Гликопротеин B герпесвируса

Герпесвирусный гликопротеин B (PH-подобный 1)
Герпесвирусный гликопротеин B (PH-подобный 1)
Идентификаторы
Символ	Гликопрот_B_PH1
Пфам	PF17416
ИнтерПро	ИПР035377
Pfam
показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

Гликопротеин B герпесвируса ( PH-подобный 2)
Гликопротеин B герпесвируса ( PH-подобный 2)
	Кристаллографическая структура гликопротеина В вируса простого герпеса 1 типа.
Идентификаторы
Символ	Гликопрот_B_PH2
Пфам	PF17417
ИнтерПро	ИПР038631
Суперсемейство OPM	109
белок OPM	3nw8
Pfam
показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

гликопротеина В герпеса Эктодомен

Идентификаторы

Символ

Гликопротеин_B

Пфам

PF00606

Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

Гликопротеин B герпесвируса представляет собой вирусный гликопротеин , который участвует в проникновении в клетку вируса простого герпеса (ВПГ). Герпесвирусы имеют липидный бислой , называемый оболочкой , который содержит двенадцать поверхностных гликопротеинов. Для инфекционности достижения геном двухцепочечной ДНК ВПГ должен проникнуть в клетку-хозяина посредством слияния ее оболочки с клеточной мембраной или посредством эндоцитоза . Другие вирусные гликопротеины, участвующие в процессе проникновения в вирусную клетку, включают gC, gB, gD, gH и gL, но только gC, gB, gD и gH необходимы для слияния оболочки ВПГ с клеточной мембраной. Можно отметить, что все герпесвирусы имеют гликопротеины gB, gH и gL. ^{[ 2 ]}

Структура

Гликопротеин B герпесвируса представляет собой трансмембранный белок типа 1 с сигнальной последовательностью на N-конце. ^{[ 2 ]} Кристаллическая структура вируса простого герпеса (ВПГ) типа 1 и вируса Эпштейна-Барра гликопротеина В эктодоменов была решена как тример, в результате чего были выявлены пять структурных доменов (IV). ^{[ 3 ]}^{[ 4 ]} Домен I содержит две внутренние петли слияния, которые, как полагают, встраиваются в клеточную мембрану во время слияния вируса и клетки. ^{[ 5 ]} Предполагается, что в HSV домен II взаимодействует с другим гликопротеином герпесвируса, gH/gL, во время процесса слияния. ^{[ 6 ]} Домен III состоит из структурно важной удлиненной альфа-спирали, тогда как предполагается, что домен IV взаимодействует с клеточными рецепторами. ^{[ 7 ]} Наконец, домен V действует совместно с доменом I во время белок-липидных взаимодействий. При ВПГ нейтрализующие моноклональные антитела локализуются в структурных доменах I, II, IV и V. ^{[ 7 ]} Благодаря своей уникальной структуре гликопротеин В герпесвируса (наряду с гликопротеином G вируса везикулярного стоматита и gp64 бакуловируса) относится к новому классу гликопротеинов вирусного слияния мембран, классу III. ^{[ 3 ]}

Функция

Гликопротеин B герпесвируса является наиболее консервативным из всех поверхностных гликопротеинов и действует преимущественно как слитый белок . Точные функции gB и gH/gL неизвестны, но они необходимы для проникновения вируса в клетку и представляют собой механизм слияния ядра. Утверждение о том, что gB участвует в слиянии, исходит из заметного синцитиального фенотипа, вызванного определенными мутациями в цитоплазматическом домене гликопротеина B. ^{[ 8 ]} а также его структурную гомологию с другими вирусными слитыми белками. ^{[ 3 ]}

Ссылки

^ PDB : 3NW8 ; Стампфер С.Д., Лу Х., Коэн Г.Х., Айзенберг Р.Дж., Хелдвейн Э.Э. (декабрь 2010 г.). «Структурные основы локальных pH-зависимых конформационных изменений гликопротеина B вируса простого герпеса 1 типа» . Дж. Вирол . 84 (24): 12924–33. дои : 10.1128/JVI.01750-10 . ПМК 3004323 . ПМИД 20943984 .
^ Jump up to: ^а ^б Перейра Л., Али М., Косулас К., Хо Б., Бэнкс Т. (сентябрь 1989 г.). «Доменная структура гликопротеина B 1 вируса простого герпеса: карта нейтрализующих эпитопов в областях непрерывных и прерывистых остатков». Вирусология . 172 (1): 11–24. дои : 10.1016/0042-6822(89)90102-5 . ПМИД 2475970 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Хелдвейн Э.Э., Лу Х., Бендер ФК, Коэн Г.Х., Айзенберг Р.Дж., Харрисон СК (июль 2006 г.). «Кристаллическая структура гликопротеина B вируса простого герпеса 1». Наука . 313 (5784): 217–20. Бибкод : 2006Sci...313..217H . CiteSeerX 10.1.1.412.1906 . дои : 10.1126/science.1126548 . ПМИД 16840698 . S2CID 15532098 .
^ Бакович М., Лонгнекер Р., Джардецки Т.С. (февраль 2009 г.). «Структура тримерного варианта гликопротеина B вируса Эпштейна-Барр» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 106 (8): 2880–5. Бибкод : 2009PNAS..106.2880B . дои : 10.1073/pnas.0810530106 . ПМЦ 2650359 . ПМИД 19196955 .
^ Ханна Б.П., Кэрнс Т.М., Бендер ФК, Уитбек Дж.К., Лу Х., Айзенберг Р.Дж., Коэн Г.Х. (июль 2009 г.). «Гликопротеин B вируса простого герпеса связывается с мембранами-мишенями через петли слияния» . Дж. Вирол . 83 (13): 6825–36. дои : 10.1128/JVI.00301-09 . ПМЦ 2698560 . ПМИД 19369321 .
^ Атанасиу Д., Уитбек Дж.С., де Леон М.П., Лу Х., Ханна Б.П., Коэн Г.Х., Айзенберг Р.Дж. (апрель 2010 г.). «Бимолекулярная комплементация определяет функциональные области gB вируса простого герпеса, которые участвуют в gH/gL, что является необходимым шагом, ведущим к слиянию клеток» . Дж. Вирол . 84 (8): 3825–34. дои : 10.1128/JVI.02687-09 . ПМЦ 2849501 . ПМИД 20130048 .
^ Jump up to: ^а ^б Бендер ФК, Саманта М., Хелдвейн Э.Э., де Леон М.П., Билман Э., Лу Х., Уитбек Дж.К., Айзенберг Р.Дж., Коэн Г.Х. (апрель 2007 г.). «Антигенный и мутационный анализ гликопротеина B вируса простого герпеса выявил четыре функциональные области» . Дж. Вирол . 81 (8): 3827–41. дои : 10.1128/JVI.02710-06 . ПМК 1866100 . ПМИД 17267495 .
^ «datasheets.scbt.com» (PDF) .

Дальнейшее чтение

«Информация о гликопротеине Санта-Крус, HSV» (PDF) . Санта-Крус Биотехнология, Инк.

В эту статью включен текст из общественного достояния Pfam и InterPro : IPR000234.

Эта мембранных белках статья о незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[pmid20943984-1] PDB : 3NW8 ; Стампфер С.Д., Лу Х., Коэн Г.Х., Айзенберг Р.Дж., Хелдвейн Э.Э. (декабрь 2010 г.). «Структурные основы локальных pH-зависимых конформационных изменений гликопротеина B вируса простого герпеса 1 типа» . Дж. Вирол . 84 (24): 12924–33. дои : 10.1128/JVI.01750-10 . ПМК 3004323 . ПМИД 20943984 .

[pmid2475970-2] Jump up to: ^а ^б Перейра Л., Али М., Косулас К., Хо Б., Бэнкс Т. (сентябрь 1989 г.). «Доменная структура гликопротеина B 1 вируса простого герпеса: карта нейтрализующих эпитопов в областях непрерывных и прерывистых остатков». Вирусология . 172 (1): 11–24. дои : 10.1016/0042-6822(89)90102-5 . ПМИД 2475970 .

[pmid16840698-3] Jump up to: ^а ^б ^с Хелдвейн Э.Э., Лу Х., Бендер ФК, Коэн Г.Х., Айзенберг Р.Дж., Харрисон СК (июль 2006 г.). «Кристаллическая структура гликопротеина B вируса простого герпеса 1». Наука . 313 (5784): 217–20. Бибкод : 2006Sci...313..217H . CiteSeerX 10.1.1.412.1906 . дои : 10.1126/science.1126548 . ПМИД 16840698 . S2CID 15532098 .

[pmid19196955-4] Бакович М., Лонгнекер Р., Джардецки Т.С. (февраль 2009 г.). «Структура тримерного варианта гликопротеина B вируса Эпштейна-Барр» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 106 (8): 2880–5. Бибкод : 2009PNAS..106.2880B . дои : 10.1073/pnas.0810530106 . ПМЦ 2650359 . ПМИД 19196955 .

[pmid19369321-5] Ханна Б.П., Кэрнс Т.М., Бендер ФК, Уитбек Дж.К., Лу Х., Айзенберг Р.Дж., Коэн Г.Х. (июль 2009 г.). «Гликопротеин B вируса простого герпеса связывается с мембранами-мишенями через петли слияния» . Дж. Вирол . 83 (13): 6825–36. дои : 10.1128/JVI.00301-09 . ПМЦ 2698560 . ПМИД 19369321 .

[pmid20130048-6] Атанасиу Д., Уитбек Дж.С., де Леон М.П., Лу Х., Ханна Б.П., Коэн Г.Х., Айзенберг Р.Дж. (апрель 2010 г.). «Бимолекулярная комплементация определяет функциональные области gB вируса простого герпеса, которые участвуют в gH/gL, что является необходимым шагом, ведущим к слиянию клеток» . Дж. Вирол . 84 (8): 3825–34. дои : 10.1128/JVI.02687-09 . ПМЦ 2849501 . ПМИД 20130048 .

[pmid17267495-7] Jump up to: ^а ^б Бендер ФК, Саманта М., Хелдвейн Э.Э., де Леон М.П., Билман Э., Лу Х., Уитбек Дж.К., Айзенберг Р.Дж., Коэн Г.Х. (апрель 2007 г.). «Антигенный и мутационный анализ гликопротеина B вируса простого герпеса выявил четыре функциональные области» . Дж. Вирол . 81 (8): 3827–41. дои : 10.1128/JVI.02710-06 . ПМК 1866100 . ПМИД 17267495 .

[urldatasheets.scbt.com-8] «datasheets.scbt.com» (PDF) .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]