Марсельвирусиды
| Марсельвирусиды | |
|---|---|
Классификация вирусов 
| |
| (без рейтинга): | Вирус |
| Область : | Вариднавирия |
| Королевство: | Бэмфордвире |
| Тип: | Нуклеоцитовирикота |
| Сорт: | Мегавирицеты |
| Заказ: | Пимасковирасы |
| Семья: | Марсельвирусиды |
| Роды | |
Marseilleviridae — семейство вирусов , впервые названное в 2012 году. [ 1 ] Геномы двухцепочечную этих вирусов представляют собой ДНК . Хозяевами часто являются амебы , но есть данные, что они встречаются у человека . и [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ] [ 5 ] Семейство включает один род и четыре вида, два из которых не отнесены к роду. [ 6 ] [ 7 ] Он принадлежит к кладе нуклеоцитоплазматических крупных ДНК-вирусов .
Таксономия
[ редактировать ]Род включает следующие роды и виды: [ 7 ]
- Марсельвирус
- Виды, не отнесенные к роду:
Родственные вирусы
[ редактировать ]
С тех пор были признаны дополнительные виды. [ 1 ] Первый признанный представитель этого семейства был назван Acanthamoeba polyphaga marseillevirus . Второй представитель — Acanthamoeba castellanii lausannevirus . Были выделены еще два вируса, но имена им еще не присвоены. Еще один представитель этого семейства был выделен от доноров крови. [ 4 ] об изоляте насекомых — вирусе инсектомима . Сообщалось также [ 8 ]
Вирусы, по-видимому, делятся как минимум на 3 линии: (1) Marseillevirus и Cannes8virus (2) Insectomime и Tunisvirus и (3) Lausannevirus . Шестой потенциальный член этого семейства — Мельбурнвирус — по-видимому, связан с кладой Marseillevirus / Cannes8virus . [ 9 ]
Сообщается о седьмом вирусе — бразильском марсельском вирусе. [ 10 ] Этот вирус, по-видимому, принадлежит к четвертой линии вирусов этого семейства.
Сообщалось также о другом вирусе — токийском вирусе. [ 11 ]
Еще одним членом этого семейства является Курлавирус. [ 12 ]
В 2017 году было предложено, чтобы семья содержала следующие пять линий: [ 13 ]
Родословная А
Родословная Б
Линия C
Линия Д
Родословная E
Еще одним предполагаемым членом этого семейства является шанхайский марсельвирус . Если этот вирус подтвердится, он будет принадлежать к линии А.
Структура
[ редактировать ]Вирусы Marseilleviridae имеют икосаэдрическую геометрию. Диаметр составляет около 250 нм. Геномы имеют круглую форму, около 372 КБ в длину. В геноме имеется 457 открытых рамок считывания. [ 6 ]
| Род | Структура | Симметрия | Капсид | Геномное расположение | Геномная сегментация |
|---|---|---|---|---|---|
| Неназначенный | Голова-Хвост | Т=16 | Без конверта | Линейный | Однодольный |
| Марсельвирус | икосаэдрический | Круговой |
Жизненный цикл
[ редактировать ]Транскрипция с помощью ДНК-матрицы - это метод транскрипции. Амеба служит естественным хозяином. [ 6 ]
| Род | Сведения о хосте | Тканевой тропизм | Детали входа | Подробности выпуска | Сайт репликации | Монтажный участок | Передача инфекции |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Марсельвирус | Амеба | Никто | Слияние | Лизис | Цитоплазма | Цитоплазма | Диффузия в воде |
Геномика
[ редактировать ]Было обнаружено, что промоторная последовательность — AAATTTT — связана с 55% идентифицированных генов этого вируса. [ 14 ] Большинство этих последовательностей встречаются в нескольких копиях. [ нужна ссылка ]
История
[ редактировать ]Один из первых представителей этого семейства был описан в 2009 году. [ 15 ] Другие члены описаны примерно в то время (2007 г.) и с тех пор были задокументированы. [ 16 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б Колсон, Филипп; Панье, Изабель; Юсуф, Нияз; Фурнус, Гислен; Ла Скола, Бернар; Рауль, Дидье (2012). « Marseilleviridae — новое семейство гигантских вирусов, поражающих амебы» . Архив вирусологии . 158 (4): 915–20. дои : 10.1007/s00705-012-1537-y . ПМИД 23188494 .
- ^ Ла Скола, Бернар (2014). «Взгляд на протистов как на источник патогенных вирусов». Микробный патогенез . 77 : 131–5. дои : 10.1016/j.micpath.2014.09.005 . ПМИД 25218687 .
- ^ Колсон, Филипп; Фанчелло, Лаура; Хименес, Грегори; Армугом, Фабрис; Десюэ, Кристель; Фурнус, Гислен; Юсуф, Нияз; Миллион, Матье; Ла Скола, Бернар; Рауль, Дидье (2013). «Доказательства мегавирома у людей». Журнал клинической вирусологии . 57 (3): 191–200. дои : 10.1016/j.jcv.2013.03.018 . ПМИД 23664726 .
- ^ Jump up to: а б Попгеоргиев, Николай; Бойер, Микаэль; Фанчелло, Лаура; Монтей, Соня; Роберт, Кэтрин; Ривет, Ромен; Наппез, Клод; Азза, Саид; Кьярони, Жак; Рауль, Дидье; Десню, Кристель (2013). «Марсельвирусоподобный вирус, выделенный из крови, сданной бессимптомными людьми» . Журнал инфекционных болезней . 208 (7): 1042–50. дои : 10.1093/infdis/jit292 . ПМИД 23821720 .
- ^ Ахерфи, Сара; Колсон, Филипп; Одоли, Жиль; Наппез, Клод; Ксерри, Люк; Валенси, Одри; Миллион, Матье; Лепиди, Юбер; Костелло, Реджис; Рауль, Дидье (2016). «Марсельвирус при лимфоме: гигант в лимфатическом узле». Ланцет инфекционных заболеваний . 16 (10): с225–е234. дои : 10.1016/S1473-3099(16)30051-2 . ПМИД 27502174 .
- ^ Jump up to: а б с «Вирусная зона» . ЭксПАСи . Проверено 12 августа 2015 г.
- ^ Jump up to: а б «Таксономия вирусов: выпуск 2020 г.» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Март 2021 года . Проверено 22 мая 2021 г.
- ^ Бугалми, Мондер; Панье, Изабель; Ахерфи, Сара; Колсон, Филипп; Рауль, Дидье; Ла Скола, Бернар (2013). «Первая изоляция марсельского вируса у Diptera Syrphidae Eristalis tenax» . Интервирусология . 56 (6): 386–94. дои : 10.1159/000354560 . ПМИД 24157885 .
- ^ Дутре, Дж; Филипп, Н; Абергель, К; Клавери, Ж.-М (2014). «Анализ генома первого представителя Marseilleviridae из Австралии показывает, что большинство его генов способствуют приспособленности вируса» . Журнал вирусологии . 88 (24): 14340–9. дои : 10.1128/JVI.02414-14 . ПМК 4249118 . ПМИД 25275139 .
- ^ Дорнас, Фабио; Ассис, Фелипе; Ахерфи, Сара; Арантес, Талита; Авраам, Джонатан; Колсон, Филипп; Ла Скола, Бернар (2016). «Бразильский марсельвирус является членом-основателем линии семейства Marseilleviridae» . Вирусы . 8 (3): 76. дои : 10.3390/v8030076 . ПМЦ 4810266 . ПМИД 26978387 .
- ^ Такемура, Масахару (2016). «Проект последовательности генома токийского вируса , члена семейства Marseilleviridae, выделенного из реки Аракава в Токио, Япония» . Геномные объявления . 4 (3): e00429–16. doi : 10.1128/genomeA.00429-16 . ПМЦ 4901213 . ПМИД 27284144 .
- ^ Чаттерджи, Анирван; Кондабагил, Киран (2017). «Полная последовательность генома курлавируса, нового члена семейства Marseilleviridae, выделенного в Мумбаи, Индия». Архив вирусологии . 162 (10): 3243–3245. дои : 10.1007/s00705-017-3469-z . ПМИД 28685284 . S2CID 3984074 .
- ^ Фабр Э., Джеди С., Сантини С., Лежандр М., Траучессек М., Клавери Дж. М. и др. (2017). Репликация нумеавируса связана с временным дистанционным контролем ядра хозяина. Нат Коммун 8:15087
- ^ ОЛИВЕЙРА, Грациеле Перейра; ЛИМА, Маурисио Тейшейра; АРАНТЕС, Талита Соуза; АССИС, Фелипе Лопес; РОДРИГЕС, Родриго Араужо Лима; да Фонсека, Флавио Гимарайнш; БОНЖАРДИМ, Клаудио Антонио; КРОН, Эрна Гессен; Колсон, Филипп; Ла Скола, Бернар; Абраао, Йонатас Сантос (2017). «Исследование промоторных последовательностей марсельвирусов выявило удивительное изобилие мотива AAATTTT в межгенных регионах» . Журнал вирусологии . 91 (21): e01088–17. дои : 10.1128/JVI.01088-17 . ПМК 5640848 . ПМИД 28794030 .
- ^ Бойер, М; Ютин, Н; Панье, я; Баррасси, Л; Фурноус, Дж; Эспиноза, Л; Роберт, К; Азза, С; Солнце, С; Россманн, MG; Сюзан-Монти, М; Ла Скола, Б; Кунин Е.В.; Рауль, Д. (2009). «Гигантский марсельский вирус подчеркивает роль амеб как плавильного котла в возникновении химерных микроорганизмов» . Труды Национальной академии наук . 106 (51): 21848–53. Бибкод : 2009PNAS..10621848B . дои : 10.1073/pnas.0911354106 . ПМЦ 2799887 . ПМИД 20007369 .
- ^ Ахерфи, Сара; Ла Скола, Бернар; Панье, Изабель; Рауль, Дидье; Колсон, Филипп (2014). «Расширяющееся семейство Marseilleviridae» . Вирусология . 466–467: 27–37. дои : 10.1016/j.virol.2014.07.014 . ПМИД 25104553 .