ВПг

VPg (вирусный белок, связанный с геномом) представляет собой белок, который ковалентно прикреплен к 5'-концу вирусной РНК с положительной цепью и действует как праймер во время синтеза РНК в различных семействах вирусов, включая Picornaviridae , Potyviridae , Astroviridae и Caliciviridae . Есть некоторые исследования, показывающие, что возможный белок VPg также присутствует у астровирусов , однако экспериментальные доказательства этого пока не предоставлены и требуют дальнейшего изучения. ^{[ 1 ]} Праймерная активность VPg возникает, когда белок уридилируется, образуя свободный гидроксил , который может быть расширен с помощью кодируемой вирусом РНК-зависимой РНК-полимеразы . Для некоторых семейств вирусов VPg также играет роль в инициации трансляции, действуя как 5'- кэп мРНК .

VPg был впервые описан при первоначальных исследованиях РНК полиовируса как белок, ковалентно прикрепленный к 5'-концу генома. ^{[ 2 ]}^{[ 3 ]} и позже наблюдался у калицивирусов. ^{[ 4 ]}

Прикрепление во время синтеза РНК

VPg должен подвергнуться посттрансляционному уридилилированию, прежде чем он сможет действовать как праймер для репликации. 3Dpol (RdRp) способен синтезировать Vpg-pUpU-OH, используя последовательность полиА в структуре «стебель-петля» ( цис-действующий элемент репликации ) 2C-АТФазы в качестве матрицы. ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]} Кроме того, 5'-концевой клеверный лист необходим в цис-системе для формирования комплекса преинициации репликации РНК 3Dpol, участвующего в уридилилировании VPg. ^{[ 8 ]}

3CDpro ( протеаза ) отщепляет VPg от мембраносвязанного 3AB.

Функционирует как 5-футовая крышка

Исследования, в которых использовалась протеиназа К для отщепления VPg от вирусного генома, показали, что вирус калицивирусной везикулярной экзантемы, лишенный VPg, больше не заразен. ^{[ 9 ]} тогда как полиовирус сохраняет инфекционность даже при отсутствии ВПг. ^{[ 10 ]} Поскольку VPg расположен на 5'-конце генома, подобно эукариотическим 5'-мРНК , было проведено несколько экспериментов для изучения его функции при трансляции. Полиовирус использует внутренний сайт входа в рибосому (IRES) вместо кэпа для инициации трансляции, что устраняет необходимость использования VPg при начальной инфекции. ^{[ 11 ]} тогда как исследования с калицивирусом кошек подтвердили, что белок VPg напрямую взаимодействует с белком, связывающим кэп рибосомы , eIF4E, и что это взаимодействие важно для трансляции вируса. ^{[ 12 ]}

Источники

Принципы вирусологии С. Дж. Флинта, Л. В. Энквиста, В. Р. Раканьелло, А. М. Скалки ( ISBN 1-55581-259-7 )

^ Гудфеллоу I (ноябрь 2011 г.). «Связанный с геномом белок VPg вирусов позвоночных — многогранный белок» . Курр Опин Вирол . 1 (5): 355–362. дои : 10.1016/j.coviro.2011.09.003 . ПМЦ 3541522 . ПМИД 22440837 .
^ Фланеган Дж. Б., Петтерсон Р. Ф., Амброс В., Хьюлетт М. Дж., Балтимор Д. Ковалентная связь белка с определенной нуклеотидной последовательностью на 5'-конце вириона и репликативных промежуточных РНК полиовируса. Proc Natl Acad Sci U SA. 1977;74:961–965.
^ Ли Ю.Ф., Номото А., Детжен Б.М., Виммер Э. Связанный с геномом белок пикорнавирусов i. Белок, ковалентно связанный с РНК генома полиовируса. Proc Natl Acad Sci, США, 1977; 74: 59–63.
^ Шаффер Ф.Л., Эресманн Д.В., Фрец М.К., Зёргель М.И. Белок vpg, ковалентно связанный с 36s РНК калицивируса. Джей Ген Вирол. 1980;47(1):215–220.
^ Гудфеллоу И., Чаудри Ю., Ричардсон А., Мередит Дж., Алмонд Дж.В., Барклай В., Эванс Д.Дж. Идентификация цис-действующего элемента репликации в кодирующей области полиовируса. Дж Вирол. 2000;74:4590–4600.
^ Пол А.В., Ридер Э., Ким Д.В., ван Бум Дж.Х., Виммер Э. Идентификация шпильки РНК в РНК полиовируса, которая служит первичной матрицей при уридилилировании VPg in vitro. Дж Вирол. 2000;74:10359–10370.
^ Ридер Э., Пол А.В., Ким Д.В., ван Бум Дж.Х., Виммер Э. Генетические и биохимические исследования цис-действующего элемента репликации полиовируса cre в связи с уридилированием VPg. Дж Вирол. 2000;74:10371–10380.
^ Лайонс Т., Мюррей К.Э., Робертс А.В., Бартон DJ. 5'-концевая РНК полиовируса клеверного листа необходима в цис-цис-состоянии для уридилилирования VPg и инициации синтеза РНК с отрицательной цепью. Дж Вирол. 2001;75(22):10696–708.
^ Берроуз Дж. Н., Браун Ф. Наличие ковалентно связанного белка на РНК калицивируса. Джей Ген Вирол. 1978;41(2):443–446.
^ Ван дер Верф С., Брэдли Дж., Виммер Э., Стьюдиер Ф.В., Данн Дж.Дж. Синтез РНК инфекционного полиовируса с помощью очищенной РНК-полимеразы Т7. Proc Natl Acad Sci. 1986;83:2330–2334.
^ Фицджеральд К.Д., Семлер Б.Л. Соединение элементов мрн с эукариотическим аппаратом трансляции. Биохим Биофиз Акта. 2009;1789(9-10):518–528.
^ Гудфеллоу I, Чаудри Ю., Джиолдаси И., Герондопулос А., Натони А., Лабри Л., Лалиберте Дж. Ф., Робертс Л. Инициация трансляции калицивируса требует взаимодействия между vpg и eif 4 e. EMBO Rep. 2005;6(10):968–972.

[1] Гудфеллоу I (ноябрь 2011 г.). «Связанный с геномом белок VPg вирусов позвоночных — многогранный белок» . Курр Опин Вирол . 1 (5): 355–362. дои : 10.1016/j.coviro.2011.09.003 . ПМЦ 3541522 . ПМИД 22440837 .

[Flanegan1977-2] Фланеган Дж. Б., Петтерсон Р. Ф., Амброс В., Хьюлетт М. Дж., Балтимор Д. Ковалентная связь белка с определенной нуклеотидной последовательностью на 5'-конце вириона и репликативных промежуточных РНК полиовируса. Proc Natl Acad Sci U SA. 1977;74:961–965.

[Lee1977-3] Ли Ю.Ф., Номото А., Детжен Б.М., Виммер Э. Связанный с геномом белок пикорнавирусов i. Белок, ковалентно связанный с РНК генома полиовируса. Proc Natl Acad Sci, США, 1977; 74: 59–63.

[Shaffer1980-4] Шаффер Ф.Л., Эресманн Д.В., Фрец М.К., Зёргель М.И. Белок vpg, ковалентно связанный с 36s РНК калицивируса. Джей Ген Вирол. 1980;47(1):215–220.

[Goodfellow2000-5] Гудфеллоу И., Чаудри Ю., Ричардсон А., Мередит Дж., Алмонд Дж.В., Барклай В., Эванс Д.Дж. Идентификация цис-действующего элемента репликации в кодирующей области полиовируса. Дж Вирол. 2000;74:4590–4600.

[Paul2000-6] Пол А.В., Ридер Э., Ким Д.В., ван Бум Дж.Х., Виммер Э. Идентификация шпильки РНК в РНК полиовируса, которая служит первичной матрицей при уридилилировании VPg in vitro. Дж Вирол. 2000;74:10359–10370.

[Rieder2000-7] Ридер Э., Пол А.В., Ким Д.В., ван Бум Дж.Х., Виммер Э. Генетические и биохимические исследования цис-действующего элемента репликации полиовируса cre в связи с уридилированием VPg. Дж Вирол. 2000;74:10371–10380.

[Lyons2001-8] Лайонс Т., Мюррей К.Э., Робертс А.В., Бартон DJ. 5'-концевая РНК полиовируса клеверного листа необходима в цис-цис-состоянии для уридилилирования VPg и инициации синтеза РНК с отрицательной цепью. Дж Вирол. 2001;75(22):10696–708.

[Burroughs1978-9] Берроуз Дж. Н., Браун Ф. Наличие ковалентно связанного белка на РНК калицивируса. Джей Ген Вирол. 1978;41(2):443–446.

[Van_der_Werf1986-10] Ван дер Верф С., Брэдли Дж., Виммер Э., Стьюдиер Ф.В., Данн Дж.Дж. Синтез РНК инфекционного полиовируса с помощью очищенной РНК-полимеразы Т7. Proc Natl Acad Sci. 1986;83:2330–2334.

[Fitzgerald2009-11] Фицджеральд К.Д., Семлер Б.Л. Соединение элементов мрн с эукариотическим аппаратом трансляции. Биохим Биофиз Акта. 2009;1789(9-10):518–528.

[Goodfellow2005-12] Гудфеллоу I, Чаудри Ю., Джиолдаси И., Герондопулос А., Натони А., Лабри Л., Лалиберте Дж. Ф., Робертс Л. Инициация трансляции калицивируса требует взаимодействия между vpg и eif 4 e. EMBO Rep. 2005;6(10):968–972.

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]