Эпикардиальное вещество кровеносного сосуда
| Построенный | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Псевдонимы | BVES , HPOP1, POPDC1, LGMD2X, Эпикардиальное вещество кровеносных сосудов, Carick, LGMDR25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Внешние идентификаторы | Омим : 604577 ; MGI : 1346013 ; Гомологен : 48497 ; GeneCards : здание ; Ома : Бес - ортолог | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Викидид | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Эпикардиальное вещество кровеносных сосудов ( BVE ), также известное как домен Popeye-домен, содержащий белок 1 ( PopDC1 ), представляет собой белок , который кодируется BVE геном у людей. [ 5 ] [ 6 ]
BVE является высококонсервативным трансмембранным белком, который участвует в клеточной адгезии , подвижности клеток , и совсем недавно было показано, что он играет роль в везикулярном транспорте . [ 7 ] [ 8 ] [ 9 ] [ 10 ] BVE встречается в широком спектре организмов (от мух до людей) и является членом эволюционно консервативного семейства белков POPDC. Хотя точная молекулярная функция BVE неизвестна, нарушение этого белка приводит к дефектам развития и нарушению клеточных процессов, фундаментальных для живых организмов. [ 11 ] [ 12 ] [ 13 ]
Открытие
[ редактировать ]BVES был обнаружен одновременно двумя независимыми лабораториями в 1999 году (BVES также был назван POPDC1 во время обнаружения; текущая принятая соглашение - BVE). [ 6 ] [ 14 ] Несмотря на то, что изначально выделяется из сердечной ткани, позже было выявлено, что BVE высоко экспрессируется в мышцах, эпителиальной и мозговой ткани. [ 8 ] Большинство исследований были сосредоточены на определении функции BVE в эпителиальной ткани на клеточном уровне.
Семья генов
[ редактировать ]BVES является наиболее изученным членом семейства генов Popeye , содержащего гены (POPDC). Два других члена этой семьи - POPDC2 и POPDC3 . POPDC2 и POPDC3 обнаруживаются только у более высоких позвоночных и имеют 50% их последовательности ДНК, тогда как BVE составляет всего 25% гомологичен с эволюционными младшими членами семейства POPDC. Все три члена семейства POPDC содержат высококонсервативный домен Popeye, так как семейство было названо в честь этого специфического белкового мотива. [ 7 ] [ 8 ] [ 9 ]
Структура
[ редактировать ]BVE представляет собой трехпроходной трансмембранной белок с коротким внеклеточным N-конце (~ 40AA) и более крупным внутриклеточным C-конце (~ 250AA). [ 15 ] В рамках С-конца находится домен Popeye , который был постулирован как важный для функции BVE. Домен Popeye не имеет гомологии с любыми известными белковыми мотивами, и специфическая функция этого домена в настоящее время неизвестна, хотя он высоко консервативный среди видов. BVE существует как гомодимер in vivo , и, как было показано гомодимеризация, важна для функции. [ 16 ]
Локализация/выражение
[ редактировать ]BVE экспрессируется в мышцах, эпителиальной и мозговой ткани и, таким образом, обнаруживается во многих органах взрослых. [ 9 ] Во время развития BVE обнаруживается во всех трех слоях зародышей , а затем локализуется в вышеупомянутых тканях. [ 17 ] Субклеточная локализация присутствует на плазматической мембране и также наблюдается во внутриклеточных везикулах. BVE демонстрирует динамическую локализацию, зависящую от образования клеточного соединения. Перед контактом клеток BVE локализуется в основном в внутриклеточных везикулах, но по мере того, как клетки начинают образовывать ассоциации, BVE также присутствует в точках контакта клеток. [ 11 ]
Взаимодействующие белки
[ редактировать ]BVE взаимодействует с GEFT , белком, который модулирует Rho GTPases , RAC1 и CDC42 , которые важны для подвижности клеток посредством модуляции актинового цитоскелета. [ 13 ] BVE также взаимодействует с VAMP3 , белком SNARE , важным для слияния пузырьков. [ 10 ] Кроме того, было показано, что BVE взаимодействуют с белком с плотным соединением ZO1 , хотя это взаимодействие, скорее всего, через белковый комплекс, поскольку прямое физическое взаимодействие никогда не было продемонстрировано. [ 11 ]
Функция
[ редактировать ]Разрушение BVE приводит к широкому диапазону клеточных и фенотипов развития. Грубо подвижность клеток и клеточная адгезия нарушаются. Только недавно были обнаружены молекулярные механизмы, лежащие в основе функции BVE.
Модуляция Rho GTPases
[ редактировать ]Было показано, что BVE взаимодействуют и совместно локализуют с GEFT, модулятором сигнальных каскадов Rho GTPase . Разрушение BVE приводит к снижению скорости клеток и увеличению округлости клеток, которые являются клеточными процессами, модулируемыми Rho GTPases, RAC1 и CDC42. Соответственно, нарушение BVE приводит к снижению активных RAC1 и CDC42. Взятые вместе, эти данные демонстрируют, что BVE модулирует каскады передачи сигналов Rho GTPase посредством взаимодействия с GEFT, чтобы влиять на движение клеток и морфологию. [ 13 ]
Регуляция везикулярного транспорта
[ редактировать ]Было показано, что BVE взаимодействуют с VAMP3 , членом комплекса SNARE , который облегчает слияние пузырьков. VAMP3 важен для переработки интегринов во время миграции клеток, а также необходим для экзоцитоза трансферрина . [ 18 ] [ 19 ] [ 20 ] [ 21 ] [ 22 ] После разрушения BVE увеличивается округление клеток, фенотип, указывающий на снижение адгезии и нарушение функции интегрина. Соответственно, нарушение BVE приводит к нарушению рециркуляции интегрина, фенокопируя результат, наблюдаемый при ингибировании VAMP3. Аналогичным образом, нарушение любого BVE приводит к ухудшению переработки трансферрина, имитируя результат, наблюдаемый при разрушении VAMP3. Таким образом, BVE важен для VAMP3-опосредованного везикулярного транспорта, лежащей в основе миграции клеток и переработки трансферрина. [ 10 ]
Молчание в злокачественных новообразованиях
[ редактировать ]BVE замолчают промоторным гиперметилированием при злокачественных новообразованиях. BVES неэкспрессируется в раке толстой кишки, легких и молочной железы. При раке толстой кишки это происходит очень рано во время онкогенеза, а BVES неэкспрессия впервые отмечена в предраченовых аденомах.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а беременный в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000112276 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ Jump up to: а беременный в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000071317 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
- ^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
- ^ Риз де, Бадер Д.М. (сентябрь 1999). «Клонирование и экспрессия HBVE, новая и высоко консервативная мРНК, экспрессируемая в развивающихся и взрослых сердцах и скелетных мышцах у человека». Геном млекопитающих . 10 (9): 913–5. doi : 10.1007/s003359901113 . PMID 10441744 . S2CID 35384190 .
- ^ Jump up to: а беременный Андре Б., Хилманн Т., Кесслер-Эйксон Г., Шмитт-Джон Т., Джокуш Х., Арнольд Х.Х., Бренд Т (июль 2000). «Выделение и характеристика нового семейства генов Popeye, экспрессируемого в скелетных мышцах и сердце» . Биология развития . 223 (2): 371–82. doi : 10.1006/dbio.2000.9751 . PMID 10882522 .
- ^ Jump up to: а беременный Бренд Т (2005). «Домен Popeye, содержащий семейство генов». Клеточная биохимия и биофизика . 43 (1): 95–103. doi : 10.1385/cbb: 43: 1: 095 . PMID 16043887 . S2CID 13142874 .
- ^ Jump up to: а беременный в Osler Me, Smith TK, Bader DM (март 2006 г.). «BVES, член домена Popeye, содержащий семейство генов» . Динамика развития . 235 (3): 586–93. doi : 10.1002/dvdy.20688 . PMC 2849751 . PMID 16444674 .
- ^ Jump up to: а беременный в Хагер Ха, Бадер Д.М. (июнь 2009 г.). «BVES: десять лет после» . Гистология и гистопатология . 24 (6): 777–87. PMC 2853719 . PMID 19337975 .
- ^ Jump up to: а беременный в Hager HA, Roberts RJ, Cross EE, Proux-Gilardeaux V, Bader DM (февраль 2010 г.). «Идентификация новой функции BVE: регуляция везикулярного транспорта » Embo Journal 29 (3): 532–4 Doi : 10.1038/ emboj.2 2830705PMC 20057356PMID
- ^ Jump up to: а беременный в Osler ME, Chang MS, Bader DM (октябрь 2005 г.). «BVE модулирует эпителиальную целостность посредством взаимодействия в плотном соединении» . Журнал сотовой науки . 118 (Pt 20): 4667–78. doi : 10.1242/jcs.02588 . PMID 16188940 .
- ^ Рипли А.Н., Ослер М.Е., Райт С.В., Бадер Д. (Январь 2006 г.). «XBVE является регулятором эпителиального движения во время раннего развития Xenopus laevis» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 103 (3): 614–9. Bibcode : 2006pnas..103..614r . doi : 10.1073/pnas.0506095103 . PMC 1334639 . PMID 16407138 .
- ^ Jump up to: а беременный в Смит Т.К., Хагер Х.А., Фрэнсис Р., Килкенни Д.М., Ло К.В., Бадер Д.М. (июнь 2008 г.). «BVE напрямую взаимодействует с GEFT и контролирует форму и движение клеток посредством регуляции активности RAC1/CDC42» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 105 (24): 8298–303. Bibcode : 2008pnas..105.8298s . doi : 10.1073/pnas.0802345105 . PMC 2423412 . PMID 18541910 .
- ^ Риз де, Завалевски М., Стрейфф Н.Л., Бадер Д. (май 1999). «BVE: новый ген, экспрессируемый во время развития коронарных кровеносных сосудов» . Биология развития . 209 (1): 159–71. doi : 10.1006/dbio.1999.9246 . PMID 10208750 .
- ^ Knight RF, Bader DM, Backstrom Jr (август 2003 г.). «Мембранная топология BVE/POP1A, молекулы клеточной адгезии, которая демонстрирует динамические изменения в клеточном распределении во время развития» . Журнал биологической химии . 278 (35): 32872–9. doi : 10.1074/jbc.m301961200 . PMID 12815060 .
- ^ Кавагучи М., Хагер Х.А., Вада А., Кояма Т., Чанг М.С., Бадер Д.М. (2008). «Идентификация нового домена внутриклеточного взаимодействия, необходимый для функции BVE» . Plos один . 3 (5): E2261. Bibcode : 2008ploso ... 3.2261K . doi : 10.1371/journal.pone.0002261 . PMC 2373926 . PMID 18493308 .
- ^ Ослер я, Бадер Д.М. (март 2004 г.). «Экспрессия BVE во время эмбриогенеза птиц» . Динамика развития . 229 (3): 658–67. doi : 10.1002/dvdy.10490 . PMID 14991721 . S2CID 12458928 .
- ^ McMahon HT, Ushkaryov YA, Edelmann L, Link E, Binz T, Niemann H, Jahn R, Südhof TC (июль 1993). «Cellubrevin-это повсеместный субстрат из столбняка, гомологичный предполагаемому синаптическим пузырьковым белкам». Природа . 364 (6435): 346–9. Bibcode : 1993natur.364..346M . doi : 10.1038/364346A0 . PMID 8332193 . S2CID 4324845 .
- ^ Proux-Gillardeaux V, Gavard J, Irinopoulou T, Mège RM, Galli T (май 2005 г.). «Тетановый нейротоксин-опосредованный расщепление клеточного пульвина нарушает миграцию эпителиальных клеток и интегрин-зависимую клеточную адгезию» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 102 (18): 6362–7. Bibcode : 2005pnas..102.6362p . doi : 10.1073/pnas.0409613102 . PMC 1088364 . PMID 15851685 .
- ^ Скалски М., Копполино М.Г. (октябрь 2005 г.). «Опосредованный SNARE Tradsing of Alpha5beta1 Integrin необходим для распространения в клетках SHO». Биохимическая и биофизическая исследовательская коммуникация . 335 (4): 1199–210. doi : 10.1016/j.bbrc.2005.07.195 . PMID 16112083 .
- ^ Tayeb MA, Skalski M, Cha MC, Kean MJ, Scaife M, Coppolino MG (апрель 2005 г.). «Ингибирование опосредованного SNARE мембранное движение ухудшает миграцию клеток». Экспериментальные исследования клеток . 305 (1): 63–73. doi : 10.1016/j.yexcr.2004.12.004 . PMID 15777788 .
- ^ Луфтман К., Хасан Н., Дей П, Харди Д., Ху С (февраль 2009 г.). «Сильком VAMP3 ингибирует миграцию клеток и опосредованную интегрином адгезию» . Биохимическая и биофизическая исследовательская коммуникация . 380 (1): 65–70. doi : 10.1016/j.bbrc.2009.01.036 . PMC 2716655 . PMID 19159614 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Местоположение генома человека генов BVE и страница BVE и страница гена в браузере UCSC Genome .
- Human POP1 Местоположение генома POP1 и страница детали гена в браузере UCSC Genome .