Потивирусиды

Потивирусиды
	Геном вируса оспы сливы рода Potyvirus с трансмиссионной электронной микрофотографией и моделью вирионов
Классификация вирусов
(без рейтинга):	Вирус
Область :	Рибовирия
Королевство:	Орторнавиры
Тип:	Писувирикота
Сорт:	Стелпавирицеты
Заказ:	Пататавиралес
Семья:	Потивирусиды
Роды
	см. текст

Potyviridae — семейство РНК-вирусов с положительной цепью , которое включает более 30% известных вирусов растений . ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]} многие из которых имеют большое сельскохозяйственное значение. В семействе 12 родов и 235 видов, три из которых не отнесены к роду. ^{[ 3 ]}^{[ 4 ]}^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Структура

Геномная карта типичного представителя рода Potyvirus .

Потивиридные вирионы представляют собой безоболочечные гибкие нитевидные палочковидные частицы. Диаметр составляет около 11–20 нм, длина 650–950 нм. ^{[ 4 ]}^{[ 5 ]}

Геном

Геномы линейные и обычно несегментированные, длиной около 8–12 КБ. ^{[ 4 ]}^{[ 5 ]} Состоит из РНК с положительным смыслом, окруженной белковой оболочкой, состоящей из одного белка, кодируемого вирусом, называемого капсидом . Все они вызывают образование вирусных включений, называемых цилиндрическими включениями («вертушками»), в своих хозяевах. Они состоят из одного белка (около 70 кДа ), образующегося в организме хозяина из одного продукта вирусного генома. ^{[ нужна ссылка ]}

Вирусы-члены кодируют большие полипептиды, которые расщепляются до зрелых белков . В 5'-3'-порядке эти белки

P1 ( сериновая протеаза ): 83 кДа.
HC (протеаза): 51 кДа
P3: 34 кДа
6К1: 5 кДа
Cl ( геликаза ): 71 кДа
6К2: 6 кДа
VPg (5'-связывающий белок): 20 кДа.
NIa-Pro (протеаза): 27 кДа.
NIb ( РНК-зависимая РНК-полимераза ): 57 кДа
Капсидный белок: 34 кДа

В зависимости от рода и вида могут быть некоторые различия в количестве белков. ^{[ 7 ]} Например, у некоторых родов отсутствует P1, у некоторых вирусов рода Ipomovirus отсутствует HC и имеется тандем P1. Довольно интересная ORF потивируса сладкого картофеля (PISPO), алкилирование B (AlkB) и инозинтрифосфатпирофосфатаза (известная как ITPase или HAM1) представляют собой белковые домены, идентифицированные у атипичных членов. ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}

Жизненный цикл

Репликация и перемещение вируса мозаики сои (ВМВ)

Репликация вируса цитоплазматическая. Проникновение в клетку-хозяина достигается путем проникновения. Репликация соответствует модели репликации вируса с положительной цепью РНК. Транскрипция вируса с положительной цепью РНК - это метод транскрипции. Трансляция происходит путем -1 сдвига рамки рибосомы. Вирус покидает клетку-хозяина путем перемещения вируса по канальцам. ^{[ 4 ]}^{[ 5 ]} Растения служат естественным хозяином. Вирус передается через переносчика (часто насекомое или клещ). Пути передачи – векторные и механические. ^{[ 4 ]}^{[ 5 ]}

Передача инфекции

Potyvirus — самый крупный род семейства, насчитывает 183 известных вида. ^{[ 9 ]} Эти вирусы имеют длину 720–850 нм и передаются тлей . Они также могут легко передаваться механическим путем. Эти вирусы имели общее происхождение 6600 лет назад. ^{[ 10 ]} и передаются более чем 200 видами тли. ^{[ нужна ссылка ]}

Виды рода Macluravirus имеют длину 650–675 нм и также передаются тлей. Вирусы растений рода Ipomovirus передаются белокрылками и имеют длину 750–950 нм. Вирусы тритимовируса и римовируса имеют длину 680–750 нм и передаются эриофидидными клещами . (Римовирусы тесно связаны с потивирусами и могут в конечном итоге слиться с потивирусами. ^{[ 11 ]}) Геном бимовируса и эти вирусы передаются хитридийным грибом состоит из двух частиц вместо одной (275 и 550 нм) , Polymyxa graminis . ^{[ нужна ссылка ]}

Таксономия

Филогенетическое древо семейства *Potyviridae.*

Выделяют следующие роды: ^{[ 6 ]}

Следующие виды не отнесены к роду: ^{[ 6 ]}

Ссылки

^ Рихманн, Дж.Л.; Лейн, С; Гарсия, Дж.А. (1992). «Основные положения и перспективы молекулярной биологии потивирусов» . Джей Ген Вирол . 73 : 1–16. дои : 10.1099/0022-1317-73-1-1 . ПМИД 1730931 .
^ Бергер PH и др. (2005) в «Таксономии вирусов: Восьмой отчет Международного комитета по таксономии вирусов», ред. Фоке К.М., Мэйо М.А., Манилофф Дж., Дессельбергер У., Болл Л.А. (Elsevier Academic, Сан-Диего), стр. 819–841.
^ Уайли, С.Дж.; Адамс, М; Чалам, К; Кройце, Дж; Лопес-Мойя, Джей-Джей; Осима, К; Правин, С; Рабенштейн, Ф; Стенджер, Д; Ван, А; Зербини, FM; Консорциум отчетов ICTV (март 2017 г.). «Профиль таксономии вирусов ICTV: Potyviridae» . Журнал общей вирусологии . 98 (3): 352–354. дои : 10.1099/jgv.0.000740 . ПМК 5797945 . ПМИД 28366187 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и "Potyviridae" . ICTV Online (10th) Report .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и «Вирусная зона» . ЭксПАСи . Проверено 15 июня 2015 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с «Таксономия вирусов: выпуск 2020 г.» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Март 2021 года . Проверено 21 мая 2021 г.
^ Jump up to: ^а ^б Пасин, Фабио; Дарос, Хосе-Антонио; Цанетакис, Иоаннис Э (2022). «Расширение протеома в эволюционной радиации Potyviridae» . Обзоры микробиологии FEMS . 46 (4): fuac011. дои : 10.1093/femsre/fuac011 . ISSN 1574-6976 . ПМЦ 9249622 . ПМИД 35195244 .
^ Юэ, Цзяньин; Вэй, Яо; Сунь, Чжэньци; Чен, Яхан; Вэй, Сюэфэн; Ван, Хайцзюань; Пасин, Фабио; Чжао, Минмин (октябрь 2022 г.). «Гомологи деметилазы РНК AlkB и N6-метиладенозин участвуют в потивирусной инфекции» . Молекулярная патология растений . 23 (10): 1555–1564. дои : 10.1111/mpp.13239 . ISSN 1364-3703 . ПМЦ 9452765 . ПМИД 35700092 .
^ Описание вирусов растений: семейство Potyviridae.
^ Нигам Д., ЛаТурретт К., Соуза ПФН, Гарсия-Руис Х (2019)Общегеномные вариации потивирусов. Переднее растение Sci 10:1439
^ Описание вирусов растений: семейства Potyviridae. рисунок

Внешние ссылки

[1] Рихманн, Дж.Л.; Лейн, С; Гарсия, Дж.А. (1992). «Основные положения и перспективы молекулярной биологии потивирусов» . Джей Ген Вирол . 73 : 1–16. дои : 10.1099/0022-1317-73-1-1 . ПМИД 1730931 .

[2] Бергер PH и др. (2005) в «Таксономии вирусов: Восьмой отчет Международного комитета по таксономии вирусов», ред. Фоке К.М., Мэйо М.А., Манилофф Дж., Дессельбергер У., Болл Л.А. (Elsevier Academic, Сан-Диего), стр. 819–841.

[ICTVProfile-3] Уайли, С.Дж.; Адамс, М; Чалам, К; Кройце, Дж; Лопес-Мойя, Джей-Джей; Осима, К; Правин, С; Рабенштейн, Ф; Стенджер, Д; Ван, А; Зербини, FM; Консорциум отчетов ICTV (март 2017 г.). «Профиль таксономии вирусов ICTV: Potyviridae» . Журнал общей вирусологии . 98 (3): 352–354. дои : 10.1099/jgv.0.000740 . ПМК 5797945 . ПМИД 28366187 .

[ICTVReport-4] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и "Potyviridae" . ICTV Online (10th) Report .

[ViralZone-5] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и «Вирусная зона» . ЭксПАСи . Проверено 15 июня 2015 г.

[ictv-6] Jump up to: ^а ^б ^с «Таксономия вирусов: выпуск 2020 г.» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Март 2021 года . Проверено 21 мая 2021 г.

[:0-7] Jump up to: ^а ^б Пасин, Фабио; Дарос, Хосе-Антонио; Цанетакис, Иоаннис Э (2022). «Расширение протеома в эволюционной радиации Potyviridae» . Обзоры микробиологии FEMS . 46 (4): fuac011. дои : 10.1093/femsre/fuac011 . ISSN 1574-6976 . ПМЦ 9249622 . ПМИД 35195244 .

[8] Юэ, Цзяньин; Вэй, Яо; Сунь, Чжэньци; Чен, Яхан; Вэй, Сюэфэн; Ван, Хайцзюань; Пасин, Фабио; Чжао, Минмин (октябрь 2022 г.). «Гомологи деметилазы РНК AlkB и N6-метиладенозин участвуют в потивирусной инфекции» . Молекулярная патология растений . 23 (10): 1555–1564. дои : 10.1111/mpp.13239 . ISSN 1364-3703 . ПМЦ 9452765 . ПМИД 35700092 .

[9] Описание вирусов растений: семейство Potyviridae.

[Nigam2019-10] Нигам Д., ЛаТурретт К., Соуза ПФН, Гарсия-Руис Х (2019)Общегеномные вариации потивирусов. Переднее растение Sci 10:1439

[11] Описание вирусов растений: семейства Potyviridae. рисунок

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]