геномовирусы

геномовирусы
Классификация вирусов
(без рейтинга):	Вирус
Область :	Моноднавирия
Королевство:	Шотокувираэ
Тип:	Крессднавирикота
Сорт:	Репенсивирицеты
Заказ:	Геплафувирусы
Семья:	геномовирусы

Genomoviridae — семейство одноцепочечных ДНК-содержащих вирусов , которые в основном поражают грибы . ^{[ 1 ]} Геномы этого семейства небольшие (2,2–2,4 тыс. п.н. в длину). Геномы представляют собой кольцевую одноцепочечную ДНК и кодируют белки инициации репликации по вращающемуся кругу (Rep) и уникальные капсидные белки . В филогениях, основанных на Rep, геномовирусы образуют сестринскую кладу вирусов растений семейства Geminiviridae . ^{[ 2 ]}^{[ 3 ]} В этом семействе выделяют десять родов. ^{[ 4 ]}^{[ 5 ]}

Фамилия представляет собой аббревиатуру, полученную от ge -минивирусоподобного без движения белка . ^{[ 2 ]}

Название рода Gemycircularvirus означает Gemini-подобный микоинфицирующий кольцевой вирус. ^{[ 6 ]}^{[ 7 ]} Типовой вид рода Gemycircularvirus — Sclerotinia gemycircularvirus 1 , эталонный штамм Sclerotinia sclerotiorum, связанный с гиповирулентностью ДНК-вируса 1 (ssHADV-1), — был первым культивируемым представителем семейства. ^{[ 2 ]}^{[ 5 ]} Большинство других геномовирусов не культивируются и были обнаружены с использованием методов метагеномики, хотя по мере роста интереса к ним выделяется все больше геномовирусов. ^{[ 1 ]}^{[ 3 ]}^{[ 8 ]}

Таксономия

Роды этого семейства: ^{[ 4 ]}

Вирусология

Эти вирусы имеют кольцевые одноцепочечные геномы длиной 2,1–2,2 тыс. нуклеотидов. Все геномовириды, кроме одного, содержат моночастные геномы, тогда как геном гемитрипвируса 1 Fusarium graminearum (род Gemytripvirus ) состоит из трех сегментов. ^{[ 1 ]} Однодольные геномы кодируют два белка — белок Rep (репликатор) и белок CP (капсид). Белок Rep наиболее близок к белку Rep Geminiviridae . Напротив, белок CP не имеет известных гомологов. ^{[ нужна ссылка ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с Ли П, Ван С, Чжан Л, Цю Д, Чжоу Х, Го Л (апрель 2020 г.). «Трёхчастный миковирус оцДНК фитопатогенного гриба заразен как клонированная ДНК и очищенные вирионы» . Достижения науки . 6 (14): eaay9634. Бибкод : 2020SciA....6.9634L . дои : 10.1126/sciadv.aay9634 . ПМЦ 7138691 . ПМИД 32284975 . S2CID 215746433 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Крупович М., Габриал С.А., Цзян Д., Варсани А. (сентябрь 2016 г.). «Геномовирусы: новое семейство широко распространенных одноцепочечных ДНК-вирусов» . Архив вирусологии . 161 (9): 2633–2643. дои : 10.1007/s00705-016-2943-3 . ПМИД 27343045 .
^ Jump up to: ^а ^б Варсани А., Крупович М. (январь 2017 г.). «Таксономическая основа на основе последовательностей для классификации некультивируемых одноцепочечных ДНК-вирусов семейства Genomoviridae » . Эволюция вирусов . 3 (1): vew037. дои : 10.1093/ve/vew037 . ПМЦ 5399927 . ПМИД 28458911 .
^ Jump up to: ^а ^б «Таксономия вирусов: выпуск 2020 г.» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Март 2021 года . Проверено 13 мая 2021 г.
^ Jump up to: ^а ^б Варсани А., Крупович М. (октябрь 2021 г.). «Семейство Genomoviridae: обновление таксономии 2021 года» . Архив вирусологии . 166 (10): 2911–2926. дои : 10.1007/s00705-021-05183-y . ПМИД 34331585 .
^ Розарио К., Даярам А., Маринов М., Уэр Дж., Крабергер С., Стейнтон Д. и др. (декабрь 2012 г.). «Различные вирусы с кольцевой оцДНК обнаружены у стрекоз (Odonata: Epiprocta)» . Журнал общей вирусологии . 93 (Часть 12): 2668–2681. дои : 10.1099/vir.0.045948-0 . ПМИД 22915694 .
^ Ю Х, Ли Б, Фу Ю, Цзян Д, Габриал С.А., Ли Г и др. (май 2010 г.). «ДНК-миковирус, родственный геминивирусу, который придает гиповирулентность патогенному грибу растений» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 107 (18): 8387–8392. Бибкод : 2010PNAS..107.8387Y . дои : 10.1073/pnas.0913535107 . ПМЦ 2889581 . ПМИД 20404139 .
^ Фэн С., Фэн Дж., Ван З., Педерсен С., Ван Х., Салим Х. и др. (август 2021 г.). «Идентификация вирусной детерминанты гиповирулентности и круга хозяев в Sclerotiniaceae геномовируса, реконструированного из метагенома растений» . Журнал вирусологии . 95 (17): e0026421. дои : 10.1128/jvi.00264-21 . ПМЦ 8354332 . ПМИД 34132570 .

[Wang-1] Jump up to: ^а ^б ^с Ли П, Ван С, Чжан Л, Цю Д, Чжоу Х, Го Л (апрель 2020 г.). «Трёхчастный миковирус оцДНК фитопатогенного гриба заразен как клонированная ДНК и очищенные вирионы» . Достижения науки . 6 (14): eaay9634. Бибкод : 2020SciA....6.9634L . дои : 10.1126/sciadv.aay9634 . ПМЦ 7138691 . ПМИД 32284975 . S2CID 215746433 .

[Genomo-2] Jump up to: ^а ^б ^с Крупович М., Габриал С.А., Цзян Д., Варсани А. (сентябрь 2016 г.). «Геномовирусы: новое семейство широко распространенных одноцепочечных ДНК-вирусов» . Архив вирусологии . 161 (9): 2633–2643. дои : 10.1007/s00705-016-2943-3 . ПМИД 27343045 .

[Genomo2-3] Jump up to: ^а ^б Варсани А., Крупович М. (январь 2017 г.). «Таксономическая основа на основе последовательностей для классификации некультивируемых одноцепочечных ДНК-вирусов семейства Genomoviridae » . Эволюция вирусов . 3 (1): vew037. дои : 10.1093/ve/vew037 . ПМЦ 5399927 . ПМИД 28458911 .

[ictv-4] Jump up to: ^а ^б «Таксономия вирусов: выпуск 2020 г.» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Март 2021 года . Проверено 13 мая 2021 г.

[:0-5] Jump up to: ^а ^б Варсани А., Крупович М. (октябрь 2021 г.). «Семейство Genomoviridae: обновление таксономии 2021 года» . Архив вирусологии . 166 (10): 2911–2926. дои : 10.1007/s00705-021-05183-y . ПМИД 34331585 .

[Rosario2012-6] Розарио К., Даярам А., Маринов М., Уэр Дж., Крабергер С., Стейнтон Д. и др. (декабрь 2012 г.). «Различные вирусы с кольцевой оцДНК обнаружены у стрекоз (Odonata: Epiprocta)» . Журнал общей вирусологии . 93 (Часть 12): 2668–2681. дои : 10.1099/vir.0.045948-0 . ПМИД 22915694 .

[Yu2010-7] Ю Х, Ли Б, Фу Ю, Цзян Д, Габриал С.А., Ли Г и др. (май 2010 г.). «ДНК-миковирус, родственный геминивирусу, который придает гиповирулентность патогенному грибу растений» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 107 (18): 8387–8392. Бибкод : 2010PNAS..107.8387Y . дои : 10.1073/pnas.0913535107 . ПМЦ 2889581 . ПМИД 20404139 .

[8] Фэн С., Фэн Дж., Ван З., Педерсен С., Ван Х., Салим Х. и др. (август 2021 г.). «Идентификация вирусной детерминанты гиповирулентности и круга хозяев в Sclerotiniaceae геномовируса, реконструированного из метагенома растений» . Журнал вирусологии . 95 (17): e0026421. дои : 10.1128/jvi.00264-21 . ПМЦ 8354332 . ПМИД 34132570 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]