Ипомовирус

Ипомовирус
	Ипомовирус вирион
Классификация вирусов
(не вмешательство):	Вирус
Область :	Рибовирия
Королевство:	Orthornavirae
Филум:	Pisuviricota
Сорт:	Girlviricetes
Заказ:	Пататавиралес
Семья:	Potyviridae
Род:	Ипомовирус

Ипомовирус является родом вирусов РНК с положительной цепью в семействе Potyviridae . Вирусы элементов заражают растения и передаются белокульями ( Bemisia tabaci ). Название рода получено из Ipomoea - общего названия сладкого картофеля . В этом роде семь видов. ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]}

Структура

Вирусы в роде iPomovirus не развиты, с гибкой и нитевидной геометрией. Диаметр составляет около 12–15 нм и может иметь различные длины в зависимости от вида (для одно сегментированных видов длины около 650–900 нм, или для двойных сегментированных видов 200–300 нм и 500–600 нм). Капсид имеет спиральную симметрию с шагом 3,4 нм. Они индуцируют характерные тела включения (вертушки) в инфицированных растительных клетках. ^{[ 1 ]}

Геном

Геном является либо монпартитным, либо двухпартным в зависимости от вида. Вирусы-члены имеют линейный одноцепочечный геном РНК положительной полярности длиной около 10-11 килобаз. 3 'Terminus имеет поли (A) тракт, а 5' Terminus имеет соединенный геном белок (VPG). ^{[ 1 ]}

Вирусы элементов кодируют один полипептид с прогнозируемой молекулярной массой 390 килограммов далтонов (KDA), который расщепляется на ~ 10 белков . В 5' -3 'порядок эти белки

P1 ( сериновая протеаза ): 83 кДа
HC (протеаза): 51 кДа
P3: 34 K.
6K1: 5 кДа
CL ( Helicase ): 71 кДа
6K2: 6 K.
VPG (5 'связывающий белок): 20 кДа
Nia-pro (протеаза): 27 кДа
NIB ( РНК -зависимая РНК -полимераза ): 57 кДа
Капсидный белок: 34 кДа

Может быть некоторое различия в количестве белков в зависимости от вида, например, некоторых ипомовирусах отсутствуют HC и имеют тандем P1. Инозин -трифосфатная пирофосфатаза (известная как ITPase или HAM1) представляет собой атипичный белковый домен, идентифицированный в некоторых ипомовирусах. ^{[ 3 ]}

Жизненный цикл

Вирусная репликация является цитоплазматической. Вступление в ячейку -хозяина достигается путем проникновения в ячейку -хозяина. Репликация следует за репликацией репликации вируса РНК с положительным становлением. Транскрипция вируса с положительным покрытием РНК является методом транскрипции. Вирус выходит из клетки-хозяина путем вирусного движения, направленного на канальцы. Растения служат естественным хозяином. Вирус передается через вектор (белая муха). Маршруты передачи являются векторными и механическими. ^{[ 1 ]}

Таксономия

Род содержит следующий вид: ^{[ 2 ]}

Угандийский вирус Cassava Brown Streak был первым ипомовирусом, который был клонирован и спасен с использованием плазмидной векторной системы кДНК. ^{[ 4 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} «Вирусная зона» . Расширение . Получено 15 июня 2015 года .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} «Таксономия вируса: выпуск 2020 года» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Март 2021 г. Получено 21 мая 2021 года .
^ Пасин, Фабио; Дарус, Хосе-Антонио; Tzanetakis, ioannis E (23 февраля 2022 г.). «Расширение протеома в эволюционном радиации Potyviridae» . Обзоры микробиологии FEMS . 46 (4): FUAC011. doi : 10.1093/femsre/fuac011 . ISSN 1574-6976 . PMC 9249622 . PMID 35195244 .
^ Грехи, Фабио; Бедо, Леонор С.; Бернабе-Ортс, Джоан Мишель; Галло, Араис; Симон-Метео, Кармен; Орцез, Диего; Гарсия, Джон Антонио (20 октября 2017 г.). Планы ACS Синтетическая биология 6 (10): 1962–1 doi : 10.1021/acsynbio . ISSN 2161-5 PMID 28657330 .

Внешние ссылки

[ViralZone-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} «Вирусная зона» . Расширение . Получено 15 июня 2015 года .

[ICTV-2] Jump up to: ^а ^{беременный} «Таксономия вируса: выпуск 2020 года» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Март 2021 г. Получено 21 мая 2021 года .

[3] Пасин, Фабио; Дарус, Хосе-Антонио; Tzanetakis, ioannis E (23 февраля 2022 г.). «Расширение протеома в эволюционном радиации Potyviridae» . Обзоры микробиологии FEMS . 46 (4): FUAC011. doi : 10.1093/femsre/fuac011 . ISSN 1574-6976 . PMC 9249622 . PMID 35195244 .

[4] Грехи, Фабио; Бедо, Леонор С.; Бернабе-Ортс, Джоан Мишель; Галло, Араис; Симон-Метео, Кармен; Орцез, Диего; Гарсия, Джон Антонио (20 октября 2017 г.). Планы ACS Синтетическая биология 6 (10): 1962–1 doi : 10.1021/acsynbio . ISSN 2161-5 PMID 28657330 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]