СИТ7

СИТ7
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	2D8K
Идентификаторы
Псевдонимы	SYT7 , IPCA-7, IPCA7, PCANAP7, SYT-VII, SYTVII, synaptotagmin 7
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 604146 ; МГИ : 1859545 ; Гомологен : 20889 ; Генные карты : SYT7 ; OMA : SYT7 — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 11 (human)
End	61,581,148 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 19 (mouse)
End	10,430,544 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	islet of Langerhans; ; right hemisphere of cerebellum; ; right frontal lobe; ; Brodmann area 9; ; prefrontal cortex; ; cerebellar vermis; ; cingulate gyrus; ; anterior cingulate cortex; ; right lobe of liver; ; pituitary gland;
	Top expressed in
	medial dorsal nucleus; ; medial geniculate nucleus; ; dentate gyrus; ; piriform cortex; ; substantia nigra; ; primary visual cortex; ; dentate gyrus of hippocampal formation granule cell; ; cerebellar cortex; ; cerebellar vermis; ; lobe of cerebellum;
	More reference expression data
	n/a
показывать Генная онтология
Molecular function	calcium ion binding; metal ion binding; protein binding; SNARE binding; syntaxin binding; clathrin binding; phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate binding; calcium-dependent phospholipid binding; calmodulin binding; phosphatidylserine binding;
Cellular component	integral component of membrane; membrane; synapse; synaptic vesicle membrane; cell junction; terminal bouton; dense core granule; extracellular exosome; cytoplasmic vesicle; transport vesicle membrane; cytosol; synaptic vesicle; presynaptic membrane; lysosome; peroxisome; peroxisomal membrane; phagocytic vesicle membrane; plasma membrane; lysosomal membrane; early phagosome; dendrite; neuronal cell body; axon terminus; axon; neuron projection; exocytic vesicle; hippocampal mossy fiber to CA3 synapse; glutamatergic synapse; GABA-ergic synapse; integral component of presynaptic membrane;
Biological process	regulation of insulin secretion; positive regulation of calcium ion-dependent exocytosis; exocytosis; regulation of bone remodeling; plasma membrane repair; calcium-ion regulated exocytosis; regulation of calcium ion-dependent exocytosis; calcium ion-regulated exocytosis of neurotransmitter; regulation of glucagon secretion; phagosome-lysosome fusion; synaptic vesicle recycling; vesicle-mediated cholesterol transport; regulation of phagocytosis; vesicle fusion; calcium ion regulated lysosome exocytosis; phagocytosis; regulation of dopamine secretion; short-term synaptic potentiation; vesicle-mediated transport; cellular response to calcium ion; calcium-dependent activation of synaptic vesicle fusion; regulation of synaptic vesicle endocytosis;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	9066
	54525
	ENSG00000011347
	ENSMUSG00000024743
	О43581
	Q9R0N7
показывать НМ_001252065 ; НМ_001300773 ; НМ_004200 ; НМ_001365809 ; НМ_001370210 ;
	NM_001370211
	НМ_018801 ; НМ_173067 ; НМ_173068 ; НМ_001373944
показывать НП_001238994 ; НП_001287702 ; НП_004191 ; НП_001352738 ; НП_001357139 ;
	NP_001357140
	НП_061271 ; НП_775090 ; НП_775091
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Синаптотагмин-7 — это белок , который у человека кодируется SYT7 геном . ^[5]^[6]

Функция

Синаптотагмины, такие как SYT7, представляют собой кальций-зависимые фосфолипидсвязывающие белки, известные своей ролью в синаптическом экзоцитозе и высвобождении нейромедиаторов. Значительная экспрессия также наблюдалась в простате и других тканях. См. MIM 600782 [предоставлен OMIM] ^[6]

Взаимодействия

Было показано, что SYT7 взаимодействует с SYNCRIP . ^[7]

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000011347 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024743 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Купер П.Р., Новак, штат Нью-Джерси, Хиггинс, М.Д., Черч, Д.М., показывает туберкулез (май 1998 г.). «Картирование транскрипта богатой генами области хромосомы 11q12-q13.1 человека идентифицирует несколько недавно описанных консервативных генов». Геномика . 49 (3): 419–29. дои : 10.1006/geno.1998.5291 . ПМИД 9615227 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтреза: синаптотагмин VII SYT7» .
^ Мизутани А., Фукуда М., Ибата К., Сираиси Ю., Микосиба К. (март 2000 г.). «SYNCRIP, цитоплазматический аналог гетерогенного ядерного рибонуклеопротеина R, взаимодействует с повсеместно распространенными изоформами синаптотагмина» . Журнал биологической химии . 275 (13): 9823–31. дои : 10.1074/jbc.275.13.9823 . ПМИД 10734137 .

Дальнейшее чтение

Ли С., Ульрих Б., Чжан Ю.З., Андерсон Р.Г., Брозе Н., Зюдхоф Т.К. (июнь 1995 г.). «Ca (2+)-зависимая и -независимая активность нейронных и ненейронных синаптотагминов». Природа . 375 (6532): 594–9. Бибкод : 1995Natur.375..594L . дои : 10.1038/375594a0 . ПМИД 7791877 . S2CID 4265549 .
Бональдо М.Ф., Леннон Дж., Соарес М.Б. (сентябрь 1996 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода к открытию генов» . Геномные исследования . 6 (9): 791–806. дои : 10.1101/гр.6.9.791 . ПМИД 8889548 .
Перин М.С. (октябрь 1996 г.). «Мотивы зеркального изображения опосредуют взаимодействие СООН-конца нескольких синаптотагминов с нейрексинами и кальмодулином». Биохимия . 35 (43): 13808–16. дои : 10.1021/bi960853x . ПМИД 8901523 .
Крэкстон М., Гедерт М. (ноябрь 1999 г.). «Альтернативный сплайсинг синаптотагминов, включающий трансмембранный пропуск экзонов» . Письма ФЭБС . 460 (3): 417–22. дои : 10.1016/S0014-5793(99)01382-4 . ПМИД 10556508 . S2CID 19207631 .
Уокер М.Г., Волкмут В., Спринзак Э., Ходжсон Д., Клинглер Т. (декабрь 1999 г.). «Прогнозирование функции генов с помощью анализа экспрессии в масштабе генома: гены, связанные с раком простаты» . Геномные исследования . 9 (12): 1198–203. дои : 10.1101/гр.9.12.1198 . ПМК 310991 . ПМИД 10613842 .
Мизутани А., Фукуда М., Ибата К., Сираиси Ю., Микосиба К. (март 2000 г.). «SYNCRIP, цитоплазматический аналог гетерогенного ядерного рибонуклеопротеина R, взаимодействует с повсеместно распространенными изоформами синаптотагмина» . Журнал биологической химии . 275 (13): 9823–31. дои : 10.1074/jbc.275.13.9823 . ПМИД 10734137 .
Калер Э.В., Чакрабарти С., Фаулер К.Т., Рао С., Эндрюс Н.В. (май 2001 г.). «Белок, регулирующий экзоцитоз, синаптотагмин VII, опосредует инвазию клеток Trypanosoma cruzi» . Журнал экспериментальной медицины . 193 (9): 1097–104. дои : 10.1084/jem.193.9.1097 . ПМК 2193425 . ПМИД 11342594 .
Фукуда М., Огата Ю., Саэгуса С., Канно Э., Микосиба К. (июль 2002 г.). «Альтернативные изоформы сплайсинга синаптотагмина VII у мышей, крыс и человека» . Биохимический журнал . 365 (Часть 1): 173–80. дои : 10.1042/BJ20011877 . ПМЦ 1222667 . ПМИД 12071850 .

Внешние ссылки

Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : O43581 (Human Synaptotagmin-7) в PDBe-KB .
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q9R0N7 (Mouse Synaptotagmin-7) в PDBe-KB .

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 11 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000011347 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024743 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9615227-5] Купер П.Р., Новак, штат Нью-Джерси, Хиггинс, М.Д., Черч, Д.М., показывает туберкулез (май 1998 г.). «Картирование транскрипта богатой генами области хромосомы 11q12-q13.1 человека идентифицирует несколько недавно описанных консервативных генов». Геномика . 49 (3): 419–29. дои : 10.1006/geno.1998.5291 . ПМИД 9615227 .

[entrez-6] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтреза: синаптотагмин VII SYT7» .

[pmid10734137-7] Мизутани А., Фукуда М., Ибата К., Сираиси Ю., Микосиба К. (март 2000 г.). «SYNCRIP, цитоплазматический аналог гетерогенного ядерного рибонуклеопротеина R, взаимодействует с повсеместно распространенными изоформами синаптотагмина» . Журнал биологической химии . 275 (13): 9823–31. дои : 10.1074/jbc.275.13.9823 . ПМИД 10734137 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]