Тективирус

Тективирусиды
	КриоЭМ- модель капсида фага PRD1 энтеробактерий. Запись PDB 1gw7
Классификация вирусов
(без рейтинга):	Вирус
Область :	Вариднавирия
Королевство:	Бэмфордвире
Тип:	Преплазмовирус
Сорт:	Тектиливирицеты
Заказ:	Каламавиралес
Семья:	Тективирусиды
Роды
	Посмотреть текст

Tectiviridae — семейство вирусов , насчитывающее 10 видов пяти родов. Бактерии служат естественными хозяевами. ^{[ 2 ]}^{[ 3 ]} Тективирусы не имеют структуры «голова-хвост», но способны образовывать хвостообразные трубки размером ~ 60 × 10 нм при адсорбции или после обработки хлороформом . Название происходит от латинского tectus (что означает «покрытый»). ^{[ 4 ]}

Вирусология

Механизм проникновения Фаг энтеробактерий PRD1

Вирионы . видов Tectiviridae не имеют оболочки, икосаэдрические и имеют псевдосимметрию Т=25 ^{[ 2 ]} Капсид имеет два слоя. Внешний слой представляет собой белковую структуру из 240 тримеров капсидных белков, а внутренний — белково-липидную мембрану, окружающую геном вируса . Апикальные шипы длиной около 20 нанометров (нм) выступают из вершин икосаэдров. ^{[ нужна ссылка ]}

Геном представляет собой одну молекулу линейной двухцепочечной ДНК длиной 15 тысяч оснований и имеет 30 открытых рамок считывания. ^{[ 2 ]} Он образует плотно упакованный клубок и кодирует несколько структурных белков. Он кодирует около 30 белков, которые транскрибируются в оперонах. В вироне присутствуют не менее 9 структурных белков. Геном имеет массу около 66 мегадальтон и составляет 14–15% массы вириона. Липиды составляют еще 15% по массе. Углеводов нет. ^{[ нужна ссылка ]}

Жизненный цикл

Репликация вируса цитоплазматическая. Проникновение в клетку-хозяина достигается путем адсорбции в клетку-хозяина. ^{[ 2 ]} После адсорбции на поверхности клетки-хозяина вирион выдавливает структуру хвостовой трубки через вершину для доставки генома в хозяина. Репликация следует модели смещения цепи ДНК. Транскрипция с помощью ДНК-матрицы - это метод транскрипции. ^{[ 2 ]} Капсидные белки полимеризуются вокруг липопротеинового пузырька, транслоцированного в цитоплазму факторами сборки вириона.

Зрелые вироны высвобождаются путем лизиса, который в случае PRD1 достигается с помощью кодируемого вирусом механизма лизиса, состоящего из четырех белков: P15 ( эндолизин ), ^{[ 5 ]} Р35 (холин), ^{[ 6 ]} P36 и P37 (гомологи белков Rz/Rz1 фага лямбда). ^{[ 7 ]}

Таксономия

Tectiviridae содержит следующие роды и виды: ^{[ 3 ]}

Другие неназначенные фаги: ^{[ 8 ]}

Ссылки

^ Сан-Мартин С., Хуисконен Дж.Т., Бэмфорд Дж.К., Батчер С.Д., Фуллер С.Д., Бэмфорд Д.Х., Бернетт Р.М. (2002). «Минорные белки, мобильные плечи и взаимодействия мембраны и капсида в капсиде бактериофага PRD1». Структурная биология природы . 9 (10): 756–63. дои : 10.1038/nsb837 . ПМИД 12219080 . S2CID 32856328 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и «Вирусная зона» . ЭксПАСи . Проверено 15 июня 2015 г.
^ Jump up to: ^а ^б «Таксономия вирусов: выпуск 2020 г.» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Март 2021 года . Проверено 22 мая 2021 г.
^ «Девятый отчет ICTV; выпуск таксономии 2009 г.: Tectiviridae » . ICTV . Архивировано из оригинала 24 апреля 2019 года . Проверено 18 сентября 2020 г.
^ Калдентей Дж., Ханнинен А.Л., Бэмфорд Д.Х. (1994). «Ген XV бактериофага PRD1 кодирует литический фермент с мурамидазной активностью» . Eur J Biochem . 225 (1): 341–346. дои : 10.1111/j.1432-1033.1994.00341.x . ПМИД 7925454 .
^ Райдман П.С., Бэмфорд Д.Х. (2003). «Идентификация и мутационный анализ холинового белка P35 бактериофага PRD1» . J Бактериол . 185 (13): 3795–3803. дои : 10.1128/JB.185.13.3795-3803.2003 . ПМК 161566 . ПМИД 12813073 .
^ Крупович М., Цвиркайте-Крупович В., Бэмфорд Д.Х. (2008). «Идентификация и функциональный анализ Rz/Rz1-подобных дополнительных генов лизиса в мембраносодержащем бактериофаге PRD1» . Мол Микробиол . 68 (2): 492–503. дои : 10.1111/j.1365-2958.2008.06165.x . ПМИД 18366440 .
^ Неклассифицированные Tectiviridae . Таксономия NCBI.

Дальнейшее чтение

ICTVdB — Универсальная база данных вирусов ICTVdB Management (2006 г.). 00.068. Тективирусиды. В: ICTVdB — Универсальная база данных вирусов, версия 3. Бюхен-Осмонд, К. (ред.), Колумбийский университет, Нью-Йорк, США.
Таксономия вирусов : восьмой отчет Международного комитета по таксономии вирусов Х.В. Ван Регенмортель, Бишоп DHL, М.Х. Ван Регенмортель, Клод М. Фоке (редакторы)
68.0.1. Тективирус. Архивировано 28 сентября 2007 г. в Wayback Machine.

Внешние ссылки

[1] Сан-Мартин С., Хуисконен Дж.Т., Бэмфорд Дж.К., Батчер С.Д., Фуллер С.Д., Бэмфорд Д.Х., Бернетт Р.М. (2002). «Минорные белки, мобильные плечи и взаимодействия мембраны и капсида в капсиде бактериофага PRD1». Структурная биология природы . 9 (10): 756–63. дои : 10.1038/nsb837 . ПМИД 12219080 . S2CID 32856328 .

[ViralZone-2] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и «Вирусная зона» . ЭксПАСи . Проверено 15 июня 2015 г.

[ICTV-3] Jump up to: ^а ^б «Таксономия вирусов: выпуск 2020 г.» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Март 2021 года . Проверено 22 мая 2021 г.

[4] «Девятый отчет ICTV; выпуск таксономии 2009 г.: Tectiviridae » . ICTV . Архивировано из оригинала 24 апреля 2019 года . Проверено 18 сентября 2020 г.

[5] Калдентей Дж., Ханнинен А.Л., Бэмфорд Д.Х. (1994). «Ген XV бактериофага PRD1 кодирует литический фермент с мурамидазной активностью» . Eur J Biochem . 225 (1): 341–346. дои : 10.1111/j.1432-1033.1994.00341.x . ПМИД 7925454 .

[6] Райдман П.С., Бэмфорд Д.Х. (2003). «Идентификация и мутационный анализ холинового белка P35 бактериофага PRD1» . J Бактериол . 185 (13): 3795–3803. дои : 10.1128/JB.185.13.3795-3803.2003 . ПМК 161566 . ПМИД 12813073 .

[7] Крупович М., Цвиркайте-Крупович В., Бэмфорд Д.Х. (2008). «Идентификация и функциональный анализ Rz/Rz1-подобных дополнительных генов лизиса в мембраносодержащем бактериофаге PRD1» . Мол Микробиол . 68 (2): 492–503. дои : 10.1111/j.1365-2958.2008.06165.x . ПМИД 18366440 .

[8] Неклассифицированные Tectiviridae . Таксономия NCBI.

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]