Эболавирус Бундибугио
Эболавирус Бундибугио | |
---|---|
Классификация вирусов | |
(без рейтинга): | Вирус |
Область : | Рибовирия |
Королевство: | Орторнавиры |
Тип: | Негарнавирикота |
Сорт: | Монхивирицетес |
Заказ: | Мононегавирусы |
Семья: | Филовириды |
Род: | Эболавирус |
Разновидность: | Эболавирус Бундибугио
|
Членский вирус | |
Вирус Бундибугио (BDBV) |
Вид Bundibugyo ( / ˌ b ʊ n d i ˈ b ʊ dʒɔː ) / BUUN -dee- BUUJ -aw эболавируса [ 1 ] является таксономическим домом для одного вируса, вируса Бундибугио (BDBV), который образует нитевидные вирионы и тесно связан с печально известным вирусом Эбола (EBOV). Вирус вызывает тяжелое заболевание у человека в виде вирусной геморрагической лихорадки и является селективным агентом . [ 2 ] Всемирной организации здравоохранения Возбудитель группы риска 4 (требуется сдерживание, эквивалентное уровню биобезопасности 4 ), [ 3 ] Национальные институты здравоохранения / Национальный институт аллергии и инфекционных заболеваний, приоритетный возбудитель категории А, [ 4 ] Центры по контролю и профилактике заболеваний Агент биотерроризма категории А , [ 5 ] и внесен в список биологических агентов экспортного контроля Австралийской группы . [ 6 ]
Использование термина
[ редактировать ]Вид Bundibugyo ebolavirus представляет собой вирусологический таксон (то есть искусственную концепцию), который в 2008 году было предложено включить в род Ebolavirus , семейство Filoviridae , отряд Mononegavirales . [ 7 ] У этого вида есть единственный вирус - вирус Бундибугио (BDBV). [ 1 ] Представители этого вида называются эболавирусами Бундибугио. [ 1 ] Название «Эболавирус Бундибугио» происходит от слова «Бундибугё» (название главного города угандийского округа Бундибугио , где вирус Бундибугио был впервые обнаружен) и таксономического суффикса «эболавирус» (который обозначает вид эболавируса). [ 1 ]
Вирус Бундибугио (сокращенно BDBV) был впервые описан в 2008 году как единственный представитель предложенного нового вида Bundibugyo ebolavirus , который предлагалось включить в род Ebolavirus , семейство Filoviridae , порядок Mononegavirales . [ 8 ]
В соответствии с правилами наименования таксонов, установленными Международным комитетом по таксономии вирусов (ICTV), название эболавируса Бундибугио всегда следует писать с заглавной буквы , курсивом , никогда не сокращать, и ему должно предшествовать слово «вид». Имена ее членов (эболавирусы Бундибугио) должны быть написаны с заглавной буквы, не выделены курсивом и использоваться без артиклей . [ 1 ] Официальное предложение о включении этого вида в таксономию вирусов было подано в 2010 году. [ 9 ] и был принят ICTV в 2011 году. [ 10 ]
Критерии включения видов
[ редактировать ]Вирус рода Ebolavirus является представителем вида эболавируса Bundibugyo, если: [ 1 ]
- это эндемик Уганды
- имеет геном с тремя перекрывающимися генами ( VP35 / VP40 , GP / VP30 , VP24 / L )
- его геномная последовательность отличается от вируса Эбола на ≥30%, но отличается от последовательности вируса Бундибугио на <30%
Вирус вида Bundibugyo ebolavirus является вирусом Bundibugyo, если его геном отличается от генома прототипа эболавируса Bundibugyo, варианта вируса Bundibugyo #811250 (BDBV/#811250), на ≤10% на уровне нуклеотидов . [ 1 ]
Предыдущие обозначения
[ редактировать ]Вирус Бундибугио был впервые представлен как эболавирус Бундибугио в 2008 году, хотя это название не отличалось от предполагаемого вида эболавируса Бундибугио . [ 8 ] В то же время было введено еще одно название — эболавирус Уганды. [ 11 ] В более поздних публикациях этот вирус также назывался новым «штаммом» вируса Эбола. [ 12 ] или как вирус Бундибугио Эбола. [ 13 ] Аббревиатуры BEBOV (для Эболавируса Бундибугио) и UEBOV (для Эболавируса Уганды). [ 11 ] некоторое время использовались до того, как BDBV стал аббревиатурой вируса Бундибугио. [ 1 ]
Болезнь
[ редактировать ]BDBV — один из четырех эболавирусов, вызывающих у человека болезнь, вызванную вирусом Эбола (БВВЭ) (в литературе ее также часто называют геморрагической лихорадкой Эбола, ГЛ). БВВЭ, вызванное инфекцией BDBV, невозможно отличить от БВВЭ, вызванного другими эболавирусами, только на основании клинического наблюдения. [ 12 ] [ 13 ] именно поэтому клиническая картина и патология инфекций, вызванных всеми эболавирусами, представлены вместе на отдельной странице (см. Болезнь, вызванная вирусом Эбола ). BDBV впервые появился 1 августа 2007 года, когда началась вспышка вирусной геморрагической лихорадки в поселках Бундибугио и Кикё округа Бундибугио на западе Уганды . США Образцы крови от подозрительных случаев были отправлены в Центры по контролю и профилактике заболеваний , где наличие эболавируса было подтверждено 29 ноября 2007 года. Углубленный анализ показал, что нынешний эболавирус был родственником, но не идентичен другому вирусу. четыре известных на тот момент эболавируса. [ 8 ] [ 12 ] Вспышка была объявлена об окончании 20 февраля 2008 г. [ 12 ]
Вторая вспышка была зарегистрирована ВОЗ 17 августа 2012 г., предположительно в результате заражения 15 человек и гибели 10 человек, в том числе 3 медицинских работников в Исиро, Паве и Дунгу, Восточная провинция, ДРК. [ 14 ] В 2 случаях было подтверждено, что это BDBV. [ 15 ] Сообщается, что источником стало мясо диких животных. [ 16 ] К 3 сентября ВОЗ сообщила, что число случаев заболевания возросло до 28, из них 8 подтвержденных, 6 вероятных и 14 подозреваемых, включая 14 смертей. [ 17 ] и по состоянию на 12 сентября он распространился на Виадану, и в общей сложности «41 случай (9 лабораторно подтвержденных и 32 вероятных) был зарегистрирован в округе Верхнее Уэле в Восточной провинции. Из этих случаев 18 закончились смертельным исходом» (5). подтверждены и 13 вероятны), в число вероятных случаев включены 18 медицинских работников, также зарегистрировано и расследуется 28 подозрительных случаев». [ 18 ] В пресс-релизе Демократическая Республика Конго объявила окончательные данные о 77 случаях заболевания (36 подтвержденных, 17 вероятных и 24 подозреваемых) с 36 смертельными исходами. [ 19 ]
Год | Географическое положение | Заболевания людей/смертность (коэффициент летальности) |
2007–2008 | Бундибугио , Уганда | 149/37 (25%) |
2012 | Восточная провинция , ДРК | 57/29 (51%) |
Экология
[ редактировать ]Экология BDBV в настоящее время неясна, и резервуар-хозяин еще не идентифицирован. Таким образом, остается неясным, как BDBV попал в человеческую популяцию. Предполагается, что летучие мыши являются переносчиками вируса инфекционные вирус Марбурга (MARV) и вирус Равна (RAVV), два отдаленно родственных филовируса. , поскольку у летучих мышей были выделены [ 20 ] и потому, что следы (но не инфекционные частицы) более близкого вируса Эбола (EBOV) были обнаружены и у летучих мышей. [ 21 ]
Молекулярная биология
[ редактировать ]BDBV практически не охарактеризован на молекулярном уровне. Однако его геномная последовательность, а вместе с ней и геномная организация и сохранение отдельных открытых рамок считывания , аналогичны таковым у четырех других известных эболавирусов (сходство нуклеотидов 58-61%). [ 8 ] Поэтому в настоящее время предполагается, что знания, полученные в отношении EBOV, можно экстраполировать на BDBV и что все белки BDBV являются аналогами белков EBOV. [ нужна ссылка ]
Патент
[ редактировать ]Заявка на патент США с международным совместным признанием была подана 26 октября 2009 г. и опубликована 4 октября 2012 г. на права на BDBV. [ 22 ] Патент указан под шестью различными номерами, включая одно наименование в США, а также одно обозначение Канады (CA), два обозначения Европейского патентного ведомства (EP) и два обозначения Всемирной организации интеллектуальной собственности (WO).
В заявлении о хранении патентной заявки (раздел [0002]) открыто отмечено, что образец вируса был передан на хранение в CDC в Атланте, штат Джорджия, 26 ноября 2007 г., а не в Международный орган по депонированию (IDA), который был принятый метод, установленный Будапештским договором о международном признании депонирования микроорганизмов для целей патентной процедуры . [ 22 ] Согласно тому же разделу, «депонированный организм» также был признан «неприемлемым для Американской коллекции типовых культур ». Этот образец был тщательно исследован и привел к подаче заявки на патент. [ 22 ]
В разделе [0037] патента его цель объясняется как «полезность в разработке диагностических тестов для мониторинга болезни Эбола HF [геморрагической лихорадки] у людей и животных, а также в разработке эффективных противовирусных препаратов и вакцин». [ 22 ] Кроме того, во избежание ограничения объема и охвата патента в Разделе [0036] указано, что:
- Следует понимать, что настоящее изобретение не ограничивается описанными конкретными вариантами осуществления, поскольку они, конечно, могут различаться. Также следует понимать, что терминология, используемая здесь, предназначена только для описания конкретных вариантов осуществления и не предназначена для ограничения. [ 22 ]
Патент был опубликован до того, как Верховный суд США постановил, что природный материал не может быть запатентован как изобретение (как это было продиктовано в судебном процессе 2013 года: « Ассоциация молекулярной патологии и др., против Myriad Genetics, Inc., et al. ;» утверждал 15.04.2013 и принял решение 13.06.2013), но синтетические копии природных материалов могут быть запатентованы и защищены. Неясно, повлияло ли и/или как это решение на патент на штамм Эболы Бундибугио. [ нужна ссылка ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с д и ж г час Кун, Дж. Х.; Беккер, С.; Эбихара, Х.; Гейсберт, ТВ; Джонсон, КМ; Каваока, Ю.; Липкин, Висконсин; Негредо, А.И.; Нетесов С.В.; Никол, СТ; Паласиос, Г.; Питерс, CJ; Тенорио, А.; Волчков, В.Е.; Ярлинг, ПБ (2010). «Предложение по пересмотренной таксономии семейства Filoviridae: Классификация, названия таксонов и вирусов, а также вирусные сокращения» . Архив вирусологии . 155 (12): 2083–2103. дои : 10.1007/s00705-010-0814-x . ПМК 3074192 . ПМИД 21046175 .
- ^ Служба инспекции здоровья животных и растений США (APHIS) и Центры США по контролю и профилактике заболеваний (CDC). «Национальный реестр избранных агентов (NSAR)» . Проверено 16 октября 2011 г.
- ^ Министерство здравоохранения и социальных служб США. «Биобезопасность в микробиологических и биомедицинских лабораториях (BMBL), 5-е издание» . Проверено 16 октября 2011 г.
- ^ Национальные институты здравоохранения США (NIH), Национальный институт аллергии и инфекционных заболеваний США (NIAID). «Биозащита — приоритетные патогены категорий A, B и C NIAID» . Проверено 16 октября 2011 г.
- ^ Центры США по контролю и профилактике заболеваний (CDC). «Агенты биотерроризма/болезни» . Архивировано из оригинала 22 июля 2014 г. Проверено 16 октября 2011 г.
- ^ Группа Австралии. «Перечень биологических агентов для экспортного контроля» . Архивировано из оригинала 6 августа 2011 г. Проверено 16 октября 2011 г.
- ^ Таунер, Дж. С.; Сили, ТК; Христова, М.Л.; Альбарино, КГ; Конлан, С.; Ридер, ЮАР; Цюань, Польша; Липкин, Висконсин; и др. (2008). «Недавно обнаруженный вирус Эбола связан со вспышкой геморрагической лихорадки в Уганде» . ПЛОС Патогены . 4 (11): e1000212. дои : 10.1371/journal.ppat.1000212 . ПМК 2581435 . ПМИД 19023410 .
- ^ Jump up to: а б с д Грюнберг, С.М. (1985). «Будущие направления химиотерапии рака головы и шеи». Американский журнал клинической онкологии . 8 (1): 51–54. ПМИД 2581435 .
- ^ Кун Дж.Х., Беккер С., Эбихара Х., Гейсберт Т.В., Джонсон К.М., Каваока Ю., Нетесов С.В., Никол С.Т., Петерс К.Дж., Волчков В.Е., Ярлинг П.Б. (14 июня 2010 г.). «Создать новый вид под названием Bundibugyo ebolavirus в роде Ebolavirus семейства Filoviridae» (PDF) . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) . Проверено 1 августа 2020 г.
- ^ «История таксономии ICTV: эболавирус Бундибугио» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) . Проверено 1 августа 2020 г.
- ^ Jump up to: а б Кун, Дж. Х. (2008). «Филовирусы. Сборник 40-летних эпидемиологических, клинических и лабораторных исследований». Архив вирусологии. Дополнение . 20 :13–360. ПМИД 18637412 .
- ^ Jump up to: а б с д Вамала, Дж. Ф.; Лукваго, Л.; Малимбо, М.; Нгуку, П.; Йоти, З.; Мусенеро, М.; Амон, Дж.; Мбабази, В.; Наньюнджа, М.; Зарамба, С.; Опиум, А.; Лутвама, Джей-Джей; Талисуна, АО; Окваре, С.И. (2010). «Геморрагическая лихорадка Эбола, связанная с новым штаммом вируса, Уганда, 2007–2008 гг.» . Новые инфекционные заболевания . 16 (7): 1087–1092. дои : 10.3201/eid1607.091525 . ПМК 3321896 . ПМИД 20587179 .
- ^ Jump up to: а б МакНил, А.; Фарнон, EC ; Вамала, Дж.; Оквар, С.; Кэннон, ДЛ; Рид, З.; Таунер, Дж. С.; Тапперо, JW; Лутвама, Дж.; Даунинг, Р.; Никол, СТ; Ксязек, Т.Г.; Роллин, ЧП (2010). «Инфекция вирусом Эбола в Бундибугио, Уганда » Новые инфекционные заболевания . 16 (12): 1969–1972. дои : 10.3201/eid1612.100627 . ПМЦ 3294552 . ПМИД 21122234 .
- ^ «Вспышка Эболы в Демократической Республике Конго (обновленная информация от 20 августа 2012 г.) – ВОЗ | Региональное бюро для Африки» . Архивировано из оригинала 4 августа 2014 г. Проверено 26 августа 2012 г.
- ^ «ВОЗ – Вспышка Эболы в Демократической Республике Конго» . www.who.int . Архивировано из оригинала 19 августа 2012 года . Проверено 20 апреля 2018 г.
- ^ «Конго-Киншаса: во вспышке Эболы обвиняют мясо диких животных» . 24 августа 2012 года . Проверено 20 апреля 2018 г. - через AllAfrica.
- ^ «ВОЗ – Вспышка Эболы в Демократической Республике Конго – обновленная информация» . www.who.int . Архивировано из оригинала 8 сентября 2012 года . Проверено 20 апреля 2018 г.
- ^ «ВОЗ – Вспышка Эболы в Демократической Республике Конго – обновленная информация» . www.who.int . Архивировано из оригинала 13 апреля 2014 года . Проверено 20 апреля 2018 г.
- ^ Центры по контролю заболеваний. «Сообщения о вспышках» . Центры по контролю заболеваний . Проверено 11 июля 2014 г.
- ^ Таунер, Дж. С.; Амман, Бразилия; Сили, ТК; Кэрролл, ЮАР; Комер, Дж.А.; Кемп, А.; Свейнпол, Р.; Пэддок, CD; Балинанди, С.; Христова, М.Л.; Форменти, П.Б.; Альбарино, КГ; Миллер, DM; Рид, З.Д.; Кайива, Джей Ти; Миллс, Дж. Н.; Кэннон, ДЛ; Грир, П.В.; Бьяруханга, Э.; Фарнон, ЕС; Атимнеди, П.; Оквар, С.; Катонголе-Мбидде, Э.; Даунинг, Р.; Тапперо, JW; Заки, СР; Ксязек, Т.Г.; Никол, СТ; Роллин, ЧП (2009). Фушье, Рон А.М. (ред.). «Выделение генетически разнообразных вирусов Марбурга из египетских летучих мышей» . ПЛОС Патогены . 5 (7): e1000536. дои : 10.1371/journal.ppat.1000536 . ПМК 2713404 . ПМИД 19649327 .
- ^ Лерой, EM; Кумулунги, Б.; Пуррут, X.; Руке, П.; Хасанин А.; Яба, П.; Деликат, А.; Павеска, Дж.Т.; Гонсалес, JP; Свейнпол, Р. (2005). «Плодовые летучие мыши как резервуары вируса Эбола». Природы . 438 (7068): 575–576. Бибкод : 2005Natur.438..575L . дои : 10.1038/438575a . ПМИД 16319873 . S2CID 4403209 .
- ^ Jump up to: а б с д и Таунер, Джонатан С., Стюарт Т. Никол, Джеймс А. Комер, Томас Г. Ксиазек и Пьер Э. Роллен. Виды вируса Эбола человека, композиции и способы их получения. Правительство США в лице министра здравоохранения, Атланта, Джорджия, правопреемник. Патент США 2012/0251502 А1. 4 октября 2012 г. Печать.