Человеческая идентичная последовательность

Идентичная последовательность человека (HIS) представляет собой последовательность РНК-элементов, 24-27 нуклеотидов , которые делятся геномами коронавируса с геномом человека . ^{[ 1 ]} В патогенном прогрессировании его действуют как намирна (ядерная активирующая miRNA) через сеть намирна- энхансер для активации соседних генов-хозяев. ^{[ 2 ]}^{[ 3 ]} Первый его элементы были идентифицированы в геноме SARS-COV-2 , который имеет пять его элементов; Другие человеческие коронавирусы имеют от одного до пяти. ^{[ 1 ]} Было высказано предположение, что эти последовательности могут быть более широко называемыми «идентичными последовательностями хозяина», поскольку были обнаружены аналогичные корреляции между геномом SARS-COV-2 и множественными потенциальными хозяевами ( летучих мышей , панголины , хорьки и кошки). ^{[ 1 ]}

SARS-Done-2

имя	длина	последовательность	Место в геноме вируса	Место в геноме человека	соседние гены	примечание
HIS-SARS2-1	26	Ugucuagcuagcuaggis	7570–7595 в ORF1A	Chr3 : 124017420-124017395	Кальрн
HIS-SARS2-2	24	Хардикаатаааааааааааааааааааааааааааааааааааааааааааааааааааааааааааааааааааааааааааааааааааааааааа	12494–12517 в ORF1A	Chr3 : 176597319-176597342
HIS-SARS2-3	24	Uuauaugccuuuuucuuuuacuuuu	6766–6789 в ORF1A	Chr5 : 28949255-28949232
HIS-SARS2-4	27	Aggagaaugaaaaaaaaaaaaaa	29860–29886 в 3 'UTR	Chr18 : 73670168-73670142	FBXO15 , TIMM21 [ UK ] , CYB5A	То же самое, что и HIS-SARS1-2
HIS-SARS2-5	24	Hurraycuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuu	8610–8633 в ORF1A	Chrx : 99693480-99693457

SARS-BUN-1

имя	длина	последовательность	Место в геноме вируса	Место в геноме человека	соседние гены	примечание
HIS-SARS-1	25	Uaacaugcuaggaauauggcccu	15251–15275 в ORF1B	Chr4 : 172887105–172887129 Chr8 : 122356667-122356690	HAS2 , ZHX2
HIS-SARS-2	27	Aggagaaugaaaaaaaaaaaaaa	29717–29743 в 3 'UTR	Chr18 : 73670168-73670142		То же самое, что и HIS-SARS2-4

Mers-

имя	длина	последовательность	Место в геноме вируса	Место в геноме человека	соседние гены	примечание
Его MERS-1	24	Uucuuuugcacucupuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuu	24364–24387 в с	Chrx : 25635779-25635802

HCOV-HKU1

имя	длина	последовательность	Место в геноме вируса	Место в геноме человека
Его-Хку1-1	24	Он не преуспевает в мире	18656-18679	Chr1 : 106816197-106816220
Его-Хку1-2	24	Uuucauaagauguuugau	14044-14067	Chr1 : 226438633-226438656 Chr4 : 151100495-151100518 Chr5 : 79284823-79284846 Chr5 : 111192947-1111192970 Chr7 : 94695722-94695745 Chr7 : 98386489-98386512 Chr15 : 59768424-5976847 Chr22 : 30137367-30137390
Его-Хку1-3	24	Auuugacuuuaaaucuucuacaacua	26693-26716	Chr4 : 11718458-11718481
Его-Хку1-4	24	Сессии меня	23527-23550	Chr4 : 33759646-33759669
Его-Хку1-5	24	Uagaacuguotheruauaaaaaaaaa	19844-19867	Chrx : 81711130-81711153

HCOV-NL63

имя	длина	последовательность	Место в геноме вируса	Место в геноме человека
HIS-NL63-1	24	Uuaugagauuuuuuuuuuuugu	13044-13067	Chr1 : 215311768-215311791
HIS-NL63-2	24	Ggudulutage yourage	14920-14943	Chr4 : 28254452-282544475
HIS-NL63-3	24	Auaggcuaaucuaucuacuu	20754-20777	Крис : 30469931-30469954
HIS-NL63-4	24	Aaguauuguuauuuuc	12124-12147	Chr7 : 19853545-19853568
HIS-NL63-5	24	Aacuuuaugaugauuuuuuuuuuuuuuuu	13039-13062	Chr9 : 1525276-1525299

HCOV-OC43

имя	длина	последовательность	Место в геноме вируса	Место в геноме человека	соседние гены	примечание
HIS-OC43-1	24	Uacaccucuuuguuguuguuguuguuguaguagagag	22827-22850	Chr8 : 122471006-122471029	HAS2, ZHX2
HIS-OC43-2	24	С uuguuugaguuuuugauuga	24509-24532	Chr13 : 30510223-30510246

HCOV-229E

имя	длина	последовательность	Место в геноме вируса	Место в геноме человека	соседние гены	примечание
HIS-229E-1	24	Aauauuuuaacaguaccacguuau	19817-19840	Chr8 : 42865576-42865599
HIS-229E-2	24	Acuuuguuuntuuuuuuuuuguacta	13139-13162	Chr11 : 112451251-112451274

Ссылки

^ Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в Li, w; Ян, с; Xu, P; Чжан, D; Тонг, y; Чен, L; Цзя, б; Ли, а; Лиан, C; Ru, d; Чжан, б; Лю, м; Чен, C; Fu, w; Юань, с; Гу, c; Ван, л; Li, w; Лян, y; Ян, Z; Рен, х; Ван, с; Чжан, х; Песня, y; Xie, y; Лу, ч; Сюй, J; Ван, ч; Ю, w (февраль 2022 г.). «РНК-элементы SARS-COV-2 разделяют идентичность последовательности человека и активируют Hyaluronan через сеть Namirna-enhancer» . Ebiomedicine . 76 : 103861. DOI : 10.1016/j.ebiom.2022.103861 . PMC 8811534 . PMID 35124429 .
^ То есть S; Пальцы, у; Zao, F; L, W; Песня, z; Да, L; L, Q; Лю, м; Тонг, y; Чен, L; Run, d; Zag, t; Чжоу, К; Рыба, б; Xu, P; Это, z; L, W; Скоро, у; Сюй, J; Чжу, т; Шан, F; Ю, w; Лук, ч (18 марта 2022 г.). «Heymecromon: клинический рецепт, который Fortorney для эффективной защиты Covid-19» . Тарджевая терапия 7 (1): 91. doi : 10.1038/s41392-022-w . PMC 893182 . PMID 35304437 .
^ Xiao M, Li J, Li W, Wang Y, Wu F, Xi Y, Zhang L, Ding C, Luo H, Li Y, Peng L, Zhao L, Peng S, Xiao Y, Dong S, Cao J, Yu W (Октябрь 2017). «МикроРНК активируют генную транскрипцию эпигенетически как триггер энхансера» . РНК -биология . 14 (10): 1326–1334. doi : 10.1080/15476286.2015.1112487 . PMC 5711461 . PMID 26853707 .

Эта Genetics статья является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[:0-1] Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в Li, w; Ян, с; Xu, P; Чжан, D; Тонг, y; Чен, L; Цзя, б; Ли, а; Лиан, C; Ru, d; Чжан, б; Лю, м; Чен, C; Fu, w; Юань, с; Гу, c; Ван, л; Li, w; Лян, y; Ян, Z; Рен, х; Ван, с; Чжан, х; Песня, y; Xie, y; Лу, ч; Сюй, J; Ван, ч; Ю, w (февраль 2022 г.). «РНК-элементы SARS-COV-2 разделяют идентичность последовательности человека и активируют Hyaluronan через сеть Namirna-enhancer» . Ebiomedicine . 76 : 103861. DOI : 10.1016/j.ebiom.2022.103861 . PMC 8811534 . PMID 35124429 .

[:1-2] То есть S; Пальцы, у; Zao, F; L, W; Песня, z; Да, L; L, Q; Лю, м; Тонг, y; Чен, L; Run, d; Zag, t; Чжоу, К; Рыба, б; Xu, P; Это, z; L, W; Скоро, у; Сюй, J; Чжу, т; Шан, F; Ю, w; Лук, ч (18 марта 2022 г.). «Heymecromon: клинический рецепт, который Fortorney для эффективной защиты Covid-19» . Тарджевая терапия 7 (1): 91. doi : 10.1038/s41392-022-w . PMC 893182 . PMID 35304437 .

[X-3] Xiao M, Li J, Li W, Wang Y, Wu F, Xi Y, Zhang L, Ding C, Luo H, Li Y, Peng L, Zhao L, Peng S, Xiao Y, Dong S, Cao J, Yu W (Октябрь 2017). «МикроРНК активируют генную транскрипцию эпигенетически как триггер энхансера» . РНК -биология . 14 (10): 1326–1334. doi : 10.1080/15476286.2015.1112487 . PMC 5711461 . PMID 26853707 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

v Т и Коронавирус геномы
Вирусный структурный белок	Спайк белок (ы) белок конверта (E) мембранный белок (м) нуклеокапсид белок (n)
Вирусный Нтруктурный белок (выражено из ORF1AB )	Неструктурный белок 1 Неструктурный белок 2 Протеаза, похожая на Папаин (NSP3) Неструктурный белок 4 3C-подобная протеаза (NSP5) Неструктурный белок 6 Неструктурный белок 7 Неструктурный белок 8 Неструктурный белок 9 Неструктурный белок 10 Неструктурный белок 11 Неструктурный белок 12 Неструктурный белок 13 Неструктурный белок 14 Неструктурный белок 15 Неструктурный белок 16
Вирусный аксессуальный белок	Orf3a Orf3b Orf3c Orf3d Орф6 Orf7a Orf7b Orf8 Orf9b Orf9c Orf10
РНК	Коронавирус 5 'UTR Коронавирус 3 'UTR Коронавирус 3 'UTR Pseudoknot Coronavirus 3 'Стебель-петля II-подобный мотив (S2M) Сигнал упаковки коронавируса Коронавирус -каркасный элемент стимуляции Человеческая идентичная последовательность