SNX17

SNX17
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	3FOG, 3LUI, 4GXB, 4TKN
Идентификаторы
Псевдонимы	SNX17 , не сортировать 17
Внешние идентификаторы	Опустить : 605963 ; МГИ : 2387801 ; Гомологен : 8838 ; Генные карты : SNX17 ; OMA : SNX17 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 2 (human)
End	27,377,535 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 5 (mouse)
End	31,356,487 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	granulocyte; ; right adrenal gland; ; right adrenal cortex; ; monocyte; ; left adrenal gland; ; left adrenal cortex; ; anterior pituitary; ; stromal cell of endometrium; ; right coronary artery; ; spleen;
	Top expressed in
	medial ganglionic eminence; ; renal corpuscle; ; internal carotid artery; ; external carotid artery; ; epithelium of lens; ; Paneth cell; ; vestibular membrane of cochlear duct; ; Rostral migratory stream; ; endocardial cushion; ; median eminence;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	low-density lipoprotein particle receptor binding; protein C-terminus binding; protein binding; phosphatidylinositol binding; signaling receptor binding; lipid binding;
Cellular component	cytosol; endosome; Golgi apparatus; membrane; intracellular membrane-bounded organelle; early endosome; endosome membrane; cytoplasmic vesicle membrane; cytoplasm; cytoplasmic vesicle; protein-containing complex;
Biological process	regulation of endocytosis; cardiac septum development; cholesterol catabolic process; receptor-mediated endocytosis; coronary vasculature development; endosomal transport; aorta development; protein transport; signal transduction; intracellular protein transport; endocytic recycling;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	9784
	266781
	ENSG00000115234
	ENSMUSG00000029146
	Q15036
	Q8BVL3
	НМ_001267059 ; НМ_001267060 ; НМ_001267061 ; НМ_014748
	НМ_153680
	НП_001253988 ; НП_001253989 ; НП_001253990 ; НП_055563
	НП_710147
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Сортирующий нексин-17 — белок , который у человека кодируется SNX17 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Функция

Этот ген кодирует члена семейства сортирующих нексинов. Члены этого семейства содержат домен phox (PX), который представляет собой домен связывания фосфоинозитида и участвует во внутриклеточном транспорте. Этот белок не содержит спиральной области, как некоторые представители семейства, но содержит домен B41. Этот белок взаимодействует с цитоплазматическим доменом Р-селектина и может участвовать во внутриклеточном транспорте Р-селектина. ^{[ 7 ]}

Взаимодействия

Было показано, что SNX17 взаимодействует с белком 8, связанным с рецептором липопротеинов низкой плотности. ^{[ 5 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000115234 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000029146 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Jump up to: ^а ^б Стокингер В., Сайллер Б., Штрассер В., Речейс Б., Фашинг Д., Кар Л., Шнайдер В.Дж., Нимпф Дж. (август 2002 г.). «Белок PX-домена SNX17 взаимодействует с членами семейства рецепторов ЛПНП и модулирует эндоцитоз рецептора ЛПНП» . ЭМБО Дж . 21 (16): 4259–67. дои : 10.1093/emboj/cdf435 . ПМК 126172 . ПМИД 12169628 .
^ Кнаут П., Шлютер Т., Чубайко М., Кирш С., Флориан В., Шрекенбергер С., Хан Х., Боненсак Р. (март 2005 г.). «Функции сортировки доменов нексина 17 и мотив распознавания трафика P-селектина». Дж. Мол. Биол . 347 (4): 813–25. дои : 10.1016/j.jmb.2005.02.004 . ПМИД 15769472 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: SNX17, сортирующий нексин 17» .

Дальнейшее чтение

Номура Н., Нагасе Т., Миядзима Н., Сазука Т., Танака А., Сато С., Секи Н., Каварабаяши Ю., Исикава К., Табата С. (1994). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. II. Кодирующие последовательности 40 новых генов (KIAA0041-KIAA0080), выведенные путем анализа клонов кДНК из линии клеток человека KG-1» . ДНК Рез . 1 (5): 223–9. дои : 10.1093/dnares/1.5.223 . ПМИД 7584044 .
Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД 8125298 .
Сузуки Ю, Ёситомо-Накагава К, Маруяма К, Суяма А, Сугано С (1997). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД 9373149 .
Ходжа М.Р., Валестедт С., Хёг С. (2000). «Стратегия визуальной внутриклеточной классификации неохарактеризованных белков человека». Эксп. Сотовый Res . 259 (1): 239–46. дои : 10.1006/excr.2000.4948 . ПМИД 10942595 .
Флориан В., Шлютер Т., Боненсак Р. (2001). «Новый член семейства сортирующих нексинов взаимодействует с С-концом P-селектина». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 281 (4): 1045–50. дои : 10.1006/bbrc.2001.4467 . ПМИД 11237770 .
Тисдейл Р.Д., Локусы Д., Хоутон Ф., Карлссон Л., Глисон П.А. (2001). «Большое семейство локализованных в эндосомах белков, связанных с сортировкой нексина 1» . Биохим. Дж . 358 (Часть 1): 7–16. дои : 10.1042/0264-6021:3580007 . ПМК 1222026 . ПМИД 11485546 .
Геверт К., Готалс М., Мартенс Л., Ван Дамм Дж., Стас А., Томас Г.Р., Вандекеркхове Дж. (2003). «Изучение протеомов и анализ обработки белков путем масс-спектрометрической идентификации отсортированных N-концевых пептидов». Нат. Биотехнология . 21 (5): 566–9. дои : 10.1038/nbt810 . ПМИД 12665801 . S2CID 23783563 .
Берден Дж.Дж., Сан XM, Гарсия А.Б., Сутар А.К. (2004). «Сортировочные мотивы во внутриклеточном домене рецептора липопротеинов низкой плотности взаимодействуют с новым доменом сортировки нексина-17» . Ж. Биол. Хим . 279 (16): 16237–45. дои : 10.1074/jbc.M313689200 . ПМИД 14739284 .
Уильямс Р., Шлютер Т., Робертс М.С., Кнаут П., Боненсак Р., Катлер Д.Ф. (2004). «Сортировка нексина 17 ускоряет интернализацию, но замедляет деградацию P-селектина» . Мол. Биол. Клетка . 15 (7): 3095–105. дои : 10.1091/mbc.E04-02-0143 . ПМЦ 452567 . ПМИД 15121882 .
Колланд Ф., Жак Икс, Труплен В., Мужен С., Гроазело С., Гамбургер А., Мейл А., Войчик Дж., Легрен П., Готье Ж.М. (2004). «Функциональное протеомное картирование сигнального пути человека» . Геном Рез . 14 (7): 1324–32. дои : 10.1101/гр.2334104 . ПМК 442148 . ПМИД 15231748 .
ван Керкхоф П., Ли Дж., Маккормик Л., Тетро Э., Лу В., Шенфиш М., Ооршот В., Строус Г.Дж., Кламперман Дж., Бу Г. (2005). «Сортировка нексина 17 облегчает рециркуляцию LRP в ранней эндосоме» . ЭМБО Дж . 24 (16): 2851–61. дои : 10.1038/sj.emboj.7600756 . ПМЦ 1187941 . ПМИД 16052210 .
Чубайко М., Кнаут П., Шлютер Т., Флориан В., Боненсак Р. (2006). «Сортирующий нексин 17, несамособирающийся аффинный белок высокого класса PtdIns(3)P, взаимодействует с белком KRIT1, связанным с кавернозной мальформацией головного мозга». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 345 (3): 1264–72. дои : 10.1016/j.bbrc.2006.04.129 . ПМИД 16712798 .

статья о гене на хромосоме 2 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000115234 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000029146 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid12169628-5] Jump up to: ^а ^б Стокингер В., Сайллер Б., Штрассер В., Речейс Б., Фашинг Д., Кар Л., Шнайдер В.Дж., Нимпф Дж. (август 2002 г.). «Белок PX-домена SNX17 взаимодействует с членами семейства рецепторов ЛПНП и модулирует эндоцитоз рецептора ЛПНП» . ЭМБО Дж . 21 (16): 4259–67. дои : 10.1093/emboj/cdf435 . ПМК 126172 . ПМИД 12169628 .

[pmid15769472-6] Кнаут П., Шлютер Т., Чубайко М., Кирш С., Флориан В., Шрекенбергер С., Хан Х., Боненсак Р. (март 2005 г.). «Функции сортировки доменов нексина 17 и мотив распознавания трафика P-селектина». Дж. Мол. Биол . 347 (4): 813–25. дои : 10.1016/j.jmb.2005.02.004 . ПМИД 15769472 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: SNX17, сортирующий нексин 17» .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

v т и Сортировка нексинов
SNX-BAR	SNX1 SNX2 SNX4 SNX5 SNX6 SNX7 SNX8 SNX9 SNX18 SNX30 SNX32 SNX33
SNX-PX	SNX3 SNX10 SNX11 SNX12 SNX16 SNX20 SNX21 SNX22 SNX24 SNX29
SNX-Other	SNX13 SNX14 SNX15 SNX17 SNX19 SNX23 SNX25 SNX26 SNX27 SNX28 SNX31
Related articles	PX domain BAR domain Retromer