SNX9

SNX9
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2RAI, 2RAJ, 2RAK, 3DYT, 3DYU, 3LGE
Идентификаторы
Псевдонимы	SNX9 , SDP1, SH3PX1, SH3PXD3A, WISP, не сортировать 9
Внешние идентификаторы	Опустить : 605952 ; МГИ : 1913866 ; Гомологен : 49454 ; Генные карты : SNX9 ; OMA : SNX9 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 6 (human)
End	157,945,077 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 17 (mouse)
End	5,982,229 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	cartilage tissue; ; mucosa of ileum; ; superficial temporal artery; ; Achilles tendon; ; decidua; ; right coronary artery; ; tendon of biceps brachii; ; tail of epididymis; ; synovial membrane; ; tibial arteries;
	Top expressed in
	Ileal epithelium; ; zygote; ; secondary oocyte; ; primary oocyte; ; choroid plexus of fourth ventricle; ; jejunum; ; lactiferous gland; ; duodenum; ; right kidney; ; calvaria;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	protein homodimerization activity; Arp2/3 complex binding; 1-phosphatidylinositol binding; protein binding; phosphatidylinositol binding; ubiquitin protein ligase binding; lipid binding; cadherin binding; identical protein binding;
Cellular component	cytoplasm; Golgi apparatus; cell projection; membrane; ruffle; extrinsic component of cytoplasmic side of plasma membrane; plasma membrane; trans-Golgi network; extracellular exosome; cytoplasmic vesicle membrane; clathrin-coated vesicle; cytosol; cytoplasmic vesicle; cuticular plate;
Biological process	endocytosis; cleavage furrow formation; mitotic cytokinesis; positive regulation of membrane protein ectodomain proteolysis; receptor-mediated endocytosis; plasma membrane tubulation; cell division; endosomal transport; positive regulation of GTPase activity; positive regulation of protein oligomerization; protein transport; lipid tube assembly; cell cycle; intracellular protein transport; positive regulation of protein kinase activity; membrane organization; mitotic cell cycle; transport; positive regulation of actin filament polymerization;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	51429
	66616
	ENSG00000130340
	ENSMUSG00000002365
	Q9Y5X1
	Q91VH2
	НМ_016224
	НМ_025664
	НП_057308
	НП_079940
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Сортирующий нексин-9 — белок , который у человека кодируется SNX9 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Этот ген кодирует члена семейства сортирующих нексинов. Члены этого семейства содержат домен phox (PX), который представляет собой домен связывания фосфоинозитида и участвует во внутриклеточном транспорте. Этот белок не содержит области спиральной спирали, как некоторые члены семейства, но содержит домен SH3 вблизи своего N-конца . Этот белок взаимодействует с цитоплазматическими доменами предшественника, но не с процессированными формами домена дезинтегрина и металлопротеазы 9 и 15. Этот белок связывает домен бета-придатка адаптерного белка 2 и может функционировать, помогая адаптерному белку 2 в его роли в плазматическая мембрана. Этот белок взаимодействует с активированной Cdc42-ассоциированной киназой-2, регулируя деградацию белка рецептора эпидермального фактора роста. ^{[ 7 ]}

Взаимодействия

Было показано, что SNX9 взаимодействует с ADAM9 . ^{[ 5 ]} ДНМ2 ^{[ 8 ]} и АДАМ15 . ^{[ 5 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000130340 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000002365 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Ховард Л; Нельсон К.К.; Мациевич Р.А.; Блобель CP (декабрь 1999 г.). «Взаимодействие металлопротеазных дезинтегринов MDC9 и MDC15 с двумя белками, содержащими домен SH3, эндофилином I и SH3PX1» . J Биол Хим . 274 (44): 31693–9. дои : 10.1074/jbc.274.44.31693 . ПМИД 10531379 .
^ Ярар Д; Уотерман-Сторер CM; Шмид С.Л. (июль 2007 г.). «SNX9 связывает сборку актина с сигналами фосфоинозитидов и необходим для ремоделирования мембраны во время эндоцитоза» . Ячейка разработчиков . 13 (1): 43–56. дои : 10.1016/j.devcel.2007.04.014 . ПМИД 17609109 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: SNX9, сортирующий нексин 9» .
^ Лундмарк, Ричард; Карлссон Свен Р. (ноябрь 2003 г.). «Сортировка нексина 9 участвует в клатрин-опосредованном эндоцитозе посредством взаимодействия с основными компонентами» . Ж. Биол. Хим . 278 (47). США: 46772–81. дои : 10.1074/jbc.M307334200 . ISSN 0021-9258 . ПМИД 12952949 .

Дальнейшее чтение

Тисдейл Р.Д., Локусы D, Хоутон Ф. и др. (2001). «Большое семейство локализованных в эндосомах белков, связанных с сортировкой нексина 1» . Биохим. Дж . 358 (Часть 1): 7–16. дои : 10.1042/0264-6021:3580007 . ПМК 1222026 . ПМИД 11485546 .
Лин Кью; Ло К.Г.; Серионе РА; Ян В. (2002). «Цель ACK2 для Cdc42 взаимодействует с сортирующим нексином 9 (SH3PX1), регулируя деградацию рецептора эпидермального фактора роста» . Ж. Биол. Хим . 277 (12): 10134–8. дои : 10.1074/jbc.M110329200 . ПМИД 11799118 .
Лундмарк Р; Карлссон С.Р. (2002). «Бета-придатки четырех комплексов адаптер-белок (AP): структура и свойства связывания, а также идентификация сортировки нексина 9 как вспомогательного белка для AP-2» . Биохим. Дж . 362 (Часть 3): 597–607. дои : 10.1042/0264-6021:3620597 . ПМЦ 1222423 . ПМИД 11879186 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Лундмарк Р; Карлссон С.Р. (2004). «Сортировка нексина 9 участвует в клатрин-опосредованном эндоцитозе посредством взаимодействия с основными компонентами» . Ж. Биол. Хим . 278 (47): 46772–81. дои : 10.1074/jbc.M307334200 . ПМИД 12952949 .
Мунгалл А.Дж., Палмер С.А., Симс С.К. и др. (2003). «Последовательность ДНК и анализ хромосомы 6 человека» . Природа . 425 (6960): 805–11. Бибкод : 2003Natur.425..805M . дои : 10.1038/nature02055 . ПМИД 14574404 .
Шульце WX; Манн М (2004). «Новый протеомный скрининг пептид-белковых взаимодействий» . Ж. Биол. Хим . 279 (11): 10756–64. дои : 10.1074/jbc.M309909200 . ПМИД 14679214 .
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД 14702039 .
Ленер Б; Сандерсон CM (2004). «Схема взаимодействия белков для деградации мРНК человека» . Геном Рез . 14 (7): 1315–23. дои : 10.1101/гр.2122004 . ПМК 442147 . ПМИД 15231747 .
Лундмарк Р; Карлссон С.Р. (2004). «Регулируемое мембранное рекрутирование динамина-2, опосредованное сортировкой нексина 9» . Ж. Биол. Хим . 279 (41): 42694–702. дои : 10.1074/jbc.M407430200 . ПМИД 15299020 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Суле Ф; Ярар Д; Леонард М; Шмид С.Л. (2005). «SNX9 регулирует сборку динамина и необходим для эффективного клатрин-опосредованного эндоцитоза» . Мол. Биол. Клетка . 16 (4): 2058–67. дои : 10.1091/mbc.E04-11-1016 . ПМЦ 1073683 . ПМИД 15703209 .
Йеу-Фонг Л; Лим Л; Мансер Э (2005). «SNX9 как адаптер для связывания синаптоянина-1 с эффектором Cdc42 ACK1» . ФЭБС Летт . 579 (22): 5040–8. дои : 10.1016/j.febslet.2005.07.093 . ПМИД 16137687 . S2CID 44482842 .
Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети межбелковых взаимодействий человека». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .
Чилдресс С; Лин Кью; Ян В. (2006). «Димеризация необходима для фосфорилирования тирозина SH3PX1 в ответ на передачу сигналов эпидермального фактора роста и взаимодействие с ACK2» . Биохим. Дж . 394 (Часть 3): 693–8. дои : 10.1042/BJ20050576 . ПМЦ 1383719 . ПМИД 16316319 .
Марше О, Бэтчелор М, Шоу Р.К. и др. (2006). «EspF энтеропатогенной Escherichia coli связывает сортирующий нексин 9» . Дж. Бактериол . 188 (8): 3110–5. дои : 10.1128/JB.188.8.3110-3115.2006 . ПМК 1447016 . ПМИД 16585770 .
Шмид Э.М., Форд М.Г., Берти А. и др. (2007). «Роль концентратора бета-придатка AP2 в наборе партнеров для сборки пузырьков, покрытых клатрином» . ПЛОС Биол . 4 (9): е262. дои : 10.1371/journal.pbio.0040262 . ПМК 1540706 . ПМИД 16903783 .
Бадур К., МакГэвин М.К., Чжан Дж. и др. (2007). «Взаимодействие белка синдрома Вискотта-Олдрича с сортирующим нексином 9 необходимо для эндоцитоза CD28 и передачи сигналов в Т-клетках» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 104 (5): 1593–8. Бибкод : 2007PNAS..104.1593B . дои : 10.1073/pnas.0610543104 . ПМК 1785243 . ПМИД 17242350 .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 6 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000130340 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000002365 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10531379-5] Jump up to: ^а ^б ^с Ховард Л; Нельсон К.К.; Мациевич Р.А.; Блобель CP (декабрь 1999 г.). «Взаимодействие металлопротеазных дезинтегринов MDC9 и MDC15 с двумя белками, содержащими домен SH3, эндофилином I и SH3PX1» . J Биол Хим . 274 (44): 31693–9. дои : 10.1074/jbc.274.44.31693 . ПМИД 10531379 .

[pmid17609109-6] Ярар Д; Уотерман-Сторер CM; Шмид С.Л. (июль 2007 г.). «SNX9 связывает сборку актина с сигналами фосфоинозитидов и необходим для ремоделирования мембраны во время эндоцитоза» . Ячейка разработчиков . 13 (1): 43–56. дои : 10.1016/j.devcel.2007.04.014 . ПМИД 17609109 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: SNX9, сортирующий нексин 9» .

[pmid12952949-8] Лундмарк, Ричард; Карлссон Свен Р. (ноябрь 2003 г.). «Сортировка нексина 9 участвует в клатрин-опосредованном эндоцитозе посредством взаимодействия с основными компонентами» . Ж. Биол. Хим . 278 (47). США: 46772–81. дои : 10.1074/jbc.M307334200 . ISSN 0021-9258 . ПМИД 12952949 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

v т и Сортировка нексинов
SNX БАР	SNX1 SNX2 SNX4 SNX5 SNX6 SNX7 SNX8 SNX9 SNX18 SNX30 SNX32 SNX33
SNX-PX	SNX3 SNX10 SNX11 SNX12 SNX16 SNX20 SNX21 SNX22 SNX24 SNX29
SNX-Другое	SNX13 SNX14 SNX15 SNX17 SNX19 SNX23 SNX25 SNX26 SNX27 SNX28 SNX31
Похожие статьи	PX-домен БАР-домен Ретромер