ORF7b
| Белок NS7B бетакоронавируса | |||
|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||
| Символ | bCoV_NS7B | ||
| Пфам | ПФ11395 | ||
| ИнтерПро | ИПР021532 | ||
| |||
ORF7b — ген обнаруженный у коронавирусов рода , Betacoronavirus , который экспрессирует дополнительный белок Betacoronavirus NS7b . [ 1 ] Это короткий высокогидрофобный трансмембранный белок функции неизвестной . [ 1 ] [ 2 ]
Структура
[ редактировать ]Белок ORF7b представляет собой трансмембранный белок с одной трансмембранной спиралью которого , топология мембраны ориентирует С-конец в цитозоле . [ 1 ] У SARS-CoV это 44 аминокислотных остатка , а у SARS-CoV-2 — 43 остатка, при этом идентичность последовательностей составляет около 85% . [ 2 ]
Выражение и локализация
[ редактировать ]ORF7b представляет собой перекрывающийся ген , который перекрывает ORF7a . [ 3 ] Белок, вероятно, экспрессируется из субгеномной РНК посредством «протекающего» сканирования . [ 1 ] При SARS-CoV он локализуется в аппарате Гольджи , для чего необходима трансмембранная спиральная последовательность. [ 1 ] [ 4 ] Сообщалось, что при SARS-CoV-2 он связан с эндоплазматической сетью . [ 5 ]
Функция
[ редактировать ]Функция белка ORF7b недостаточно изучена. Это не является необходимым для репликации вируса . [ 1 ] [ 3 ] хотя в исследованиях SARS-CoV имеются противоречивые данные о том, влияет ли его удаление на репликацию. [ 1 ] [ 6 ] В SARS-CoV было обнаружено его включение в вирионы , что позволяет предположить, что это второстепенный структурный белок вируса . [ 1 ] [ 7 ] вариант SARS -CoV-2 с делеционной мутацией в области ORF7b, приводящей к образованию слитого белка между ORF7b и ORF8 , значение которого неясно. Был идентифицирован [ 2 ] [ 8 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с д и ж г час Лю Д.С., Фунг Т.С., Чонг К.К., Шукла А., Хильгенфельд Р. (сентябрь 2014 г.). «Акцессорные белки SARS-CoV и других коронавирусов» . Противовирусные исследования . 109 : 97–109. дои : 10.1016/j.antiviral.2014.06.013 . ПМЦ 7113789 . ПМИД 24995382 .
- ^ Jump up to: а б с Редондо Н., Сальдивар-Лопес С., Гарридо Х.Дж., Монтойя М. (7 июля 2021 г.). «Акцессорные белки SARS-CoV-2 в вирусном патогенезе: известные и неизвестные» . Границы в иммунологии . 12 : 708264. дои : 10.3389/fimmu.2021.708264 . hdl : 10261/249329 . ПМЦ 8293742 . ПМИД 34305949 .
- ^ Jump up to: а б Пекош А., Шехер С.Р., Даймонд М.С., Фремонт Д.Х., Симс А.С., Барик Р.С. (2006). «Структура, экспрессия и внутриклеточная локализация вспомогательных белков 7a и 7b SARS-CoV». Нидовирусы . Достижения экспериментальной медицины и биологии. Том. 581. С. 115–120. дои : 10.1007/978-0-387-33012-9_20 . ISBN 978-0-387-26202-4 . ПМК 7123408 . ПМИД 17037516 .
- ^ Шехер С.Р., Даймонд М.С., Пекош А. (октябрь 2008 г.). «Трансмембранный домен белка ORF7b коронавируса тяжелого острого респираторного синдрома необходим и достаточен для его удержания в комплексе Гольджи» . Журнал вирусологии . 82 (19): 9477–9491. дои : 10.1128/JVI.00784-08 . ПМК 2546951 . ПМИД 18632859 .
- ^ Чжан Дж., Круз-Косме Р., Чжуан М.В., Лю Д., Лю Ю., Тенг С. и др. (ноябрь 2020 г.). «Системное и молекулярное исследование субклеточной локализации белков SARS-CoV-2» . Сигнальная трансдукция и таргетная терапия . 5 (1): 269. дои : 10.1038/s41392-020-00372-8 . ПМЦ 7670843 . ПМИД 33203855 .
- ^ Макбрайд Р., Филдинг, Британская Колумбия (ноябрь 2012 г.). «Роль дополнительных белков тяжелого острого респираторного синдрома (ТОРС)-коронавируса в патогенезе вируса» . Вирусы . 4 (11): 2902–2923. дои : 10.3390/v4112902 . ПМК 3509677 . ПМИД 23202509 .
- ^ Шехер С.Р., Маккензи Дж.М., Пекош А. (январь 2007 г.). «Белок ORF7b коронавируса тяжелого острого респираторного синдрома (SARS-CoV) экспрессируется в инфицированных вирусом клетках и включается в частицы SARS-CoV» . Журнал вирусологии . 81 (2): 718–731. дои : 10.1128/JVI.01691-06 . ПМЦ 1797472 . ПМИД 17079322 .
- ^ Су Ю.К., Андерсон Д.Е., Янг Б.Е., Линстер М., Чжу Ф., Джаякумар Дж. и др. (июль 2020 г.). «Обнаружение и геномная характеристика делеции 382 нуклеотидов в ORF7b и ORF8 во время ранней эволюции SARS-CoV-2» . мБио . 11 (4). дои : 10.1128/mBio.01610-20 . hdl : 11343/277716 . ПМК 7374062 . ПМИД 32694143 .
