Амальгавирусиды
| Амальгавирусиды | |
|---|---|
Классификация вирусов 
| |
| (без рейтинга): | Вирус |
| Область : | Рибовирия |
| Королевство: | Орторнавиры |
| Тип: | Писувирикота |
| Сорт: | Дуплопивирицеты |
| Заказ: | дурнавиралес |
| Семья: | Амальгавирусиды |
| Роды | |
Amalgaviridae — семейство вирусов с двухцепочечной РНК . Членские вирусы заражают растения и передаются вертикально через семена . [ 1 ] Название происходит от слова «амальгама» (смесь, смесь), которое относится к амальгавирусам, обладающим характеристиками как партитивирусов , так и тотивирусов . [ 1 ] [ 2 ] В семействе десять видов. [ 3 ]
Геном
[ редактировать ]Геномы амальгавирусов однодольные около 3,5 тысяч оснований . и имеют длину [ 2 ] [ 4 ] Они имеют две частично перекрывающиеся открытые рамки считывания , которые кодируют РНК-зависимую РНК-полимеразу (RdRp) и предполагаемый капсидный белок. [ 2 ] [ 5 ]
Эволюция
[ редактировать ]Было высказано предположение, что амальгавирусы возникли в результате рекомбинации вирусов с геномами двухцепочечной и отрицательной РНК. [ 6 ] Филогенетический анализ показывает, что амальгавирус RdRp образует сестринскую кладу соответствующего белка RdRp партитивирусов ( Partitiviridae ), которые имеют сегментированные (двудольные) геномы дцРНК и заражают растения, грибы и протистов. [ 1 ] [ 2 ] [ 4 ] [ 6 ] Напротив, предполагаемый капсидный белок амальгавирусов гомологичен нуклеокапсидным белкам РНК-вирусов с отрицательной цепью родов Phlebovirus ( Banyaviridae ) и Tenuivirus . [ 6 ]
Таксономия
[ редактировать ]Семейство Amalgaviridae насчитывает два рода и десять видов: [ 3 ]
- Чесночно-луковая амальгама 1
- Чесночно-луковая амальгама 2
- Латентный вирус черники [ 1 ]
- Вирус рододендрона А [ 4 ]
- Южный томатный вирус [ 2 ]
- Шпинатный амальгавирус 1
- Криптический вирус Vicia M [ 5 ]
- Амальгавирус Zoostera marina 1
- Амальгавирус Zoostera Marina 2
Ссылки
[ редактировать ]
- ^ Jump up to: а б с д Мартин, РР; Чжоу, Дж; Цанетакис, И.Э. (2011). «Латентный вирус черники: смесь Partitiviridae и Totiviridae». Вирусные исследования . 155 (1): 175–80. doi : 10.1016/j.virusres.2010.09.020 . ПМИД 20888379 .
- ^ Jump up to: а б с д и Сабанадзович, С; Вальверде, РА; Браун, Дж. К.; Мартин, РР; Цанетакис, И.Э. (2009). «Вирус южного томата: связь между семействами Totiviridae и Partitiviridae». Вирусные исследования . 140 (1–2): 130–7. doi : 10.1016/j.virusres.2008.11.018 . ПМИД 19118586 .
- ^ Jump up to: а б «Таксономия» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) . Проверено 21 марта 2020 г.
- ^ Jump up to: а б с Сабанадзович, С; Абу Ганем-Сабанадзович, Н; Вальверде, РА (2010). «Новый однодольный вирус дцРНК из рододендрона». Архив вирусологии . 155 (11): 1859–63. дои : 10.1007/s00705-010-0770-5 . ПМИД 20721591 . S2CID 13303861 .
- ^ Jump up to: а б Лю, В; Чен, Дж (2009). «Двухцепочечная РНК как геном потенциального вируса, инфицирующего Vicia faba». Гены вирусов . 39 (1): 126–31. дои : 10.1007/s11262-009-0362-1 . ПМИД 19472044 . S2CID 10806942 .
- ^ Jump up to: а б с Крупович М., Доля В.В., Кунин Е.В. (2015). «Растительные вирусы семейства Amalgaviridae эволюционировали путем рекомбинации вирусов с геномами двухцепочечной и отрицательной РНК» . Биол Директ . 10 (1): 12. дои : 10.1186/s13062-015-0047-8 . ПМЦ 4377212 . ПМИД 25886840 .