Лигаменвирусы
Лигаменвирусы | |
---|---|
Классификация вирусов ![]() | |
(без рейтинга): | Вирус |
Область : | Аднавирия |
Королевство: | Зиллигвире |
Тип: | Талеавирикота |
Сорт: | Токивирицетес |
Заказ: | Лигаменвирусы |
Семьи | |
Ligamenvirales — это отряд линейных вирусов, которые заражают архей типа Thermoproteota (ранее Crenarchaeota) и имеют геномы с двухцепочечной ДНК. [ 1 ] Порядок был предложен Давидом Прангишвили и Мартом Круповичем в 2012 году и впоследствии создан Международным комитетом по таксономии вирусов (ICTV). [ 2 ]
Имя
[ редактировать ]Название происходит от латинского ligamen , что означает струна или нить . [ нужна ссылка ]
Таксономия
[ редактировать ]В этом отряде три семейства — Lipothrixviridae , Rudiviridae и Ungulaviridae . [ 2 ]
Вироны нитевидные со спиральным нуклеокапсидом . К обоим концам прикреплены либо волокна, либо более сложные структуры, участвующие в адгезии хозяина. [ 3 ] [ 4 ]
Основные белки оболочки как липотриксвирусов, так и рудивирусов имеют необычную топологию четырехспирального пучка . [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ] Геном представляет собой несегментированную линейную двухцепочечную ДНК. Вирусы этих двух семейств имеют до десяти общих генов. Основное различие между этими двумя семействами заключается в том, что члены семейства Rudiviridae не имеют оболочки, тогда как нуклеокапсиды липотриксвирусов окружены липидной мембраной. Более того, в то время как капсид рудивирусов построен из одного основного капсидного белка, капсид липотриксвирусов образован из двух паралогичных основных капсидных белков. В обеих группах вирусов основные капсидные белки образуют клешневидный димер (гомодимер у рудивирусов и гетеродимер у липотриксвирусов), который обертывает дцДНК. [ нужна ссылка ]
Члены Ligamenvirales структурно родственны архейным вирусам семейства Tristromaviridae , которые, как и липотриксвирусы, кодируют два паралогичных главных капсидных белка с той же укладкой, что и у лигаменвирусов. [ 9 ] Из-за этого структурного сходства порядок Ligamenvirales и семейство Tristromaviridae было предложено объединить в класс Tokiviricetes (токи по-грузински означает «нить», а viricetes является официальным суффиксом класса вирусов). [ 9 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Прангишвили Д ; Крупович М (2012). «Новый предлагаемый таксон вирусов с двухцепочечной ДНК, порядок Ligamenvirales » . Арх Вирол . 157 (4): 791–795. дои : 10.1007/s00705-012-1229-7 . ПМИД 22270758 .
- ^ Jump up to: а б «Таксономия вирусов: выпуск 2022 г.» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Март 2023 года . Проверено 14 сентября 2023 г.
- ^ «Вирусная зона: липотриксвирус» . ЭксПАСи . Проверено 14 сентября 2023 г.
- ^ «Вирусная зона: Rudiviridae» . ЭксПАСи . Проверено 14 сентября 2023 г.
- ^ Гуле А., Бланги С., Реддер П., Прангишвили Д., Фелисберто-Родригес С., Фортерр П., Кампаначчи В., Камбиллау С. (2009) Белки оболочки 1 нитчатого вируса Acidianus имеют спиральную складку, охватывающую линию нитчатых архейных вирусов. ПНАС 106 (50) 21155–60
- ^ ДиМайо, Ф; Ю, Х; Ренсен, Э; Крупович, М; Прангишвили, Д; Эгельман, Э.Х. (2015). «Вирусология. Вирус, поражающий гипертермофила, инкапсидирует ДНК А-формы» . Наука . 348 (6237): 914–7. дои : 10.1126/science.aaa4181 . ПМЦ 5512286 . ПМИД 25999507 .
- ^ Кассон, П; ДиМайо, Ф; Ю, Х; Лукас-Стаат, С; Крупович, М; Схаутен, С; Прангишвили, Д; Эгельман, Э.Х. (2017). «Модель новой мембранной оболочки нитчатого гипертермофильного вируса» . электронная жизнь . 6 : е26268. дои : 10.7554/eLife.26268 . ПМК 5517147 . ПМИД 28639939 .
- ^ Лю, Ю; Осинский, Т; Ван, Ф; Крупович, М; Схаутен, С; Кассон, П; Прангишвили, Д; Эгельман, Э.Х. (2018). «Структурная консервативность нитчатого вируса с мембранной оболочкой, инфицирующего гипертермофильный ацидофил» . Природные коммуникации . 9 (1): 3360. Бибкод : 2018NatCo...9.3360L . дои : 10.1038/s41467-018-05684-6 . ПМК 6105669 . ПМИД 30135568 .
- ^ Jump up to: а б Ван, Фэнбинь; Бакеро, Диана П; Су, Чжанли; Осинский, Томаш; Прангишвили, Давид; Эгельман, Эдвард Х; Крупович, Март (2020). «Структура нитчатого вируса раскрывает семейные связи внутри виросферы архей» . Эволюция вирусов . 6 (1): veaa023. дои : 10.1093/ve/veaa023 . ПМЦ 7189273 . ПМИД 32368353 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]
СМИ, связанные с Ligamenvirales, на Викискладе?