Снейкхед Рабдовирус
| Снейкхед Новирхабдовирус | |
|---|---|
Классификация вирусов 
| |
| (не вмешательство): | Вирус |
| Область : | Рибовирия |
| Королевство: | Orthornavirae |
| Филум: | Денавирикота |
| Сорт: | Monjiviricetes |
| Заказ: | Mononegavirales |
| Семья: | Rhabdoviridae |
| Род: | Новирхабдовирус |
| Разновидность: | Снейкхед Новирхабдовирус
|
Snakehead Rhabdovirus (SHRV) - новирхабдовирус [ 1 ] Это поражает теплую воду дикую и культурированную по прудам рыбу различных видов в Юго-Восточной Азии , включая змеиную головку , для которой она названа. [ 2 ]
Изоляция
[ редактировать ]Исследования были проведены в 1970 -х и 1980 -х годах для поиска инфекционных агентов, которые вызывают или способствуют тяжелым язвенным заболеваниям, известным как язвенное синдром эпизоотии (EUS), что вызывает высокую смертность среди разнообразных видов рыб в Азии и Тихоокеанском регионе . [ 3 ] SNRV был выделен вирологом В. Ваттанавиджарном из змеиного голова, Чанна Стриата (ранее Ophicepahalus striatus ), вида рыб змеи , который демонстрировал признаки язвенного синдрома эпизоота после вспышки этого синдрома в Таиланде . [ 3 ] Новый вирусный изолят был идентифицирован как рабдовирус на основе изображений и измерений, проведенных с помощью просвечивающей электронной микроскопии и результатов биохимических испытаний. [ 3 ] Plaque neutralization tests and immunofluorescence tests demonstrated that the new isolate was serologically unrelated to several other fish rhabdoviruses, including anquilla rhabdovirus (EVX), infectious hematopoietic necrosis virus (IHNV), pike fry rhabdovirus (PFRV), spring viremia of carp virus (SVCV) и вирусная геморрагическая сепсис вирус (VHSV). [ 3 ] Последующие исследования инфекции, разоблачающие здоровые змеиные головы от восприимчивой популяции к SHNV, не разрабатывали клинические признаки, связанные с EUS, что позволяет предположить, что SHRV не играет значительной роли в EUS. [ 4 ]
Таксономия
[ редактировать ]Он классифицируется как новирхабдовирус, потому что он обладает невирным геном (NV), который является отличительной особенностью этого рода. [ 5 ] Ген NV расположен между гликопротеином (G) и генами полимеразы (L), [ 6 ] и содержит одну открытую рамку считывания (ORF), которая составляет 335 нуклеотидов в длину. [ 5 ] нет соответствующего белка Он называется «невирным» геном, потому что в вирионе . [ 2 ] Хотя гены NV новирхабдовирусов имеют одинаковое размеры, в том числе приблизительно 110-122 кодонов последовательности . небольшая гомология , очевидно [ 2 ]
Было обнаружено, что кодирующие последовательности генов гликопротеина (G) аналогичны трем другим в настоящее время классифицированным в настоящее время новирхабдовирусами, VHSV, IHNV и Hirame Rhabdovirus (Hirrv), с идентичностью от 36% до 47% аминокислотной кислоты. [ 7 ]
Структура
[ редактировать ]SHRV представляет собой охваченный пулей-формованным вирусом РНК, размером примерно 170 нм x 60 нм с электронным плотным нуклеокапсидом. [ 3 ]
Геном
[ редактировать ]SHRV Геном представляет собой не сегментированный, негативное геном РНК, приблизительно 11 550 нуклеотидов , длиной [ 2 ] С шестью ORF, включая ген матрикса (M), ген невирного (NV), ген нуклеопротеина (N), ген фосфопротеина (P), ген полимеразы (большой белок, L) и ген вирусного гликопротеина (G ), организовано в следующем порядке: 3'-NPMG-NV-L-5 '. [ 6 ]
Репликация
[ редактировать ]Вирусная репликация происходит как при 15 ° C, так и при 28 ° C в клеточной линии, полученной из змеиной головки и карпа , [ 3 ] Хотя оптимальный диапазон температуры для репликации вируса составляет от 28 ° C до 31 ° C. [ 2 ]
Стабильность
[ редактировать ]Было продемонстрировано, что SHRV становится инактивированным после обработки кислотой (pH = 3), хлороформ (50%) и тепло (56 ° C). [ 3 ] SHRV в дистиллированной воде может быть полностью инактивирован менее чем за пять минут воздействия хлора 12,5 ч / млн , йода 50 ч / млн или разведением дезинфицирующего средства пероксидона 1: 2000 . [ 8 ]
Воздействие инфекционных вирионов в материале культивирования клеток до 2% формалина снизило инфекционность на 99,9% через 5 минут и полностью через 30 минут. [ 8 ] Тем не менее, воздействие на материал инфекционного культивирования клеток до 0,025% формалина в течение 60 минут вызывал лишь незначительное снижение инфекционности, [ 8 ] и было необходимо более 50 ч / млн хлор, чтобы инактивировать вирус [ 8 ] Также в клеточных жидкостях, воздействие йода 500 ч / млн в течение 30 минут не снижало инфекционность. [ 8 ] Вирус не теряет инфекционность при воздействии в клеточных культуральных жидкостях для малахитового зеленого в течение 6 часов при 5 ч / млн. [ 8 ]
Экспериментальные инфекции
[ редактировать ]Змеиные инфекции
[ редактировать ]Исследования инфекции с SHNV не вызывали заболевания у поднятых здоровых змеиных головных голов. [ 4 ]
Инфекции рыбок данио
[ редактировать ]Первые экспериментальные инфекции, проведенные с SHRV у рыбок данио, что ген NV не играл важной роли в патогенезе инфекции показали , . [ 5 ] Последующие экспериментальные инфекции подвергали эмбрионов рыбок данио, несовершеннолетних и взрослых для погружения и/или внутрибрюшинной (IP) инъекции . [ 9 ] Принимая во внимание, что эмбрионы и личинки были подвержены инфекции погружением, взрослые рыбок данио были только восприимчивы к инфекции инъекцией IP. [ 9 ] Гистопатология инфицированных эмбрионов и ювенильных рыб выявила накопление сосудистых моноцитов , накопление клеточного мусора в газовом пузыре , некроз гепатоцитов и некроз эпителиальных клеток глотки. [ 9 ] Экспрессия гена гена (MX) индуцировала SHRV ( IFN) и ортомиксовирус -резистентность (MX) у рыбок данио на уровнях, зависящих от пути инокуляции и возраста рыбы. [ 9 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Rhabdoviridae ICTVDB Индекс вирусов, версия 28, июнь 2002 г. Получено в 2007-07-15.
- ^ Jump up to: а беременный в дюймовый и Джонсон М.К., Саймон Б.Е., Ким Ч., Леонг Дж.А. (март 2000 г.). «Производство рекомбинантного рабдовируса змей: белок NV не требуется для репликации вируса» . J. Virol . 74 (5): 2343–50. doi : 10.1128/JVI.74.5.2343-2350.2000 . PMC 111716 . PMID 10666265 .
- ^ Jump up to: а беременный в дюймовый и фон глин Ахне, w; Йоргенсен, Пев; Олесен, Нью -Джерси; Wattanavijarn (1988). «Серологическое исследование рабдовируса, выделенного из змеиного голова ( стриат Ophicepahlus ) в Таиланде с язвенным синдромом» . Журнал прикладной ихтиологии . 4 (4): 194–196. Bibcode : 1988, Japic ... 4..194a . doi : 10.1111/j.1439-0426.1988.tb00562.x .
- ^ Jump up to: а беременный Frerichs, GN; Миллар, SD; Чинабут, S (1993). «Клинический ответ змеиных головок ( стриатус Ophicephalus ) на экспериментальную инфекцию рабдовирусом рыб змеи и линии клеток змеиной головки». Аквакультура . 116 (4): 297–301. doi : 10.1016/0044-8486 (93) 90414-t .
- ^ Jump up to: а беременный в Алонсо, м; Ким, г; Джонсон, MC; Прессли, м; Леонг, Дж. (2004). «Ген NV рабдовируса змей (SHRV) не требуется для патогенеза, а гетерологичный гликопротеин может быть включен в оболочку SHRV» . Журнал вирусологии . 78 (11): 5875–5882. doi : 10.1128/JVI.78.11.5875-5882.2004 . PMC 415808 . PMID 15140985 .
- ^ Jump up to: а беременный Курат, г; Ахерн, кг; Пирсон, GD; Jeong, JC (1985). «Молекулярное клонирование шести видов мРНК вируса инфекционного гематопоэтического некроза, рыб-рабдовируса и определения генов с помощью картирования R-петли» . Журнал вирусологии . 53 (2): 469–476. doi : 10.1128/jvi.53.2.469-476.1985 . PMC 254659 . PMID 3838192 .
- ^ Джонсон MC, Maxwell JM, Loh PC, Leong Ja (ноябрь 1999). «Молекулярная характеристика гликопротеинов из двух рабдовирусов теплой воды: рабдовирус змеи (SHRV) и рабдовирус креветок пенеид (RPS)/пружина виремии вируса карпа (SVCV)». Вирус Res . 64 (2): 95–106. doi : 10.1016/s0168-1702 (99) 00071-4 . PMID 10518707 .
- ^ Jump up to: а беременный в дюймовый и фон Frerichs, GN (1990). «Эффективность химических дезинфицирующих средств против рабдовируса змеина» . Журнал прикладной ихтиологии . 6 (2): 117–123. Bibcode : 1990japic ... 6..117f . doi : 10.1111/j.1439-0426.1990.tb00509.x .
- ^ Jump up to: а беременный в дюймовый Фелан, PE; Прессли, я; Witten, PE; Меллон, MT; Блейк, S; Ким, Ч. (2005). «Характеристика змеиной рабдовирусной инфекции у рыбок данио ( Danio Rerio ))» . Журнал вирусологии . 79 (3): 1842–1852. doi : 10.1128/JVI.79.3.1842-1852.2005 . PMC 544118 . PMID 15650208 .