Ленарвирикота
Ленарвирикота | |
---|---|
![]() | |
ТЕМ типа Lenarviricota вирионов : вирус дыни Ourmia (слева); нарнавирусы и митовирусы не имеют капсида и оболочки (справа); бактериофаги Qbeta, прикрепленные к ворсинкам E. coli (внизу) | |
Классификация вирусов ![]() | |
(без рейтинга): | Вирус |
Область : | Рибовирия |
Королевство: | Орторнавиры |
Тип: | Ленарвирикота |
Классы | |
Посмотреть текст |
Lenarviricota — это тип РНК-вирусов , который включает все РНК-вирусы с положительной цепью , которые инфицируют прокариотов . Некоторые представители также заражают эукариотов . Большинство этих вирусов не имеют капсида , за исключением рода Ourmiavirus . [ 1 ] Название группы представляет собой слоговую аббревиатуру названий членов семейств-основателей « Le viviridae и Nar naviridae » с суффиксом -viricota , обозначающим тип вируса . [ 2 ]
Филогенетика
[ редактировать ]Lenarviricota - первая появившаяся ветвь РНК-вирусов, поскольку они являются самой базальной ветвью. [ 1 ] Большинство его представителей, левивирусы (класс Leviviricetes ), заражают только прокариотов, и известный уровень их разнообразия в последние годы резко возрос, что позволяет предположить, что РНК-вирусы могут быть более широко распространены среди прокариот, чем считалось ранее. [ 3 ]
Было высказано предположение, что происхождение Lenarviricota может предшествовать происхождению последнего универсального общего предка (LUCA). [ 3 ] Вирусы Lenarviricota , по-видимому, возникли из первичного RdRP мира РНК-белков , давшего начало левивирусам (класс Leviviricetes ). [ 4 ] Было также высказано предположение, что ретроэлементы клеточной жизни ( интроны группы II и ретротранспозоны ) произошли от общего предка с Lenarviricota . [ 5 ]
Эукариотические РНК-вирусы без капсида — Mitoviridae , Narnaviridae и Botourmiaviridae — возникли из левивирусов с потерей капсида в то время, когда происходил эукариогенез , когда бактериальный эндосимбионт стал митохондриями . Род Ourmiavirus возник в результате рекомбинации некапсидного ботурмиавируса и вируса из семейства Tombusviridae , унаследовавшего его капсидные белки. [ 1 ] [ 4 ]
Таксономия
[ редактировать ]
Признаются следующие классы: [ 6 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с Вольф, Юрий И.; Казлаускас, Дариус; Иранзо, Джеймс; Люсия-Санс, Адриана; Кун, Йенс Х.; Крупович, Март; Доля, Валериан В.; Кунин, Евгений В. (21 декабря 2018 г.). «Происхождение и эволюция глобального РНК-вирома» . мБио 9 (6). дои : 10.1128/mBio.02329-18 . ISSN 2150-7511 . ПМК 6282212 . ПМИД 30482837 .
- ^ Кунин Е.В., Доля В.В., Крупович М., Варсани А., Вольф Ю.И., Ютин Н., Зербини М., Кун Дж.Х. «Предложение: Создать мегатаксономическую структуру, заполняющую все основные таксономические ранги для области рибовирий» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) . Проверено 21 мая 2020 г.
- ^ Jump up to: а б Крупович М., Доля В.В., Кунин Е.В. (14 июля 2020 г.). «LUCA и его комплекс виром» (PDF) . Обзоры природы Микробиология . 18 (11): 661–670. дои : 10.1038/s41579-020-0408-x . PMID 32665595 . S2CID 220516514 . Проверено 16 августа 2020 г. .
- ^ Jump up to: а б Кунин Е.В., Доля В.В. (июнь 2014 г.). «Вирусный мир как эволюционная сеть вирусов и безкапсидных эгоистичных элементов» . Обзоры микробиологии и молекулярной биологии . 78 (2): 278–303. дои : 10.1128/MMBR.00049-13 . ПМК 4054253 . ПМИД 24847023 .
- ^ Заид, Ахмед А.; и др. (8 апреля 2022 г.). «Загадочные и многочисленные морские вирусы, лежащие в основе эволюционного происхождения РНК-вирома Земли» . Наука . 376 (6589): 156–162. Бибкод : 2022Sci...376..156Z . дои : 10.1126/science.abm5847 . ПМЦ 10990476 . ПМИД 35389782 . S2CID 248025736 .
- ^ «Таксономия вирусов: выпуск 2020 г.» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Март 2021 года . Проверено 16 мая 2021 г.