Мононегавирусы
| Мононегавирусы | |
|---|---|
| |
| Вирион вируса везикулярного стоматита (ВВС) и Mononegavirales геномы | |
Классификация вирусов 
| |
| (без рейтинга): | Вирус |
| Область : | Рибовирия |
| Королевство: | Орторнавиры |
| Тип: | Негарнавирикота |
| Сорт: | Монхивирицетес |
| Заказ: | Мононегавирусы |
| Семьи | |
Mononegavirales — это отряд РНК-вирусов с отрицательной цепью , которые имеют несегментированный геном. Некоторые члены, вызывающие заболевания человека в этом порядке, включают вирус Эбола , респираторно-синцитиальный вирус человека , вирус кори , вирус эпидемического паротита , вирус Нипах и вирус бешенства . важные патогены животных и растений, В эту группу также входят не относящихся к человеку. В отряд входят одиннадцать вирусов семейств : Artoviridae , Bornaviridae , Filoviridae , Lispiviridae , Mymonaviridae , Nyamiviridae , Paramyxoviridae , Pneumoviridae , Rhabdoviridae , Sunviridae и Xinmoviridae . [ 1 ]
Использование термина
[ редактировать ]Отряд Mononegavirales (произносится: / ˌ m ɒ ə n ˌ n ε ɡ ə v i ˈ r ɑː l ɪ z / MON -ə- NEG -ə -vee- RAH -liz ) [ примечание 1 ] [ 2 ] [ 3 ] вирусологический таксон, созданный в 1991 г. [ 4 ] [ 5 ] с поправками, внесенными в 1995 г., [ 6 ] 1997, [ 7 ] 2000, [ 8 ] 2005, [ 9 ] 2011, [ 2 ] 2016, [ 10 ] 2017, [ 11 ] и 2018. [ 1 ] Название Mononegavirales происходит от древнегреческого прилагательного μóνος monos (имеется в виду однодольные и одноцепочечные геномы большинства мононегавирусов), латинского глагола negare (имеется в виду отрицательная полярность этих геномов) и таксономического суффикса -virales (обозначающего вирусный заказ). [ 3 ]
Критерии включения заказа
[ редактировать ]
Вирус относится к отряду Mononegavirales, если [ 2 ] [ 3 ]
- его геном представляет собой линейную, обычно (но не всегда) несегментированную одноцепочечную неинфекционную РНК отрицательной полярности; имеет инверсно-комплементарные 3'- и 5'-концы; и не связан ковалентно с белком ;
- его геном имеет характерный генов порядок 3'-UTR – гены основных белков – гены белков оболочки – ген РНК-зависимой РНК-полимеразы – 5'-UTR (3'-NPMGL-5') (есть, однако, некоторые исключения);
- он производит 5–10 различных мРНК из своего генома посредством полярной последовательной транскрипции с одного промотора, расположенного на 3'-конце генома; мРНК кэпированы с 5'-конца и полиаденилированы ;
- он реплицируется путем синтеза полных антигеномов;
- он образует инфекционные спиральные рибонуклеокапсиды как матрицы для синтеза мРНК, антигеномов и геномов;
- он кодирует РНК-зависимую РНК-полимеразу (RdRp, L), которая в высокой степени гомологична таковым других мононегавирусов; и/или
- обычно (но не всегда) он производит оболочечные вирионы с молекулярной массой 300–1000 × 10. 6 ; S ; 20 Вт 550–>1045 и плавучая плотность в CsCl 1,18–1,22 г/см. 3 .
Жизненный цикл
[ редактировать ]
мононегавируса Жизненный цикл на клеточной поверхности начинается с прикрепления вириона к специфическим рецепторам , за которым следует слияние вируса оболочки вириона с клеточными мембранами и сопутствующее высвобождение нуклеокапсида в цитозоль . RdRp частично снимает оболочку нуклеокапсида и транскрибирует гены Вирус с положительной цепью в мРНК , которые затем транслируются в структурные и неструктурные белки. [ 9 ]
RdRps мононегавируса связывается с единственным промотором, расположенным на 3'-конце генома. Транскрипция либо заканчивается после гена, либо продолжается до следующего гена. Это означает, что гены, расположенные вблизи 3'-конца генома, транскрибируются в наибольшем количестве, тогда как гены, расположенные ближе к 5'-концу, транскрибируются с наименьшей вероятностью. Таким образом, порядок генов является простой, но эффективной формой регуляции транскрипции. Наиболее распространенным белком является нуклеопротеин , концентрация которого в клетке определяет, когда RdRp переключается с транскрипции гена на репликацию генома. [ 9 ]
Репликация приводит к образованию полноразмерных антигеномов с положительной цепью, которые, в свою очередь, транскрибируются в копии генома потомства вируса с отрицательной цепью. Вновь синтезированные структурные белки и геномы самособираются и накапливаются внутри клеточной мембраны . Вирионы отпочковываются от клетки, получая свои оболочки из клеточной мембраны, из которой они отпочковываются. Зрелые частицы потомства затем заражают другие клетки, чтобы повторить цикл. [ 9 ]
Палеовирусология
[ редактировать ]Мононегавирусы имеют историю, насчитывающую несколько десятков миллионов лет. « Окаменелости » мононегавируса были обнаружены в виде генов или фрагментов генов мононегавируса, интегрированных в геномы млекопитающих . Например, «ископаемые» гены борнавируса были обнаружены в геномах летучих мышей , рыб , даманов , сумчатых , приматов , грызунов , жвачных животных и слонов . [ 12 ] [ 13 ] [ 14 ] [ 15 ] [ 16 ] «Окаменелости» гена филовируса были обнаружены в геномах летучих мышей, грызунов, землероек , тенреков и сумчатых . [ 13 ] [ 14 ] [ 17 ] [ 18 ] В геноме рыбок данио был обнаружен «ископаемый» вирус Мидуэй . [ 13 ] Наконец, «окаменелости» рабдовируса были обнаружены в геномах ракообразных , комаров , клещей и растений . [ 19 ] [ 14 ] [ 20 ] [ 21 ]
Таксономия
[ редактировать ]
Отряд насчитывает одиннадцать семейств, включающих многочисленные роды, состоящие из множества различных видов: [ нужна ссылка ]
Таблица порядка с указанием всех семейств, родов, видов и их вирусов: [ 1 ]
| Семья | Род | Разновидность | Вирус (аббревиатура) |
Условные обозначения таблицы: «*» обозначает типовой вид.
Примечания
[ редактировать ]- ^ Согласно правилам наименования таксонов, установленным Международным комитетом по таксономии вирусов (ICTV) , название Mononegavirales всегда следует писать с заглавной буквы, курсивом и никогда не сокращать. Названия физических членов отряда («мононегавирусы» или «мононегавирады») пишутся строчными буквами, не выделяются курсивом и используются без артиклей.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б с Амарасингхе Г.К., Аречига Себальос Н.Г., Баньярд А.С., Баслер К.Ф., Бавари С., Беннетт А.Дж. и др. (апрель 2018 г.). обновление» «Таксономия отряда Mononegavirals : . Архивы вирусологии 163 (8): 2283–2294. дои : 10.1007/s00705-018-3814-x . ПМК 6076851 . ПМИД 29637429 .
- ^ Перейти обратно: а б с Истон А., Прингл CR (2011). «Отряд Mononegavirales». В книге King AM, Adams MJ, Carstens EB, Lefkowitz EJ (ред.). Таксономия вирусов — Девятый отчет Международного комитета по таксономии вирусов . Лондон, Великобритания: Elsevier/Academic Press. стр. 653–657 . ISBN 978-0-12-384684-6 .
- ^ Перейти обратно: а б с Кун Дж.Х., Беккер С., Эбихара Х., Гейсберт Т.В., Джонсон К.М., Каваока Ю. и др. (декабрь 2010 г.). «Предложение по пересмотренной таксономии семейства Filoviridae: классификация, названия таксонов и вирусов, а также вирусные сокращения» . Архив вирусологии . 155 (12): 2083–103. дои : 10.1007/s00705-010-0814-x . ПМК 3074192 . ПМИД 21046175 .
- ^ Прингл CR (1991). «Отряд Mononegavirales» . Архив вирусологии . 117 (1–2): 137–40. дои : 10.1007/BF01310499 . ПМИД 2006902 . S2CID 312908 .
- ^ Прингл CR (1991). «Отряд Mononegavirales». Франки Р.И., Фоке С.М., Кнудсон Д.К., Браун Ф. (ред.). Классификация и номенклатура вирусов – пятый доклад Международного комитета по таксономии вирусов. Дополнение к Архиву вирусологии, том. 2 . Вена, Австрия: Шпрингер. стр. 239–41. ISBN 978-0-387-82286-0 .
- ^ Епископ Д.Х., Прингл CR (1995). «Отряд Mononegavirales». Мерфи Ф.А., Фоке К.М., Бишоп Д.Х., Габриал С.А., Джарвис А.В., Мартелли Г.П., Мэйо М.А., Саммерс Д.М. (ред.). Таксономия вирусов — шестой отчет Международного комитета по таксономии вирусов. Дополнение к архиву вирусологии . Том. 10. Вена, Австрия: Шпрингер. стр. 265–267. ISBN 978-3-211-82594-5 .
- ^ Прингл CR (1997). «Отряд Mononegavirales - текущий статус». Архив вирусологии . 142 (11): 2321–6. ПМИД 9672597 .
- ^ Прингл CR (2000). «Отряд Mononegavirales». Ван Регенмортель М.К., Фоке К.М., Бишоп Д.Х., Карстенс Э.Б., Эстес М.К., Лемон С.М., Манилофф Дж., Мэйо М.А., МакГеоч Д.Д., Прингл С.Р., Викнер Р.Б. (ред.). Таксономия вирусов — Седьмой доклад Международного комитета по таксономии вирусов . Сан-Диего, США: Academic Press. стр. 525–530. ISBN 978-0-12-370200-5 .
- ^ Перейти обратно: а б с д Прингл CR (2005). «Отряд Mononegavirales». В Fauquet CM, Mayo M, Maniloff J, Desselberger U, Ball LA (ред.). Таксономия вирусов — Восьмой доклад Международного комитета по таксономии вирусов . Сан-Диего, США: Elsevier/Academic Press. стр. 609–614. ISBN 978-0-12-370200-5 .
- ^ Афонсо К.Л., Амарасингхе Г.К., Баньяи К., Бао Ю., Баслер К.Ф., Бавари С. и др. (август 2016 г.). обновление» «Таксономия отряда Mononegavirals : . Архивы вирусологии 161 (8): 2351–60. дои : 10.1007/ s00705-016-2880-1 ПМЦ 4947412 . ПМИД 27216929 .
- ^ Амарасингхе Г.К., Бао И., Баслер К.Ф., Бавари С., Бир М., Беджерман Н. и др. (август 2017 г.). обновление» «Таксономия отряда Mononegavirals : . Архивы вирусологии 162 (8): 2493–2504. дои : 10.1007/s00705-017-3311-7 . ПМК 5831667 . ПМИД 28389807 .
- ^ Хори М., Хонда Т., Сузуки Ю., Кобаяши Ю., Дайто Т., Осида Т. и др. (январь 2010 г.). «Эндогенные неретровирусные РНК-вирусные элементы в геномах млекопитающих» . Природа . 463 (7277): 84–7. Бибкод : 2010Natur.463...84H . дои : 10.1038/nature08695 . ПМЦ 2818285 . ПМИД 20054395 .
- ^ Перейти обратно: а б с Белый В.А., Левин А.Дж., Скалка А.М. (июль 2010 г.). Бухмайер М.Дж. (ред.). «Неожиданное наследование: множественные интеграции древних последовательностей борнавируса и эболавируса/марбургвируса в геномах позвоночных» . ПЛОС Патогены . 6 (7): e1001030. дои : 10.1371/journal.ppat.1001030 . ПМК 2912400 . ПМИД 20686665 .
- ^ Перейти обратно: а б с Кацуракис А., Гиффорд Р.Дж. (ноябрь 2010 г.). Малик Х.С. (ред.). «Эндогенные вирусные элементы в геномах животных» . ПЛОС Генетика . 6 (11): e1001191. дои : 10.1371/journal.pgen.1001191 . ПМЦ 2987831 . ПМИД 21124940 .
- ^ Цуй Дж, Ван Л.Ф. (ноябрь 2015 г.). «Геномный анализ раскрывает глубокие эволюционные связи между борнавирусами и летучими мышами» . Вирусы . 7 (11): 5792–800. дои : 10.3390/v7112906 . ПМЦ 4664979 . ПМИД 26569285 .
- ^ Хори М., Томонага К. (апрель 2018 г.). «Палеовирусология борнавирусов: что можно узнать из молекулярных окаменелостей борнавирусов». Вирусные исследования . 262 : 2–9. doi : 10.1016/j.virusres.2018.04.006 . ПМИД 29630909 . S2CID 4776419 .
- ^ Тейлор DJ, Лич Р.В., Брюэнн Дж. (июнь 2010 г.). «Филовирусы древние и интегрированы в геномы млекопитающих» . Эволюционная биология BMC . 10 (1): 193. Бибкод : 2010BMCEE..10..193T . дои : 10.1186/1471-2148-10-193 . ПМК 2906475 . ПМИД 20569424 .
- ^ Тейлор DJ, Диттмар К., Баллинджер М.Дж., Брюэнн Дж.А. (ноябрь 2011 г.). «Эволюционное поддержание филовирусоподобных генов в геномах летучих мышей» . Эволюционная биология BMC . 11 (1): 336. Бибкод : 2011BMCEE..11..336T . дои : 10.1186/1471-2148-11-336 . ПМЦ 3229293 . ПМИД 22093762 .
- ^ Метенье Г., Беккинг Т., Шебби М.А., Жиро И., Мумен Б., Шаак С. и др. (2015). «Сравнительный палеовирусологический анализ ракообразных позволяет выявить многочисленные широко распространенные вирусные группы» . Мобильная ДНК . 6:16 . дои : 10.1186/s13100-015-0047-3 . ПМЦ 4573495 . ПМИД 26388953 .
- ^ Чиба С., Кондо Х., Тани А., Сайшо Д., Сакамото В., Канемацу С. и др. (июль 2011 г.). Надь П.Д. (ред.). «Широко распространенная эндогенизация последовательностей генома неретровирусных РНК-вирусов в геномы растений» . ПЛОС Патогены . 7 (7): e1002146. дои : 10.1371/journal.ppat.1002146 . ПМК 3136472 . ПМИД 21779172 .
- ^ Форт П., Альбертини А., Ван-Хуа А., Бертомье А., Рош С., Дельсук Ф. и др. (январь 2012 г.). «Ископаемые последовательности рабдовируса, интегрированные в геномы членистоногих: онтогенез, эволюция и потенциальная функциональность» (PDF) . Молекулярная биология и эволюция . 29 (1): 381–90. дои : 10.1093/molbev/msr226 . ПМИД 21917725 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]| Базы данных органов управления : Национальные |
|---|
