Jump to content

белок ВПУ

Впу
структура каналообразующего трансмембранного домена вирусного белка «u» (vpu) ВИЧ -1
Идентификаторы
Символ Впу
Пфам PF00558
ИнтерПро ИПР008187
ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2 1впу / СКОПе / СУПФАМ
TCDB 1.А.40
Суперсемейство OPM 262
белок OPM 2k7y
Доступные белковые структуры:
Pfam  structures / ECOD  
PDBRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsumstructure summary
Уникальный вирусный белок
Идентификаторы
Организм ВИЧ-1
Символ ВПУ
Входить 155945
RefSeq (защита) НП_057855.1
ЮниПрот P05919
Другие данные
хромосома вирусный геном: 0,01 - 0,01 Мб
Искать
StructuresSwiss-model
DomainsInterPro

Vpu — это дополнительный белок , который при ВИЧ кодируется vpu геном . Vpu означает «вирусный белок U». Белок Vpu участвует в деградации CD4 в эндоплазматическом ретикулуме и в усилении высвобождения вирионов из плазматической мембраны инфицированных клеток . [ 1 ] Vpu индуцирует деградацию вирусного рецептора CD4 и, следовательно, участвует в общем снижении экспрессии CD4 во время ВИЧ-инфекции. Считается, что Vpu-опосредованная деградация CD4 предотвращает связывание CD4- Env в эндоплазматическом ретикулуме, чтобы облегчить правильную сборку Env в вирионы. [ 2 ] Он обнаруживается в мембранах инфицированных клеток, но не в самих вирусных частицах.

Ген Vpu обнаружен исключительно в ВИЧ-1 и некоторых изолятах вируса иммунодефицита обезьян ( SIV ), связанных с ВИЧ-1, таких как SIV cpz , SIV gsn и SIV mon , но не в ВИЧ-2 или большинстве изолятов SIV. [ 3 ] Структурное сходство между Vpu и другим небольшим вирусным белком, M2, кодируемым вирусом гриппа А, было впервые отмечено вскоре после открытия Vpu. С тех пор было показано, что Vpu образует катион-селективные ионные каналы при экспрессии в ооцитах Xenopus или клетках млекопитающих, а также при очистке и восстановлении в плоские липидные бислои . [ 4 ] Vpu также обеспечивает проницаемость мембран бактерий и клеток млекопитающих для небольших молекул. [ 5 ] Поэтому его считают членом семейства Виропоринов . [ 6 ]

Выражение

[ редактировать ]

Vpu и Env экспрессируются из одной и той же бицистронной мРНК Rev-зависимым образом, предположительно путем «протекающего» сканирования рибосом vpu через кодон инициации . [ 7 ] Фактически ген Vpu перекрывается на своем 3'-конце с геном env. Было обнаружено, что несколько изолятов ВИЧ-1 несут точечные мутации в кодоне инициации трансляции Vpu, но в остальном имеют интактные гены vpu. Поскольку удаление кодона инициации Vpu приводит к усилению экспрессии нижестоящего гена env, возможно, что ВИЧ-1 фактически использует этот механизм в качестве молекулярного переключателя для регулирования относительной экспрессии Vpu или Env в инфицированных клетках. Возможные выгоды от такого регулирования неясны. [ 8 ]

Белку Vpu приписывают две основные функции. Известно, что первая функция вызывает деградацию молекулы вирусного рецептора CD4, а вторая функция заключается в усилении высвобождения вновь образовавшихся вирионов с поверхности клетки. Vpu выполняет эти две функции с помощью двух разных механизмов. В случае CD4 Vpu действует как молекулярный адаптер для соединения CD4 с комплексом убиквитинлигазы E3, что приводит к деградации CD4 клеточными протеасомами . домене Vpu Для этого необходимы сигналы, расположенные в цитоплазматическом . С другой стороны, усиление высвобождения вируса включает нейтрализацию клеточного фактора-хозяина BST-2 (также известного как CD317, HM1.24 или тетерин ) и требует домена Vpu TM. [ 9 ] однако точный механизм того, как Vpu противодействует BST-2, до сих пор неясен. [ 8 ] В отсутствие Vpu тетерин связывается с оболочкой вируса и связывает ее с клеточной мембраной и другими вирусными частицами, препятствуя высвобождению вирусных частиц. Недавние данные показывают, что трансмембранный домен BST-2 имеет решающее значение для вмешательства со стороны Vpu. Взаимодействие Vpu и BST-2 приводит к снижению активности BST-2 на клеточной поверхности. [ 10 ]

BST-2, который представляет собой белок клеточной поверхности, индуцируемый интерфероном (IFN), по-видимому, «привязывает» ВИЧ к клетке в отсутствие Vpu. BST-2 представляет собой сильно гликозилированный массой от 29 до 33 кДа интегральный мембранный белок , имеющий как трансмембранный домен , так и предполагаемый гликозилфосфатидилинозитоловый якорь (GPI). [ 11 ] На поверхности клетки BST2 располагается в липидных рафтах через якорь GPI, тогда как его ТМ-домен находится вне них, опосредованно взаимодействуя с актиновым цитоскелетом. Первичным местом действия Vpu является плазматическая мембрана, где этот белок нацеливается на BST-2 на клеточной поверхности посредством их взаимного связывания TM-to-TM, что приводит к образованию лизосом, частично зависящих от βTrCP. [ 12 ]

Структура

[ редактировать ]

Вирусный белок «u» (Vpu) представляет собой олигомерный 81 аминокислоты мембранный белок типа I из (16 кДа), который транслируется с бицистронной мРНК vpu-env. N -конец Vpu, кодирующий трансмембранный (ТМ) якорь, представляет собой активный домен, важный для регуляции высвобождения вируса, но не для деградации CD4. С -концевой цитоплазматический домен (54 остатка), содержащий пару остатков серина (в положениях 52 и 56), конститутивно фосфорилируется казеинкиназой 2 . Фосфорилирование двух остатков серина в цитоплазматическом домене имеет решающее значение для деградации CD4 в ЭР. [ 13 ] На основании 2D 1H ЯМР-спектроскопии пептида, соответствующего цитоплазматическому домену Vpu, было высказано предположение, что цитоплазматический домен Vpu содержит два α-спиральных домена, спираль-1 и спираль-2, которые соединены неструктурированной областью, содержащей два консервативных фосфосерильных остатка. Кроме того, компьютерные модели предсказывают наличие третьего α-спирального домена в трансмембранном домене Vpu, который может играть важную роль в формировании ионных каналов . [ 14 ]

См. также

[ редактировать ]
  1. ^ Бур С., Шуберт У., Штребель К. (март 1995 г.). «Белок Vpu вируса иммунодефицита человека типа 1 специфически связывается с цитоплазматическим доменом CD4: значение механизма деградации» . Журнал вирусологии . 69 (3): 1510–20. doi : 10.1128/JVI.69.3.1510-1520.1995 . ЧВК   188742 . ПМИД   7853484 .
  2. ^ Эстрабо Э, Ле Рузик Э, Лопес-Вержес С, Морель М, Белайдуни Н, Бенарус Р, Транси С, Берлиоз-Торрент С, Марготен-Гоге Ф (июль 2007 г.). «Регулируемая деградация белка Vpu ВИЧ-1 через бетаTrCP-независимый путь ограничивает высвобождение вирусных частиц» . ПЛОС Патог . 3 (7): е104. дои : 10.1371/journal.ppat.0030104 . ЧВК   1933454 . ПМИД   17676996 .
  3. ^ Хусейн А., Уэсли С., Халид М., Чаудри А., Джамиль С. (январь 2008 г.). «Белок Vpu вируса иммунодефицита человека типа 1 взаимодействует с CD74 и модулирует презентацию главного комплекса гистосовместимости класса II» (PDF) . Журнал вирусологии . 82 (2): 893–902. дои : 10.1128/JVI.01373-07 . ПМК   2224584 . ПМИД   17959659 .
  4. ^ Юарт Г.Д., Сазерленд Т., Гейдж П.В., Кокс ГБ (октябрь 1996 г.). «Белок Vpu вируса иммунодефицита человека 1-го типа образует катион-селективные ионные каналы» . Журнал вирусологии . 70 (10): 7108–15. doi : 10.1128/JVI.70.10.7108-7115.1996 . ЧВК   190763 . ПМИД   8794357 .
  5. ^ Гонсалес М.Э., Карраско Л. (сентябрь 1998 г.). «Белок Vpu вируса иммунодефицита человека типа 1 повышает проницаемость мембран». Биохимия . 37 (39): 13710–9. дои : 10.1021/bi981527f . hdl : 20.500.12105/7976 . ПМИД   9753459 .
  6. ^ Гонсалес М.Э., Карраско Л. (сентябрь 2003 г.). «Виропорины» . Письма ФЭБС . 552 (1): 28–34. дои : 10.1016/S0014-5793(03)00780-4 . hdl : 20.500.12105/7778 . ПМИД   12972148 . S2CID   209557930 .
  7. ^ Геттлингер Х.Г., Дорфман Т., Коэн Э.А., Хазелтайн В.А. (август 1993 г.). «Белок Vpu вируса иммунодефицита человека типа 1 усиливает высвобождение капсидов, продуцируемых генными конструкциями gag широко расходящихся ретровирусов» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 90 (15): 7381–5. Бибкод : 1993PNAS...90.7381G . дои : 10.1073/pnas.90.15.7381 . ПМК   47141 . ПМИД   8346259 .
  8. ^ Jump up to: а б Штребель К. (декабрь 1996 г.). «Структура и функция Vpu ВИЧ-1» (PDF) . Лос-Аламосская национальная лаборатория.
  9. ^ Эндрю А., Штребель К. (октябрь 2010 г.). «ВИЧ-1 Vpu воздействует на маркеры клеточной поверхности CD4 и BST-2 посредством различных механизмов» . Мол. Аспекты Мед . 31 (5): 407–17. дои : 10.1016/j.mam.2010.08.002 . ПМЦ   2967615 . ПМИД   20858517 .
  10. ^ Эндрю А.Дж., Мияги Э., Штребель К. (март 2011 г.). «Дифференциальное влияние вируса иммунодефицита человека типа 1 Vpu на стабильность BST-2/тетерина» . Дж. Вирол . 85 (6): 2611–9. дои : 10.1128/JVI.02080-10 . ПМК   3067951 . ПМИД   21191020 .
  11. ^ Дуглас Дж.Л., Вишванатан К., МакКэрролл М.Н., Гастин Дж.К., Фрю К., Мозес А.В. (август 2009 г.). «Vpu управляет деградацией фактора рестрикции вируса иммунодефицита человека BST-2/Tetherin посредством {beta}TrCP-зависимого механизма» . Дж. Вирол . 83 (16): 7931–47. дои : 10.1128/JVI.00242-09 . ПМЦ   2715753 . ПМИД   19515779 .
  12. ^ Ивабу Ю, Фудзита Х, Киномото М, Канеко К, Ишизака Ю, Танака Ю, Сата Т, Токунага К (декабрь 2009 г.). «Аксессуарный белок Vpu ВИЧ-1 интернализует BST-2/тетерин на клеточной поверхности посредством трансмембранных взаимодействий, приводящих к лизосомам» . Ж. Биол. Хим . 284 (50): 35060–72. дои : 10.1074/jbc.M109.058305 . ПМЦ   2787367 . ПМИД   19837671 .
  13. ^ Номагути М., Фудзита М., Адачи А. (июль 2008 г.). «Роль белка Vpu ВИЧ-1 в распространении и патогенезе вируса» . Микробы заражают . 10 (9): 960–7. дои : 10.1016/j.micinf.2008.07.006 . ПМИД   18672082 .
  14. ^ Коэн Э.А., Тервиллигер Э.Ф., Содроски Дж.Г., Хазелтайн В.А. (август 1988 г.). «Идентификация белка, кодируемого геном vpu ВИЧ-1». Природа . 334 (6182): 532–4. Бибкод : 1988Natur.334..532C . дои : 10.1038/334532a0 . ПМИД   3043230 . S2CID   4372649 .
[ редактировать ]
В эту статью включен текст из общественного достояния Pfam и InterPro : IPR008187.
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 5e5f253c9921532410ba28aecf6ba440__1713144360
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/5e/40/5e5f253c9921532410ba28aecf6ba440.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Vpu protein - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)