Эболавирус Тайского леса
Это лесной эболавирус. | |
---|---|
Классификация вирусов ![]() | |
(без рейтинга): | Вирус |
Область : | Рибовирия |
Королевство: | Орторнавиры |
Тип: | Негарнавирикота |
Сорт: | Монхивирицетес |
Заказ: | Мононегавирусы |
Семья: | Филовириды |
Род: | Эболавирус |
Разновидность: | Это лесной эболавирус.
|
Синонимы | |
Вирус Тайского леса (TAFV) |
Вид эболавируса Taï Forest ( / t ɑː ˈ iː / ) [ 1 ] — вирусологический таксон, входящий в род Ebolavirus , семейство Filoviridae , порядок Mononegavirales . У этого вида есть единственный вирус - вирус Тай Форест (TAFV). [ 1 ] Представители этого вида называются эболавирусами Тайского леса. [ 1 ]
Эболавирус Тай Форест был обнаружен при единичном заражении человека в результате контакта с шимпанзе из Тай Форест в Кот-д'Ивуаре . [ 2 ]
Номенклатура
[ редактировать ]Название эболавируса Тай Форест происходит от слова Parc National de Taï (название национального парка в Кот-д'Ивуаре , где впервые был обнаружен вирус Тай Форест) и таксономического суффикса эболавирус (который обозначает вид эболавируса). [ 1 ] В соответствии с правилами наименования таксонов, установленными Международным комитетом по таксономии вирусов (ICTV), название эболавируса Тай Форест всегда следует писать с заглавной буквы , курсивом , никогда не сокращать, и ему должно предшествовать слово «вид». Имена его членов (эболавирусы Тайского леса) должны быть написаны с заглавной буквы, не выделены курсивом и использоваться без артиклей . [ 1 ]
Этот вид был завезен в 1998 году как вирус Эбола Кот-д'Ивуара . [ 3 ] [ 4 ] В 2002 году название было изменено на эболавирус Кот-д’Ивуара . [ 5 ] [ 6 ] Название было предложено изменить на эболавирус Тай Форест в 2010 году. [ 1 ] и это предложение было немедленно принято ICTV. [ нужна ссылка ]
Вирус рода Ebolavirus является представителем вида эболавируса Taï Forest, если: [ 1 ]
- это эндемик Кот-д'Ивуара.
- имеет геном с тремя перекрывающимися генами ( VP35 / VP40 , GP / VP30 , VP24 / L )
- его геномная последовательность отличается от вируса Эбола на ≥30%, но отличается от последовательности вируса Тай Форест на <30%.
Вирус Taï Forest ( / t ɑː ˈ iː / ; [ 1 ] TAFV) является близким родственником гораздо более известного вируса Эбола (EBOV). TAFV вызывает тяжелое заболевание у приматов — Эбола геморрагическую лихорадку . TAFV является избранным агентом , Всемирной организации здравоохранения возбудителем группы риска 4 (требующим сдерживания, эквивалентным уровню биобезопасности 4 ), Национальным институтам здравоохранения / Национальному институту аллергии и инфекционных заболеваний , приоритетному возбудителю категории A, Центрам по контролю и профилактике заболеваний, агенту биотерроризма категории A. и внесен в список биологических агентов экспортного контроля Австралийской группы . [ нужна ссылка ]
Использование термина
[ редактировать ]Вирус Тай Форест (сокращенно TAFV) был впервые описан в 1995 году как новый «штамм» вируса Эбола . [ 7 ] Это единственный представитель вида эболавируса Тай Форест , который входит в род Эболавирус , семейство Filoviridae , порядок Mononegavirales . [ 1 ] Название вируса Taï Forest происходит от Parc National de Taï (название национального парка в Кот-д'Ивуаре , где он был впервые обнаружен) и таксономического суффикса вирус . Согласно правилам наименования таксонов, установленным Международным комитетом по таксономии вирусов (ICTV), название вируса Тай Форест всегда должно быть написано с заглавной буквы , но (в отличие от названий таксонов, например названий рода и вида) никогда не выделяется курсивом и может быть сокращено (официальным сокращением является TAFV). [ 8 ]
Предыдущие обозначения
[ редактировать ]Вирус Тай Форест был впервые представлен как новый «штамм» вируса Эбола в 1995 году. [ 7 ] В 2000 году он получил обозначение «Вирус Эболы Кот-д'Ивуар». [ 9 ] [ 10 ] а в 2002 году название было изменено на эболавирус Кот-д'Ивуара. [ 5 ] [ 6 ] (оба раза с ошибкой «Кот»). Другими названиями, циркулирующими в литературе, были правильный вирус Эбола Кот-д'Ивуара и эболавирус Кот-д'Ивуара, а также жаргонные термины вирус Эбола Кот-д'Ивуара и эболавирус Кот-д'Ивуара. Предыдущие сокращения для вируса были EBOV-CI (для вируса Эбола Кот-д'Ивуар или вируса Эбола Кот-д'Ивуар), EBOV-IC (для вируса Эбола Кот-д'Ивуар), ICEBOV (для вируса Эбола Кот-д’Ивуар или эболавирус Кот-д’Ивуар) и совсем недавно CIEBOV (для вируса Эбола Кот-д'Ивуар, Эбола Кот-д'Ивуар вирус, эболавирус Кот-д'Ивуара или эболавирус Кот-д'Ивуара). Вирус получил свое окончательное обозначение в 2010 году, когда он был переименован в вирус Тай Форест (TAFV). [ 1 ]
Критерии включения вируса
[ редактировать ]Вирус вида эболавирус Тай Форест является вирусом Тай Форест (TAFV), если он обладает свойствами эболавирусов Тай Форест и если его геном отличается от генома прототипа вируса Тай Форест, варианта вируса Тай Форест Кот-д'Ивуар (TAFV/ CI), на ≤10% на уровне нуклеотидов . [ 1 ]
Болезнь
[ редактировать ]TAFV — один из четырех эболавирусов, вызывающих у человека болезнь, вызванную вирусом Эбола (БВВЭ) (в литературе ее также часто называют геморрагической лихорадкой Эбола, ГЛ). БВВЭ, вызванное инфекцией TAFV, невозможно отличить от БВВЭ, вызванного другими эболавирусами, только на основании клинического наблюдения, поэтому клиническая картина и патология инфекций, вызванных всеми эболавирусами, представлены вместе на отдельной странице (см. Болезнь, вызванная вирусом Эбола ). TAFV впервые и пока единственный известный случай появился в 1994 году во время эпизоотии вирусной геморрагической лихорадки среди западных шимпанзе (Pan troglodytes verus) в национальном парке Тай , Кот-д'Ивуар . По мере того, как было обнаружено больше мертвых западных шимпанзе, многие из них дали положительный результат на инфекцию эболавирусом, отличным от уже известных. Один из ученых, проводивших вскрытие инфицированных западных шимпанзе, заразился TAFV. у нее появились симптомы, похожие на симптомы лихорадки денге Примерно через неделю после вскрытия , и ее перевезли в Швейцарию для лечения. Через две недели ее выписали из больницы, а через шесть недель после заражения она полностью выздоровела. [ нужна ссылка ]
Год | Географическое положение | Заболевания людей/смертность (коэффициент летальности) |
1994 | Национальный парк Тай , Кот-д'Ивуар | 1/0 (0%) |
Экология
[ редактировать ]Экология TAFV в настоящее время неясна, и резервуар-хозяин еще не идентифицирован. Таким образом, остается неясным, как TAFV попал в популяцию западных шимпанзе. Предполагается, что летучие мыши являются переносчиками вируса, поскольку от летучих мышей был выделен инфекционный вирус Марбурга (MARV), отдаленно родственный филовирус. [ 11 ] и потому, что следы (но не инфекционные частицы) более близкого вируса Эбола (EBOV) были обнаружены и у летучих мышей. [ 12 ]
Молекулярная биология
[ редактировать ]TAFV практически не охарактеризован на молекулярном уровне. Однако его геномная последовательность, а вместе с ней и геномная организация и сохранение отдельных открытых рамок считывания , аналогичны таковым у четырех других известных эболавирусов. Поэтому в настоящее время предполагается, что знания, полученные для EBOV, можно экстраполировать на TAFV и что все белки TAFV ведут себя аналогично белкам EBOV. [ нужна ссылка ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б с д и ж г час я дж к Кун, Йенс Х.; Беккер, Стефан; Эбихара, Хидеки; Гейсберт, Томас В.; Джонсон, Карл М.; Каваока, Ёсихиро; Липкин, В. Ян; Негредо, Ана I; и др. (2010). «Предложение по пересмотренной таксономии семейства Filoviridae: Классификация, названия таксонов и вирусов, а также вирусные сокращения» . Архив вирусологии . 155 (12): 2083–103. дои : 10.1007/s00705-010-0814-x . ПМК 3074192 . ПМИД 21046175 .
- ^ Байзе, Сильвен; Паннетье, Дельфин; Аустерайх, Лиза; Ригер, Тони; Койвоги, Ламин; Магассуба, Н'Фали; Соропоги, Барре; Соу, Мамаду Салиу; Кейта, Сакоба; Де Клерк, Хильда; Тиффани, Аманда; Домингес, Джемма; Луа, Мэтью; Траоре, Алексис; Колье, Мусса; Малано, Эммануэль Роланд; Элез, Эммануэль; Бокен, Энн; Мели, Стефан; Рауль, Эрве; Каро, Валери; Кадар, Даниэль; Габриэль, Мартин; Пальманн, Майке; Таппе, Деннис; Шмидт-Чанасит, Йонас; Импума, Бенидо; Диалло, Абдул Карим; Форменти, Пьер; и др. (2014). «Появление Заирской болезни, вызванной вирусом Эбола, в Гвинее» . Медицинский журнал Новой Англии . 371 (15): 1418–25. дои : 10.1056/NEJMoa1404505 . ПМИД 24738640 .
- ^ Нетесов С.В.; Фельдманн, Х.; Ярлинг, ПБ; Кленк, HD; Санчес, А. (2000). «Семейство Filoviridae». Ин ван Регенмортель, MHV; Фоке, СМ; Бишоп, DHL; Карстенс, Э.Б.; Эстес, МК; Лимон, СМ; Манилофф Дж.; Мэйо, Массачусетс; МакГеоч, диджей; Прингл, Чехия; Викнер, Р.Б. (ред.). Таксономия вирусов — Седьмой доклад Международного комитета по таксономии вирусов . Сан-Диего, США: Academic Press. стр. 539–48. ISBN 978-0-12-370200-5 .
- ^ Прингл, ЧР (1998). «Таксономия вирусов – Сан-Диего, 1998». Архив вирусологии . 143 (7): 1449–59. дои : 10.1007/s007050050389 . ПМИД 9742051 . S2CID 13229117 .
- ^ Перейти обратно: а б Фельдманн, Х.; Гейсберт, ТВ; Ярлинг, ПБ; Кленк, Х.-Д.; Нетесов С.В.; Питерс, CJ; Санчес, А.; Свейнпол, Р.; Волчков, В.Е. (2005). «Семейство Filoviridae». Ин Фоке, CM; Мэйо, Массачусетс; Манилофф Дж.; Дессельбергер, У.; Болл, Лос-Анджелес (ред.). Таксономия вирусов — Восьмой доклад Международного комитета по таксономии вирусов . Сан-Диего, США: Elsevier/Academic Press. стр. 645–653. ISBN 978-0-12-370200-5 .
- ^ Перейти обратно: а б Мэйо, Массачусетс (2002). «ICTV на Парижской ICV: итоги пленарного заседания и биномиального голосования» . Архив вирусологии . 147 (11): 2254–60. дои : 10.1007/s007050200052 . S2CID 43887711 .
- ^ Перейти обратно: а б ле Генно, Б.; Форменти, П.; Уайерс, М.; Гунон, П.; Уокер, Ф.; Бош, К. (1995). «Выделение и частичная характеристика нового штамма вируса Эбола». Ланцет . 345 (8960): 1271–4. дои : 10.1016/S0140-6736(95)90925-7 . ПМИД 7746057 . S2CID 38897209 .
- ^ ICTV: Как написать имя вируса , на ICTV онлайн (2019)
- ^ Нетесов С.В.; Фельдманн, Х.; Ярлинг, ПБ; Кленк, HD; Санчес, А. (2000). «Семейство Filoviridae». Ин ван Регенмортель, MHV; Фоке, СМ; Бишоп, DHL; Карстенс, Э.Б.; Эстес, МК; Лимон, СМ; Манилофф Дж.; Мэйо, Массачусетс; МакГеоч, диджей; Прингл, Чехия; Викнер, Р.Б. (ред.). Таксономия вирусов — Седьмой доклад Международного комитета по таксономии вирусов . Сан-Диего, США: Academic Press. стр. 539–48. ISBN 978-0-12-370200-5 .
- ^ Прингл, ЧР (1998). «Таксономия вирусов – Сан-Диего, 1998». Архив вирусологии . 143 (7): 1449–59. дои : 10.1007/s007050050389 . ПМИД 9742051 . S2CID 13229117 .
- ^ Таунер, Дж. С.; Амман, Бразилия; Сили, ТК; Кэрролл, ЮАР; Комер, Дж.А.; Кемп, А.; Свейнпол, Р.; Пэддок, CD; Балинанди, С.; Христова, М.Л.; Форменти, П.Б.; Альбарино, КГ; Миллер, DM; Рид, З.Д.; Кайива, Джей Ти; Миллс, Дж. Н.; Кэннон, ДЛ; Грир, П.В.; Бьяруханга, Э.; Фарнон, ЕС; Атимнеди, П.; Оквар, С.; Катонголе-Мбидде, Э.; Даунинг, Р.; Тапперо, JW; Заки, СР; Ксязек, Т.Г.; Никол, СТ; Роллин, ЧП (2009). Фушье, Рон А.М. (ред.). «Выделение генетически разнообразных марбургских вирусов из египетских летучих мышей» . ПЛОС Патогены . 5 (7): e1000536. дои : 10.1371/journal.ppat.1000536 . ПМК 2713404 . ПМИД 19649327 .
- ^ Лерой, EM; Кумулунги, Б.; Пуррут, X.; Руке, П.; Хасанин А.; Яба, П.; Деликат, А.; Павеска, Дж.Т.; Гонсалес, JP; Свейнпол, Р. (2005). «Плодовые летучие мыши как резервуары вируса Эбола». Природы . 438 (7068): 575–576. Бибкод : 2005Natur.438..575L . дои : 10.1038/438575a . ПМИД 16319873 . S2CID 4403209 .