Гиповирус

Гиповирус
Классификация вирусов
(без рейтинга):	Вирус
Область :	Рибовирия
Королевство:	Орторнавиры
Тип:	Писувирикота
Сорт:	Дуплопивирицеты
Заказ:	дурнавиралес
Семья:	Гиповирусиды
Род:	Гиповирус

Гиповирусы — род вирусов семейства Hypoviridae . ^{[ 1 ]} Грибы служат естественными хозяевами. В этом роде четыре вида. ^{[ 2 ]} Инфекция снижает вирулентность своего паразитического хозяина, что делает его гиперпаразитом, полезным для борьбы с фитофторозом . ^{[ 1 ]}^{[ 3 ]}

Разновидность

Следующие виды признаны Международным комитетом по таксономии вирусов (ICTV), все из которых были обнаружены вместе с Cryphonectria parasitica : ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]}

Существует множество представителей семейства, поражающих другие фитопатогенные грибы, еще не включенные в номенклатуру ICTV. Предложение реорганизует семейство на три рода. ^{[ 4 ]} Неформальное семейство Fusariviridae является сестринской группой. ^{[ 5 ]}

Структура

Диаметр составляет около 50–80 нм. Геномы линейные, длиной около 9–13 КБ. В геноме есть 1 или 2 открытые рамки считывания , называемые OrfA (присутствуют не всегда) и OrfB. ^{[ 1 ]}^{[ 3 ]}

Род	Структура	Симметрия	Капсид	Геномное расположение	Геномная сегментация
Гиповирус	Нет настоящего капсида		Без конверта	Линейный	Однодольный

Геном не содержит структурных белков. Соответственно, вирус не выходит из клетки (см. «жизненный цикл» ниже). Обе открытые рамки считывания CHV1 содержат папаин -подобную протеазу на N-конце , которая автокаталитически расщепляется. OrfA (p69, P10941 ) расщепляется на протеазу p29 C7 и несущественный белок p40. OrfB ( Q04350 ) расщепляется на протеазу p48 C8 и РНК-репликазу — хеликазу . ^{[ 3 ]}

Жизненный цикл

Репликация вируса цитоплазматическая . Репликация соответствует модели репликации вируса с двухцепочечной РНК . Транскрипция вируса двухцепочечной РНК - это метод транскрипции. Вирус покидает клетку-хозяина путем перемещения от клетки к клетке. Грибы служат естественным хозяином. ^{[ 1 ]}^{[ 3 ]}

Род	Сведения о хосте	Тканевой тропизм	Детали входа	Подробности выпуска	Сайт репликации	Монтажный участок	Передача инфекции
Гиповирус	Грибы	Никто	Цитоплазматический обмен; гифальный анастомоз	Цитоплазматический обмен; гифальный анастомоз	Цитоплазма	Цитоплазма	Цитоплазматический обмен; гифальный анастомоз

CHV1 – гиповирулентность фитофтороза каштана.

До 2000 года гиповирус CHV1 был единственным гиповирусом, обнаруженным в Европе. ^{[ 6 ]} Он известен тем, что снижает вирулентность гриба, вызывающего болезнь каштана (т.е. гиповирулентность). ^{[ 7 ]} Cryphonectria parasitica в Азии и вызывает болезнь каштана возник , аскомицетный гриб , ( Castanea spp.). Хотя симптомы легкие у азиатских видов каштанов, которые развивались одновременно с грибком, они очень тяжелые у североамериканских каштанов видов C. dentata , а также у европейского сладкого каштана C. sativa . ^{[ 8 ]} Гиповирус используется для защиты от фитофтороза каштанов в Европе с 1970-х годов. ^{[ 6 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и Сузуки, Н; Габриал, ЮАР; Ким, К.Х.; Пирсон, М; Марцано, СЛ; Яэгаши, Х; Се, Дж; Го, Л; Кондо, Х; Колония, я; Хиллман, Б.И.; Отчет Ictv, Консорциум (май 2018 г.). «Профиль таксономии вирусов ICTV: Hypoviridae» . Журнал общей вирусологии . 99 (5): 615–616. дои : 10.1099/jgv.0.001055 . hdl : 10261/329670 . ПМИД 29589826 .
^ Jump up to: ^а ^б «Таксономия вирусов: выпуск 2020 г.» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Март 2021 года . Проверено 20 мая 2021 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д «Вирусная зона» . ЭксПАСи . Проверено 15 июня 2015 г.
^ Торрес-Тренас, Альмудена; Гианизарес, М. Ярмен; Гарсиа-Педрахас, М. Долорес; Перес-Артес, Энкарнасьон (2020). «Молекулярная и биологическая характеристика первого гиповируса, выявленного у Fusarium oxysporum» . Границы микробиологии . 10 : 3131. дои : 10.3389/fmicb.2019.03131 . ПМК 6992542 . ПМИД 32038565 .
^ «Репортаж ICTV: Гиповирусы» . Ictv.global . Проверено 31 декабря 2021 г.
^ Jump up to: ^а ^б Пивер, Тобин; Лю, Йир-Чунг; Кортезе, Паоло; Милгрум, Майкл (ноябрь 2000 г.). «Изменения в толерантности и вирулентности при взаимодействии грибка с ожогом каштана и гиповируса» . Прикладная и экологическая микробиология . 66 (11): 4863–4869. Бибкод : 2000ApEnM..66.4863P . CiteSeerX 10.1.1.504.6576 . дои : 10.1128/АЕМ.66.11.4863-4869.2000 . ПМК 92392 . ПМИД 11055936 . Проверено 13 августа 2014 г.
^ Чой, Гил (1992). «Гиповирулентность грибка каштановой гнили, обусловленная инфекционной вирусной кДНК». Наука . 257 (5071): 800–803. Бибкод : 1992Sci...257..800C . дои : 10.1126/science.1496400 . ПМИД 1496400 .
^ «Сладкий каштан ( Cryphonectria parasitica )» . Комиссия по лесному хозяйству, Великобритания . Проверено 13 августа 2014 г.

Внешние ссылки

[ICTV-1] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и Сузуки, Н; Габриал, ЮАР; Ким, К.Х.; Пирсон, М; Марцано, СЛ; Яэгаши, Х; Се, Дж; Го, Л; Кондо, Х; Колония, я; Хиллман, Б.И.; Отчет Ictv, Консорциум (май 2018 г.). «Профиль таксономии вирусов ICTV: Hypoviridae» . Журнал общей вирусологии . 99 (5): 615–616. дои : 10.1099/jgv.0.001055 . hdl : 10261/329670 . ПМИД 29589826 .

[ictv2020-2] Jump up to: ^а ^б «Таксономия вирусов: выпуск 2020 г.» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Март 2021 года . Проверено 20 мая 2021 г.

[ViralZone-3] Jump up to: ^а ^б ^с ^д «Вирусная зона» . ЭксПАСи . Проверено 15 июня 2015 г.

[4] Торрес-Тренас, Альмудена; Гианизарес, М. Ярмен; Гарсиа-Педрахас, М. Долорес; Перес-Артес, Энкарнасьон (2020). «Молекулярная и биологическая характеристика первого гиповируса, выявленного у Fusarium oxysporum» . Границы микробиологии . 10 : 3131. дои : 10.3389/fmicb.2019.03131 . ПМК 6992542 . ПМИД 32038565 .

[5] «Репортаж ICTV: Гиповирусы» . Ictv.global . Проверено 31 декабря 2021 г.

[Peever-6] Jump up to: ^а ^б Пивер, Тобин; Лю, Йир-Чунг; Кортезе, Паоло; Милгрум, Майкл (ноябрь 2000 г.). «Изменения в толерантности и вирулентности при взаимодействии грибка с ожогом каштана и гиповируса» . Прикладная и экологическая микробиология . 66 (11): 4863–4869. Бибкод : 2000ApEnM..66.4863P . CiteSeerX 10.1.1.504.6576 . дои : 10.1128/АЕМ.66.11.4863-4869.2000 . ПМК 92392 . ПМИД 11055936 . Проверено 13 августа 2014 г.

[Choi-7] Чой, Гил (1992). «Гиповирулентность грибка каштановой гнили, обусловленная инфекционной вирусной кДНК». Наука . 257 (5071): 800–803. Бибкод : 1992Sci...257..800C . дои : 10.1126/science.1496400 . ПМИД 1496400 .

[ForestryComm-8] «Сладкий каштан ( Cryphonectria parasitica )» . Комиссия по лесному хозяйству, Великобритания . Проверено 13 августа 2014 г.

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

Идентификаторы таксонов
Гиповирус	Викиданные : Q3775807 Викивиды : Гиповирус Коллектив : 52Y7 Срок действия : 67662 ГБИФ : 10276161 ИРМНГ : 1294153 НКБИ : 39749 ВорМС : 600380
Гиповирусиды	Викиданные : Q10885843 Викивиды : Гиповирусиды Коллектив : BBS Срок действия : 5015 ГБИФ : 6216 ИРМНГ : 106871 НКБИ : 39748 ВорМС : 600099