Клубничная Crinkle Cytorhabdovirus

Клубничная Crinkle Cytorhabdovirus
Классификация вирусов
(не вмешательство):	Вирус
Область :	Рибовирия
Королевство:	Orthornavirae
Филум:	Денавирикота
Сорт:	Monjiviricetes
Заказ:	Mononegavirales
Семья:	Rhabdoviridae
Род:	Cytorhabdovirus
Разновидность:	Клубничная Crinkle Cytorhabdovirus
Синонимы
	Клубничный вирус Crinkle ;

Клубничная Crinkle Cytorhabdovirus , обычно называемая вирусом клубничного Crinkle (SCV), представляет собой негативное вирус RNA с негативным чувством, который угрожает производству клубники во всем мире. Этот вирус снижает жесткость растений, производство бегуна, размер фруктов и производство, вызывая при этом искажения и скручивания листьев. Этот вирус был впервые описан в 1932 году в Орегоне и Калифорнии с коммерческими сортами клубники, а затем стал проблемой во всем мире, включая Северную Америку, Южную Америку, Европу, Южную Африку, Новую Зеландию, Австралию и Японию. Из семейства Rhabdoviridae это большое семейство вирусов, которое поражает растения, позвоночные и беспозвоночные. В частности, этот вирус заражает клубничные растения рода Fragaria и передается двумя векторами тли , которые питаются клубникой, Chaetosiphon fragaefolii и C. jacobi . Когда SCV объединяется с другими тлюми, передаваемыми тлей, таких как вирусы для китла, мягкий желтый крах, полосатая вен или паллидоз, повреждение становится еще более вредным. Экономически единственный значительный множество SCV - это Фрагария в Анане . ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]}^{[ 3 ]}

Балтиморская классификация

Основываясь на классификации Балтимора, которая представляет собой систему классификации вирусов, которые группируют вирусы в семейства, основанные на их типе генома, мы можем знать шаги, которые вирус должен предпринять, чтобы продуцировать мРНК, и как геном копируется для создания большего количества геномов. Все вирусы хотят добраться до мРНК, чтобы пройти процесс перевода; Тем не менее, только положительный смысл одноцепочечный вирус РНК (+РНК) способен сделать это. (-) РНК-вирусы, такие как SCV, не могут быть переведены хозяином, поскольку клетки не имеют механизма для его копирования, что указывает на то, что вирус должен принести свой собственный фермент, РНК-зависимую РНК-полимеразу, чтобы Скопируйте негативную прядь в мРНК. Это позволяет вирусам, таким как SCV, производить (+) РНК, которая может быть переведена хозяином. ^{[ Цитация необходима ]}

Структура и геном

SCV охвачен бацилформирной морфологией. Вирус длиной около 163-383 нм и диаметром 74-88 нм. Скорее всего, гликопротеины являются основными поверхностными проекциями, которые встречаются в цитоплазме, которые либо покрыты, либо не покрыты без покрытия. Его нуклеокапсиды заключены в оболочку с хозяином и, как правило, спиральны с линейным геномом, который является негативным смыслом RNA с одним покрытием (- РНК). Как правило, вирусный геном SCV составляет примерно 13 КБ и содержит четыре белка. Четыре белка, участвующие в этом вирусе, - это гликопротеин (G), нуклеокапсид (N), фосфопротеин (P) и матрица (M) с их соответствующими размерами 77 кДа, 55 кДа, 45 кДа и 23 кДа. Как и другие растительные рабдовирусы, участвует пятый белок, большой белок (L), который составляет 230 кДа. ^{[ Цитация необходима ]}

Организация этих пяти белков в геноме SCV высоко консервативна. Порядок генома выглядит следующим образом: N, P, M, G, L, в то время как области между этими белками существуют. Важно отметить, что накопление белков M и G ответственны за морфологию SCV в форме бациллообраформы. ^{[ 4 ]}^{[ 1 ]}

Цикл репликации

Экспрессия гена

РНК -зависимая РНК -полимераза связывается с геномом SCV на 3 'конце, где затем транскрибируются гены. Как только синтез достигает L -белка вблизи 5 -дюймового конца, мРНК ограничены и полиаденилированы. ^{[ 5 ]}

Вход в ячейку

Вступление вируса в клетку -хозяина происходит, когда вирусные гликопротеины прикрепляются к рецепторам клеточной поверхности хозяина, инициируя эндоцитоз. Эндоцитоз инициируется с помощью низких уровней pH и покрытых ям, которые состоят из клатрина. Затем вирус способен сливаться с мембраной хозяев, которая возникает в цитоплазме. ^{[ Цитация необходима ]}

Репликация

Как только вирус сливается с мембраной хозяев, возникает репликация. Пять белков в SCV транскрибируются из их (-) РНК с помощью РНК-полимеразы, которая также является L-белком. Помимо этой функции, L -белок также является ферментативно необходимым для ограничения мРНК и фосфорилирования белка P. Сайт промотора расположен в 3'-конце генома, где прикрепляется полимераза, и он движется вдоль матрицы РНК в направлении 5'-конца. Это движение от лидера к концу мРНК прицепа производит соответствующие белки N, P, M, G и L. ^{[ Цитация необходима ]}

Репликация генома требует вновь синтезированных N -белков, чтобы заключить РНК. Это используется для получения более отрицательной зондированной геномной РНК. ^{[ Цитация необходима ]}

Транскрипция

Транскрипция происходит после въезда в клетку и регулируется после того, как оба белка L и P экспрессируются в репликации. Этот процесс происходит и накапливается в вироплазмах, которые представляют собой нити, похожие на структуры, которые расположены в цитоплазме инфицированных клеток. РНК -зависимая РНК -полимераза или обычно известная как транскриптаза, перемещается от 3 'конца генома к 5' конец и может случайным образом заканчиваться в любой последовательности белка, что позволяет образуется мРНК отдельно друг от друга. N белков обычно вырабатываются в изобилии и накапливаются, так как они расположены в начале генома (3 'End), который расположен сразу после последовательности РНК лидера. Это важно, потому что белок N необходим для вируса, потому что он используется для покрытия внешней внешней части реплицированных геномов. ^{[ Цитация необходима ]}

Во время этого процесса существуют сигналы начала и остановки, которые позволяют только части молекулы полимеразы проходить мимо каждого соединения, чтобы транскрипция продолжалась. Это прерывание приводит к большему количеству мРНК, которые продуцируются в начале генома, что приводит к различным количествам мРНК, продуцируемой, когда полимераза движется вниз по течению от N, P, M, G, к L. Это несоответствие приводит к большему количеству нуклеокапсидных белков сделано, чем крупные (L) белки. ^{[ Цитация необходима ]}

После того, как транскрипция происходит, все полученные мРНК ограничены на 5 -дюймовом конце и полиаденилируются на 3 -дюймовом конце. Этот процесс производит мРНК для SCV, чтобы произошел перевод. ^{[ Цитация необходима ]}

Перевод

После того, как мРНК образуются, ограничены и полиаденилируются до их соответствующих концов, эта структура имитирует клеточные мРНК и позволяет транслировать клеточные рибосомы для получения белков. ^{[ Цитация необходима ]}

Грубая эндоплазматическая ретикулума используется для перевода белка G, что указывает на то, что G -белки имеют простой пептид в коде начала их мРНК. Фосфопротеины (P) и гликопротеины (G) затем проходят посттрансляционную модификацию. После фосфорилирования большого (L) белка производится тримеры P -белка. Затем G -белок гликозилирован в грубой эндоплазматической ретикулуме и комплексе Гольджи. ^{[ Цитация необходима ]}

Сборка и выпуск

Вирус выходит из клетки-хозяина через процесс почкования и вирусного движения под руководством канальцев. Растения являются естественным хозяином для SCV, и этот вирус специально передается тли -векторами. В основном, Chaetosiphon fragaefolii.

Важно отметить, что цикл передачи зависит от температуры. Более низкие температуры увеличивают период инкубации в клубнике и скрытый период в векторе. ^{[ 6 ]}

Модуляция процессов хоста/взаимодействие с хостом

Векторы тли -клубники, такие как Chaeetosiphon fragaefolii , имеют род Chaetosiphon, которые являются основными причинами проблем, наблюдаемых в клубничных растениях по всему миру. Эти векторы проникают в клубничные растения и, по-видимому, являются либо полупрозрачным желто-белым и бледно-зелено-желтым цветом. Длина тела C. fragaefolii примерно 0,9–1,8 миллиметра ( 5 ~ 128-9 ~ 128 дюймов . ), в то время как антенны в 0,9-1,1 раза превышают длину тела Повреждение растений вызвано тем, что векторы тли высасывают сок из растений, вызывая наблюдаемые симптомы SCV. Эти векторы могут быть заражены этим вирусом всего за 24 часа после рождения, в то время как наблюдается скрытый период 10–19 дней. После заражения этот вектор может передавать SCV в течение 2 недель. ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}

Связанные заболевания

Клубничный скрытый вирус, штаммы A и B
Вирусы поражения клубники-а и поражения
Вирус хлороза клубничной вены ^{[ 9 ]}

Признаки и симптомы

Симптомы вируса клубничного скручивания варьируются между различными разновидностями растений, и они также могут варьироваться в зависимости от тяжести. Общие симптомы могут включать в себя определение растений. Пятнистые пятно могут быть хлоротичными (желтовато -пятно на поверхности листьев) или некротическим с областями черного, указывающими на гибель ткани в этих областях. Лепестки цветов также могут быть деформированы, а лепестки также могут иметь ненормальные полосы. Вирус также может вызвать узорные листочки, извращенные листья, а также неравномерное распределение листьев на растении. Другим симптомом может быть образование поражений или областей повреждения в черешках и столонах растения. Эпизоция также может происходить из вируса, что вызывает повышенный рост верхней области растения, что, в свою очередь, делает растение, заставляя его сгибаться вниз. ^{[ 9 ]}

Географическое распределение

SCV видны во всем мире, а географические регионы включают, но не ограничиваются:
- Европа: Бельгия, Болгария, Чехия, Франция, Германия, Италия, Нидерланды, Польша, Великобритания, Югославия
- Азия: Китай (Хэбэй, Хубэй, Хелонгцзян, Джилин, Цзянси, Ляонинг, Шандун, Шаньси, Чжэцзян), Израиль, Япония, Казахстан
- Африка: Южная Африка
- Северная Америка: Канада, США (Калифорния, Орегон)
- Южная Америка: Чили
- Океания: Австралия (Новый Южный Уэльс, Тасмания, Виктория), Новая Зеландия ^{[ 9 ]}

Тропизм

Естественный диапазон SCV -хозяев узкий, в том числе дикая клубника Ф. Веска, Ф. Вирджиана и Ф. Чилуэнсис , а также на культивируемых видах, Ф. Ананасса. ^{[ 6 ]}

В исследовании вирус был выделен из материала клубничного листа; Тем не менее, необходимы больше экспериментов, чтобы сделать вывод, какие ткани клубники являются оптимальными для вируса. ^{[ 1 ]}

Экономическое воздействие и решения

Клубника - одна из самых важных ягодных культур, которые выращиваются в умеренных регионах. Благодаря этому, клубничная промышленность представляет собой многомиллиардную промышленность в умеренных регионах мира. Вирусы считаются незначительным фактором патогенных микроорганизмов, которые вызывают основной подразделение на сельскохозяйственные производства. Чтобы контролировать SCR, рекомендуется контролировать векторы этого вируса, тли Chaetosiphon frageefolii и C. jacobi . Тем не менее, важно отметить, что инсектициды не используются для регулирования векторов тли из -за возможного вредного взаимодействия с шмелями, которые необходимы для опыления растений. Кроме того, культивируя здоровые, без вирусов растения могут помочь контролировать распространение SCR. Растительный материал, который был заражен вирусом, должен быть уничтожен. При обмене клубничных растений важно убедиться, что растительный материал соответствует условиям схемы сертификации без вирусов; Тем не менее, апикальные меристемы от больных растений могут быть получены и делают без вирусов, выращивая их на культуральной среде. Это наиболее успешно, когда родительские растения были обработаны теплом 35 ° C-41 ° C в течение нескольких месяцев. ^{[ 6 ]}^{[ 10 ]}^{[ 7 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Posthuma, Ki; Адамс, Ан; Hong, Y.; Кирби, MJ (2002). «Обнаружение вируса клубнично-морщин в растениях и тля с помощью ОТ-ПЦР с использованием консервативных последовательностей генов L» . Патология растений . 51 (3): 266–274. doi : 10.1046/j.1365-3059.2002.00725.x . ISSN 1365-3059 .
^ Колонук, Игорь; Франова, Яна; Саркисова, Татьяна; Přibylová, Jaroslava (2018-09-01). «Полные последовательности генома двух дивергентных изолятов клубничного вируса с ячейки кольца и отдельного клубничного растения». Архив вирусологии . 163 (9): 2539–2542. Doi : 10.1007/s00705-018-3860-4 . ISSN 1432-8798 . PMID 29728910 . S2CID 19150995 .
^ Байерс, Лорен В. (2013-04-15). Вторая линия обороны, Анкета для анкеты вторичной проверки, Руководство-Руководство по пользователям (отчет). doi : 10.2172/1073755 . Ости 1073755 . Получено 14 марта 2019 года .
^ Posthuma, Karin I.; Адамс, Энтони Н.; Хонг, Игуо (2000). «Вирус клубничного Crinkle, циторабдовирус, нуждающийся в большем внимании вирутологов» . Патология молекулярного растения . 1 (6): 331–336. doi : 10.1046/j.1364-3703.2000.00041.x . ISSN 1364-3703 . PMID 20572980 .
^ "Rhabdoviridae ~ страница вирусной вируса" . viralzone.expasy.org . Получено 2019-03-13 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в «Клубничная Crinkle Cytorhabdovirus» (PDF) . Листы данных о карантинных вредителях - через Cabi и Eppo для ЕС по контракту 90/399003.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Кэнлифф, Даниэль Дж.; Рондон, Сильвия И. (декабрь 2004 г.). «Chaetosiphon fragaefolii (Homoptera: Aphididae): потенциальный новый вредитель во Флориде?» Полем Флорида Энтомолог . 87 (4): 612–615. doi : 10.1653/0015-4040 (2004) 087 [0612: CFHAAP] 2.0.co; 2 . ISSN 0015-4040 .
^ «ChaeTosiphon fragaefolii (клубничная тля) идентификация, изображения, экология, контроль» . ImployentialPoints.com . Получено 2019-03-13 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Brunt AA, Crabtree K, Dallwitz MJ, Gibbs AJ, Watson L, Zurcher EJ (1996-08-20). «Вирусы растений онлайн - клубничная Crinkle Cytorhabdovirus » . Srs.im.ac.cn. Получено 2020-09-03 .
^ Мартин, Роберт Р.; Tzanetakis, Ioannis E. (октябрь 2013 г.). «Вирусы клубники с высоким риском по регионам в Соединенных Штатах и Канаде: последствия для сертификации, питомников и производства фруктов» . Болезнь растений . 97 (10): 1358–1362. doi : 10.1094/pdis-09-12-0842-re . ISSN 0191-2917 . PMID 30722134 .

Внешние ссылки

[Posthuma_2002_266–274-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Posthuma, Ki; Адамс, Ан; Hong, Y.; Кирби, MJ (2002). «Обнаружение вируса клубнично-морщин в растениях и тля с помощью ОТ-ПЦР с использованием консервативных последовательностей генов L» . Патология растений . 51 (3): 266–274. doi : 10.1046/j.1365-3059.2002.00725.x . ISSN 1365-3059 .

[2] Колонук, Игорь; Франова, Яна; Саркисова, Татьяна; Přibylová, Jaroslava (2018-09-01). «Полные последовательности генома двух дивергентных изолятов клубничного вируса с ячейки кольца и отдельного клубничного растения». Архив вирусологии . 163 (9): 2539–2542. Doi : 10.1007/s00705-018-3860-4 . ISSN 1432-8798 . PMID 29728910 . S2CID 19150995 .

[3] Байерс, Лорен В. (2013-04-15). Вторая линия обороны, Анкета для анкеты вторичной проверки, Руководство-Руководство по пользователям (отчет). doi : 10.2172/1073755 . Ости 1073755 . Получено 14 марта 2019 года .

[4] Posthuma, Karin I.; Адамс, Энтони Н.; Хонг, Игуо (2000). «Вирус клубничного Crinkle, циторабдовирус, нуждающийся в большем внимании вирутологов» . Патология молекулярного растения . 1 (6): 331–336. doi : 10.1046/j.1364-3703.2000.00041.x . ISSN 1364-3703 . PMID 20572980 .

[5] "Rhabdoviridae ~ страница вирусной вируса" . viralzone.expasy.org . Получено 2019-03-13 .

[:0-6] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в «Клубничная Crinkle Cytorhabdovirus» (PDF) . Листы данных о карантинных вредителях - через Cabi и Eppo для ЕС по контракту 90/399003.

[Cantliffe_612–615-7] Jump up to: ^а ^{беременный} Кэнлифф, Даниэль Дж.; Рондон, Сильвия И. (декабрь 2004 г.). «Chaetosiphon fragaefolii (Homoptera: Aphididae): потенциальный новый вредитель во Флориде?» Полем Флорида Энтомолог . 87 (4): 612–615. doi : 10.1653/0015-4040 (2004) 087 [0612: CFHAAP] 2.0.co; 2 . ISSN 0015-4040 .

[8] «ChaeTosiphon fragaefolii (клубничная тля) идентификация, изображения, экология, контроль» . ImployentialPoints.com . Получено 2019-03-13 .

[srs.im.ac.cn-9] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Brunt AA, Crabtree K, Dallwitz MJ, Gibbs AJ, Watson L, Zurcher EJ (1996-08-20). «Вирусы растений онлайн - клубничная Crinkle Cytorhabdovirus » . Srs.im.ac.cn. Получено 2020-09-03 .

[10] Мартин, Роберт Р.; Tzanetakis, Ioannis E. (октябрь 2013 г.). «Вирусы клубники с высоким риском по регионам в Соединенных Штатах и Канаде: последствия для сертификации, питомников и производства фруктов» . Болезнь растений . 97 (10): 1358–1362. doi : 10.1094/pdis-09-12-0842-re . ISSN 0191-2917 . PMID 30722134 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]