ОРС6
| Белок NS6 бетакоронавируса | |||
|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||
| Символ | bCoV_NS6 | ||
| Пфам | ПФ12133 | ||
| ИнтерПро | ИПР022736 | ||
| |||
ORF6 — ген , который кодирует вирусный добавочный белок у коронавирусов подрода Sarbecovirus , включая SARS-CoV и SARS-CoV-2 . Его нет в MERS-CoV . Считается, что он снижает реакцию иммунной системы на вирусную инфекцию за счет антагонизма интерферона . [ 1 ] [ 2 ] [ 3 ]
Структура
[ редактировать ]Белок ORF6 довольно мал и состоит из 63 аминокислотных остатков в SARS-CoV. [ 2 ] и 61 — SARS-CoV-2 . [ 3 ] Последовательность ORF6 недостаточно консервативна и имеет относительно низкую идентичность последовательностей между двумя вирусами - около 66%. [ 4 ] Он имеет амфипатическую N-концевую альфа-спираль , которая связана с мембраной , но не является трансмембранным белком . состоящий примерно из 20 остатков, Его С-концевой хвост, полярен , простирается в цитозоль и содержит сигнальные последовательности для транспортировки белков . [ 1 ] [ 2 ]
Выражение и локализация
[ редактировать ]Как и гены других вспомогательных белков, ген ORF6 расположен рядом с генами, кодирующими структурные белки , на 5'- конце генома РНК коронавируса. Наряду с ORF7a , ORF7b и ORF8 , ORF6 расположена между мембраны (M) и нуклеокапсида (N). генами [ 1 ] [ 2 ] [ 3 ] Локализуется в эндоплазматическом ретикулуме и аппарате Гольджи . [ 1 ] [ 2 ] [ 3 ] исследования SARS-CoV-2 также указывают на связь с везикулами , такими как аутофагосомы и лизосомы . [ 3 ]
Функция
[ редактировать ]Считается, что основной функцией белка ORF6 является иммуномодуляция и антагонизм интерферона . Он не важен для репликации вируса , хотя его отсутствие, по-видимому, снижает эффективность репликации. [ 1 ] [ 2 ]
Взаимодействие вирусных белков
[ редактировать ]Исследования SARS-CoV показывают, что белок ORF6 проявляет белок-белковые взаимодействия с другим вирусным добавочным белком, белком ORF9b . [ 1 ] [ 5 ] В SARS-CoV, но не в рекомбинантном вирусе мышиного гепатита , белок ORF6 был обнаружен в вирусоподобных частицах и зрелых вирионах , что позволяет предположить, что он может быть второстепенным структурным белком вируса . [ 1 ] [ 2 ]
Иммунные эффекты
[ редактировать ]Белок ORF6 как SARS-CoV, так и SARS-CoV-2 является антагонистом интерферона и, как полагают, участвует в уклонении от иммунитета . несколько белок-белковых взаимодействий с белками клетки-хозяина, Описано которые опосредуют этот эффект. Сообщалось, что он ингибирует ядерный импорт STAT , транскрипционного фактора ингибируя активацию интерферона. [ 1 ] [ 3 ] Исследования SARS-CoV показывают, что это может быть опосредовано связыванием белка ORF6 с кариоферинами . [ 1 ] [ 4 ] Сообщается, что при SARS-CoV-2 белок ORF6 взаимодействует с RAE1 и NUP98 , блокируя взаимодействие кариоферина. [ 3 ] [ 6 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с д и ж г час я Лю Д.С., Фунг Т.С., Чонг К.К., Шукла А., Хильгенфельд Р. (сентябрь 2014 г.). «Акцессорные белки SARS-CoV и других коронавирусов» . Противовирусные исследования . 109 : 97–109. дои : 10.1016/j.antiviral.2014.06.013 . ПМЦ 7113789 . ПМИД 24995382 .
- ^ Jump up to: а б с д и ж г Макбрайд Р., Филдинг, Британская Колумбия (ноябрь 2012 г.). «Роль дополнительных белков тяжелого острого респираторного синдрома (ТОРС)-коронавируса в патогенезе вируса» . Вирусы . 4 (11): 2902–2923. дои : 10.3390/v4112902 . ПМК 3509677 . ПМИД 23202509 .
- ^ Jump up to: а б с д и ж г Редондо Н., Сальдивар-Лопес С., Гарридо Х.Дж., Монтойя М. (7 июля 2021 г.). «Акцессорные белки SARS-CoV-2 в вирусном патогенезе: известные и неизвестные» . Границы в иммунологии . 12 : 708264. дои : 10.3389/fimmu.2021.708264 . ПМЦ 8293742 . ПМИД 34305949 .
- ^ Jump up to: а б Сурьяванши Р.К., Коганти Р., Агелидис А., Патил К.Д., Шукла Д. (март 2021 г.). «Нарушение регуляции клеточной сигнализации SARS-CoV-2» . Тенденции в микробиологии . 29 (3): 224–237. дои : 10.1016/j.tim.2020.12.007 . ПМЦ 7836829 . ПМИД 33451855 .
- ^ Болд Э., ДеДиего М.Л., Гарсия П., Лопес Х.А., Перес-Бренья П., Фалькон А. (октябрь 2012 г.). «Дополнительные белки 6 и 9b коронавируса тяжелого острого респираторного синдрома взаимодействуют in vivo» . Вирусные исследования 169 (1): 282–288. doi : 10.1016/j.virusres.2012.07.012 . ПМЦ 7114373 . ПМИД 22820404 .
- ^ Миорин Л., Керер Т., Санчес-Апарисио М.Т., Чжан К., Коэн П., Патель Р.С. и др. (ноябрь 2020 г.). «SARS-CoV-2 Orf6 захватывает Nup98, чтобы блокировать импорт ядра STAT и противодействовать передаче сигналов интерферона» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 117 (45): 28344–28354. Бибкод : 2020PNAS..11728344M . дои : 10.1073/pnas.2016650117 . ПМЦ 7668094 . ПМИД 33097660 .
