гепацивирус
| гепацивирус | |
|---|---|
 | |
| Структура и геном гепацивируса | |
Классификация вирусов  | |
| (без рейтинга): | Вирус |
| Область : | Рибовирия |
| Королевство: | Орторнавиры |
| Тип: | Китриновирикота |
| Сорт: | Фласувирицеты |
| Заказ: | Амарилловирусы |
| Семья: | Флавивирусиды |
| Род: | гепацивирус |
| Синонимы | |
Гепацивирусы — род РНК-содержащих вирусов с положительной цепью семейства Flaviviridae . [3] Вирус гепатита С (HCV), вид Hepacivirus C , заражает людей и связан с гепатитом и гепатоцеллюлярной карциномой . [3] [4] В этом роде четырнадцать видов, которые заражают ряд других позвоночных . [3]
История
[ редактировать ]Вирус гепатита С (ВГС), который является возбудителем гепатита С у человека и принадлежит к виду Hepacivirus C , был открыт в 1989 году. [5] Названы семь генотипов (1–7) и восемьдесят шесть подтипов (1а, 1b и т. д.) вируса гепатита С. [6]
Вирус GBV-B (также известный как GB вирус B), открытый в 1995 году, способен инфицировать обезьян Нового Света , в частности тамаринов . Как и ВГС, он передается через кровь и, как и ВГС, связан с вирусным гепатитом . Однако GBV-B никогда не выявлялся у диких животных, и его естественный хозяин неизвестен. [5]
Структура
[ редактировать ]Вирусы рода Hepacivirus имеют оболочку и сферическую икосаэдрическую геометрию с псевдосимметрией T=3. Диаметр вирусных частиц составляет около 50 нм. Геномы линейные, несегментированные, имеют длину около 10 000 нуклеотидов. [3] [4]
Жизненный цикл
[ редактировать ]Проникновение в клетку-хозяина достигается путем прикрепления белка Е вирусной оболочки к рецепторам хозяина, что опосредует клатрин-опосредованный эндоцитоз . Репликация соответствует модели репликации вируса с положительной цепью РНК. Транскрипция вируса с положительной цепью РНК - это метод транскрипции. Трансляция происходит путем вирусной инициации. Естественным хозяином служат люди и другие позвоночные. Пути передачи – половой, кровь и контактный. [3] [4]
| Род | Сведения о хосте | Тканевой тропизм | Детали входа | Подробности выпуска | Сайт репликации | Монтажный участок | Передача инфекции |
|---|
Таксономия
[ редактировать ]
В роде Hepacvirus насчитывается 14 видов: [7] [3]
- Гепацивирус А ( собачий гепацивирус , лошадиный гепацивирус)
- Гепацивирус B (GBV-B)
- Гепацивирус С (вирус гепатита С)
- Гепацивирус D (гепацивирус Гереса)
- Гепацивирус Е (гепацивирус-339 грызунов)
- Гепацивирус F (гепацивирус грызунов-NLR07-oct70)
- Гепацивирус G (гепацивирус 1 норвежской крысы)
- Гепацивирус H (гепацивирус 2 норвежской крысы)
- Гепацивирус I (гепацивирус грызунов-SAR-3/RSA/2008)
- Гепацивирус J (гепацивирус грызунов-RMU10-3382/GER/2010)
- Гепацивирус К (гепацивирус летучих мышей-PDB-829)
- Гепацивирус L (гепацивирус летучих мышей-PDB-112)
- Гепацивирус М (гепацивирус летучих мышей-PDB-491.1)
- Гепацивирус N (бычий гепацивирус)
Дополнительная информация
[ редактировать ]Дополнительные гепацивирусы были описаны у летучих мышей, грызунов, включая рыжих полевок, лошадей и собак. [8] [9] [10] Гепацивирус грызунов обнаружен у мышей-оленей ( Peromyscus maniculatus ). [5] У бамбуковой крысы обнаружен вирус, родственный гепацивирусам ( Rhizomys pruinosus ). [11] Вирус, родственный гепацивирусам, поражает длиннохвостого суслика Spermophilus undulatus . [12]
Крупный рогатый скот является хозяином вирусов вида Hepacivirus N. [13] [14] Вирусы, наиболее близкие к гепацивирусу С, представляют собой лошадиные гепацивирусы вида Hepacivirus A. [15] Существует как минимум два подтипа лошадиного гепацивируса. [16] Гепацивирус А, заражающий лошадей, также был обнаружен у ослов. [17]
От белоголовых орланов выделен вирус, родственный гепацивирусам ( Haliaeetus leucocephalus ). [18] Еще одним неклассифицированным вирусом этого таксона является вирус, подобный гепацивирусу уток. [19] ) выделен вирус, родственный гепацивирусам От изящной кошачьей акулы ( Proscyllium habereri . [20] Описан вирус — вирус Джогалонг, который, по-видимому, принадлежит другому виду этого рода. [21]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Прингл, ЧР (1996). «Таксономия вирусов 1996 г. - Бюллетень X-го Международного конгресса вирусологов в Иерусалиме» (PDF) . Архив вирусологии . 141 (11): 2251–6. дои : 10.1007/BF01718231 . ISSN 1432-8798 . OCLC 76349762 . ПМК 7086844 . ПМИД 8992952 . Проверено 13 марта 2019 г.
Назвать род, включающий вирусы, подобные вирусу гепатита С, родом Hepacivirus .
- ^ 1ICTV 6-й отчет Мерфи, Ф.А., Фоке, КМ, Бишоп, ДХЛ, Габриал, С.А., Джарвис, А.В. Мартелли, Г.П. Мэйо, Массачусетс и Саммерс, доктор медицины (редакторы) (1995). Таксономия вирусов. Шестой доклад Международного комитета по таксономии вирусов. Приложение 10 к Архиву вирусологии, стр. 10. 424 https://ictv.global/ictv/proposals/ICTV%206th%20Report.pdf
- ^ Jump up to: а б с д и ж «Флавивирусиды» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) .
- ^ Jump up to: а б с «Вирусная зона» . ЭксПАСи . Проверено 15 июня 2015 г.
- ^ Jump up to: а б с Стэплтон, Дж. Т.; Фунг, С; Мюерхофф, А.С.; Бух, Дж; Симмондс, П. (2010). «Вирусы GB: обзор и предлагаемая классификация GBV-A, GBV-C (HGV) и GBV-D рода Pegivirus семейства Flaviviridae» . Журнал общей вирусологии . 92 (2): 233–46. дои : 10.1099/vir.0.027490-0 . ПМК 3081076 . ПМИД 21084497 .
- ^ «Классификация ВГС» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) . [ мертвая ссылка ]
- ^ Смит, Дональд Б.; Бехер, Пол; Бух, Йенс; Гулд, Эрнест А; Мейерс, Грегор; Монат, Томас; Мюерхофф, А. Скотт; Плетнев, Александр; Рико-Гессен, Ребекка; Стэплтон, Джек Т; Симмондс, Питер (2016). «Предлагаемое обновление таксономии родов Hepacivirus и Pegivirus семейства Flaviviridae» . Журнал общей вирусологии . 97 (11): 2894–2907. дои : 10.1099/jgv.0.000612 . ПМК 5770844 . ПМИД 27692039 .
- ^ Капур, А; Симмондс, П; Шил, ТК Х; Хьелле, Б; Каллен, Дж. М.; Бурбело, П.Д.; Чаухан, Л.В.; Дурайсами, Р; Санчес Леон, М; Джайн, К; Вандегрифт, К.Дж.; Калишер, CH ; Райс, CM; Липкин, В.И. (2013). «Идентификация гомологов вируса гепатита С и пегивирусов у грызунов» . мБио . 4 (2): e00216–13. дои : 10.1128/mBio.00216-13 . ПМЦ 3622934 . ПМИД 23572554 .
- ^ Дрекслер, Ян Феликс; Корман, Виктор Макс; Мюллер, Марсель Александер; Лукашев, Александр Н; Гмыль, Анатолий; Кутар, Бруно; Адам, Александр; Ритц, Дэниел; Лейтен, Лоннеке М; Ван Риель, Дебби; Каллис, Рене; Клозе, Стивен М; Глоза-Рауш, Флориан; Бингер, Табеа; Аннан, Августина; Аду-Саркодие, Яу; Оппонг, Сэмюэл; Бургарель, Матье; Рупп, Дэниел; Хоффманн, Бернд; Шлегель, Матиас; Куммерер, Беате М; Крюгер, Детлев Х; Шмидт-Чанасит, Йонас; Сетьен, Альваро Агилар; Коттонтейл, Вероника М; Хемачуда, Тирават; Watcharaluesadee, Superporn; Остерридер, Клаус; и др. (2013). «Доказательства существования новых гепацивирусов у грызунов» . ПЛОС Патогены . 9 (6): e1003438. дои : 10.1371/journal.ppat.1003438 . ПМЦ 3688547 . ПМИД 23818848 .
- ^ Лаук, М; Сибли, С.Д.; Лара, Дж; Перди, Массачусетс; Худяков Ю.; Хероба, Д; Тумукунде, А; Вени, Дж; Свитцер, WM; Чепмен, Калифорния; Хьюз, А.Л.; Фридрих, Т.К.; О'Коннор, Д.Х; Гольдберг, Т.Л. (2013). «Новый гепацивирус с необычно длинным и внутренне неупорядоченным белком NS5A у дикого примата Старого Света» . Журнал вирусологии . 87 (16): 8971–81. дои : 10.1128/JVI.00888-13 . ПМК 3754081 . ПМИД 23740998 .
- ^ Ван Нгуен, Дунг; Ван Нгуен, Куонг; Бонсолл, Дэвид; Нго, Вт; Каррике-Мас, Хуан; Фам, Ань; Брайант, Джульетта; Туэйтс, Гай; Бейкер, Стивен; Вулхаус, Марк; Симмондс, Питер (2018). «Обнаружение и характеристика гомологов вирусов гепатита человека и пегивирусов у грызунов и летучих мышей во Вьетнаме» . Вирусы . 10 (3): 102. дои : 10.3390/v10030102 . ПМЦ 5869495 . ПМИД 29495551 .
- ^ Ли ЛЛ, Лю ММ, Шен С., Чжан Ю.Дж., Сюй Ю.Л., Дэн Х.И., Дэн Ф., Дуань З.Дж. (2019) Обнаружение и характеристика нового гепацивируса у длиннохвостых сусликов ( Spermophilus undulatus ) в Китае. Арка Вирол
- ^ Корман, Виктор Макс; Грундхофф, Адам; Бэхляйн, Кристина; Фишер, Николь; Гмыль, Анатолий; Уолни, Роберт; Деи, Диксон; Ритц, Дэниел; Бингер, Табеа; Аданква, Эрнест; Марфо, Квадво Сарфо; Эннисон, Лоуренс; Аннан, Августина; Аду-Саркодие, Яу; Оппонг, Сэмюэл; Бехер, Пол; Дростен, Кристиан ; Дрекслер, Ян Феликс (2015). «Сильно дивергентные гепацивирусы африканского крупного рогатого скота» . Журнал вирусологии . 89 (11): 5876–82. дои : 10.1128/JVI.00393-15 . ПМЦ 4442428 . ПМИД 25787289 .
- ^ Бэхляйн, Кристина; Фишер, Николь; Грундхофф, Адам; Алави, Малик; Инденбиркен, Даниэла; Постель, Александр; барон, Анна Лена; Оффингер, Дженнифер; Беккер, Кэтрин; Бейнеке, Андреас; Рехаге, Юрген; Бехер, Пол (2015). «Идентификация нового гепацивируса у домашнего скота из Германии» . Журнал вирусологии . 89 (14): 7007–15. дои : 10.1128/JVI.00534-15 . ПМЦ 4473572 . ПМИД 25926652 .
- ^ Тезе, Жюльен; Лоус, София; Паркер, Джо; Пайбус, Оливер Дж. (2015). «Эволюционный и филогенетический анализ гепацивирусов и пегивирусов» . Геномная биология и эволюция . 7 (11): 2996–3008. дои : 10.1093/gbe/evv202 . ПМЦ 5635594 . ПМИД 26494702 .
- ^ Проност, С; Хюэ, Е; Фортье, С; Фурсин, М; Фортье, Г; Дебросс, Ф; Рей, Ф.А.; Питель, П.-Х; Ричард, Э; Сонье, Б. (2017). «Распространенность гепацивирусной инфекции лошадей во Франции и данные о двух подтипах вируса, циркулирующих во всем мире» . Трансграничные и новые болезни . 64 (6): 1884–1897. дои : 10.1111/tbed.12587 . ПМИД 27882682 . S2CID 19064165 .
- ^ Уолтер С, Раше А, Морейра-Сото А, Пфаендер С, Блетса М, Корман ВМ, Агилар-Сетьен А, Гарсиа-Лейси Ф, Ханс А, Тодт Д, Шулер Г, Шнайдерман-Торбан А, Штайнман А, Ронкорони С , Венециано В, Русенова N12, Сандев N12, Русенов А, Запрянова Д, Гарсиа-Боканегра I, Хорес Дж, Карлуччио А, Веронези MC, Каваллери ЖМВ, Дростен С , Лемей П, Стейнманн Е, Дрекслер Дж. Ф. (2016) Дифференциальные модели инфекций и недавнее эволюционное происхождение лошадиных гепацивирусов у ослов. Дж Вирол 91(1)
- ^ Голдберг Т.Л., Сибли С.Д., Пинкертон М.Э., Данн К.Д., Лонг Л.Дж., Уайт Л.С., Стром С.М. (2019) Смертность за несколько десятилетий и гомолог вируса гепатита С у белоголовых орланов (Haliaeetus leucocephalus), национальной птицы США. Научная репутация 9(1):14953
- ^ Чу Л., Джин М., Фэн С., Ван Х, Чжан Д. (2019) Сильно дивергентный гепацивирусоподобный флавивирус у домашних уток. Джей Ген Вирол
- ^ Ши, Манг; Линь, Сиань-Дань; Василакис, Никос; Тянь, Цзюнь-Хуа; Ли, Ци-Сю; Чен, Лян-Цзюнь; Иствуд, Джиллиан; Дяо, Сю-Нянь; Чен, Мин-Хуэй; Чен, Сяо; Цинь, Синь-Чэн; Уайден, Стивен Дж; Вуд, Томас Дж; Теш, Роберт Б; Сюй, Цзяньго; Холмс, Эдвард С; Чжан, Юн-Чжэнь (2016). «Дивергентные вирусы, обнаруженные у членистоногих и позвоночных, пересматривают эволюционную историю Flaviviridae и родственных вирусов» . Журнал вирусологии . 90 (2): 659–69. дои : 10.1128/JVI.02036-15 . ПМК 4702705 . ПМИД 26491167 .
- ^ Уильямс С.Х., Леви А., Йейтс Р.А., Сомавиера Н., Невилл П.Дж., Николсон Дж., Линдси МДА, Маккензи Дж.С., Джайн К., Имри А., Смит Д.В., Липкин В.И. (2020) Открытие вируса Джогалонг, нового гепацивируса, идентифицированного в Комар Culex annulirostris (Skuse) из региона Кимберли в Западной Австралии. PLoS One 15(1):e0227114