сековирусы

сековирусы
	Структура вируса мозаики вигны на основе PDB 2BFU
Классификация вирусов
(без рейтинга):	Вирус
Область :	Рибовирия
Королевство:	Орторнавиры
Тип:	Писувирикота
Сорт:	Пизонивирицеты
Заказ:	Пикорнавирусы
Семья:	сековирусы
Роды
	Посмотреть текст

Secoviridae — семейство вирусов отряда Picornavirales . Растения служат естественными хозяевами. В этом семействе 8 родов и 86 видов, один из которых не отнесен к роду. ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]}^{[ 3 ]}^{[ 4 ]} Семейство было создано в 2009 году из группировки семейств Sequiviridae , ныне распавшихся, и Comoviridae , ныне подсемейства Comovirinae , а также неназначенных тогда родов Cheravirus , Sadwavirus и Torradovirus . ^{[ 4 ]}

Таксономия

Семейство включает следующие роды (-virinae обозначает подсемейство и -virus обозначает род): ^{[ 4 ]}

Комовирины
- Комовирус
- Неповирус
- Фабавирус
Не назначено подсемейству:

Структура

Вирусы Secoviridae не имеют оболочки, имеют икосаэдрическую геометрию и симметрию T = псевдо3. Диаметр составляет около 25-30 нм. Геномы линейные и сегментированные, двудольные, длиной около 24-7 т.п.н. ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]}^{[ 3 ]}

Род	Структура	Симметрия	Капсид	Геномное расположение	Геномная сегментация
Секвивирус	икосаэдрический	Псевдо Т=3	Без конверта	Линейный	Однодольный
Садвавирус	икосаэдрический	Псевдо Т=3	Без конверта	Линейный	Сегментированный
Неповирус	икосаэдрический	Псевдо Т=3	Без конверта	Линейный	Сегментированный
Фабавирус	икосаэдрический	Псевдо Т=3	Без конверта	Линейный	Сегментированный
Комовирус	икосаэдрический	Псевдо Т=3	Без конверта	Линейный	Сегментированный
Черавирус	икосаэдрический	Псевдо Т=3	Без конверта	Линейный	Сегментированный
Торрадовирус	икосаэдрический	Псевдо Т=3	Без конверта	Линейный	Сегментированный
Вайкавирус	икосаэдрический	Псевдо Т=3	Без конверта	Линейный	Однодольный

Жизненный цикл

Репликация вируса цитоплазматическая. Вход в клетку-хозяина достигается путем проникновения в клетку-хозяина. Репликация соответствует модели репликации вируса с положительной многоцепочечной РНК. Транскрипция вируса с положительной цепью РНК - это метод транскрипции. Вирус покидает клетку-хозяина путем перемещения вируса по канальцам. Растения служат естественным хозяином. Пути передачи механические. ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]}^{[ 3 ]}

Род	Сведения о хосте	Тканевой тропизм	Детали входа	Подробности выпуска	Сайт репликации	Монтажный участок	Передача инфекции
Секвивирус	Растения	Никто	Вирусное движение; механическая инокуляция	Вирусное движение	Цитоплазма	Цитоплазма	Механическая инокуляция: тля; Механическая инокуляция: Cavariella aegopodii; Механическая инокуляция: Cavariella Pastinacae.
Садвавирус	Растения	Никто	Вирусное движение; механическая инокуляция	Вирусное движение	Цитоплазма	Цитоплазма	нематоды; клещи; трипсы
Неповирус	Растения	Никто	Вирусное движение; механическая инокуляция	Вирусное движение	Цитоплазма	Цитоплазма	нематоды; клещи; трипсы
Фабавирус	Растения	Никто	Вирусное движение; механическая инокуляция	Вирусное движение	Цитоплазма	Цитоплазма	Механическая инокуляция: тля
Комовирус	Растения	Никто	Вирусное движение; механическая инокуляция	Вирусное движение	Цитоплазма	Цитоплазма	Механическая прививка: жуки
Черавирус	Растения	Никто	Вирусное движение; механическая инокуляция	Вирусное движение	Цитоплазма	Цитоплазма	нематоды; клещи; трипсы
Торрадовирус	Растения	Никто	Вирусное движение; механическая инокуляция	Вирусное движение	Цитоплазма	Цитоплазма	Неизвестный
Вайкавирус	Трава	Флоэма; флоэмная паренхима; пучок оболочек	Вирусное движение	Вирусное движение	Цитоплазма	Цитоплазма	Механическая инокуация: тля; механическая инокуация: цикадки

Эволюция

Подсемейство Comovirinae возникло примерно 1000 лет назад, а современные виды появились между 50 и 250 годами назад. ^{[ 5 ]} Этот период времени совпадает с интенсификацией сельскохозяйственной практики в индустриальных обществах. ^{[ нужна ссылка ]}

Частота мутаций оценивается в 9,29 × 10. ⁻³ до 2,74×10 ⁻³ подписки/сайт/год. ^{[ нужна ссылка ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с Томпсон-младший; Дасгупта, я; Фукс, М; Иванами, Т; Карасев А.В.; Петрзик, К; Санфасон, Х; Цанетакис, И; ван дер Влугт, Р.; Ветцель, Т; Ёсикава, Н.; Консорциум отчетов ICTV (апрель 2017 г.). «Профиль таксономии вирусов ICTV: Secoviridae» . Журнал общей вирусологии . 98 (4): 529–531. дои : 10.1099/jgv.0.000779 . ПМК 5657025 . ПМИД 28452295 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с «Сековиридиды» . ICTV Online (10-й) репортаж .
^ Jump up to: ^а ^б ^с «Вирусная зона» . ЭксПАСи . Проверено 15 июня 2015 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с «Таксономия вирусов: выпуск 2020 г.» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Март 2021 года . Проверено 20 мая 2021 г.
^ Томпсон-младший; Камат, Н; Перри, КЛ (2014). «Эволюционный анализ вирусов семейства сековирусов» . ПЛОС ОДИН . 9 (9): е106305. Бибкод : 2014PLoSO...9j6305T . дои : 10.1371/journal.pone.0106305 . ПМЦ 4152289 . ПМИД 25180860 .

Внешние ссылки

ICTV Online (10th) Report: Secoviridae
Вирусная зона : сековирусы.
Таксономия UniProt [1]

[ICTVProfile-1] Jump up to: ^а ^б ^с Томпсон-младший; Дасгупта, я; Фукс, М; Иванами, Т; Карасев А.В.; Петрзик, К; Санфасон, Х; Цанетакис, И; ван дер Влугт, Р.; Ветцель, Т; Ёсикава, Н.; Консорциум отчетов ICTV (апрель 2017 г.). «Профиль таксономии вирусов ICTV: Secoviridae» . Журнал общей вирусологии . 98 (4): 529–531. дои : 10.1099/jgv.0.000779 . ПМК 5657025 . ПМИД 28452295 .

[ICTVReport-2] Jump up to: ^а ^б ^с «Сековиридиды» . ICTV Online (10-й) репортаж .

[ViralZone-3] Jump up to: ^а ^б ^с «Вирусная зона» . ЭксПАСи . Проверено 15 июня 2015 г.

[ictv-4] Jump up to: ^а ^б ^с «Таксономия вирусов: выпуск 2020 г.» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Март 2021 года . Проверено 20 мая 2021 г.

[Thompson2014-5] Томпсон-младший; Камат, Н; Перри, КЛ (2014). «Эволюционный анализ вирусов семейства сековирусов» . ПЛОС ОДИН . 9 (9): е106305. Бибкод : 2014PLoSO...9j6305T . дои : 10.1371/journal.pone.0106305 . ПМЦ 4152289 . ПМИД 25180860 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]