Йедц семья
Yedz ( TC# 5.b.7 ) E. coli был исследован топологически и имеет 6 трансмембранных сегментов (TMS) как N-, так и с C-концевых локализованных в цитоплазме. [ 1 ] Von Rozycki et al. 2004 идентифицировали гомологи yedz у бактерий и животных. Гомологи yedz демонстрируют консервативные гистидильные остатки в своих трансмембранных доменах, которые могут функционировать при связывании гема. [ 2 ] Некоторые из гомологов, кодируемых в геномах различных бактерий, имеют домены yedz, слитые для транспортировки, переноса электронов и белков биогенеза. [ 2 ] Одним из гомологов животных является 6-ТМС-эпителиальная плазматическая мембрана антигена простаты (Stamp1), который чрезмерно экспрессируется при раке предстательной железы. У некоторых гомологов животных есть домены yedz, слитые с C-терминалом к гомологам NADP- оксидоредуктаз .
Гомологи yedz возникли в результате интрагенного трипроизводства элемента, кодирующего 2 TMS. Они демонстрируют статистически значимое сходство последовательностей с двумя семействами предполагаемых систем экспорта гема и одному семейству цитохромосодержащих электронных носителей и имеют биогенез. [ 2 ] Гомологи yedz могут функционировать как гем-связывающие белки, которые облегчают или регулируют оксидидоровку, трансмембранную электронную поток и транспорт. Гомологи yedz обнаружены в различных бактериях, включая магнитотаксические бактерии и цианобактерии , где домены yedz слиты с C-концевыми к переносчикам магнитосом суперсемейства MFS ( TC# 2.A.1 и к электронным носителям семейства DSBD ( TC. # 5.A.1 ), соответственно.
Гомологи yedz обнаруживаются у животных, где один из них включает в себя антиген эпителиальной мембраны человека на 6 человека, который экспрессируется на высоких уровнях в клетках рака предстательной железы. [ 3 ] [ 4 ] Еще более отдаленные гомологи могут включать трансмембранную домен в членах GP91 поток NADPH -оксидаза, связанная с цитохромом B 558 (CYTB) Семейство (TC #5.B.2). Гем-содержащие трансмембранные домены редуктазы железа (FRD) обнаружены как в бактериальных, так и в эукариотических белках, включая редуктазы железа (FRE) и NADPH оксидазы (NOX). [ 2 ] Бактерии содержат белки FRD, состоящие только из домена редуктазы железа, таких как YEDZ и короткие Fre -белки. Ферменты FEUR и NOX в основном обнаруживаются у эукариот и обладают дегидрогеназной доменом, что позволяет им катализировать перенос электронов из цитозольного NADPH в ионы внеклеточного металла (FRE) или кислорода (NOX). Metazoa обладают yedz-связанными белками. Филогенетический анализ предполагает, что свободные ферменты появились на ранних стадиях эволюции, а затем переход к EF-руку, содержащий ферменты NOx (NOX5- и Duox-подобные). Ферменты NOX отличаются от свободных ферментов через четыре аминокислотного мотива, охватывающего от трансмембранного домена 3 (TM3) до TM4, а белки yedz/steap идентифицируются путем замены первого канонического гемора, охватывающего гистидин, высококонсервативный аргинин. [ 5 ]
Шесть трансмембранного эпителиального антигена простаты 3 (STEAP3) является основной редуктазой железа в развивающихся эритроцитах. Семейные белки Steap определяются общим трансмембранным доменом, который, как было показано в STEAP3, функционирует как трансмембранная электронная трансфера, перемещая цитоплазматические электроны, полученные из NADPH через липидный бислой, к внеклеточному лицом, где они используются для уменьшения Fe 3+ в Fe 2+ и потенциально ку 2+ к 1+ . [ 6 ] В уцембранном домене STEAP3 присутствуют высокоаффинные сайты связывания железа, а также один сайт связывания гема B-типа присутствует. STEAP3 функционирует в качестве гомодимера и использует внутрисубонный путь переноса электрона через единый гем-фрагмент, а не межсубной электронный путь через потенциальный домен, заваленный доменом. [ 6 ] Мотивы последовательности в трансмембранном домене, которые связаны с сайтами связывания FAD и металлом, присутствуют не только в STEAP2 и STEAP4, но и в STEAP1, в котором отсутствует N-концевая оксидоредуктаза, предполагая, что STEAP1 содержит латентную оксидоредуктазу.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Дрю, Дэвид; Шестранд, Дэн; Нильссон, Йохан; Урбиг, Томас; Подбородок, Чэнь-Ни; Де Гиер, Ян-Уим; фон Хейне, Гуннар (2002-03-05). «Быстрое отображение топологии белков Escherichia coli внутренней мембранной белков с помощью прогнозирования и анализа слияния PHOA/GFP» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 99 (5): 2690–2695. Bibcode : 2002pnas ... 99.2690d . doi : 10.1073/pnas.052018199 . ISSN 0027-8424 . PMC 122409 . PMID 11867724 .
- ^ Jump up to: а беременный в дюймовый фон Розики, Торстен; Йен, Мин-Рен; Ленде, Эрик Э.; Saier, Milton H. (2004-01-01). «Семейство yedz: возможные белки, связывающие гем, которые могут быть слиты с транспортерами и электронными носителями». Журнал молекулярной микробиологии и биотехнологии . 8 (3): 129–140. doi : 10.1159/000085786 . ISSN 1464-1801 . PMID 16088215 . S2CID 34128668 .
- ^ Хьюберт, RS; Vivanco, я.; Чен, E.; Rastegar, S.; Леонг, К.; Митчелл, Южная Каролина; Мадрасвала, Р.; Zhou, y.; Kuo, J. (1999-12-07). «Steap: Простат-специфический антиген-поверхность клеточной поверхности, высоко экспрессируемый в опухолях простаты человека» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 96 (25): 14523–14528. Bibcode : 1999pnas ... 9614523H . doi : 10.1073/pnas.96.25.14523 . ISSN 0027-8424 . PMC 24469 . PMID 10588738 .
- ^ Ян, Д.; Холт, GE; Вельдерс, MP; Квон, Эд; Каст, WM (2001-08-01). «Мышиный шестирансмембранный эпителиальный антиген простаты, антигена стволовых клеток предстательной железы и простат-специфический мембранный антиген: антигены простат-поверхности поверхности, высоко экспрессируемые при раке предстательной железы мышей-мышей-простаты на мыши аденокарциномы». РАНКА . 61 (15): 5857–5860. ISSN 0008-5472 . PMID 11479226 .
- ^ Чжан, Сюэжи; Краузе, Карл-Хейнц; Xenarios, ioannis; Sondati, Thierry; Boeckmann, Brigitte (2013-01-01). «Эволюция суперсемейства домена редуктазы железа (FRD): модульность, функциональная диверсификация и мотивы подписи» . Plos один . 8 (3): E58126. BIBCODE : 2013PLOSO ... 858126Z . doi : 10.1371/journal.pone.0058126 . ISSN 1932-6203 . PMC 3591440 . PMID 23505460 .
- ^ Jump up to: а беременный Kleven, Mark D.; Длакич, Менсур; Лоуренс, С. Мартин (2015-09-11). «Характеристика единых сайтов связывания гема B-типа, FAD и металлов в трансмембранном домене шестирансмембранного эпителиального антигена белков семейства простаты (Steap)» . Журнал биологической химии . 290 (37): 22558–22569. doi : 10.1074/jbc.m115.664565 . ISSN 1083-351X . PMC 4566230 . PMID 26205815 .
На этом редактировании в этой статье используется контент из «5.B.7. Семейство YEDZ (YEDZ)» , которая лицензирована таким образом, что позволяет повторно использовать в соответствии с лицензией Creative Commons Attribution-Sharealike 3.0 , но не под GFDL Полем Все соответствующие условия должны соблюдаться.