует в эндоцитозе» . Дж. Биол. Химический 279 (38): 40091–9. doi : 10.1074/jbc.m404899200 . PMID 15252009 .

[pmid12023017-10] Гадими М.П., Санзенбахер Р., Тиде Б., Венцель Дж., Цзин К., Пломанн М., Боркхардт А., Кабелиц Д., Янссен О (май 2002). «Идентификация партнеров по взаимодействию цитозольной полипролиновой области лиганда CD95 (CD178)». Фебс Летт . 519 (1–3): 50–8. doi : 10.1016/s0014-5793 (02) 02709-6 . PMID 12023017 . S2CID 26765451 .

[pmid14596906-11] Jump up to: ^а ^{беременный} Fuchs U, Rehkamp GF, Slany R, Follo M, Borkhardt A (ноябрь 2003 г.). «Связывающий форман белок 17, FBP17, связывается через мотиву связывания TNKS с танковой картой, белок, участвующий в поддержании теломер». Фебс Летт . 554 (1–2): 10–6. doi : 10.1016/s0014-5793 (03) 01063-9 . PMID 14596906 . S2CID 19552309 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]