ВП40
| ВП40 | |||
|---|---|---|---|
 Гексамер матричного белка VP40, вирус Эбола | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | ВП40 | ||
| Пфам | PF07447 | ||
| ИнтерПро | ИПР008986 | ||
| ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2 | 1ч2с / СКОПе / СУПФАМ | ||
| |||
В молекулярной биологии VP40 — это название белка вирусного матрикса . Чаще всего он встречается у вируса Эбола (EBOV). [ 1 ] тип несегментированного РНК- вируса с отрицательной цепью . тяжелую и часто смертельную геморрагическую лихорадку Вирус Эбола вызывает у людей , известную как болезнь, вызванная вирусом Эбола . вирусного матрикса Белок VP40 является основным структурным белком, который играет центральную роль в сборке вируса и отпочковании на плазматической мембране инфицированных клеток . VP40 Белки действуют путем ассоциации с клеточными мембранами, взаимодействия с цитоплазматическими хвостами гликопротеинов и связывания с рибонуклеопротеиновым комплексом . [ нужна ссылка ]
Структура
[ редактировать ]VP40 Мономер состоит из двух белковых доменов , N-концевого домена олигомеризации и С-концевого мембраносвязывающего домена, соединенных гибким линкером. И N-, и C-концевые домены складываются в бета-сэндвич -структуры схожей топологии. [ 2 ] Внутри N-концевого домена находятся два перекрывающихся L-домена с последовательностями PTAP и PPEY в остатках с 7 по 13, которые необходимы для эффективного почкования. [ 3 ] Считается, что L-домены опосредуют свою функцию при почковании посредством взаимодействия со специфическими клеточными белками хозяина, такими как TSG101 и vps-4. [ 4 ]
Функция
[ редактировать ]
VP40 координирует многочисленные функции в жизненном цикле вируса Эбола . К ним относятся: регуляция вирусной транскрипции , морфогенез , упаковка и почкование зрелых вирионов. [ 5 ]
VP40 проходит через промежуточные состояния сборки (например, октамеры). Было отмечено, что белки, кодируемые EBOV (VP30, VP35 и VP40), действуют независимо как супрессоры молчания РНК , что указывает на то, что вирус активно сопротивляется клеточным РНКи во время репликации. [ 5 ]
Значение VP40
[ редактировать ]
Исследование матричного белка VP40 важно из-за высокого уровня смертности от вируса Эбола, который внесен в список ВОЗ патогенов группы риска HHS 4, специального агента , NIH / NIAID приоритетного патогена категории A CDC. , агента биотерроризма категории A и биологический агент для экспортного контроля Австралийской группы . [ 5 ]
Экспрессии матриксного белка VP40 достаточно для образования вирусоподобных частиц ( без вирусного генетического материала ) в организме млекопитающего , которые с морфологической точки зрения совершенно неотличимы от живого вируса. [ 5 ]
Вспышка вируса Эбола в Западной Африке
[ редактировать ]Во время и после западноафриканской эпидемии вируса Эбола в 2014–2016 годах искались варианты лечения; среди них был матричный белок VP40 как мишень для возможных исследований, которые могут ( или не могут ) привести к выбору терапевтического варианта. [ 6 ] [ 7 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Дессен, Андреа; Волчков, Виктор; Дольник, Ольга; Кленк, Ханс-Дитер; Вайссенхорн, Винфрид (15 августа 2000 г.). «Кристаллическая структура матричного белка VP40 вируса Эбола» . Журнал ЭМБО . 19 (16): 4228–4236. дои : 10.1093/emboj/19.16.4228 . ISSN 0261-4189 . ПМК 302032 . ПМИД 10944105 .
- ^ Дессен А., Волчков В., Дольник О., Кленк Х.Д., Вейсенхорн В. (август 2000 г.). «Кристаллическая структура матричного белка VP40 вируса Эбола» . ЭМБО Дж . 19 (16): 4228–36. дои : 10.1093/emboj/19.16.4228 . ПМК 302032 . ПМИД 10944105 .
- ^ Тимминс Дж., Шон Г., Рикар-Блюм С., Скианиманико С., Верне Т., Рюигрок Р.В., Вайсенхорн В. (февраль 2003 г.). «Взаимодействие матричного белка VP40 вируса Эбола с клеточными факторами человека Tsg101 и Nedd4». Дж. Мол. Биол . 326 (2): 493–502. дои : 10.1016/S0022-2836(02)01406-7 . ПМИД 12559917 .
- ^ Ликата Дж. М., Симпсон-Холли М., Райт Н. Т., Хан З., Парагас Дж., Харти Р. Н. (февраль 2003 г.). «Перекрывающиеся мотивы (PTAP и PPEY) в белке VP40 вируса Эбола функционируют независимо как домены позднего почкования: участие белков-хозяев TSG101 и VPS-4» . Дж. Вирол . 77 (3): 1812–9. дои : 10.1128/jvi.77.3.1812-1819.2003 . ПМК 140960 . ПМИД 12525615 .
- ^ Перейти обратно: а б с д Сильва Л.П., Ванзиле М., Бавари С., Аман Дж.М., Шример Д.К. (2012). «Сборка матричного белка VP40 вируса Эбола регулируется защелкивающимися свойствами N- и C-концевых хвостов» . ПЛОС ОДИН . 7 (7): e39978. Бибкод : 2012PLoSO...739978S . дои : 10.1371/journal.pone.0039978 . ПМК 3390324 . ПМИД 22792204 .
- ^ Мадара, Джонатан Дж; Хан, Цзыин; Рутель, Гордон; Фридман, Брюс Д; Харти, Рональд Н. (05 февраля 2017 г.). «Многофункциональный матричный белок VP40 вируса Эбола является многообещающей терапевтической мишенью» . Будущая вирусология . 10 (5): 537–546. дои : 10.2217/fvl.15.6 . ISSN 1746-0794 . ПМЦ 4480923 . ПМИД 26120351 .
- ^ Балмит, Марисса; Солиман, Махмуд Э.С. (01 февраля 2017 г.). «VP40 вируса Эбола как мишень для терапии EboV: комплексная конформационная среда и ландшафт связывания ингибиторов на основе ускоренной молекулярной динамики». Клеточная биохимия и биофизика . 75 (1): 65–78. дои : 10.1007/s12013-017-0783-8 . ISSN 1559-0283 . ПМИД 28144904 . S2CID 26535324 . необходима подписка