РАЭ1

РАЭ1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	3MMY, 4OWR
Идентификаторы
Псевдонимы	RAE1 , MIG14, MRNP41, Mnrp41, dJ481F12.3, dJ800J21.1, экспорт рибонуклеиновой кислоты 1, Gle2
Внешние идентификаторы	Опустить : 603343 ; МГИ : 1913929 ; Гомологен : 2676 ; Генные карты : RAE1 ; OMA : RAE1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 20 (human)
End	57,379,211 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 2 (mouse)
End	172,857,532 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	secondary oocyte; ; sperm; ; left testis; ; right testis; ; tendon of biceps brachii; ; internal globus pallidus; ; embryo; ; trabecular bone; ; ganglionic eminence; ; bone marrow;
	Top expressed in
	otic placode; ; spermatocyte; ; saccule; ; otic vesicle; ; spermatid; ; epiblast; ; zygote; ; embryo; ; mandibular prominence; ; ventricular zone;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	microtubule binding; RNA binding; protein binding; ubiquitin binding;
Cellular component	cytoplasm; nuclear pore; nucleus; nuclear envelope; fibrillar center; mitotic spindle pole; spindle pole; cytoskeleton; host cell;
Biological process	cellular response to organic cyclic compound; viral process; regulation of mitotic spindle organization; transcription-dependent tethering of RNA polymerase II gene DNA at nuclear periphery; RNA export from nucleus; protein import into nucleus; cell cycle; cell division; mRNA export from nucleus; regulation of glycolytic process; tRNA export from nucleus; protein sumoylation; viral transcription; regulation of gene silencing by miRNA; intracellular transport of virus; regulation of cellular response to heat;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	8480
	66679
	ENSG00000101146
	ENSMUSG00000027509
	P78406
	Q8C570
	НМ_001015885 ; НМ_003610
	НМ_175112
	НП_001015885 ; НП_003601
	НП_780321
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Фактор экспорта мРНК — белок , который у человека кодируется RAE1 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Было показано, что мутации в генах Schizosaccharomyces pombe Rae1 и Saccharomyces cerevisiae Gle2 приводят к накоплению поли(А)-содержащей мРНК в ядре, что позволяет предположить, что кодируемые белки участвуют в экспорте РНК. Белок, кодируемый этим геном, является гомологом дрожжевого Rae1. Он содержит четыре мотива WD40 и, как было показано, локализуется в отдельных фокусах в нуклеоплазме, в ядерном ободе и в сетчатых структурах по всей цитоплазме. Считается, что этот ген участвует в нуклеоцитоплазматическом транспорте, а также в прямом или опосредованном прикреплении цитоплазматических мРНП к цитоскелету. Для этого гена были обнаружены альтернативно сплайсированные варианты транскрипта, кодирующие тот же белок. ^{[ 7 ]}

Взаимодействия

Было показано, что RAE1 взаимодействует с NUP98 . ^{[ 8 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000101146 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027509 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Бхарати А., Гош А., Уэлен В.А., Юн Дж.Х., Пу Р., Дассо М., Дхар Р. (декабрь 1997 г.). «Ген человека RAE1 является функциональным гомологом гена Schizosaccharomyces pombe rae1, участвующего в ядерном экспорте поли(А)+ РНК». Джин . 198 (1–2): 251–8. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00322-3 . ПМИД 9370289 .
^ Кремер Д., Блобель Г. (сентябрь 1997 г.). «МРНК-связывающий белок mrnp 41 локализуется как в ядре, так и в цитоплазме» . Proc Natl Acad Sci США . 94 (17): 9119–24. Бибкод : 1997PNAS...94.9119K . дои : 10.1073/pnas.94.17.9119 . ПМК 23064 . ПМИД 9256445 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: RAE1, RAE1 РНК, экспортный гомолог 1 (S. pombe)» .
^ Причард, CE; Форнерод М; Каспер Л.Х.; ван Дёрсен Дж. М. (апрель 1999 г.). «RAE1 представляет собой фактор экспорта челночной мРНК, который связывается с GLEBS-подобным мотивом NUP98 в комплексе ядерных пор через несколько доменов» . Дж. Клеточная Биол . 145 (2): 237–54. дои : 10.1083/jcb.145.2.237 . ISSN 0021-9525 . ПМК 2133102 . ПМИД 10209021 .

Дальнейшее чтение

Номура М., Зоу З., Джо Т. и др. (1997). «Геномные структуры и характеристика членов семейства Rae1, кодирующих GPI-заякоренные белки клеточной поверхности и экспрессируемых преимущественно в мозге эмбриональных мышей». Дж. Биохим . 120 (5): 987–95. doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a021517 . ПМИД 8982867 .
Юн Дж.Х., Уэлен В.А., Бхарати А. и др. (1997). «Npp106p, нуклеопорин Schizosaccharomyces pombe, аналогичный Saccharomyces cerevisiae Nic96p, функционально взаимодействует с Rae1p при экспорте мРНК» . Мол. Клетка. Биол . 17 (12): 7047–60. дои : 10.1128/MCB.17.12.7047 . ПМК 232561 . ПМИД 9372936 .
Мацуока Ю., Такаги М., Бан Т. и др. (1999). «Идентификация и характеристика субкомплексов ядерных пор в митотическом экстракте соматических клеток человека». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 254 (2): 417–23. дои : 10.1006/bbrc.1998.9953 . ПМИД 9918853 .
Притчард С.Э., Форнерод М., Каспер Л.Х., ван Дёрсен Дж.М. (1999). «RAE1 представляет собой фактор экспорта мРНК, который связывается с GLEBS-подобным мотивом NUP98 в комплексе ядерных пор через несколько доменов» . Дж. Клеточная Биол . 145 (2): 237–54. дои : 10.1083/jcb.145.2.237 . ПМК 2133102 . ПМИД 10209021 .
Бачи А., Браун И.С., Родригес Дж.П. и др. (2000). «С-концевой домен TAP взаимодействует с комплексом ядерных пор и способствует экспорту специфических CTE-несущих РНК-субстратов» . РНК . 6 (1): 136–58. дои : 10.1017/S1355838200991994 . ПМЦ 1369901 . ПМИД 10668806 .
Юн Дж.Х., Лав Д.С., Гухатхакурта А. и др. (2000). «Mex67p Schizosaccharomyces pombe взаимодействует с Rae1p, обеспечивая экспорт мРНК» . Мол. Клетка. Биол . 20 (23): 8767–82. дои : 10.1128/MCB.20.23.8767-8782.2000 . ПМК 86506 . ПМИД 11073978 .
Сабри Н., Виза Н (2000). «Белок Ct-RAE1 взаимодействует с частицами РНП кольца Бальбиани в ядерной поре» . РНК . 6 (11): 1597–609. дои : 10.1017/S1355838200001138 . ПМК 1370029 . ПМИД 11105759 .
Ван Х, Бабу Дж.Р., Харден Дж.М. и др. (2001). «Белок митотической контрольной точки hBUB3 и фактор экспорта мРНК hRAE1 взаимодействуют с белками, содержащими GLE2p-связывающую последовательность (GLEBS)» . Ж. Биол. Хим . 276 (28): 26559–67. дои : 10.1074/jbc.M101083200 . ПМИД 11352911 .
О'Каллаган К.А., Червенка А., Уиллкокс Б.Е. и др. (2001). «Молекулярная конкуренция за NKG2D: H60 и RAE1 неравным образом конкурируют за NKG2D с доминированием H60» . Иммунитет . 15 (2): 201–11. дои : 10.1016/S1074-7613(01)00187-X . ПМИД 11520456 .
Делоукас П., Мэтьюз Л.Х., Ашерст Дж. и др. (2002). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ 20-й хромосомы человека» . Природа . 414 (6866): 865–71. Бибкод : 2001Natur.414..865D . дои : 10.1038/414865a . ПМИД 11780052 .
Кремер Д., Дресбах Т., Дренкхан Д. (2002). «Mrnp41 (Rae 1p) ассоциируется с микротрубочками в клетках HeLa и нейронах». Евро. Дж. Клеточная Биол . 80 (12): 733–40. дои : 10.1078/0171-9335-00216 . ПМИД 11831386 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД 14702039 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Фариа П.А., Чакраборти П., Левай А. и др. (2005). «ВВС нарушает путь ядерного экспорта мРНК Rae1/mrnp41» . Мол. Клетка . 17 (1): 93–102. doi : 10.1016/j.molcel.2004.11.023 . ПМИД 15629720 .
Бензингер А., Мустер Н., Кох Х.Б. и др. (2005). «Целевой протеомный анализ сигмы 14-3-3, эффектора p53, который обычно подавляется при раке» . Мол. Клетка. Протеомика . 4 (6): 785–95. дои : 10.1074/mcp.M500021-MCP200 . ПМИД 15778465 .
Блоуэр, М.Д., Начури М., Хилд Р., Вейс К. (2005). «Для сборки митотического веретена необходим рибонуклеопротеиновый комплекс, содержащий Rae1» . Клетка . 121 (2): 223–34. дои : 10.1016/j.cell.2005.02.016 . ПМИД 15851029 . S2CID 242561 .
Вонг Р.В., Блобель Г., Кутавас Э. (2007). «Взаимодействие Rae1 с NuMA необходимо для формирования биполярного веретена» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 103 (52): 19783–7. Бибкод : 2006PNAS..10319783W . дои : 10.1073/pnas.0609582104 . ПМК 1750899 . ПМИД 17172455 .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 20 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000101146 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027509 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9370289-5] Бхарати А., Гош А., Уэлен В.А., Юн Дж.Х., Пу Р., Дассо М., Дхар Р. (декабрь 1997 г.). «Ген человека RAE1 является функциональным гомологом гена Schizosaccharomyces pombe rae1, участвующего в ядерном экспорте поли(А)+ РНК». Джин . 198 (1–2): 251–8. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00322-3 . ПМИД 9370289 .

[pmid9256445-6] Кремер Д., Блобель Г. (сентябрь 1997 г.). «МРНК-связывающий белок mrnp 41 локализуется как в ядре, так и в цитоплазме» . Proc Natl Acad Sci США . 94 (17): 9119–24. Бибкод : 1997PNAS...94.9119K . дои : 10.1073/pnas.94.17.9119 . ПМК 23064 . ПМИД 9256445 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: RAE1, RAE1 РНК, экспортный гомолог 1 (S. pombe)» .

[pmid10209021-8] Причард, CE; Форнерод М; Каспер Л.Х.; ван Дёрсен Дж. М. (апрель 1999 г.). «RAE1 представляет собой фактор экспорта челночной мРНК, который связывается с GLEBS-подобным мотивом NUP98 в комплексе ядерных пор через несколько доменов» . Дж. Клеточная Биол . 145 (2): 237–54. дои : 10.1083/jcb.145.2.237 . ISSN 0021-9525 . ПМК 2133102 . ПМИД 10209021 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]