НУП98

НУП98
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB showСписок идентификационных кодов PDB 1KO6, 2Q5X, 2Q5Y, 3MMY, 4OWR, 5A9Q
Идентификаторы
Псевдонимы	NUP98 , ADIR2, NUP196, NUP96, нуклеопорин 98 кДа, нуклеопорин 98
Внешние идентификаторы	Опустить : 601021 ; МГИ : 109404 ; Гомологен : 35472 ; Генные карты : NUP98 ; ОМА : NUP98 — ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 11 (human) Band 11p15.4 Start 3,671,083 bp End 3,797,792 bp
showМестоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 7 (mouse) Band 7 E2|7 54.71 cM Start 101,768,605 bp End 101,859,383 bp
show экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in left testis right testis epithelium of colon secondary oocyte ventricular zone muscle of thigh left ovary Achilles tendon left uterine tube upper lobe of left lung Top expressed in secondary oocyte zygote spermatid primary oocyte vestibular membrane of cochlear duct tail of embryo internal carotid artery external carotid artery spermatocyte genital tubercle More reference expression data BioGPS More reference expression data
showГенная онтология Molecular function transporter activity peptide binding protein binding nuclear localization sequence binding RNA binding peptidase activity serine-type peptidase activity hydrolase activity transcription coactivator activity mRNA binding promoter-specific chromatin binding structural constituent of nuclear pore Cellular component cytosol nuclear membrane nuclear envelope nuclear periphery membrane nuclear pore nuclear pore outer ring nuclear inclusion body nuclear pore nuclear basket nucleus kinetochore nuclear pore cytoplasmic filaments nucleoplasm intracellular membrane-bounded organelle nuclear body ribonucleoprotein complex host cell Biological process mRNA transport nuclear pore complex assembly DNA replication protein transport viral process nuclear pore organization posttranscriptional tethering of RNA polymerase II gene DNA at nuclear periphery RNA export from nucleus telomere tethering at nuclear periphery mRNA export from nucleus protein import into nucleus proteolysis positive regulation of transcription by RNA polymerase II positive regulation of mRNA splicing, via spliceosome transcription by RNA polymerase II nucleocytoplasmic transport positive regulation of nucleic acid-templated transcription regulation of glycolytic process tRNA export from nucleus protein sumoylation viral transcription regulation of gene silencing by miRNA intracellular transport of virus regulation of cellular response to heat Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 4928 269966 Вместе ENSG00000110713 ENSMUSG00000063550 ЮниПрот P52948 Q6PFD9 RefSeq (мРНК) НМ_005387 НМ_016320 НМ_139131 НМ_139132 НМ_001287164 НМ_001287165 НМ_001287166 НМ_001287167 НМ_022979 RefSeq (белок) showНП_005378 НП_057404 НП_624357 НП_624358 НП_001352054 NP_001352055 NP_001352056 NP_001352057 NP_001352058 showНП_001274093 НП_001274094 НП_001274095 НП_001274096 НП_075355 NP_001391063 NP_001391064 NP_001391065 NP_001391066 NP_001391067 NP_001391068 NP_001391069 NP_001391070 Местоположение (UCSC) Чр 11: 3,67 – 3,8 Мб Chr 7: 101,77 – 101,86 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Белок комплекса ядерных пор Nup98-Nup96 представляет собой белок , который у человека кодируется NUP98 геном .

Функция

Опосредованный сигналами ядерный импорт и экспорт происходят через комплекс ядерных пор (NPC), который состоит примерно из 30 уникальных белков, известных под общим названием нуклеопорины. Нуклеопорин массой 98 кДа образуется путем биогенеза, который включает синтез и протеолитическое расщепление белка-предшественника массой 186 кДа. В результате этого расщепления образуется нуклеопорин 98 кДа, а также нуклеопорин 96 кДа, оба из которых локализованы на нуклеоплазматической стороне NPC. Исследования на крысах показывают, что нуклеопорин 98 кДа функционирует как один из нескольких нуклеопоринов сайта стыковки транспортных субстратов. Было показано, что человеческий ген сливается с несколькими генами после хромосомных транслокаций при остром миелогенном лейкозе (ОМЛ) и остром Т-клеточном лимфоцитарном лейкозе (Т-ОЛЛ). Этот ген является одним из нескольких генов, расположенных в импринтированном генном домене 11p15.5, важной области гена-супрессора опухолей. Изменения в этой области связаны с синдромом Беквита-Видемана, опухолью Вильмса, рабдомиосаркомой, адренокортикальной карциномой, а также раком легких, яичников и молочной железы. Альтернативный сплайсинг этого гена приводит к образованию нескольких вариантов транскрипта; однако не все варианты полностью описаны.

Взаимодействия

Было показано, что NUP98 взаимодействует с:

• CREB-связывающий белок ,
• КПНБ1 ,
• НУП88 ,
• РАЭ1 , и
• ТНПО2 .

Дальнейшее чтение

• Слейп С., Аплан П.Д. (2004). «Роль слияний генов NUP98 в гематологических злокачественных новообразованиях». Лейк. Лимфома . 45 (7): 1341–50. дои : 10.1080/10428190310001659325 . ПМИД   15359631 . S2CID   20926084 .
• Мур М.А., Чунг К.Ю., Пласилова М., Шуринга Дж.Дж., Ши Дж.Х., Чжоу П., Морроне Г. (2007). «Нарушение регуляции NUP98 при миелоидном лейкемогенезе». Энн. Н-Й акад. Наука . 1106 (1): 114–42. Бибкод : 2007NYASA1106..114M . дои : 10.1196/анналы.1392.019 . ПМИД   17442773 . S2CID   25039911 .
• Раду А., Мур М.С., Блобель Г. (1995). «Домен пептидного повтора нуклеопорина Nup98 функционирует как место стыковки при транспорте через комплекс ядерных пор» . Клетка . 81 (2): 215–22. дои : 10.1016/0092-8674(95)90331-3 . ПМИД   7736573 . S2CID   19024872 .
• Накамура Т., Ларгаэспада Д.А., Ли М.П., ​​Джонсон Л.А., Охяшики К., Тояма К., Чен С.Дж., Уиллман К.Л., Чен И.М., Файнберг А.П., Дженкинс Н.А., Коупленд Н.Г., Шонесси Дж.Д. (1996). «Слияние гена нуклеопорина NUP98 с HOXA9 путем хромосомной транслокации t (7; 11) (p15; p15) при миелолейкозе человека». Нат. Жене . 12 (2): 154–8. дои : 10.1038/ng0296-154 . ПМИД   8563753 . S2CID   6400265 .
• Заем Дж., Ширман А.М., Стэнтон В.П., Бечер Р., Коллинз Т., Уильямс А.Дж., Дубе И., Кац Ф., Квонг Ю.Л., Моррис С., Охьяшики К., Тояма К., Роули Дж., Хаусман Д.Э. (1996). «Транслокация t (7; 11) (p15; p15) при остром миелолейкозе объединяет гены нуклеопорина NUP98 и гомеопротеина класса I HOXA9». Нат. Жене . 12 (2): 159–67. дои : 10.1038/ng0296-159 . ПМИД   8563754 . S2CID   21252465 .
• Ху Т, Гуань Т, Джераче Л (1996). «Молекулярная и функциональная характеристика комплекса p62, совокупности гликопротеинов комплекса ядерных пор» . Дж. Клеточная Биол . 134 (3): 589–601. дои : 10.1083/jcb.134.3.589 . ПМК   2120945 . ПМИД   8707840 .
• Штутц Ф., Изаурральде Э., Маттай И.В., Росбаш М. (1996). «Роль повторяющихся доменов нуклеопорина FG в экспорте белка Rev вируса иммунодефицита человека типа 1 и РНК из ядра» . Мол. Клетка. Биол . 16 (12): 7144–50. дои : 10.1128/mcb.16.12.7144 . ПМК   231718 . ПМИД   8943370 .
• Ясин Н.Р., Блобель Г. (1997). «Клонирование и характеристика кариоферина бета3 человека» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 94 (9): 4451–6. Бибкод : 1997PNAS...94.4451Y . дои : 10.1073/pnas.94.9.4451 . ПМК   20743 . ПМИД   9114010 .
• Бонифачи Н., Морояну Дж., Раду А., Блобель Г. (1997). «Кариоферин бета2 опосредует ядерный импорт белка, связывающего мРНК» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 94 (10): 5055–60. Бибкод : 1997PNAS...94.5055B . дои : 10.1073/pnas.94.10.5055 . ПМК   24630 . ПМИД   9144189 .
• Гранди П., Данг Т., Пане Н., Шевченко А., Манн М., Форбс Д., Хёрт Э. (1997). «Nup93, гомолог дрожжей Nic96p у позвоночных, образует комплекс с новым белком массой 205 кДа и необходим для правильной сборки ядерных пор» . Мол. Биол. Клетка . 8 (10): 2017–38. дои : 10.1091/mbc.8.10.2017 . ПМК   25664 . ПМИД   9348540 .
• Золотухин А.С., Фельбер Б.К. (1999). «Нуклеопорины nup98 и nup214 участвуют в ядерном экспорте вируса иммунодефицита человека типа 1 Rev» . Дж. Вирол . 73 (1): 120–7. doi : 10.1128/JVI.73.1.120-127.1999 . ПМЦ   103815 . ПМИД   9847314 .
• Каспер Л.Х., Бриндл П.К., Шнабель К.А., Притчард С.Э., Клири М.Л., ван Дёрсен Дж.М. (1999). «CREB-связывающий белок взаимодействует со специфичными для нуклеопоринов повторами FG, которые активируют транскрипцию и опосредуют онкогенность NUP98-HOXA9» . Мол. Клетка. Биол . 19 (1): 764–76. дои : 10.1128/mcb.19.1.764 . ПМЦ   83933 . ПМИД   9858599 .
• Фонтура Б.М., Блобель Г., Матунис М.Ю. (1999). «Консервативный путь биогенеза нуклеопоринов: протеолитический процессинг предшественника массой 186 килодальтон генерирует Nup98 и новый нуклеопорин Nup96» . Дж. Клеточная Биол . 144 (6): 1097–112. дои : 10.1083/jcb.144.6.1097 . ПМК   2150585 . ПМИД   10087256 .
• Притчард С.Э., Форнерод М., Каспер Л.Х., ван Дёрсен Дж.М. (1999). «RAE1 представляет собой фактор экспорта челночной мРНК, который связывается с GLEBS-подобным мотивом NUP98 в комплексе ядерных пор через несколько доменов» . Дж. Клеточная Биол . 145 (2): 237–54. дои : 10.1083/jcb.145.2.237 . ПМК   2133102 . ПМИД   10209021 .
• Ахуджа Х.Г., Феликс К.А., Аплан П.Д. (1999). «Хромосомная транслокация t(11;20)(p15;q11), связанная с миелодиспластическим синдромом, связанным с терапией, приводит к слиянию NUP98-TOP1». Кровь . 94 (9): 3258–61. дои : 10.1182/blood.V94.9.3258 . ПМИД   10556215 .
• Бачи А., Браун И.С., Родригес Ж.П., Панте Н., Риббек К., фон Коббе С., Кутай У., Вильм М., Герлих Д., Кармо-Фонсека М., Изаурральде Е (2000). «С-концевой домен TAP взаимодействует с комплексом ядерных пор и способствует экспорту специфических CTE-несущих РНК-субстратов» . РНК . 6 (1): 136–58. дои : 10.1017/S1355838200991994 . ПМЦ   1369901 . ПМИД   10668806 .
• Фонтура Б.М., Блобель Г., Ясин Н.Р. (2000). «Нуклеопорин Nup98 является местом обмена GDP/GTP для запуска и прекращения ядерного импорта, опосредованного кариоферином бета 2» . Ж. Биол. Хим . 275 (40): 31289–96. дои : 10.1074/jbc.M004651200 . ПМИД   10875935 .
• Родригес Х.П., Ситтерлин Д., Бачи А., Ву Х, Вильм М., Кармо-Фонсека М., Изаурральде Э. (2000). «Белок матрикса вируса везикулярного стоматита ингибирует экспрессию генов клетки-хозяина, воздействуя на нуклеопорин Nup98» . Мол. Клетка . 6 (5): 1243–52. дои : 10.1016/S1097-2765(00)00120-9 . ПМИД   11106761 .
• Хофманн В., Райхарт Б., Эвальд А., Мюллер Э., Шмитт И., Стаубер Р.Х., Лотспейх Ф., Йокуш Б.М., Шеер У., Хаубер Дж., Дабаувалле М.С. (2001). «Требования к кофакторам для ядерного экспорта ретровирусных РНК, содержащих Rev-ответный элемент (RRE) и конститутивный транспортный элемент (CTE). Неожиданная роль актина» . Дж. Клеточная Биол . 152 (5): 895–910. дои : 10.1083/jcb.152.5.895 . ПМК   2198816 . ПМИД   11238447 .