STXBP5

STXBP5
Идентификаторы
Псевдонимы	STXBP5 , Tomosyn, LGL3, LLGL3, Nbla04300, синтаксин-связывающий белок 5
Внешние идентификаторы	Опустить : 604586 ; МГИ : 1926058 ; Гомологен : 16402 ; Генные карты : STXBP5 ; OMA : STXBP5 — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 6 (human)
End	147,390,476 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 10 (mouse)
End	9,901,079 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	Brodmann area 23; ; Achilles tendon; ; cerebellar hemisphere; ; endothelial cell; ; Brodmann area 9; ; sperm; ; right hemisphere of cerebellum; ; superior frontal gyrus; ; primary visual cortex; ; Brodmann area 46;
	Top expressed in
	zygote; ; secondary oocyte; ; granulocyte; ; mammillary body; ; paraventricular nucleus of hypothalamus; ; supraoptic nucleus; ; inferior colliculus; ; neural layer of retina; ; habenula; ; dentate gyrus;
	More reference expression data
	n/a
показывать Генная онтология
Molecular function	GTPase activator activity; syntaxin-1 binding; syntaxin binding; myosin II binding;
Cellular component	integral component of membrane; acetylcholine-gated channel complex; membrane; synaptic vesicle; plasma membrane; synapse; cell junction; cytoplasmic vesicle membrane; cytoplasmic vesicle; cytosol; cytoplasm; neuromuscular junction; Schaffer collateral - CA1 synapse; extrinsic component of presynaptic membrane; presynaptic cytosol; SNARE complex;
Biological process	regulation of exocytosis; protein transport; positive regulation of exocytosis; vesicle-mediated transport; exocytosis; regulation of protein secretion; positive regulation of GTPase activity; synaptic vesicle cycle;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	134957
	78808
	ENSG00000164506
	ENSMUSG00000019790
	Q5T5C0
	Q8K400
	НМ_001127715 ; НМ_139244 ; НМ_001394409
	НМ_001081344 ; НМ_030191
	НП_001121187 ; НП_640337
	НП_001074813 ; НП_001394992 ; НП_001394993 ; НП_001394994
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Синтаксин-связывающий белок 5 — это белок , который у человека кодируется STXBP5 геном . Он также известен как томосин , в честь 友 , «друг» по- японски , из-за его роли связывающего белка. ^[5]^[6]^[7]

Функция

Синтаксин 1 является компонентом комплексов 7S и 20S SNARE, которые участвуют в стыковке и слиянии синаптических везикул с пресинаптической плазматической мембраной. Этот ген кодирует белок, связывающий синтаксин 1. У крыс аналогичный белок диссоциирует синтаксин 1 от комплекса Munc18/n-Sec1/rbSec1 с образованием комплекса 10S, промежуточного продукта, который может быть преобразован в комплекс 7S SNARE. Таким образом, считается, что этот белок участвует в высвобождении нейромедиаторов, стимулируя образование комплекса SNARE. Альтернативно сплайсированные варианты были идентифицированы, но их биологическая ценность не определена. ^[7]

Позиционное клонирование позволило предположить, что томозин может ингибировать секрецию нейромедиаторов в Caenorhabditis elegans нейронах .] ^[8] Эта гипотеза была проверена и подтверждена, показав, что томозин специфически ингибирует прайминг синаптических пузырьков — биохимический этап, непосредственно предшествующий слиянию пузырьков и высвобождению нейротрансмиттера. ^[9]

Структура

Первоначально были идентифицированы два функциональных домена , в том числе один, который связывается с синтаксином , но недавняя кристаллизация дрожжевого гомолога Sro7 показала, что томосин, вероятно, имеет три функциональных домена: один домен WD40 и один домен, связывающий синтаксин, как было установлено ранее, а также еще один домен WD40. . Исследование также показало, что «синтаксин-связывающий домен» томозина не является причиной того, что томозин ингибирует высвобождение нейротрансмиттера, как первоначально предполагалось. ^[10] Структура на основе Sro7 в настоящее время представлена в SWISS-MODEL, которая включает домены WD40, но не большую часть спирального домена, связывающего синтаксин, который показан в информационном окне. ^[11]

Взаимодействия

Было показано, что STXBP5 взаимодействует с STX4. ^[12] и STX1A . ^[5]^[12]

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000164506 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000019790 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Перейти обратно: ^а ^б Фудзита Ю., Ширатаки Х., Сакисака Т., Асакура Т., Охья Т., Котани Х., Ёкояма С., Нисиока Х., Мацуура Ю., Мидзогучи А., Шеллер Р.Х., Такай Ю. (июнь 1998 г.). «Томосин: белок, связывающий синтаксин-1, который образует новый комплекс в процессе высвобождения нейромедиатора» . Нейрон . 20 (5): 905–15. дои : 10.1016/S0896-6273(00)80472-9 . ПМИД 9620695 . S2CID 12597505 .
^ Като М, Като М (февраль 2004 г.). «Идентификация и характеристика гена LLGL4 человека и гена Llgl4 мыши in silico». Межд. Дж. Онкол . 24 (3): 737–42. дои : 10.3892/ijo.24.3.737 . ПМИД 14767561 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтреза: белок 5, связывающий синтаксин STXBP5 (томосин)» .
^ Диббс М., Нгай Дж., Каплан Дж. М. (июль 2005 г.). «Использование микрочипов для облегчения позиционного клонирования: идентификация томозина как ингибитора нейросекреции» . ПЛОС Генет . 1 (1): 6–16. дои : 10.1371/journal.pgen.0010002 . ПМЦ 1183521 . ПМИД 16103915 .
^ Грачева Е.О., Бурдина А.О., Хольгадо А.М. и др. (июль 2006 г.). «Томосин ингибирует праймирование синаптических пузырьков у Caenorhabditis elegans» . ПЛОС Биол . 4 (8): е261. doi : 10.1371/journal.pbio.0040261 . ПМЦ 1514790 . ПМИД 16895441 .
^ Хаттендорф Д.А., Андреева А., Гангар А., Бреннвальд П.Дж., Вайс В.И. (март 2007 г.). «Структура дрожжевого белка полярности Sro7 раскрывает механизм регуляции SNARE». Природа . 446 (7135): 567–71. Бибкод : 2007Natur.446..567H . дои : 10.1038/nature05635 . ПМИД 17392788 . S2CID 4399611 .
^ «Q5T5C0» . Репозиторий SWISS-MODEL .
^ Перейти обратно: ^а ^б Видберг Ч., Брайант, Нью-Джерси, Джиротти М., Ри С., Джеймс Д.Е. (сентябрь 2003 г.). «Томосин взаимодействует с синтаксином 4 и SNAP23 t-SNARE и играет роль в стимулируемой инсулином транслокации GLUT4» . Ж. Биол. Хим . 278 (37): 35093–101. дои : 10.1074/jbc.M304261200 . ПМИД 12832401 .

Дальнейшее чтение

Олсен Дж.В., Благоев Б., Гнад Ф., Мачек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях» . Клетка . 127 (3): 635–48. дои : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . ПМИД 17081983 . S2CID 7827573 .
Видберг Ч., Брайант, Нью-Джерси, Джиротти М., Ри С., Джеймс Д.Е. (2003). «Томосин взаимодействует с синтаксином 4 и SNAP23 t-SNARE и играет роль в стимулируемой инсулином транслокации GLUT4» . Ж. Биол. Хим . 278 (37): 35093–101. дои : 10.1074/jbc.M304261200 . ПМИД 12832401 .
Ёкояма С., Ширатаки Х., Сакисака Т., Такай Ю. (1999). «Три варианта сплайсинга томозина и идентификация их области связывания синтаксина». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 256 (1): 218–22. дои : 10.1006/bbrc.1999.0300 . ПМИД 10066450 .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 6 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000164506 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000019790 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9620695-5] Перейти обратно: ^а ^б Фудзита Ю., Ширатаки Х., Сакисака Т., Асакура Т., Охья Т., Котани Х., Ёкояма С., Нисиока Х., Мацуура Ю., Мидзогучи А., Шеллер Р.Х., Такай Ю. (июнь 1998 г.). «Томосин: белок, связывающий синтаксин-1, который образует новый комплекс в процессе высвобождения нейромедиатора» . Нейрон . 20 (5): 905–15. дои : 10.1016/S0896-6273(00)80472-9 . ПМИД 9620695 . S2CID 12597505 .

[pmid14767561-6] Като М, Като М (февраль 2004 г.). «Идентификация и характеристика гена LLGL4 человека и гена Llgl4 мыши in silico». Межд. Дж. Онкол . 24 (3): 737–42. дои : 10.3892/ijo.24.3.737 . ПМИД 14767561 .

[entrez-7] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтреза: белок 5, связывающий синтаксин STXBP5 (томосин)» .

[8] Диббс М., Нгай Дж., Каплан Дж. М. (июль 2005 г.). «Использование микрочипов для облегчения позиционного клонирования: идентификация томозина как ингибитора нейросекреции» . ПЛОС Генет . 1 (1): 6–16. дои : 10.1371/journal.pgen.0010002 . ПМЦ 1183521 . ПМИД 16103915 .

[9] Грачева Е.О., Бурдина А.О., Хольгадо А.М. и др. (июль 2006 г.). «Томосин ингибирует праймирование синаптических пузырьков у Caenorhabditis elegans» . ПЛОС Биол . 4 (8): е261. doi : 10.1371/journal.pbio.0040261 . ПМЦ 1514790 . ПМИД 16895441 .

[Hattendorf-10] Хаттендорф Д.А., Андреева А., Гангар А., Бреннвальд П.Дж., Вайс В.И. (март 2007 г.). «Структура дрожжевого белка полярности Sro7 раскрывает механизм регуляции SNARE». Природа . 446 (7135): 567–71. Бибкод : 2007Natur.446..567H . дои : 10.1038/nature05635 . ПМИД 17392788 . S2CID 4399611 .

[11] «Q5T5C0» . Репозиторий SWISS-MODEL .

[pmid12832401-12] Перейти обратно: ^а ^б Видберг Ч., Брайант, Нью-Джерси, Джиротти М., Ри С., Джеймс Д.Е. (сентябрь 2003 г.). «Томосин взаимодействует с синтаксином 4 и SNAP23 t-SNARE и играет роль в стимулируемой инсулином транслокации GLUT4» . Ж. Биол. Хим . 278 (37): 35093–101. дои : 10.1074/jbc.M304261200 . ПМИД 12832401 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]