NSP6 (ротавирус)
| NSP6 (ротавирус) | |||
|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||
| Символ | Rota_NS6 | ||
| Пфам | PF04866 | ||
| ИнтерПро | ИПР006950 | ||
| |||
Неструктурный белок 6 (NSP6) является одним из двух неструктурных белков, которые ген 11 ротавируса кодирует наряду с NSP5 . [ 1 ] Это предполагаемый белок трансмембранного домена. [ 2 ] NSP6 состоит из шести трансмембранных доменов и С-концевого хвоста. [ 3 ] Было обнаружено, что в отличие от других неструктурных белков ротавируса NSP6 имеет высокую скорость оборота и полностью разлагается в течение 2 часов после синтеза. Было обнаружено, что NSP6 представляет собой независимый от последовательности белок, связывающий нуклеиновую кислоту , с одинаковым сродством к оцРНК и дцРНК. [ 4 ]
Было установлено, что NSP6 выполняет три важные функции. репликации Когда сообщения передаются между органеллами и эндоплазматической сетью (ЭР), NSP6 действует как фильтр. В этом случае NSP6 препятствует доступу белков просвета ЭР к DMV, но обеспечивает прохождение липидов . Затем NSP6 организует кластеры DMV, поскольку кластеры DMV организованы NSP6, он может реконструировать их с помощью липидов, полученных из LD. Наконец, через комплекс LD-привязки DFCP1-RAB18 вмешивается в контакт липидных капель (LD). [ 5 ]
Поскольку NSP6 является одним из двух неструктурных белков, которые кодирует ген 11 NSP6, он обнаружен как в α-, так и в β- коронавирусах и продуцирует аутофагосомы . [ 6 ] Хотя обнаружено, что NSP6 продуцирует значительное количество аутофагосом, при анализе точек MAP1LC3B наблюдается, что аутофагосомы, продуцируемые NSP6, намного меньше по размеру. Как показал статистический анализ точек WIPI2, размер аутофагосом, продуцируемых NSP6, ограничен при формировании омегасомы . Небольшой размер этих аутофагосом препятствует транспортировке вирусных компонентов в лизосомы , что может способствовать заражению коронавирусом. [ 7 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Комото С., Канаи Ю., Фукуда С., Кугита М., Кавагиши Т., Ито Н. и др. (ноябрь 2017 г.). «Система обратной генетики демонстрирует, что неструктурный белок ротавируса NSP6 не важен для репликации вируса в клеточной культуре» . Журнал вирусологии . 91 (21):e00695-1 дои : 10.1128/JVI.00695-17 . ПМК 5640853 . ПМИД 28794037 .
- ^ Ядав Р., Чаудхари Дж.К., Джайн Н., Чаудхари П.К., Ханра С., Дхамиджа П. и др. (апрель 2021 г.). «Роль структурных и неструктурных белков и терапевтических мишеней SARS-CoV-2 для COVID-19» . Клетки . 10 (4): 821. doi : 10.3390/cells10040821 . ПМЦ 8067447 . ПМИД 33917481 .
- ^ Балиджи С., Каммер С.А., Собрал Б., Бейкер СК (июль 2009 г.). «Обнаружение неструктурного белка 6 в клетках, инфицированных мышиным коронавирусом, и анализ трансмембранной топологии с использованием биоинформатики и молекулярных подходов» . Журнал вирусологии . 83 (13): 6957–6962. дои : 10.1128/jvi.00254-09 . ПМЦ 2698535 . ПМИД 19386712 .
- ^ Рейнсфорд Э.В., МакКрэй Массачусетс (декабрь 2007 г.). «Характеристика белкового продукта NSP6 гена 11 ротавируса». Вирусные исследования . 130 (1–2): 193–201. doi : 10.1016/j.virusres.2007.06.011 . ПМИД 17658646 .
- ^ Риккарди С., Гуарино А.М., Джаквинто Л., Полищук Е.В., Санторо М., Ди Туллио Г. и др. (июнь 2022 г.). «Роль NSP6 в биогенезе органеллы репликации SARS-CoV-2» . Природы . 606 (7915): 761–768. Бибкод : 2022Natur.606..761R . дои : 10.1038/s41586-022-04835-6 . ПМЦ 7612910 . ПМИД 35551511 .
- ^ Бенвенуто Д., Анджелетти С., Джованетти М., Бьянки М., Паскарелла С., Кауда Р. и др. (июль 2020 г.). «Эволюционный анализ SARS-CoV-2: как мутация неструктурного белка 6 (NSP6) может повлиять на вирусную аутофагию» . Журнал инфекции . 81 (1): e24–e27. дои : 10.1016/j.jinf.2020.03.058 . ПМЦ 7195303 . ПМИД 32283146 .
- ^ Коттам Э.М., Велбанд М.К., Уайлман Т. (август 2014 г.). «Коронавирус NSP6 ограничивает расширение аутофагосом» . Аутофагия . 10 (8): 1426–1441. дои : 10.4161/auto.29309 . ПМЦ 4203519 . ПМИД 24991833 .