Лиссавирус
| Лиссавирус | |
|---|---|
 | |
| Цветная трансмиссионная электронная микрофотография лиссавируса австралийских летучих мышей . Пулеподобные объекты — это вирионы, некоторые из них отпочковываются от клетки. | |
Классификация вирусов  | |
| (без рейтинга): | Вирус |
| Область : | Рибовирия |
| Королевство: | Орторнавиры |
| Тип: | Негарнавирикота |
| Сорт: | Монхивирицетес |
| Заказ: | Мононегавирусы |
| Семья: | Рабдовирусиды |
| Род: | Лиссавирус |
| Разновидность | |
| |
Лиссавирус (от греческого λύσσα lyssa «ярость, ярость, бешенство» и латинского вируса ) [1] [2] — род РНК-вирусов семейства Rhabdoviridae , порядка Mononegavirales . Млекопитающие, включая человека, могут служить естественными хозяевами . [3] [4] Род Lyssavirus включает возбудителя ( вирус бешенства ) бешенства . [5]
Таксономия
[ редактировать ]Вирусология
[ редактировать ]Структура
[ редактировать ]Лиссавирионы имеют оболочку и имеют пулевидную форму. Эти вирионы имеют ширину около 75 нм и длину 180 нм. [3] Лиссавирионы обладают спиральной симметрией, поэтому их инфекционные частицы имеют примерно цилиндрическую форму. Это типично для вирусов, поражающих растения. Вирионы вирусов, инфицирующих человека, чаще имеют кубическую симметрию и принимают форму, приближающуюся к правильным многогранникам . [ нужна ссылка ]
Структура состоит из шипованной внешней оболочки , средней области, состоящей из матриксного белка М, и внутренней области рибонуклеокапсидного комплекса, состоящей из генома, связанного с другими белками. [ нужна ссылка ]
Геном
[ редактировать ]лиссавирусов Геномы состоят из одноцепочечной молекулы РНК с отрицательным смыслом , которая кодирует пять вирусных белков: полимеразу L, матричный белок M, фосфопротеин P, нуклеопротеин N и гликопротеин G. Геномы линейные, длиной около 11 КБ. [3]
На основании недавних филогенетических данных лиссавирусы были разделены на семь основных видов . Кроме того, недавно были обнаружены еще пять видов: вирус западно-кавказских летучих мышей, вирус Араван, вирус Худжанд, вирус Иркут и вирус летучих мышей Шимони. [8] [9] Род лиссавирусов можно разделить на четыре филогруппы на основании гомологии последовательностей ДНК. Филогруппа I включает вирусы, такие как вирус бешенства, вирус Дювенхаге, лиссавирус европейских летучих мышей типов 1 и 2, лиссавирус австралийских летучих мышей, вирус Худжанд, лиссавирус летучих мышей Бокело, вирус Иркут и вирус Араван. Филогруппа II содержит вирус летучих мышей Лагос, вирус Мокола и вирус летучих мышей Шимони. Лиссавирус западнокавказских летучих мышей — единственный вирус, входящий в филогруппу III. Лиссавирус Ikoma и лиссавирус летучей мыши Lleida являются примерами филогруппы IV. Лиссавирус летучих мышей Западного Кавказа был отнесен к отдельной филогруппе, поскольку это наиболее дивергентный лиссавирус из всех обнаруженных. [10]
| Род | Структура | Симметрия | Капсид | Геномное расположение | Геномная сегментация |
|---|---|---|---|---|---|
| Лиссавирус | Пулеобразный | обернутый | Линейный | Однодольный |
Эволюция
[ редактировать ]Филогенетические исследования показывают, что первоначальными хозяевами этих вирусов были летучие мыши. [11] Однако недавнее открытие последовательностей лиссавирусов у амфибий и рептилий ставит под сомнение происхождение лиссавирусов у млекопитающих. [12] [13] Большее антигенное разнообразие лиссавирусов из Африки привело к предположению, что Африка является источником этих вирусов. Вместо этого исследование 153 вирусов, собранных в период с 1956 по 2015 год из различных географических мест, предположило палеарктическое происхождение этих вирусов (вероятность 85%). [14] Оценки дат (вероятность 95%) для самого последнего общего предка были очень широкими – между 3995 и 166 820 годами ранее, – что предполагает дальнейшую работу в этой области. Хотя летучие мыши эволюционировали в Палеарктике, [15] их происхождение предшествует происхождению лиссавирусов на миллионы лет, что свидетельствует против их совместного видообразования. Скорость эволюции гена N в линии Африки 2 оценивается в 3,75×10. −3 замен на сайт в год. [16] Эта скорость аналогична скорости других РНК-вирусов.
Жизненный цикл
[ редактировать ]Репликация вируса цитоплазматическая. Проникновение в клетку-хозяина достигается путем прикрепления вирусных G-гликопротеинов к рецепторам хозяина, что опосредует клатрин-опосредованный эндоцитоз . Репликация соответствует модели репликации вируса с отрицательной цепью РНК. Транскрипция вируса с отрицательной цепью РНК с использованием заикания полимеразы - это метод транскрипции. Вирус покидает клетку-хозяина путем почкования и движения вируса по канальцам.Дикие млекопитающие, особенно летучие мыши и некоторые хищники, служат естественными хозяевами. Пути передачи обычно происходят через укушенные раны. [3]
| Род | Сведения о хосте | Тканевой тропизм | Детали входа | Подробности выпуска | Сайт репликации | Монтажный участок | Передача инфекции |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Лиссавирус | летучие мыши, землеройки Crocidura и некоторые хищники. | Нейроны | Клатрин-опосредованный эндоцитоз | зарождающийся | Цитоплазма | Цитоплазма | Укушенные раны |
Тестирование
[ редактировать ]По состоянию на 2018 год тест на прямые флуоресцентные антитела (DFA) по-прежнему остается золотым стандартом для выявления лиссавирусной инфекции. С начала нового тысячелетия были разработаны тесты ПЦР с обратной транскрипцией (ОТ-ПЦР) на бешенство, но они использовались только в качестве подтверждающего теста. Тесты на основе ПЦР в реальном времени , которые имеют более высокую чувствительность и объективные диагностические пороги и позволяют хранить образцы при комнатной температуре, являются многообещающими с 2005 года, но требуют аппарата для ПЦР в реальном времени и квалифицированных работников с опытом молекулярной диагностики. По данным международной оценки, один анализ TaqMan LN34 позволил обнаружить лиссавирус с высокой чувствительностью (99,90%) по всему роду и высокой специфичностью (99,68%) по сравнению с тестом DFA. Там, где это возможно, он станет основным посмертным диагностическим тестом на бешенство. [17]
Эпидемиология
[ редактировать ]Классический вирус бешенства распространен на большей части мира и может переноситься любым теплокровным млекопитающим. Остальные лиссавирусы имеют гораздо меньшее разнообразие носителей. Только избранные хозяева могут переносить каждый из этих видов вирусов . Кроме того, эти другие виды характерны только для определенной географической области. Известно, что летучие мыши являются животными -переносчиками всех идентифицированных лиссавирусов, за исключением вируса Мокола . [18]
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ λύσσα . Лидделл, Генри Джордж ; Скотт, Роберт ; Греко-английский лексикон в проекте «Персей» .
- ^ вирус . Чарльтон Т. Льюис и Чарльз Шорт. Латинский словарь по проекту «Персей» .
- ^ Перейти обратно: а б с д «Вирусная зона» . ЭксПАСи . Проверено 15 июня 2015 г.
- ^ ICTV. «Таксономия вирусов: выпуск 2014 г.» . Проверено 15 июня 2015 г.
- ^ «Вирус – Аннотированная классификация» . Британника . 18 июня 2024 г.
- ^ Афонсо К.Л., Амарасингхе Г.К., Баньяй К., Бао Ю., Баслер К.Ф., Бавари С. и др. (август 2016 г.). обновление» «Таксономия отряда Mononegavirals : . Архивы вирусологии 161 (8): 2351–2360. дои : 10.1007/ s00705-016-2880-1 ПМЦ 4947412 . ПМИД 27216929 .
- ^ «Род: Лиссавирус » . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) . Проверено 18 декабря 2018 г. [ мертвая ссылка ]
- ^ Таксономия вирусов: выпуск 2013 г. . ictvonline.org
- ^ Кузьмин И.В., Хьюз Г.Дж., Ботвинкин А.Д., Орчиари Л.А., Рупрехт К.Э. (июль 2005 г.). «Филогенетические взаимоотношения вирусов иркутских и западнокавказских летучих мышей внутри рода Lyssavirus и предложенные количественные критерии, основанные на последовательности гена N, для определения генотипа лиссавируса» . Вирусные исследования . 111 (1): 28–43. doi : 10.1016/j.virusres.2005.03.008 . ПМИД 15896400 .
- ^ Гулд А.Р., Каттенбелт Дж.А., Гамли С.Г., Лант Р.А. (октябрь 2002 г.). «Характеристика варианта лиссавируса австралийской летучей мыши, выделенного от насекомоядной летучей мыши». Вирусные исследования . 89 (1): 1–28. дои : 10.1016/s0168-1702(02)00056-4 . ПМИД 12367747 .
- ^ Баньярд AC, Хейман Д., Джонсон Н., МакЭлхинни Л., Фукс А.Р. (2011). «Летучие мыши и лиссавирусы». Достижения в области исследования вирусов . 79 : 239–289. дои : 10.1016/B978-0-12-387040-7.00012-3 . ISBN 978-0-12-387040-7 . ПМИД 21601050 .
- ^ Оберхубер М., Шопф А., Хенрих А.А., Сантос-Мандуджано Р., Хун А.Г., Зейтц С., Ридель С., Конзельманн К.К. (сентябрь 2021 г.). «Гликопротеины предсказанных лиссавирусов амфибий и рептилий могут опосредовать инфекцию клеток млекопитающих и рептилий» . Вирусы . 13 (9): 1726. doi : 10.3390/v13091726 . ПМЦ 8473393 . ПМИД 34578307 .
- ^ Хорие М., Акаши Х., Кавата М., Томонага К. (1 февраля 2021 г.). «Идентификация лиссавируса рептилий у Anolis allogus дала новое представление об эволюции лиссавируса». Гены вирусов . 57 (1): 40–49. дои : 10.1007/s11262-020-01803-y . ПМИД 33159637 . S2CID 226276694 .
- ^ Хейман Д.Т., Фукс А.Р., Марстон Д.А., Гарсия-Р. Дж.К. (декабрь 2016 г.). «Глобальная филогеография лиссавирусов - оспаривание гипотезы« выхода из Африки »» . PLOS Забытые тропические болезни . 10 (12): e0005266. дои : 10.1371/journal.pntd.0005266 . ПМК 5231386 . ПМИД 28036390 .
- ^ Тилинг Э.К., Спрингер М.С., Мэдсен О., Бейтс П., О'Брайен С.Дж., Мерфи В.Дж. (январь 2005 г.). «Молекулярная филогения летучих мышей проливает свет на биогеографию и летопись окаменелостей». Наука . 307 (5709): 580–584. Бибкод : 2005Sci...307..580T . дои : 10.1126/science.1105113 . ПМИД 15681385 . S2CID 25912333 .
- ^ Хэ В., Чжан Х., Чжан Ю., Ван Р., Лу С., Цзи Ю. и др. (октябрь 2017 г.). «Смещение использования кодонов в гене N вируса бешенства». Инфекция, генетика и эволюция . 54 : 458–465. дои : 10.1016/j.meegid.2017.08.012 . ПМИД 28818621 .
- ^ Гиганте CM, Деттингер Л., Пауэлл Дж.В., Сейдерс М., Кондори Р.Э., Гриссер Р. и др. (16 мая 2018 г.). «Многоцентровая оценка пан-лиссавирусного анализа RT-PCR в реальном времени для посмертной диагностики бешенства» . ПЛОС ОДИН . 13 (5): e0197074. Бибкод : 2018PLoSO..1397074G . дои : 10.1371/journal.pone.0197074 . ПМЦ 5955534 . ПМИД 29768505 .
- ^ Составление карт ВОЗ Rabnet/CDC (2008 г.). «Бешенство, страны или районы риска» . Всемирная организация здравоохранения. Архивировано из оригинала 9 октября 2010 года.
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Ботвинкин А.Д., Полещук Е.М., Кузьмин И.В., Борисова Т.И., Газарян С.В., Ягер П., Рупрехт К.Э. (декабрь 2003 г.). «Новые лиссавирусы, выделенные от летучих мышей в России» . Новые инфекционные заболевания . 9 (12): 1623–1625. дои : 10.3201/eid0912.030374 . ПМК 3034350 . ПМИД 14720408 .
- Арай Ю.Т., Кузьмин И.В., Камеока Ю., Ботвинкин А.Д. (март 2003 г.). «Новый генотип лиссавируса малой мышеухой летучей мыши (Myotis blythi), Кыргызстан» . Новые инфекционные заболевания . 9 (3): 333–337. дои : 10.3201/eid0903.020252 . ПМЦ 2958534 . ПМИД 12643828 .
- Всемирная организация здравоохранения (2005). Консультация экспертов ВОЗ по бешенству (PDF) . Серия технических докладов ВОЗ. Женева, Швейцария: Всемирная организация здравоохранения. ISBN 978-92-4-120931-1 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]