Флавивирусиды
Флавивирусиды | |
---|---|
![]() | |
вируса Зика Структура и геном вириона | |
Классификация вирусов ![]() | |
(без рейтинга): | Вирус |
Область : | Рибовирия |
Королевство: | Орторнавиры |
Тип: | Китриновирикота |
Сорт: | Фласувирицеты |
Заказ: | Амарилловирусы |
Семья: | Флавивирусиды |
Роды | |
Flaviviridae — семейство оболочечных РНК-вирусов с положительной цепью , которые в основном поражают млекопитающих и птиц . [1] Они в основном передаются через членистоногих- переносчиков (в основном клещей и комаров ). [2] Семья получила свое название от вируса желтой лихорадки ; flavus в переводе с латыни означает «желтый», а желтая лихорадка, в свою очередь, была названа из-за ее склонности вызывать желтуху у жертв. [3] В семействе 89 видов, разделенных на четыре рода. [2] К заболеваниям, связанным с этой группой, относятся: гепатит ( гепацивирусы ), геморрагические синдромы , фатальные заболевания слизистых оболочек ( пестивирусы ), геморрагическая лихорадка , энцефалит и врожденная дефектная микроцефалия ( флавивирусы ). [4]
Структура
[ редактировать ]Вирусные частицы имеют оболочку и сферическую форму, имеют икосаэдрическую геометрию и псевдосимметрию T=3. Их около 40–60 нм . диаметр составляет [2] [4]
Геном
[ редактировать ]![]() | Этот раздел включает список общих ссылок , но в нем отсутствуют достаточные соответствующие встроенные цитаты . ( Июль 2024 г. ) |
Члены семейства Flaviviridae имеют моночастные, линейные, одноцепочечные РНК- геномы положительной полярности и общей длиной от 9,6 до 12,3 тысяч оснований. 5'-концы флавивирусов несут метилированный нуклеотидный кэп, в то время как другие члены этого семейства не имеют кэпа и кодируют внутренний сайт входа в рибосому.
Геном кодирует один полипротеин с множеством трансмембранных доменов, который расщепляется как хозяйскими, так и вирусными протеазами на структурные и неструктурные белки. Среди неструктурных белковых продуктов (NS) места и последовательности NS3 и NS5, которые содержат мотивы, необходимые для процессинга полипротеинов и репликации РНК соответственно, относительно хорошо консервативны во всем семействе и могут быть полезны для филогенетического анализа.
Жизненный цикл
[ редактировать ]
Репликация вируса цитоплазматическая. Проникновение в клетку-хозяина достигается путем прикрепления белка Е вирусной оболочки к рецепторам хозяина, что опосредует клатрин -опосредованный эндоцитоз. Репликация соответствует модели репликации вируса с положительной цепью РНК. Транскрипция вируса с положительной цепью РНК - это метод транскрипции. Трансляция происходит путем вирусной инициации. Вирион собирается путем отпочкования через внутриклеточные мембраны и покидает клетку-хозяина путем экзоцитоза. [2] [4] [5]
Род | Сведения о хосте | Тканевой тропизм | Детали входа | Подробности выпуска | Сайт репликации | Монтажный участок | Передача инфекции |
---|
Диапазон хозяев и история эволюции
[ редактировать ]используют широкий спектр естественных хозяев . Различные представители Flaviviridae , включая рыбу, млекопитающих, включая человека, и различных беспозвоночных, специфичных для моллюсков и ракообразных, [6] Геномы этих флавивирусов обнаруживают близкую синтению с геномами типового вида флавивирусов — вируса желтой лихорадки. [7] Один флавивирус, флавивирус акулы Вэньчжоу , заражает как тихоокеанских лопатоносых акул ( Scoliodon macrorhynchos ), так и крабов Газами ( Portunus trituberculatus ) с перекрывающимися ареалами, что повышает вероятность морского жизненного цикла с двумя хозяевами. [6] Однако другая клада флавивирусов, специфичные для насекомых флавивирусы, имеют геномы, которые не демонстрируют сильной синтении ни с одной из этих групп, что предполагает сложную эволюционную историю. [2] [8]
флавивируса Эндогенные вирусные элементы , следы геномов флавивируса, интегрированные в ДНК хозяина, обнаружены у многих видов, в том числе у головастика-креветки Lepidurus articus , водяной блохи Daphnia magna и пресноводной медузы Craspedacusta sowerbii , [7] предполагая древнюю коэволюцию между линиями животных и флавивирусов. [6] [7] Многие из хорошо известных представителей семейства, вызывающих заболевания у позвоночных, передаются через членистоногих-переносчиков (клещей и комаров). [2] [4] [7]
Таксономия
[ редактировать ]
Flaviviridae , в которую входят некоторые вирусы растений и бактериальные вирусы входят в супергруппу II РНК-вирусов . [2]
В семействе четыре рода: [1] [2]
- Род Flavivirus , переименованный в 2023 году в Orthoflavivirus (включает вирус Денге , японский энцефалит , лесную болезнь Кьясанур , вирус Повассан , вирус Западного Нила , вирус желтой лихорадки и вирус Зика ).
- Род Hepacivirus (включает Hepacivirus C ( вирус гепатита C ) и Hepacivirus B (вирус GB B))
- Род Pegivirus (включает пегивирус A (вирус GB A), пегивирус C (вирус C GB) и пегивирус B (вирус D GB))
- Род Pestivirus (включает пестивирус А ( вирус вирусной диареи крупного рогатого скота 1 ) и пестивирус С ( вирус классической чумы свиней , ранее вирус холеры свиней)). Вирусы этого рода поражают млекопитающих, кроме человека.
- Неклассифицированный
Известны и другие ортофлавивирусы, которые еще предстоит классифицировать. К ним относится вирус акулы Венлин.
Вирус Цзинмэнь представляет собой группу неклассифицированных вирусов семейства, в которое входят вирус Алонгшань , вирус Гуайко Кулекс, вирус клеща Цзинмэнь и вирус клеща Могиана. Эти вирусы имеют сегментированный геном из четырех или пяти частей. Два из этих сегментов происходят от флавивирусов. [ нужна ссылка ]
Ряд вирусов могут быть родственны флавивирусам, но имеют особенности, нетипичные для флавивирусов. К ним относятся цитрусовый Цзинмэнь-подобный вирус, вирус соевой нематоды 5, возбудитель личинок Toxocara canis, уханьский вирус сверчка и, возможно, вирус, ассоциированный с горечавкой Кобу-сё. [ нужна ссылка ]
Клиническое значение
[ редактировать ]Основные заболевания, вызываемые членами семейства Flaviviridae, включают:
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б Симмондс, П; Бехер, П; Бух, Дж; Гулд, Э; Мейерс, Дж; Месяц, Т; Мюерхофф, С; Плетнев А; Рико-Гессен, Р.; Смит, Д; Стэплтон, Дж; Консорциум отчетов ICTV (2017). «Профиль таксономии вируса ICTV: Flaviviridae» . Журнал общей вирусологии . 98 (1): 2–3. дои : 10.1099/jgv.0.000672 . ПМК 5370391 . ПМИД 28218572 .
- ^ Jump up to: а б с д и ж г час Рикко-Гессе, Ребекка (2023). Ноулз, Ник Дж.; Сидделл, Стюарт Г. (ред.). «Флавивирусиды» . Онлайн-репортаж ICTV . Проверено 11 июля 2024 г.
- ^ «Флавивирусиды» . Микроб вики . Проверено 22 июля 2008 г.
- ^ Jump up to: а б с д «Вирусная зона» . ЭксПАСи . Проверено 11 июля 2024 г.
- ^ Симмондс П., Бехер П., Бух Дж., Гулд Э.А., Мейерс Г., Монат Т., Мюерхофф С., Плетнет А., Рико-Гессен Р., Смит Д.Б., Стэплтон Дж.Т., Консорциум отчетов ICTV (2017). «Профиль таксономии вируса ICTV: Flaviviridae » . Журнал общей вирусологии . 98 (1): 2–3. дои : 10.1099/jgv.0.000672 . ПМК 5370391 . ПМИД 28218572 .
- ^ Jump up to: а б с Ленсинк М.Дж., Ли Ю, Леким С. (2022). «Водные флавивирусы» . Журнал вирусологии . 96 (17): e0043922. дои : 10.1128/jvi.00439-22 . ПМЦ 9472621 . ПМИД 35975997 . Искусство. № e00439-22.
- ^ Jump up to: а б с д Парри Р., Асгари С. (2019). «Открытие новых флавивирусов ракообразных и головоногих: понимание эволюции и циркуляции флавивирусов между морскими беспозвоночными и позвоночными-хозяевами» . Журнал вирусологии . 93 (14). дои : 10.1128/JVI.00432-19 . ПМК 6600200 . PMID 31068424 . Искусство. № e00432-19.
- ^ Ши М., Лин XD, Василакис Н., Тянь Дж.Х., Ли CX, Чен Л.Дж. и др. (2015). «Дивергентные вирусы, обнаруженные у членистоногих и позвоночных, пересматривают эволюционную историю Flaviviridae и родственных вирусов» . Журнал вирусологии . 90 (2): 659–669. дои : 10.1128/JVI.02036-15 . ПМК 4702705 . ПМИД 26491167 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Отчет ICTV : Flaviviridae
- геномов Flaviviridae Результаты поиска в базе данных из Ресурсного центра вирусной биоинформатики
- Вирусная зона : Flaviviridae
- База данных и аналитический ресурс вирусных патогенов (ViPR): Flaviviridae
- « Флавивирусиды » . Браузер таксономии NCBI . 11050.