Amalgaviridae
| Amalgaviridae | |
|---|---|
Классификация вирусов 
| |
| (не вмешательство): | Вирус |
| Область : | Рибовирия |
| Королевство: | Orthornavirae |
| Филум: | Pisuviricota |
| Сорт: | Duplopviricetes |
| Заказ: | Дурнавиралес |
| Семья: | Amalgaviridae |
| Роды | |
Amalgaviridae -это семейство двухцепочечных РНК-вирусов . Вирусы элементов заражают растения и передаются вертикально через семена . [ 1 ] Название происходит от Amalgam (Blend, Mix), которая относится к амальгавирусам, обладающим характеристиками как партивирусов , так и тотавирусов . [ 1 ] [ 2 ] В семействе десять видов. [ 3 ]
Геном
[ редактировать ]Амальгавирусные геномы являются монопартийными около 3,5 килобаз . и длиной [ 2 ] [ 4 ] Они имеют два частично перекрывающихся открытых кадрах считывания , которые кодируют РНК-зависимую РНК-полимеразу (RDRP) и предполагаемый капсидный белок. [ 2 ] [ 5 ]
Эволюция
[ редактировать ]Было высказано предположение, что амальгавирусы эволюционировали путем рекомбинации между вирусами с двухцепочечными и отрицательными геномами РНК. [ 6 ] Филогенетический анализ показывает, что амальгавирус RDRP образует сестринскую кладу для соответствующего белка RDRP партивирусов ( PartiTiviridae ), которые имеют сегментированные (двудольные) геномы дцРНК и заражают растения, грибы и протесты. [ 1 ] [ 2 ] [ 4 ] [ 6 ] Напротив, предполагаемый капсидный белок амальгавирусов гомологичен нуклеокапсидным белкам вирусов РНК с негативной цепью родов флебовируса ( Bunyaviridae ) и Tenuivirus . [ 6 ]
Таксономия
[ редактировать ]Семейство Amalgaviridae имеет два рода и десять видов: [ 3 ]
- Чеснок лук Амальгавирус 1
- Чеснок лук Амальгавирус 2
- Черничный скрытый вирус [ 1 ]
- Рододендрон вирус а [ 4 ]
- Южный томатный вирус [ 2 ]
- Шпинат Амальгавирус 1
- Vicia Cryptic Virus m [ 5 ]
- Зостер Марина Амальгавирус 1
- Зостер Марина Амальгавирус 2
Ссылки
[ редактировать ]
- ^ Подпрыгнуть до: а беременный в дюймовый Мартин, RR; Чжоу, J; Tzanetakis, IE (2011). «Черничный скрытый вирус: амальгама Partitiviridae и Totiviridae». Исследование вируса . 155 (1): 175–80. doi : 10.1016/j.virusres.2010.09.020 . PMID 20888379 .
- ^ Подпрыгнуть до: а беременный в дюймовый и Сабанадзович; Valgerde, RA; Браун, JK; Мартин, RR; Tzaneakis, IE (2009). Семьи: вируса Исследование 140 (1–2): 130–7. doi : 10.1016/j . PMID 191118586 .
- ^ Подпрыгнуть до: а беременный "Таксономия" . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) . Получено 21 марта 2020 года .
- ^ Подпрыгнуть до: а беременный в Sabanadzovic, S; Abou Ghanem-Sabanadzovic, n; Valverde, RA (2010). «Новый монопартийный вирус дсРНК от рододендрона». Архив вирусологии . 155 (11): 1859–63. Doi : 10.1007/s00705-010-0770-5 . PMID 20721591 . S2CID 13303861 .
- ^ Подпрыгнуть до: а беременный Лю, w; Чен, Дж. (2009). «Двухцепочечная РНК как геном потенциального вируса, заражающего Vicia Faba». Вирусные гены . 39 (1): 126–31. doi : 10.1007/s11262-009-0362-1 . PMID 19472044 . S2CID 10806942 .
- ^ Подпрыгнуть до: а беременный в Krupovic M, Dolja VV, Koonin EV (2015). «Вирусы растений семейства Amalgaviridae эволюционировали путем рекомбинации между вирусами с двухцепочечными и отрицательными геномами РНК» . Biol Direct . 10 (1): 12. doi : 10.1186/s13062-015-0047-8 . PMC 4377212 . PMID 25886840 .