Нодавирусиды
Нодавирусиды | |
---|---|
![]() | |
Кристаллическая структура вируса нервного некроза групера и рыб бетанодавируса | |
Классификация вирусов ![]() | |
(без рейтинга): | Вирус |
Область : | Рибовирия |
Королевство: | Орторнавиры |
Тип: | Китриновирикота |
Сорт: | Магсавирицетес |
Заказ: | Нодамувиралес |
Семья: | Нодавирусиды |
Nodaviridae — семейство безоболочковых РНК-вирусов с положительной цепью . [ 1 ] Позвоночные и беспозвоночные служат естественными хозяевами. Заболевания, связанные с этим семейством, включают: вирусную энцефалопатию и ретинопатию рыб. В семействе девять видов, отнесенных к двум родам. [ 2 ] [ 3 ]
История
[ редактировать ]Название семейства происходит от японской деревни Нодамура в префектуре Иватэ , где вирус Нодамура был впервые выделен из Culex tritaeniorhynchus . комаров [ нужна ссылка ]
Вирусология
[ редактировать ]Структура
[ редактировать ]Вирус не имеет оболочки и имеет икосаэдрический капсид (число триангуляции = 3) диаметром от 29 до 35 нм. Капсид . состоит из 32 капсомеров [ 2 ]
Геном
[ редактировать ]
Геном представляет собой линейную, позитивно-смысловую, двудольную (состоящую из двух сегментов - РНК1 и РНК2) одноцепочечную РНК , состоящую из 4500 нуклеотидов с 5'-концевым метилированным кэпом и неполиаденилированным 3'-концом. [ 2 ]
РНК1, длина которой составляет ~3,1 тыс. оснований, кодирует белок, который имеет несколько функциональных доменов: домен митохондриального нацеливания, трансмембранный домен, домен РНК-зависимой РНК-полимеразы (RdRp), домен самодействия и домен кэпирования РНК. Кроме того, РНК1 кодирует субгеномную РНК3, которая кодирует белок B2, ингибитор молчания РНК. [ 2 ]
РНК2 кодирует белок α, предшественник вирусного капсидного белка, который автоматически расщепляется на два зрелых белка, β-белок массой 38 кДа и γ-белок массой 5 кДа, по консервативному сайту Asn / Ala во время сборки вируса. [ 2 ]
Жизненный цикл
[ редактировать ]Репликация вируса цитоплазматическая. Вход в клетку-хозяина достигается путем проникновения в клетку-хозяина. Репликация соответствует модели репликации вируса с положительной многоцепочечной РНК. Транскрипция вируса с положительной цепью РНК с использованием модели внутренней инициации транскрипции субгеномной РНК представляет собой метод транскрипции. Позвоночные и беспозвоночные служат естественным хозяином. Пути передачи – контактный и контаминационный. [ 2 ] [ 3 ]
Таксономия
[ редактировать ]Представители рода Alphanodavirus первоначально были выделены из насекомых, а представители рода Betanodavirus — из рыб. Небольшое количество нодовирусов, по-видимому, находится за пределами любой из этих клад. [ 2 ] Вирус стадного дома (FHV) является наиболее изученным из нодавирусов. [ 2 ] В этом семействе девять видов, отнесенных к двум родам: [ 2 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Сахул Хамид, AS; Нинаве, AS; Накаи, Т; Чи, Южная Каролина; Джонсон, КЛ; Отчет ICTV, Консорциум (январь 2019 г.). «Профиль таксономии вируса ICTV: Nodaviridae» . Журнал общей вирусологии . 100 (1): 3–4. дои : 10.1099/jgv.0.001170 . ПМИД 30431412 . S2CID 53435394 .
- ^ Jump up to: а б с д и ж г час я "ICTV Report Nodaviridae" .
- ^ Jump up to: а б «Вирусная зона» . ЭксПАСи . Проверено 15 июня 2015 г.