Вирус Эбола из Судана
Вирус Эбола из Судана | |
---|---|
Классификация вирусов | |
(без рейтинга): | Вирус |
Область : | Рибовирия |
Королевство: | Орторнавиры |
Тип: | Негарнавирикота |
Сорт: | Монхивирицетес |
Заказ: | Мононегавирусы |
Семья: | Филовириды |
Род: | Эболавирус |
Разновидность: | Вирус Эбола из Судана
|
Членский вирус | |
Суданский вирус (SUDV) |
Вид Filoviridae суданский эболавирус — вирусологический таксон, входящий род Ebolavirus , семейство в , порядок Mononegavirales . У этого вида есть единственный вирусный представитель - Суданский вирус (SUDV). [ 1 ] Представители этого вида называются суданскими эболавирусами. [ 1 ] Он был открыт в 1977 году и вызывает Эболу, клинически неотличимую от штамма Эболы Заир , но менее заразную, чем он. В отличие от Эболы, в Заире вакцины нет.
Номенклатура
[ редактировать ]Название «суданский эболавирус» происходит от слова «Судан» (страна, в которой суданский вирус был впервые обнаружен) и таксономического суффикса «эболавирус» (который обозначает вид эболавируса). [ 1 ]
Этот вид был завезен в 1998 году как суданский вирус Эбола . [ 2 ] [ 3 ] В 2002 году название было изменено на Суданский эболавирус . [ 4 ] [ 5 ]
Вирус рода Ebolavirus является представителем вида Суданский эболавирус, если: [ 1 ]
- это эндемик Судана и/или Уганды.
- имеет геном с тремя перекрывающимися генами ( VP35 / VP40 , GP / VP30 , VP24 / L )
- его геномная последовательность отличается от вируса Эбола на ≥30%, но отличается от последовательности суданского вируса на <30%
Суданский вирус (SUDV) — один из шести известных вирусов рода Эболавирус и один из четырех, вызывающих болезнь, вызванную вирусом Эбола (БВВЭ), у людей и других приматов ; это единственный представитель вида суданский эболавирус . SUDV является избранным агентом , Всемирной организации здравоохранения возбудителем группы риска 4 (требующим сдерживания, эквивалентным уровню 4 биобезопасности ), Национальными институтами здравоохранения / Национальным институтом аллергии и инфекционных заболеваний , приоритетным возбудителем категории A, Центрами по контролю и профилактике заболеваний , агентом биотерроризма категории A. и внесен в список биологических агентов экспортного контроля Австралийской группы . [ нужна ссылка ]
Первая известная вспышка БВВЭ произошла из-за суданского вируса в Южном Судане в период с июня по ноябрь 1976 года, в результате чего заразились 284 человека и погиб 151 человек, причем первый выявленный случай произошел 27 июня 1976 года. [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ]
Использование термина
[ редактировать ]Суданский вирус (сокращенно SUDV) был впервые описан в 1977 году. [ 9 ] Это единственный представитель вида суданского эболавируса , входящего в род Эболавирус , семейство Filoviridae , порядок Mononegavirales . [ 1 ] Название «Суданский вирус» происходит от названия Южного Судана (где он был впервые обнаружен до отделения Южного Судана от Судана). [ 10 ] ) и таксономический суффикс вируса . [ нужна ссылка ]
Предыдущие обозначения
[ редактировать ]Суданский вирус был впервые представлен как новый «штамм» вируса Эбола в 1977 году. [ 9 ] Суданский вирус был описан как «геморрагическая лихорадка Эбола» в отчете ВОЗ 1978 года, описывающем вспышку в Судане в 1976 году. [ 11 ] В 2000 году он получил обозначение Суданский вирус Эбола. [ 12 ] [ 13 ] а в 2002 году название было изменено на Суданский эболавирус. [ 4 ] [ 5 ] Предыдущие сокращения для вируса были EBOV-S (для вируса Эбола Судан) и совсем недавно SEBOV (для вируса Эбола Судана или вируса Эбола Судана). Вирус получил свое окончательное обозначение в 2010 году, когда он был переименован в Суданский вирус (SUDV). [ 1 ]
Критерии включения вируса
[ редактировать ]Вирус вида Суданский эболавирус является суданским вирусом (SUDV), если он обладает свойствами суданских эболавирусов и если его геном отличается от генома прототипа суданского вируса, варианта суданского вируса Бонифаций (SUDV/Bon), на ≤10% при нуклеотидов . уровень [ 1 ]
Болезнь
[ редактировать ]SUDV — один из четырех эболавирусов, вызывающих у человека болезнь, вызванную вирусом Эбола (БВВЭ) (в литературе также часто называемую геморрагической лихорадкой Эбола, ГЛ). БВВЭ, вызванное SUDV-инфекцией, невозможно отличить от БВВЭ, вызванного другими эболавирусами, только на основании клинического наблюдения, поэтому клиническая картина и патология инфекций, вызванных всеми эболавирусами, представлены вместе на отдельной странице. Этот штамм менее заразен, чем заирский эболавирус . [ 14 ]
В прошлом SUDV вызывал следующие вспышки БВВЭ: [ 15 ] [ 16 ] [ необходимы дополнительные ссылки ]
Год | Географическое положение | Заболевания людей/смертность (коэффициент летальности) |
1976 | Джуба , Мариди , Нзара и Тембура, Южный Судан | 284/151 (53%) |
1979 | Голод , Южный Судан | 34/22 (65%) |
2000–2001 | Гулу , Мбарара и Районы Масинди , Уганда | 425/224 (53%) |
2004 | Округ Ямбио, Южный Судан | 17/7 (41%) |
2011 | Луверо , Уганда | 1/1 (100%) |
2014 | Эквадор , Конго [ 17 ] | 0/1 * зарегистрировано два штамма, один суданский и один суданско-заирский гибрид, до 24 августа 2014 г. (0%) |
2022-2023 | Центральный и Западный регионы , Уганда | 164/77 (47%) |
Разработка вакцины
[ редактировать ]По состоянию на 2022 год существует шесть экспериментальных вакцин, но только три дошли до стадии, когда начались клинические испытания на людях. [ 18 ]
Агентство общественного здравоохранения Канады разработало кандидатную вакцину RVSV от суданского эболавируса. Компания Merck разрабатывала его, но по состоянию на 18 октября 2022 г. [update] прекратил разработку; Монополия компании Merck на технологии rVSV, приобретенная за счет финансирования ГАВИ , недоступна другим компаниям, разрабатывающим вакцины против rVSV. [ 19 ]
По состоянию на 2021 год GeoVax разрабатывала MVA-SUDV-VLP, который представляет собой модифицированный вирус коровьей оспы Анкары, производящий частицы, подобные суданскому вирусу; Первые данные их исследования показали, что вакцина-кандидат GeoVax на 100% эффективна в предотвращении смертности от суданского эболавируса среди животных. [ 20 ]
Вакцина на основе аденовируса , ранее лицензированная GSK, и доработана была передана в дар Институту вакцин Сабина в партнерстве с Исследовательским центром вакцин Национального института аллергии и инфекционных заболеваний США; с октября 2022 года он будет предлагаться контактам с известными случаями SDV во время вспышки Эболы в Уганде в 2022 году в рамках клинического исследования . [ 18 ]
Экология
[ редактировать ]Экология SUDV в настоящее время неясна, и резервуар-хозяин еще не идентифицирован. Таким образом, остается неясным, как SUDV неоднократно попадал в популяцию людей. По состоянию на 2009 год предполагалось, что летучие мыши являются переносчиками вируса, поскольку от летучих мышей был выделен инфекционный вирус Марбурга (MARV), отдаленно родственный филовирус. [ 21 ] и потому, что следы (но не инфекционные частицы) более близкого вируса Эбола (EBOV) были обнаружены и у летучих мышей. [ 22 ]
Молекулярная биология
[ редактировать ]SUDV практически не охарактеризован на молекулярном уровне. Однако его геномная последовательность, а вместе с ней и геномная организация и сохранение отдельных открытых рамок считывания , аналогичны таковым у четырех других известных эболавирусов. Поэтому в настоящее время предполагается, что знания, полученные для EBOV, можно экстраполировать на SUDV и что все белки SUDV ведут себя аналогично белкам EBOV. [ нужна ссылка ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с д и ж г Кун, Йенс Х.; Беккер, Стефан; Эбихара, Хидеки; Гейсберт, Томас В.; Джонсон, Карл М.; Каваока, Ёсихиро; Липкин, В. Ян; Негредо, Ана I; и др. (2010). «Предложение по пересмотренной таксономии семейства Filoviridae: Классификация, названия таксонов и вирусов, а также вирусные сокращения» . Архив вирусологии . 155 (12): 2083–103. дои : 10.1007/s00705-010-0814-x . ПМК 3074192 . ПМИД 21046175 .
- ^ Нетесов С.В.; Фельдманн, Х.; Ярлинг, ПБ; Кленк, HD; Санчес, А. (2000). «Семейство Filoviridae». Ин ван Регенмортель, MHV; Фоке, СМ; Бишоп, DHL; Карстенс, Э.Б.; Эстес, МК; Лимон, СМ; Манилофф Дж.; Мэйо, Массачусетс; МакГеоч, диджей; Прингл, Чехия; Викнер, Р.Б. (ред.). Таксономия вирусов — Седьмой доклад Международного комитета по таксономии вирусов . Сан-Диего, США: Academic Press. стр. 539–48. ISBN 978-0-12-370200-5 .
- ^ Прингл, ЧР (1998). «Таксономия вирусов – Сан-Диего, 1998». Архив вирусологии . 143 (7): 1449–59. дои : 10.1007/s007050050389 . ПМИД 9742051 . S2CID 13229117 .
- ^ Jump up to: а б Фельдманн, Х.; Гейсберт, ТВ; Ярлинг, ПБ; Кленк, Х.-Д.; Нетесов С.В.; Питерс, CJ; Санчес, А.; Свейнпол, Р.; Волчков, В.Е. (2005). «Семейство Filoviridae». Ин Фоке, CM; Мэйо, Массачусетс; Манилофф Дж.; Дессельбергер, У.; Болл, Лос-Анджелес (ред.). Таксономия вирусов – Восьмой доклад Международного комитета по таксономии вирусов . Сан-Диего, США: Elsevier/Academic Press. стр. 645–653. ISBN 978-0-12-370200-5 .
- ^ Jump up to: а б Мэйо, Массачусетс (2002). «ICTV на Парижской ICV: итоги пленарного заседания и биномиального голосования» . Архив вирусологии . 147 (11): 2254–60. дои : 10.1007/s007050200052 . S2CID 43887711 .
- ^ «Геморрагическая лихорадка Эбола в Судане, 1976 г.» (PDF) . Архивировано из оригинала (PDF) 13 октября 2014 года.
- ^ Фельдманн, Х.; Гейсберт, TW (2011). «Геморрагическая лихорадка Эбола» . Ланцет . 377 (9768): 849–862. дои : 10.1016/S0140-6736(10)60667-8 . ПМК 3406178 . ПМИД 21084112 .
- ^ Хоенен Т., Гросет А., Фельдманн Х. (июль 2012 г.). «Современные вакцины против Эболы» . Эксперт Опин Биол Тер . 12 (7): 859–72. дои : 10.1517/14712598.2012.685152 . ПМЦ 3422127 . ПМИД 22559078 .
- ^ Jump up to: а б Боуэн, ETW; Ллойд, Г.; Харрис, WJ; Платт, Г.С.; Баскервиль, А.; Велла, Э.Э. (1977). «Вирусная геморрагическая лихорадка в южном Судане и северном Заире. Предварительные исследования этиологического агента». Ланцет . 309 (8011): 571–3. дои : 10.1016/s0140-6736(77)92001-3 . ПМИД 65662 . S2CID 3092094 .
- ^ Голод, Южный Судан
- ^ «Дом» (PDF) . Архивировано из оригинала (PDF) 13 октября 2014 года . Проверено 11 февраля 2015 г.
- ^ Нетесов С.В.; Фельдманн, Х.; Ярлинг, ПБ; Кленк, HD; Санчес, А. (2000). «Семейство Filoviridae». Ин ван Регенмортель, MHV; Фоке, СМ; Бишоп, DHL; Карстенс, Э.Б.; Эстес, МК; Лимон, СМ; Манилофф Дж.; Мэйо, Массачусетс; МакГеоч, диджей; Прингл, Чехия; Викнер, Р.Б. (ред.). Таксономия вирусов – Седьмой отчет Международного комитета по таксономии вирусов . Сан-Диего, США: Academic Press. стр. 539–48. ISBN 978-0-12-370200-5 .
- ^ Прингл, ЧР (1998). «Таксономия вирусов – Сан-Диего, 1998». Архив вирусологии . 143 (7): 1449–59. дои : 10.1007/s007050050389 . ПМИД 9742051 . S2CID 13229117 .
- ^ Бирьябарема, Элиас (22 сентября 2022 г.). «На данный момент в Уганде подтверждено семь случаев Эболы и один смерть» . Рейтер . Проверено 23 сентября 2022 г.
- ^ «Вспышка Эболы: ДР Конго подтверждает две смерти» . Би-би-си. 24 августа 2014 г.
- ^ «Болезнь Эбола, вызванная суданским вирусом – Уганда» . www.who.int . Проверено 27 сентября 2022 г.
- ^ «Вспышка Эболы: ДР Конго подтверждает две смерти» . Би-би-си. 24 августа 2014 г.
- ^ Jump up to: а б Хелен Брансвелл (29 сентября 2022 г.). «Экспериментальные испытания вакцины против Эболы могут скоро начаться в Уганде» . Новости СТАТ . Проверено 10 октября 2022 г.
- ^ «Ответ MSF на политику CEPI в отношении равного доступа» . Кампания по доступу к организации «Врачи без границ» . 25 сентября 2018 года . Проверено 23 сентября 2022 г.
При разработке вакцин важен доступ к знаниям. Знания и опыт, включая, помимо прочего, методы очистки, клеточные линии, материалы, программные коды и их передачу альтернативным производителям в случае, если лауреат прекратит разработку многообещающей вакцины, имеют решающее значение. Ярким примером является недавний пример отказа компании Merck от разработки вакцин rVSV для Марбурга (rVSV-MARV) и для Судана и Эболы (rVSV-SUDV). Компания Merck продолжает сохранять жизненно важные ноу-хау в области платформы rVSV, поскольку она разработала вакцину rVSV для Заира и Эболы (rVSV-ZEBOV) при финансовой поддержке ГАВИ. Хотя оно передало права на эти вакцины обратно Агентству общественного здравоохранения Канады, на платформе rVSV не существует механизма для обмена ноу-хау с другими разработчиками вакцин, которые хотели бы также использовать rVSV в качестве вектора против других патогенов.
- ^ «GeoVax объявляет о презентации данных о суданской вакцине против Эболавируса на ежегодном собрании Американского общества вирусологии» . 21 июля 2021 г.
- ^ Таунер, Дж. С.; Амман, Бразилия; Сили, ТК; Кэрролл, ЮАР; Комер, Дж.А.; Кемп, А.; Свейнпол, Р.; Пэддок, CD; Балинанди, С.; Христова, М.Л.; Форменти, П.Б.; Альбарино, КГ; Миллер, DM; Рид, З.Д.; Кайива, Джей Ти; Миллс, Дж. Н.; Кэннон, ДЛ; Грир, П.В.; Бьяруханга, Э.; Фарнон, ЕС; Атимнеди, П.; Оквар, С.; Катонголе-Мбидде, Э.; Даунинг, Р.; Тапперо, JW; Заки, СР; Ксязек, Т.Г.; Никол, СТ; Роллин, ЧП (2009). Фушье, Рон А.М. (ред.). «Выделение генетически разнообразных вирусов Марбурга из египетских летучих мышей» . ПЛОС Патогены . 5 (7): e1000536. дои : 10.1371/journal.ppat.1000536 . ПМК 2713404 . ПМИД 19649327 .
- ^ Лерой, EM; Кумулунги, Б.; Пуррут, X.; Руке, П.; Хасанин А.; Яба, П.; Деликат, А.; Павеска, Дж.Т.; Гонсалес, JP; Свейнпол, Р. (2005). «Плодовые летучие мыши как резервуары вируса Эбола». Природы . 438 (7068): 575–576. Бибкод : 2005Natur.438..575L . дои : 10.1038/438575a . ПМИД 16319873 . S2CID 4403209 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Вирусы животных
- Человеческие вирусы
- Вирусы описаны в 1977 г.
- Человеческие вирусы описаны в 1977 г.
- Вирусные лихорадки, передающиеся членистоногими, и вирусные геморрагические лихорадки
- Биологическое оружие
- Геморрагические лихорадки
- Эболавирусы
- Тропические болезни
- Кожные заболевания, связанные с вирусами
- Зоонозы
- Болезни приматов
- Внутривидовые таксоны вирусов