Капсидный портальный белок HHV
| Капсидный портальный белок HHV | |||
|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||
| Организм | ? | ||
| Символ | Л6 | ||
| ЮниПрот | P10190 | ||
| |||
Капсидный портальный белок HHV , или - 6 HSV-1 UL белок , представляет собой белок , который образует цилиндрический портал в капсиде вируса простого герпеса (HSV-1) . Этот белок обычно называют белком HSV-1 UL - 6 , поскольку он является продуктом транскрипции герпеса гена UL - 6.
вируса герпеса ДНК входит и выходит из капсида через капсидный портал. Капсидный портал образован двенадцатью копиями портального белка, расположенными в виде кольца; белки содержат с лейциновой застежкой-молнией последовательность аминокислот , которая позволяет им прилипать друг к другу. [ 1 ] Каждый икосаэдрический капсид содержит единственный портал, расположенный в одной вершине. [ 2 ] [ 3 ]
Портал формируется во время начальной сборки капсида и взаимодействует с каркасными белками, которые строят прокапсид. [ 4 ] [ 5 ] [ 6 ] Когда капсид почти готов, вирусная ДНК проникает в капсид (т. е. ДНК инкапсидирована ) по механизму, включающему портал и ДНК-связывающий белковый комплекс, аналогичный бактериофага терминазе . [ 7 ] Многочисленные исследования предполагают эволюционную связь между капсидным портальным белком и портальными белками бактериофага. [ 2 ] [ 7 ]
Когда вирус заражает клетку, необходимо, чтобы вирусная ДНК высвободилась из капсида. ДНК вируса герпеса выходит через капсидный портал. [ 8 ]
Генетическая последовательность гена UL - 6 HSV-1 консервативна во всем семействе Herpesviridae , и это семейство генов известно как семейство генов «UL6-подобного вируса герпеса». [ 9 ] « UL -6» представляет собой номенклатуру, означающую, что белок генетически кодируется шестой (6-й) открытой рамкой считывания , обнаруженной в сегменте вирусного генома, называемом «Unique-Long (UL ) ».
Исследования
[ редактировать ]| Исследования по расположению аминокислотной последовательности | ||
| pU L -6 Диапазон аминокислот | Краткое содержание | Ссылка |
|---|---|---|
| Е121, А618, К621 | Точечные мутации придают устойчивость к ингибитору портальной сборки WAY-150138. | ван Зейл и др. , 2000 г. [ 10 ] |
| 198-295 | Делеционный мутант образует незрелые B-капсиды без порталов. | Неллиссери и др. , 2007 г. [ 3 ] |
| 322-416 | Делеционные мутанты образуют незрелые B-капсиды, которые содержат порталы. | Неллиссери и др. , 2007 г. [ 3 ] |
| 409-473 | ||
| Л429, Л436 | Исследования мутаций предполагают, что предполагаемая лейциновая молния. для формирования портального кольца необходима | Неллиссери и др. , 2007 г. [ 3 ] |
| 676 рэндов | Карбоксильный ( С )-конец | Последовательность NCBI [ 11 ] |
| pU L -26,5 «Каркасный белок» Аминокислотный диапазон | Краткое содержание | Ссылка |
| 143-151 | Удаление ингибирует UL сборку портала -6. | Сингер и др. , 2005 г. [ 6 ] |
Додекамерная структура
[ редактировать ]Исследования, проведенные в 2004 году с использованием электронной микроскопии, позволили предсказать, что UL - 6 образует 11, 12, 13 и 14-звенные полимеры. додекамерная форма . Наиболее вероятной оказалась [ 2 ]
Усовершенствования электронной микроскопии в 2007 году позволили обнаружить, что портал представляет собой двенадцатизвенный полимер, присутствующий в одной из двенадцати вершин капсида вместо пентамера UL - 19, обнаруженного в непортальных вершинах. [ 1 ]
Лейциновая молния создает межбелковую адгезию
[ редактировать ]Исследование с использованием делеции и мутации аминокислотной последовательности UL - 6 продемонстрировало, что лейциновые остатки в предсказанном мотиве лейциновой застежки необходимы для формирования додекамерной кольцевой структуры. [ 3 ]
Раннее участие в сборке капсида
[ редактировать ]Сборка портальных единиц является начальным шагом в конструировании капсидов вирусного потомства. Капсиды, собранные в отсутствие порталов, лишены порталов. [ 4 ]
Взаимодействие с каркасным белком капсида
[ редактировать ]В 2003 году исследования гель-электрофореза показали, что интактные порталы UL - 6 связываются in vitro с вирусным белком UL - 26. Этой ассоциации противодействует действие WAY-150138, ингибитора тиомочевины ВГЧ инкапсидации . [ 5 ]
Дальнейшие исследования, проведенные в 2006 году, показали, что сборка капсида с порталом зависит от взаимодействия UL - 6 с «каркасным» белком UL - 26,5, аминокислотами со 143 по 151. [ 6 ]
Взаимодействие с терминазным комплексом
[ редактировать ]UL - -6 связывается с белковым комплексом UL 15 /UL - 28 во время сборки капсида. терминаза , путем упаковки Считается, что UL-15/UL-28 связывается с вирусной ДНК и служит той же цели, что и вирусной ДНК в капсид во время сборки капсида. [ 7 ]
Функция во время выхода ДНК
[ редактировать ]ДНК выходит из капсида в виде одного линейного сегмента. Выход ДНК может контролироваться UL - 6 и зависеть от температуры или белков окружающей среды. [ 8 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б Кардоне Дж., Винклер Д.С., Трус Б.Л., Ченг Н., Хойзер Дж.Э., Ньюкомб В.В., Браун Дж.К., Стивен А.С. (10 мая 2007 г.). «Визуализация портала вируса простого герпеса in situ с помощью криоэлектронной томографии» . Вирусология . 361 (2): 426–34. дои : 10.1016/j.virol.2006.10.047 . ЧВК 1930166 . ПМИД 17188319 .
- ^ Перейти обратно: а б с Трус Б.Л., Ченг Н., Ньюкомб В.В., Хома ФЛ, Браун Дж.К., Стивен А.С. (ноябрь 2004 г.). «Структура и полиморфизм портального белка UL6 вируса простого герпеса типа 1» . Журнал вирусологии . 78 (22): 12668–71. doi : 10.1128/JVI.78.22.12668-12671.2004 . ПМК 525097 . ПМИД 15507654 . (Статья: [1] )
- ^ Перейти обратно: а б с д и Неллисери Дж.К., Щепаньяк Р., Ламберти С., Веллер С.К. (20 июня 2007 г.). «Предположительная лейциновая молния в белке UL6 HSV-1 необходима для формирования портального кольца» . Журнал вирусологии . 81 (17): 8868–77. дои : 10.1128/JVI.00739-07 . ЧВК 1951442 . ПМИД 17581990 .
- ^ Перейти обратно: а б Ньюкомб В.В., Хома, Флорида, Браун Дж.К. (август 2005 г.). «Вовлечение портала на раннем этапе сборки капсида вируса простого герпеса» . Журнал вирусологии . 79 (16): 10540–6. doi : 10.1128/JVI.79.16.10540-10546.2005 . ПМЦ 1182615 . ПМИД 16051846 .
- ^ Перейти обратно: а б Ньюкомб В.В., Томсен Д.Р., Хома Флорида, Браун Дж.К. (сентябрь 2003 г.). «Сборка капсида вируса простого герпеса: идентификация растворимых комплексов каркас-портал и их роль в формировании портальных капсидов» . Журнал вирусологии . 77 (18): 9862–71. doi : 10.1128/JVI.77.18.9862-9871.2003 . ПМК 224603 . ПМИД 12941896 . (Статья: [2] )
- ^ Перейти обратно: а б с Singer GP, Newcomb WW, Thomsen DR, Homa FL, Brown JC (2005). «Идентификация участка каркасного белка вируса простого герпеса, необходимого для взаимодействия с порталом» . Журнал вирусологии . 79 (1): 132–9. doi : 10.1128/JVI.79.1.132-139.2005 . ПМК 538710 . ПМИД 15596809 .
- ^ Перейти обратно: а б с Уайт Калифорния, Стоу Н.Д., Патель А.Х., Хьюз М., Престон В.Г. (июнь 2003 г.). «Портальный белок UL6 вируса простого герпеса типа 1 взаимодействует с предполагаемыми субъединицами терминазы UL15 и UL28» . Журнал вирусологии . 77 (11): 6351–8. doi : 10.1128/JVI.77.11.6351-6358.2003 . ПМК 154995 . ПМИД 12743292 .
- ^ Перейти обратно: а б Ньюкомб В.В., Буй Ф.П., Браун Дж.К. (13 мая 2007 г.). «Раскрытие генома вируса простого герпеса» . Журнал молекулярной биологии . 370 (4): 633–42. дои : 10.1016/j.jmb.2007.05.023 . ЧВК 1975772 . ПМИД 17540405 .
- ^ Герпесвирус UL6, как просмотр консервативных доменов в NCBI
- ^ Марья ван Зейл; Джанетт Фэйрхерст; Томас Р. Джонс; Стивен К. Вернон; Джон Морин; Джеймс ЛаРок; Борис Фельд; Брайан О'Хара; Джонатан Д. Блум; Стивен В. Иоганн (октябрь 2000 г.). «Новый класс соединений тиомочевины, которые ингибируют расщепление и инкапсидацию ДНК вируса простого герпеса типа 1: карты устойчивости к гену UL6» . Журнал вирусологии . 74 (19): 9054–9061. doi : 10.1128/JVI.74.19.9054-9061.2000 . ПМК 102102 . ПМИД 10982350 .
- ^ HSV-1 UL - 6 в NCBI Аминокислотная последовательность