Портоглобовирусиды
| Портоглобовирусиды | |
|---|---|
 | |
| портоглобовируса Вирион | |
Классификация вирусов  | |
| (без рейтинга): | Вирус |
| Область : | Вариднавирия (?) |
| Семья: | Портоглобовирусиды |
Portogloboviridae — семейство , дцДНК-вирусов поражающих архей . Это предполагаемое семейство из области Varidnaviria , но ICTV официально называет его вирусом incertae sedis . Вирусы этого семейства относятся к Helvetiavirae . Капсидные белки этих вирусов и их характеристики имеют эволюционное значение для происхождения других вирусов Varidnaviria , поскольку они, по-видимому, сохраняют изначальные признаки. [1]
Описание
[ редактировать ]Вирионы , этого семейства имеют капсид с икосаэдрической геометрией и вирусную оболочку защищающую генетический материал . Диаметр составляет от 83 до 87 нанометров. Геном представляет собой кольцевую дцДНК длиной 20 222 пары оснований. Геном (ОРС), которые расположены близко друг к другу содержит 45 открытых рамок считывания и занимают 89,1% генома. ORF обычно короткие, их средняя длина составляет 103 кодона . Вирионы содержат 10 белков массой от 20 до 32 кДа. Из этих белков 8 кодируют капсид и два — вирусную оболочку, включая один, который представляет собой капсидный белок с вертикальным одиночным желеобразным рулоном (SJR) . Вход в клетку-хозяин осуществляется путем проникновения. Репликация вируса происходит при хронической инфекции без литического цикла . [2]
Вирусы Portogloboviridae вместе с Halopanivirales имеют эволюционное значение в эволюции других вирусов Varidnaviria, поскольку они, по-видимому, являются реликтами того, какими были первые вирусы этой области. Portogloboviridae вместе с Halopanivirales могли заразить последнего универсального общего предка (LUCA) и возникли до этого организма. [1]
Было высказано предположение, что это может быть связано с происхождением вариднавирии следующим образом. [1]
| Вариднавирия |
| ||||||
Таксономия
[ редактировать ]В семействе имеется один род, включающий два вида: [3]
- Альфапортоглобовирус
| Имя | Имя | Сокр. | ГенБанк | REFSEQ |
|---|---|---|---|---|
| Альфапортоглобовирус SPV2 | Полиэдрический вирус сульфобус 2 | СПВ2 | МК064567 | NC_055116 |
| Сульфолобус альфапортоглобовирус 1 | Полиэдрический вирус сульфолобус 1 | СПВ1 | KY780159 | NC_038017 |
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с Крупович М., Доля В.В., Кунин Е.В. (14 июля 2020 г.). «LUCA и ее комплексный виром» . Nat Rev Микробиол . 18 (11): 661–670. дои : 10.1038/s41579-020-0408-x . PMID 32665595 . S2CID 220516514 . Проверено 22 октября 2020 г.
- ^ Лю Ю, Ишино С, Ишино Ю, Пеау-Арноде Г, Крупович М, Прангишвили Д (9 июля 2017 г.). «Новый тип многогранных вирусов, инфицирующих гипертермофильные археи» . Дж Вирол . 91 (13): e00589-17. дои : 10.1128/JVI.00589-17 . ПМЦ 5469268 . ПМИД 28424284 .
- ^ «Таксономия вирусов: выпуск 2022 г.» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) . Март 2023 года . Проверено 20 августа 2023 г.