SEC13

SEC13
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB showСписок идентификационных кодов PDB 3BG0, 3BG1, 5A9Q
Идентификаторы
Псевдонимы	SEC13 , D3S1231E, SEC13L1, SEC13R, npp-20, гомолог SEC13, ядерная пора и компонент комплекса оболочки COPII
Внешние идентификаторы	Опустить : 600152 ; МГИ : 99832 ; Гомологен : 6479 ; GeneCards : SEC13 ; OMA : SEC13 — ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 3 (human) Band 3p25.3 Start 10,293,131 bp End 10,321,112 bp
showМестоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 6 (mouse) Band 6 E3|6 52.84 cM Start 113,705,023 bp End 113,717,704 bp
show экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in stromal cell of endometrium oocyte pituitary gland beta cell anterior pituitary duodenum jejunal mucosa parotid gland cartilage tissue tibia Top expressed in molar epithelium of small intestine seminal vesicula otic placode Ileal epithelium mandibular prominence maxillary prominence endocardial cushion neural tube duodenum More reference expression data BioGPS More reference expression data
showГенная онтология Molecular function protein binding identical protein binding structural molecule activity Cellular component endoplasmic reticulum membrane intracellular membrane-bounded organelle membrane nuclear envelope nuclear pore nucleoplasm GATOR2 complex nuclear pore outer ring endoplasmic reticulum ER to Golgi transport vesicle membrane extracellular exosome cytoplasmic vesicle nucleus kinetochore Golgi membrane lysosome lysosomal membrane COPII vesicle coat cytosol host cell Biological process mRNA transport antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class I COPII vesicle coating protein transport intracellular protein transport vesicle-mediated transport positive regulation of TOR signaling sister chromatid cohesion COPII-coated vesicle cargo loading transport protein exit from endoplasmic reticulum COPII-coated vesicle budding positive regulation of TORC1 signaling regulation of glycolytic process mRNA export from nucleus tRNA export from nucleus viral process viral transcription regulation of gene silencing by miRNA intracellular transport of virus regulation of cellular response to heat Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 6396 110379 Вместе ENSG00000157020 ENSMUSG00000030298 ЮниПрот P55735 Q9D1M0 RefSeq (мРНК) НМ_001136026 НМ_001136232 НМ_001278946 НМ_030673 НМ_183352 НМ_024206 RefSeq (белок) НП_001129498 НП_001129704 НП_001265875 НП_109598 НП_899195 НП_077168 Местоположение (UCSC) Чр 3: 10,29 – 10,32 Мб Chr 6: 113,71 – 113,72 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Гомолог белка SEC13 — белок , который у человека кодируется SEC13 геном .

Белок, кодируемый этим геном, принадлежит к семейству белков WD-повторов SEC13 . Он имеет сходство с дрожжевыми белками SEC13 и SEC31 , которые необходимы для биогенеза везикул из эндоплазматической сети во время транспорта белков.

Дальнейшее чтение

• Шайвиц Д.А., Орси Л., Раваццола М. и др. (1995). «Человеческий SEC13Rp функционирует в дрожжах и расположен на транспортных везикулах, отпочковавшихся от эндоплазматического ретикулума» . Дж. Клеточная Биол . 128 (5): 769–77. дои : 10.1083/jcb.128.5.769 . ПМК   2120388 . ПМИД   7876304 .
• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД   8125298 .
• Андерссон Б., Вентланд М.А., Рикафренте Дж.Ю. и др. (1996). «Метод «двойного адаптера» для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Анальный. Биохим . 236 (1): 107–13. дои : 10.1006/abio.1996.0138 . ПМИД   8619474 .
• Ю В., Андерссон Б., Уорли К.С. и др. (1997). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК» . Геном Рез . 7 (4): 353–8. дои : 10.1101/гр.7.4.353 . ПМК   139146 . ПМИД   9110174 .
• Сузуки И., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД   9373149 .
• Маммото А., Сасаки Т., Ким Ю., Такай Ю. (2000). «Физическое и функциональное взаимодействие рабфилина-11 с белком Sec13 млекопитающих. Участие в торговле везикулами» . Ж. Биол. Хим . 275 (18): 13167–70. дои : 10.1074/jbc.C000096200 . ПМИД   10747849 .
• Тан Б.Л., Чжан Т., Лоу Д.И. и др. (2000). «Гомологи дрожжей sec31p у млекопитающих. Повсеместно экспрессируемая форма локализована в местах выхода эндоплазматического ретикулума (ER) и необходима для транспорта ER-Гольджи» . Ж. Биол. Хим . 275 (18): 13597–604. дои : 10.1074/jbc.275.18.13597 . ПМИД   10788476 .
• Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК   139241 . ПМИД   12477932 .
• Геварт К., Готалс М., Мартенс Л. и др. (2004). «Изучение протеомов и анализ обработки белков путем масс-спектрометрической идентификации отсортированных N-концевых пептидов». Нат. Биотехнология . 21 (5): 566–9. дои : 10.1038/nbt810 . ПМИД   12665801 . S2CID   23783563 .
• Эннинга Дж., Левай А., Фонтура Б.М. (2003). «Sec13 перемещается между ядром и цитоплазмой и стабильно взаимодействует с Nup96 в комплексе ядерных пор» . Мол. Клетка. Биол . 23 (20): 7271–84. дои : 10.1128/MCB.23.20.7271-7284.2003 . ПМК   230331 . ПМИД   14517296 .
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД   14702039 .
• Баумистер Т., Баух А., Раффнер Х. и др. (2004). «Физическая и функциональная карта пути передачи сигнала TNF-альфа / NF-каппа B человека». Нат. Клеточная Биол . 6 (2): 97–105. дои : 10.1038/ncb1086 . ПМИД   14743216 . S2CID   11683986 .
• Лоиодице I, Алвес А, Рабут Г и др. (2005). «Весь комплекс Nup107-160, включая трех новых членов, как единое целое нацелен на кинетохоры в митозе» . Мол. Биол. Клетка . 15 (7): 3333–44. doi : 10.1091/mbc.E03-12-0878 . ПМЦ   452587 . ПМИД   15146057 .
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК   528928 . ПМИД   15489334 .
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД   16189514 . S2CID   4427026 .
• Стэгг С.М., Гюркан С., Фаулер Д.М. и др. (2006). «Конструкция клетки для пальто Sec13/31 COPII». Природа . 439 (7073): 234–8. Бибкод : 2006Natur.439..234S . дои : 10.1038/nature04339 . ПМИД   16407955 . S2CID   2426465 .