Партивирусиды
| Партивирусиды | |
|---|---|
| |
| КриоЭМ капсида S вируса Penicillium stoloniferum , EMD-5161 [ 1 ] | |
| |
| ПЭМ вируса Penicillium stoloniferum S | |
Классификация вирусов 
| |
| (без рейтинга): | Вирус |
| Область : | Рибовирия |
| Королевство: | Орторнавиры |
| Тип: | Писувирикота |
| Сорт: | Дуплопивирицеты |
| Заказ: | дурнавиралес |
| Семья: | Партивирусиды |
Partitiviridae — семейство вирусов с двухцепочечной РНК . [ 2 ] растения , грибы и простейшие Естественными хозяевами служат . Было высказано предположение, что они также могут заражать бактерии . [ 3 ] Название происходит от латинского partitius, что означает разделенный, и относится к сегментированному геному партитивирусов. В семействе пять родов и 60 видов, 15 из которых не отнесены к роду. [ 4 ] [ 5 ]
Структура
[ редактировать ]
Вирусы семейства Partitiviridae не имеют оболочки, имеют икосаэдрическую геометрию и симметрию T = 1. [ 6 ] Диаметр партитивирусов составляет около 25–43 нм. [ 4 ]
Геном
[ редактировать ]
Партивирусы имеют геномы двухцепочечной РНК, разделенные на два геномных сегмента, а также могут существовать дополнительные субгеномные сегменты. Два сегмента генома упакованы в отдельные вирусные частицы. Они кодируют два отдельных белка. Первый сегмент кодирует РНК-зависимую РНК-полимеразу (RdRp), а второй сегмент кодирует белок оболочки . Длина сегментов составляет около 1,4–3,0 кб, а общая длина генома составляет около 3,0–4,8 кб. [ 4 ] [ 6 ]
Жизненный цикл
[ редактировать ]Репликация вируса цитоплазматическая. Вход в клетку-хозяина достигается путем проникновения в клетку-хозяина. Репликация соответствует модели репликации вируса с двухцепочечной РНК. Транскрипция вируса двухцепочечной РНК - это метод транскрипции. Вирус покидает клетку-хозяина путем перемещения от клетки к клетке. Грибы и растения служат естественным хозяином. [ 4 ] [ 6 ] Крисповирусы поражают апикомплексные простейшие рода Cryptosporidium . [ 7 ] вирусы других родов поражают растения и грибы. Было высказано предположение, что они также могут заражать бактерии.
| Род | Сведения о хосте | Тканевой тропизм | Детали входа | Подробности выпуска | Сайт репликации | Монтажный участок | Передача инфекции |
|---|
Филогенетика
[ редактировать ]По гену РНК-полимеразы эту группу можно разделить на четыре клады (I-IV). [ 8 ] Четыре изолята от животных и простейших образуют пятую кладу. Клады I–IV состоят из смесей партитивирусоподобных последовательностей растений и грибов. [ нужна ссылка ]
Таксономия
[ редактировать ]
имеется пять признанных родов В семействе Partitiviridae . В семействе есть еще пятнадцать видов, не отнесенных к роду: [ 4 ] [ 5 ]
- Загадочный вирус свеклы 1
- Морковный загадочный вирус
- Партитивирус, ассоциированный с хлоротичной ржавой пятнистостью вишни
- Загадочный вирус Chondrostereus purpureum 1
- Вирус побурения Flammulina velutipes
- Вирус Хеликобактер пилори V70
- Гетеробазидион партитивирус 1
- Гетеробазидион партитивирус 3
- Гетеробазидион партитивирус 12
- Гетеробазидион партитивирус 13
- Гетеробазидион партитивирус 15
- Розеллиния некатрикс партитивирус 2
- Криптический вирус Vicia
- Загадочный вирус белого клевера 1
- Вирус гипоксилона Аткинсонелла
- Загадочный вирус каннабиса
- Вирус Ceratocystisresinifera 1
- Загадочный вирус малинового клевера 2
- Загадочный вирус укропа 2
- Вирус фузариоза Poae 1
- Гетеробазидион партитивирус 2
- Гетеробазидион партитивирус 7
- Гетеробазидион партитивирус 8
- Гетеробазидион партитивирус P
- Загадочный вирус трилистника хмеля 2
- Вирус Pleurotus ostreatus 1
- Вирус Primula Malacoides 1
- Загадочный вирус красного клевера 2
- Вирус Rhizoctonia solani 717
- Вирус розеллинии некатрикс 1
- Загадочный вирус белого клевера 2
- Загадочный вирус свеклы 2
- Загадочный вирус свеклы 3
- Фиговый загадочный вирус
- Перцовый загадочный вирус 1
- Перцовый загадочный вирус 2
- Вирус Aspergillus ochraceous
- Разрушительный вирус 1
- Разрушительный вирус 2
- Вирус Fusarium solani 1
- РНК-вирус Gremmeniella abietina MS1
- Партитивирус офиостомы 1
- Вирус Penicillium stoloniferum F
- Вирус Penicillium stoloniferum S
Не отнесен к роду:
- Вирус Agaricus bisporus 4
- Загадочный вирус люцерны 1
- Загадочный вирус гвоздики 1
- Вирус умеренного климата моркови 1
- Вирус умеренного климата моркови 2
- Вирус умеренного климата моркови 3
- Вирус умеренного климата моркови 4
- Вирус травы Gaeumannomyces 0196A
- Вирус травы Gaeumannomyces T1A
- Загадочный вирус трилистника хмеля 1
- Загадочный вирус трилистника хмеля 3
- Вирус желтого края редиса
- Загадочный вирус райграса
- Шпинатный умеренный вирус
- Загадочный вирус белого клевера 3
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Тан, Дж.; Пан, Дж.; Хэвенс, штат Вирджиния; Очоа, ВФ; Гуу, TSY; Габриал, ЮАР ; Ниберт, ML; Тао, Ю.Дж.; Бейкер, Т.С. (2010). «Основной след капсидного белка партитивируса по данным электронной криомикроскопии и моделирования гомологии» . Биофизический журнал . 99 (2): 685–694. Бибкод : 2010BpJ....99..685T . дои : 10.1016/j.bpj.2010.04.058 . ПМК 2905076 . ПМИД 20643089 .
- ^ Вайнио, Э.Дж.; Чиба, С; Габриал, ЮАР; Майсс, Э; Руссинк, М; Сабанадзович, С; Сузуки, Н; Се, Дж; Ниберт, М; Отчет Ictv, Консорциум (январь 2018 г.). «Профиль таксономии вируса ICTV: Partitiviridae» . Журнал общей вирусологии . 99 (1): 17–18. дои : 10.1099/jgv.0.000985 . ПМЦ 5882087 . ПМИД 29214972 .
- ^ Нери Ю, Вольф Й.И., Ру С., Камарго А.П., Казлаускас Д., Мин Чен И., Ли Б., Иванова Н., Аллен Л.З., Паес-Эспино Д., Брайант Д.А., Бхая Д., Крупович М., Доля В.В., Кирпидес Н.К., Кунин Е.В. , Гофна У (17 февраля 2022 г.). «Пятикратное расширение глобального РНК-вирома обнаруживает множество новых клад РНК-бактериофагов». bioRxiv 10.1101/2022.02.15.480533 .
- ^ Jump up to: а б с д и «Онлайн-репортаж ICTV Partitiviridae » .
- ^ Jump up to: а б «Таксономия вирусов: выпуск 2020 г.» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Март 2021 года . Проверено 20 мая 2021 г.
- ^ Jump up to: а б с «Вирусная зона» . ЭксПАСи . Проверено 15 июня 2015 г.
- ^ Ниберт М.Л., Вудс К.М., Аптон С.Дж., Габриал С.А. (2009)Cryspovirus: новый род простейших вирусов семейства Partitiviridae. Арх Вирол 154 (12): 1959–1965.
- ^ Лю Х, Фу Ю, Се Дж, Ченг Дж, Габриал С.А., Ли Г, И Икс, Цзян Д (2012) Открытие новых вирусных последовательностей дцРНК с помощью клонирования in Silico и последствий для вирусного разнообразия, диапазона хозяев и эволюции. ПЛОС Один. 2012;7(7):e42147.