Нуклеопорин 88

НУП88
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB показывать Список идентификационных кодов PDB 7R5J, 7R5K, 7TDZ, 7VOP
Идентификаторы
Псевдонимы	NUP88 , нуклеопорин 88, FADS4
Внешние идентификаторы	Опустить : 602552 ; МГИ : 104900 ; Гомологен : 1901 ; Генные карты : NUP88 ; OMA : NUP88 — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 17 (human) Band 17p13.2 Start 5,360,963 bp End 5,419,676 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 11 (mouse) Band 11 B4|11 43.21 cM Start 70,833,884 bp End 70,860,799 bp
показывать экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in right testis left testis oocyte gonad right lobe of liver secondary oocyte sperm mucosa of transverse colon left lobe of thyroid gland ventricular zone Top expressed in tail of embryo zygote genital tubercle secondary oocyte medial ganglionic eminence spermatocyte primary oocyte abdominal wall ventricular zone epiblast More reference expression data BioGPS More reference expression data
показывать Генная онтология Molecular function transporter activity structural constituent of nuclear pore Cellular component cytosol nuclear pore nucleoplasm nucleus host cell Biological process mRNA transport protein import into nucleus protein transport viral process mRNA export from nucleus mitotic cell cycle ribosomal large subunit export from nucleus ribosomal small subunit export from nucleus nucleocytoplasmic transport protein export from nucleus regulation of glycolytic process tRNA export from nucleus protein sumoylation viral transcription regulation of gene silencing by miRNA intracellular transport of virus regulation of cellular response to heat Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи Разновидность Человек Мышь Входить 4927 19069 Вместе ENSG00000108559 ENSMUSG00000040667 ЮниПрот Q99567 Q8CEC0 RefSeq (мРНК) НМ_002532 НМ_001320653 НМ_001083331 НМ_001276406 НМ_172394 RefSeq (белок) НП_001307582 НП_002523 НП_001076800 НП_001263335 НП_765982 Местоположение (UCSC) Чр 17: 5,36 – 5,42 Мб Чр 11: 70,83 – 70,86 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Нуклеопорин 88 ( Nup88 ) представляет собой белок , который у человека кодируется NUP88 геном .

Функция

Комплекс ядерных пор представляет собой массивную структуру, которая простирается через ядерную оболочку, образуя ворота, регулирующие поток макромолекул между ядром и цитоплазмой. Нуклеопорины, семейство, состоящее из 50–100 белков, являются основными компонентами комплекса ядерных пор в эукариотических клетках. Белок, кодируемый этим геном, принадлежит к семейству нуклеопоринов и связан с онкогенным нуклеопорином CAN/Nup214 в динамическом субкомплексе. Этот белок также сверхэкспрессируется при большом количестве злокачественных новообразований и предраковых дисплазий.

Взаимодействия

Было показано, что NUP88 взаимодействует с NUP98 .

Дальнейшее чтение

• Стоффлер Д., Фаренкрог Б., Эби Ю. (1999). «Комплекс ядерных пор: от молекулярной архитектуры к функциональной динамике». Курс. Мнение. Клеточная Биол . 11 (3): 391–401. дои : 10.1016/S0955-0674(99)80055-6 . ПМИД   10395558 .
• Худ Дж.К., Сильвер Пенсильвания (2000). «Различные пути ядерного транспорта регулируют пролиферацию клеток и онкогенез». Биохим. Биофиз. Акта . 1471 (1): М31–41. дои : 10.1016/s0304-419x(00)00018-4 . ПМИД   10967423 .
• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД   8125298 .
• Форнерод М., ван Баал С., Валентин В., Шапиро Д.Н., Гросвельд Г. (1997). «Хромосомная локализация генов, кодирующих белки, взаимодействующие с CAN/Nup214: CRM1 человека локализуется в 2p16, тогда как Nup88 локализуется в 17p13 и физически связан с SF2p32». Геномика . 42 (3): 538–40. дои : 10.1006/geno.1997.4767 . ПМИД   9205132 .
• Сузуки Ю, Ёситомо-Накагава К, Маруяма К, Суяма А, Сугано С (1997). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД   9373149 .
• Бур Дж., Бонтен-Суртель Дж., Гросвельд Г. (1998). «Сверхэкспрессия нуклеопорина CAN/NUP214 вызывает остановку роста, дефекты нуклеоцитоплазматического транспорта и апоптоз» . Мол. Клетка. Биол . 18 (3): 1236–47. дои : 10.1128/mcb.18.3.1236 . ПМЦ   108836 . ПМИД   9488438 .
• Мартинес Н., Алонсо А., Морагес, доктор медицинских наук, Понтон Дж., Шнайдер Дж. (1999). «Белок Nup88 комплекса ядерных пор сверхэкспрессируется в опухолевых клетках». Рак Рез . 59 (21): 5408–11. ПМИД   10554006 .
• Гулд В.Е., Мартинес Н., Оручевич А., Шнайдер Дж., Алонсо А. (2000). «Новая, связанная с ядерными порами, широко распространенная молекула, сверхэкспрессирующаяся в онкогенезе и развитии» . Являюсь. Дж. Патол . 157 (5): 1605–13. дои : 10.1016/S0002-9440(10)64798-0 . ПМК   1885726 . ПМИД   11073820 .
• Ву X, Каспер Л.Х., Манчева РТ, Манчев Г.Т., Спрингетт М.Дж., ван Дёрсен Дж.М. (2001). «Нарушение нуклеопорина FG NUP98 вызывает избирательные изменения в стехиометрии и функции комплекса ядерных пор» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 98 (6): 3191–6. Бибкод : 2001PNAS...98.3191W . дои : 10.1073/pnas.051631598 . ПМК   30629 . ПМИД   11248054 .
• Гулд В.Е., Оручевич А., Зентграф Х., Гаттузо П., Мартинес Н., Алонсо А. (2002). «Nup88 (кариопорин) при злокачественных новообразованиях и дисплазиях человека: корреляция иммуноокрашивания срезов тканей, цитологических мазков и иммуноблот-анализа». Хм. Патол . 33 (5): 536–44. дои : 10.1053/hupa.2002.124785 . ПМИД   12094380 .
• Гриффис Э.Р., Сюй С., Пауэрс М.А. (2003). «Nup98 локализуется как на ядерной, так и на цитоплазматической стороне ядерной поры и связывается с двумя различными субкомплексами нуклеопоринов» . Мол. Биол. Клетка . 14 (2): 600–10. doi : 10.1091/mbc.E02-09-0582 . ПМК   149995 . ПМИД   12589057 .
• Агудо Д., Гомес-Эскер Ф., Мартинес-Аррибас Ф., Нуньес-Вильяр М.Дж., Поллан М., Шнайдер Дж. (2004). «Сверхэкспрессия мРНК Nup88 связана с высокой агрессивностью рака молочной железы» . Межд. Дж. Рак . 109 (5): 717–20. дои : 10.1002/ijc.20034 . ПМИД   14999780 . S2CID   28081933 .
• Шнайдер Дж., Линарес Р., Мартинес-Аррибас Ф., Морагес М.Д., Нуньес-Вильяр М.Дж., Паломар М.А., Понтон Дж. (2004). «Развивающиеся куриные эмбрионы экспрессируют белок, который имеет гомологию с белком комплекса ядерных пор Nup88, присутствующим в опухолях человека» . Межд. Дж. Дев. Биол . 48 (4): 339–42. дои : 10.1387/ijdb.031748js . ПМИД   15300515 .
• Бернад Р., Энгельсма Д., Сандерсон Х., Пикерсгилл Х., Форнерод М. (2006). «Субкомплекс нуклеопоринов Nup214-Nup88 необходим для CRM1-опосредованного прерибосомального ядерного экспорта 60S» . Ж. Биол. Хим . 281 (28): 19378–86. дои : 10.1074/jbc.M512585200 . ПМИД   16675447 .
• Босолей С.А., Виллен Дж., Гербер С.А., Раш Дж., Гиги С.П. (2006). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации сайтов». Нат. Биотехнология . 24 (10): 1285–92. дои : 10.1038/nbt1240 . ПМИД   16964243 . S2CID   14294292 .