АП1С1

АП1С1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	4P6Z, 1W63
Идентификаторы
Псевдонимы	AP1S1 , AP19, CLAPS1, EKV3, MEDNIK, SIGMA1A, WUGSC:H_DJ0747G18.2, адапторный белковый комплекс 1 сигма 1 субъединица, адапторный белковый комплекс 1 субъединица сигма 1
Внешние идентификаторы	Опустить : 603531 ; МГИ : 1098244 ; Гомологен : 20342 ; Генные карты : AP1S1 ; ОМА : AP1S1 — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 7 (human)
End	101,161,596 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 5 (mouse)
End	137,074,989 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	mucosa of transverse colon; ; stromal cell of endometrium; ; prefrontal cortex; ; nucleus accumbens; ; right frontal lobe; ; islet of Langerhans; ; caudate nucleus; ; putamen; ; Brodmann area 9; ; amygdala;
	Top expressed in
	dentate gyrus of hippocampal formation granule cell; ; entorhinal cortex; ; superior frontal gyrus; ; perirhinal cortex; ; CA3 field; ; primary visual cortex; ; olfactory tubercle; ; yolk sac; ; nucleus accumbens; ; lip;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
скрывать Ортологи
	1174
	11769
	ENSG00000106367
	ENSMUSG00000004849
	P61966
	P61967
	НМ_057089 ; НМ_001283
	НМ_007457
	НП_001274
	НП_031483
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Субъединица сигма-1А комплекса AP-1 представляет собой белок , который у человека кодируется AP1S1 геном . ^[5]^[6]^[7]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является частью комплекса сборки клатриновой оболочки, который связывает клатрин с рецепторами в покрытых оболочкой везикулах. Эти везикулы участвуют в эндоцитозе и процессинге Гольджи. Этот белок, а также бета-прайм-адаптин, гамма-адаптин и средняя (мю) цепь AP47 образуют белковый комплекс сборки AP-1, расположенный в пузырьке Гольджи. Сообщалось о двух альтернативно сплайсированных вариантах транскрипта этого гена, которые кодируют разные изоформы. ^[7]

Мутация AP1S1 вызывает редкий семейный синдром MEDNIK, описанный в 2008 году. ^[8]

Взаимодействия

Было показано, что AP1S1 взаимодействует с AP1G1. ^[6]^[9]^[10] и RAB10 . ^[11]

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000106367 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000004849 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Пейрард М., Парвене С., Лагеркранц С., Экман М., Франссон И., Сален С., Думански Дж. П. (июнь 1998 г.). «Клонирование, характер экспрессии и хромосомное присвоение 16q23 гена гамма-адаптина человека (ADTG)». Геномика . 50 (2): 275–80. дои : 10.1006/geno.1998.5289 . ПМИД 9653655 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Такацу Х., Сакураи М., Шин Х.В., Мураками К., Накаяма К. (сентябрь 1998 г.). «Идентификация и характеристика новых белков, связанных с адаптером клатрина» . Журнал биологической химии . 273 (38): 24693–700. дои : 10.1074/jbc.273.38.24693 . ПМИД 9733768 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: белковый комплекс 1, связанный с адаптером AP1S1, субъединица сигма 1» .
^ Монтпети А., Коте С., Брустайн Э., Друэн К.А., Лапуант Л., Будро М., Мелош С., Друэн Р., Хадсон Т.Дж., Драпо П., Коссетт П. (декабрь 2008 г.). Ван Хейнинген В. (ред.). «Нарушение AP1S1, вызывающее новый нейрокожный синдром, нарушает развитие кожи и спинного мозга» . ПЛОС Генетика . 4 (12): e1000296. дои : 10.1371/journal.pgen.1000296 . ПМЦ 2585812 . ПМИД 19057675 .
^ Фёльш Х., Оно Х., Бонифачино Дж.С., Меллман I (октябрь 1999 г.). «Новый адаптерный комплекс клатрина опосредует базолатеральное нацеливание в поляризованные эпителиальные клетки» . Клетка . 99 (2): 189–98. дои : 10.1016/S0092-8674(00)81650-5 . ПМИД 10535737 . S2CID 15288582 .
^ Пейдж Л.Дж., Робинсон М.С. (ноябрь 1995 г.). «Нацеленные сигналы и взаимодействия субъединиц в покрытых адаптерных комплексах везикул» . Журнал клеточной биологии . 131 (3): 619–30. дои : 10.1083/jcb.131.3.619 . ПМК 2120623 . ПМИД 7593184 .
^ Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф., Ли Х., Тейлор П., Клими С., МакБрум-Сераевски Л., Робинсон М.Д., О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дарси М., Хо Ю, Хейлбут А., Мур Л., Чжан С., Орнацкий О, Бухман Ю.В., Этьер М., Шэн Ю., Василеску Дж., Абу-Фарха М., Ламберт Дж.П., Дьюэл Х.С., Стюарт II, Кюль Б., Хог К., Колвилл К., Гладвиш К., Маскат Б., Кинач Р., Адамс С.Л., Моран М.Ф., Морин ГБ, Топалоглу Т., Фигейс Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белково-белковых взаимодействий человека методом масс-спектрометрии» . Молекулярная системная биология . 3 (1): 89. дои : 10.1038/msb4100134 . ПМЦ 1847948 . ПМИД 17353931 .

Дальнейшее чтение

Кирххаузен Т (2000). «Клатрин». Ежегодный обзор биохимии . 69 : 699–727. doi : 10.1146/annurev.biochem.69.1.699 . ПМИД 10966473 .
Гейер М., Факлер О.Т., Петерлин Б.М. (июль 2001 г.). «Структурно-функциональные взаимоотношения при ВИЧ-1 Nef» . Отчеты ЭМБО . 2 (7): 580–5. doi : 10.1093/embo-reports/kve141 . ПМЦ 1083955 . ПМИД 11463741 .
Бенишу С., Бенмера А. (январь 2003 г.). «[Нэф ВИЧ и белки K3/K5 вируса, ассоциированного с саркомой Капоши: «паразиты» пути эндоцитоза]» . Медицина/Науки . 19 (1): 100–6. дои : 10.1051/medsci/2003191100 . ПМИД 12836198 .
Кирххаузен Т., Дэвис А.С., Фрухт С., Греко Б.О., Пейн Г.С., Табб Б. (июнь 1991 г.). «AP17 и AP19, небольшие цепи клатрин-ассоциированных белковых комплексов млекопитающих демонстрируют гомологию с Yap17p, их предполагаемым гомологом у дрожжей» . Журнал биологической химии . 266 (17): 11153–7. дои : 10.1016/S0021-9258(18)99141-6 . ПМИД 2040623 .
Крейг Х.М., Пандори М.В., Гуателли Дж.К. (сентябрь 1998 г.). «Взаимодействие Nef ВИЧ-1 с клеточным путем сортировки на основе дилейцина необходимо для подавления CD4 и оптимальной вирусной инфекционности» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 95 (19): 11229–34. Бибкод : 1998PNAS...9511229C . дои : 10.1073/pnas.95.19.11229 . ПМК 21624 . ПМИД 9736718 .
Бреснахан П.А., Йонемото В., Феррелл С., Уильямс-Херман Д., Гелезюнас Р., Грин В.К. (ноябрь 1998 г.). «Дилейциновый мотив в Nef ВИЧ-1 действует как сигнал интернализации для подавления CD4 и связывает адаптер клатрина AP-1» . Современная биология . 8 (22): 1235–8. Бибкод : 1998CBio....8.1235B . дои : 10.1016/S0960-9822(07)00517-9 . ПМИД 9811606 . S2CID 16541580 .
Гринберг М., ДеТуллео Л., Рапопорт И., Сковронски Дж., Кирххаузен Т. (ноябрь 1998 г.). «Дилейциновый мотив в Nef ВИЧ-1 необходим для сортировки в покрытые клатрином ямки и для подавления CD4» . Современная биология . 8 (22): 1239–42. Бибкод : 1998CBio....8.1239G . дои : 10.1016/S0960-9822(07)00518-0 . ПМИД 9811611 . S2CID 14272751 .
Центр Сэнгера T, Центр секвенирования генома Вашингтонского университета (ноябрь 1998 г.). «На пути к полной последовательности генома человека» . Геномные исследования . 8 (11): 1097–108. дои : 10.1101/гр.8.11.1097 . ПМИД 9847074 .
Берлиоз-Торрент С., Шаклетт Б.Л., Эрдтманн Л., Деламар Л., Бушар И., Сониго П., Докелар М.К., Бенарус Р. (февраль 1999 г.). «Взаимодействие цитоплазматических доменов ретровирусных трансмембранных белков человека и обезьяны с компонентами адапторных комплексов клатрина модулируют внутриклеточную и клеточную поверхностную экспрессию гликопротеинов оболочки» . Журнал вирусологии . 73 (2): 1350–61. doi : 10.1128/JVI.73.2.1350-1361.1999 . ПМЦ 103959 . ПМИД 9882340 .
Фёльш Х., Оно Х., Бонифачино Дж.С., Меллман I (октябрь 1999 г.). «Новый адаптерный комплекс клатрина опосредует базолатеральное нацеливание в поляризованные эпителиальные клетки» . Клетка . 99 (2): 189–98. дои : 10.1016/S0092-8674(00)81650-5 . ПМИД 10535737 . S2CID 15288582 .
Висс С., Берлиоз-Торрент С., Боге М., Блот Г., Хёнинг С., Бенарус Р., Тали М. (март 2001 г.). «Высококонсервативный С-концевой дилейциновый мотив в цитозольном домене оболочечного гликопротеина вируса иммунодефицита человека типа 1 имеет решающее значение для его ассоциации с клатриновым адаптером AP-1 [коррекция адаптера]» . Журнал вирусологии . 75 (6): 2982–92. doi : 10.1128/JVI.75.6.2982-2992.2001 . ПМЦ 115924 . ПМИД 11222723 .
Бём М., Агилар Р.К., Бонифачино Дж.С. (ноябрь 2001 г.). «Функциональные и физические взаимодействия комплекса адаптерного белка AP-4 с факторами АДФ-рибозилирования (ARF)» . Журнал ЭМБО . 20 (22): 6265–76. дои : 10.1093/emboj/20.22.6265 . ПМЦ 125733 . ПМИД 11707398 .
Жанвье К., Крейг Х., Хитчин Д., Мадрид Р., Соль-Фулон Н., Рено Л., Шерфилс Дж., Кассель Д., Бенишу С., Гуателли Дж. (март 2003 г.). «ВИЧ-1 Nef стабилизирует ассоциацию комплексов адаптерных белков с мембранами» . Журнал биологической химии . 278 (10): 8725–32. дои : 10.1074/jbc.M210115200 . ПМИД 12486136 .

Внешние ссылки

человека AP1S1 Расположение генома AP1S1 и страница сведений о гене в браузере генома UCSC .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 7 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000106367 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000004849 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9653655-5] Пейрард М., Парвене С., Лагеркранц С., Экман М., Франссон И., Сален С., Думански Дж. П. (июнь 1998 г.). «Клонирование, характер экспрессии и хромосомное присвоение 16q23 гена гамма-адаптина человека (ADTG)». Геномика . 50 (2): 275–80. дои : 10.1006/geno.1998.5289 . ПМИД 9653655 .

[pmid9733768-6] Перейти обратно: ^а ^б Такацу Х., Сакураи М., Шин Х.В., Мураками К., Накаяма К. (сентябрь 1998 г.). «Идентификация и характеристика новых белков, связанных с адаптером клатрина» . Журнал биологической химии . 273 (38): 24693–700. дои : 10.1074/jbc.273.38.24693 . ПМИД 9733768 .

[entrez-7] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: белковый комплекс 1, связанный с адаптером AP1S1, субъединица сигма 1» .

[pmid19057675-8] Монтпети А., Коте С., Брустайн Э., Друэн К.А., Лапуант Л., Будро М., Мелош С., Друэн Р., Хадсон Т.Дж., Драпо П., Коссетт П. (декабрь 2008 г.). Ван Хейнинген В. (ред.). «Нарушение AP1S1, вызывающее новый нейрокожный синдром, нарушает развитие кожи и спинного мозга» . ПЛОС Генетика . 4 (12): e1000296. дои : 10.1371/journal.pgen.1000296 . ПМЦ 2585812 . ПМИД 19057675 .

[pmid10535737-9] Фёльш Х., Оно Х., Бонифачино Дж.С., Меллман I (октябрь 1999 г.). «Новый адаптерный комплекс клатрина опосредует базолатеральное нацеливание в поляризованные эпителиальные клетки» . Клетка . 99 (2): 189–98. дои : 10.1016/S0092-8674(00)81650-5 . ПМИД 10535737 . S2CID 15288582 .

[pmid7593184-10] Пейдж Л.Дж., Робинсон М.С. (ноябрь 1995 г.). «Нацеленные сигналы и взаимодействия субъединиц в покрытых адаптерных комплексах везикул» . Журнал клеточной биологии . 131 (3): 619–30. дои : 10.1083/jcb.131.3.619 . ПМК 2120623 . ПМИД 7593184 .

[pmid17353931-11] Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф., Ли Х., Тейлор П., Клими С., МакБрум-Сераевски Л., Робинсон М.Д., О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дарси М., Хо Ю, Хейлбут А., Мур Л., Чжан С., Орнацкий О, Бухман Ю.В., Этьер М., Шэн Ю., Василеску Дж., Абу-Фарха М., Ламберт Дж.П., Дьюэл Х.С., Стюарт II, Кюль Б., Хог К., Колвилл К., Гладвиш К., Маскат Б., Кинач Р., Адамс С.Л., Моран М.Ф., Морин ГБ, Топалоглу Т., Фигейс Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белково-белковых взаимодействий человека методом масс-спектрометрии» . Молекулярная системная биология . 3 (1): 89. дои : 10.1038/msb4100134 . ПМЦ 1847948 . ПМИД 17353931 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]