Тристромавирусы

Тристромавирусы
Классификация вирусов
(без рейтинга):	Вирус
Область :	Аднавирия
Королевство:	Зиллигвире
Тип:	Талеавирикота
Сорт:	Токивирицетес
Заказ:	Примавирусы
Семья:	Тристромавирусы

Тристромавирусы — семейство вирусов. ^{[ 1 ]} археи родов Thermoproteus и Pyrobaculum . Естественными хозяевами служат ^{[ 2 ]} Tristromaviridae — единственное семейство в отряде Primavirales . В семействе два рода и три вида. ^{[ 3 ]}

Таксономия

К семейству отнесены следующие роды и виды: ^{[ 3 ]}

Структура

Вирусы рода Tristromaviridae имеют оболочку и палочковидную геометрию. Диаметр составляет около 38 нм, длина 410 нм. Геномы линейные, длиной около 15,9 КБ. Вирион TTV1 содержит четыре кодируемых вирусом белка, TP1-4. ^{[ 2 ]}^{[ 4 ]} Белки не имеют никакого сходства последовательностей со структурными белками вирусов других семейств, включая липотриксвирусы. Нуклеокапсидный белок TP1, по-видимому, произошел от эндонуклеазы Cas4, консервативного компонента адаптивного иммунитета CRISPR-Cas, что представляет собой первый описанный случай экзаптации фермента для функции капсидного белка вируса. ^{[ 5 ]}

Структура вириона с высоким разрешением была определена с помощью крио-ЭМ для нитчатого вируса Pyrobaculum 2 (PFV2), вируса, близкородственного PFV1, который представляет типовой вид. ^{[ 6 ]} Структура показала, что нуклеокапсид образуется из двух основных белков капсида (MCP1 и MCP2). MCP1 и MCP2 образуют гетеродимер, который окружает линейный геном дцДНК, превращая его в А-форму. Взаимодействие генома и MCP приводит к конденсации генома в суперспираль вириона. ^{[ 6 ]} Спиральный нуклеокапсид окружен липидной оболочкой и содержит другие вирусные белки, наиболее распространенным из которых является VP3. ^{[ 7 ]}

Складка MCP, а также организация вирионов тристромавирусов аналогичны таковым у представителей семейств Rudiviridae. ^{[ 8 ]} и липотриксвирусиды , ^{[ 9 ]}^{[ 10 ]} которые вместе составляют отряд Ligamenvirales . Из-за этого структурного сходства порядок Ligamenvirales и семейство Tristromaviridae было предложено объединить в класс Tokiviricetes (токи по-грузински означает «нить», а viricetes является официальным суффиксом класса вирусов). ^{[ 6 ]}

Жизненный цикл

Репликация вируса цитоплазматическая. Проникновение в клетку-хозяина достигается путем адсорбции на ней. Транскрипция с помощью ДНК-матрицы - это метод транскрипции. археи родов Thermoproteus и Pyrobaculum Естественными хозяевами служат . Вирионы высвобождаются путем лизиса. Пути передачи – пассивная диффузия. ^{[ 2 ]}

Ссылки

^ Прангишвили, Д; Ренсен, Э; Мочизуки, Т; Крупович, М; Отчет ICTV, Консорциум (февраль 2019 г.). «Профиль таксономии вируса ICTV: тристромавирусы» . Журнал общей вирусологии . 100 (2): 135–136. дои : 10.1099/jgv.0.001190 . ПМИД 30540248 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с «Тристромавирусиды» . ВиралЗона . Швейцарский институт биоинформатики . Проверено 14 мая 2021 г.
^ Jump up to: ^а ^б «Таксономия вирусов: выпуск 2020 г.» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Март 2021 года . Проверено 14 мая 2021 г.
^ Нойманн, Хорст; Швасс, Волкер; Экерскорн, Кристоф; Зиллиг, Вольфрам (1989). «Идентификация и характеристика генов, кодирующих три структурных белка вируса Thermoproteus tenax TTV1». MGG Молекулярная и общая генетика . 217 (1): 105–110. дои : 10.1007/BF00330948 . ПМИД 2505050 . S2CID 13335423 .
^ Крупович М, Цвиркайте-Крупович В, Прангишвили Д, Кунин ЕВ (2015). «Эволюция нуклеокапсидного белка архейного вируса из CRISPR-ассоциированной нуклеазы Cas4» . Биол Директ . 10 (1): 65. дои : 10.1186/s13062-015-0093-2 . ПМЦ 4625639 . ПМИД 26514828 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Ван, Ф; Бакеро, ДП; Су, З; Осинский, Т; Прангишвили, Д; Эгельман, Э.Х.; Крупович, М. (январь 2020 г.). «Структура нитчатого вируса раскрывает семейные связи внутри виросферы архей» . Эволюция вирусов . 6 (1): veaa023. дои : 10.1093/ve/veaa023 . ПМЦ 7189273 . ПМИД 32368353 .
^ Ренсен, Э.И.; Мочизуки, Т; Кемин, Э; Схаутен, С; Крупович, М; Прангишвили, Д (2016). «Вирус гипертермофильных архей с уникальной архитектурой среди ДНК-вирусов» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 113 (9): 2478–83. Бибкод : 2016PNAS..113.2478R . дои : 10.1073/pnas.1518929113 . ПМЦ 4780613 . ПМИД 26884161 .
^ ДиМайо, Ф; Ю, Х; Ренсен, Э; Крупович, М; Прангишвили, Д; Эгельман, Э.Х. (2015). «Вирусология. Вирус, поражающий гипертермофила, инкапсидирует ДНК А-формы» . Наука . 348 (6237): 914–7. дои : 10.1126/science.aaa4181 . ПМЦ 5512286 . ПМИД 25999507 .
^ Кассон, П; ДиМайо, Ф; Ю, Х; Лукас-Стаат, С; Крупович, М; Схаутен, С; Прангишвили, Д; Эгельман, Э.Х. (2017). «Модель новой мембранной оболочки нитчатого гипертермофильного вируса» . электронная жизнь . 6 . дои : 10.7554/eLife.26268 . ПМК 5517147 . ПМИД 28639939 .
^ Лю, Ю; Осинский, Т; Ван, Ф; Крупович, М; Схаутен, С; Кассон, П; Прангишвили, Д; Эгельман, Э.Х. (2018). «Структурная консервативность нитчатого вируса с мембранной оболочкой, инфицирующего гипертермофильный ацидофил» . Природные коммуникации . 9 (1): 3360. Бибкод : 2018NatCo...9.3360L . дои : 10.1038/s41467-018-05684-6 . ПМК 6105669 . ПМИД 30135568 .

Внешние ссылки

СМИ, связанные с тристромавирусами, на Викискладе?
Отчет ICTV: Тристромавирусы

[ICTV-tristroma-1] Прангишвили, Д; Ренсен, Э; Мочизуки, Т; Крупович, М; Отчет ICTV, Консорциум (февраль 2019 г.). «Профиль таксономии вируса ICTV: тристромавирусы» . Журнал общей вирусологии . 100 (2): 135–136. дои : 10.1099/jgv.0.001190 . ПМИД 30540248 .

[ViralZone-2] Jump up to: ^а ^б ^с «Тристромавирусиды» . ВиралЗона . Швейцарский институт биоинформатики . Проверено 14 мая 2021 г.

[ictv-3] Jump up to: ^а ^б «Таксономия вирусов: выпуск 2020 г.» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Март 2021 года . Проверено 14 мая 2021 г.

[4] Нойманн, Хорст; Швасс, Волкер; Экерскорн, Кристоф; Зиллиг, Вольфрам (1989). «Идентификация и характеристика генов, кодирующих три структурных белка вируса Thermoproteus tenax TTV1». MGG Молекулярная и общая генетика . 217 (1): 105–110. дои : 10.1007/BF00330948 . ПМИД 2505050 . S2CID 13335423 .

[5] Крупович М, Цвиркайте-Крупович В, Прангишвили Д, Кунин ЕВ (2015). «Эволюция нуклеокапсидного белка архейного вируса из CRISPR-ассоциированной нуклеазы Cas4» . Биол Директ . 10 (1): 65. дои : 10.1186/s13062-015-0093-2 . ПМЦ 4625639 . ПМИД 26514828 .

[tristroma-6] Jump up to: ^а ^б ^с Ван, Ф; Бакеро, ДП; Су, З; Осинский, Т; Прангишвили, Д; Эгельман, Э.Х.; Крупович, М. (январь 2020 г.). «Структура нитчатого вируса раскрывает семейные связи внутри виросферы архей» . Эволюция вирусов . 6 (1): veaa023. дои : 10.1093/ve/veaa023 . ПМЦ 7189273 . ПМИД 32368353 .

[Rensen2016-7] Ренсен, Э.И.; Мочизуки, Т; Кемин, Э; Схаутен, С; Крупович, М; Прангишвили, Д (2016). «Вирус гипертермофильных архей с уникальной архитектурой среди ДНК-вирусов» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 113 (9): 2478–83. Бибкод : 2016PNAS..113.2478R . дои : 10.1073/pnas.1518929113 . ПМЦ 4780613 . ПМИД 26884161 .

[8] ДиМайо, Ф; Ю, Х; Ренсен, Э; Крупович, М; Прангишвили, Д; Эгельман, Э.Х. (2015). «Вирусология. Вирус, поражающий гипертермофила, инкапсидирует ДНК А-формы» . Наука . 348 (6237): 914–7. дои : 10.1126/science.aaa4181 . ПМЦ 5512286 . ПМИД 25999507 .

[9] Кассон, П; ДиМайо, Ф; Ю, Х; Лукас-Стаат, С; Крупович, М; Схаутен, С; Прангишвили, Д; Эгельман, Э.Х. (2017). «Модель новой мембранной оболочки нитчатого гипертермофильного вируса» . электронная жизнь . 6 . дои : 10.7554/eLife.26268 . ПМК 5517147 . ПМИД 28639939 .

[10] Лю, Ю; Осинский, Т; Ван, Ф; Крупович, М; Схаутен, С; Кассон, П; Прангишвили, Д; Эгельман, Э.Х. (2018). «Структурная консервативность нитчатого вируса с мембранной оболочкой, инфицирующего гипертермофильный ацидофил» . Природные коммуникации . 9 (1): 3360. Бибкод : 2018NatCo...9.3360L . дои : 10.1038/s41467-018-05684-6 . ПМК 6105669 . ПМИД 30135568 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]