ДНК-полимераза вируса гепатита В
| Белок P (ДНК-полимераза/РНКаза H) | |||
|---|---|---|---|
 Геномная организация HBV; гены перекрываются. ORF P, выделенная синим цветом, кодирует ДНК-полимеразу вируса гепатита B. | |||
| Идентификаторы | |||
| Организм | |||
| Символ | П | ||
| ЮниПрот | P03156 | ||
| |||
| Белок Р | |
|---|---|
| Идентификаторы | |
| Символ | ? |
| ИнтерПро | ИПР037531 |
ДНК-полимераза вируса гепатита В представляет собой гепатита В. белок вируса [1] [2] Это ДНК-полимераза , которая может использовать матрицы ДНК или РНК, а также рибонуклеаза H , разрезающая РНК в дуплексе. Обе функции выполняются доменом обратной транскриптазы (RT).
Структура
[ редактировать ]Гепаднавирусный доменом белок P разделен на три домена: N-концевой домен ( InterPro : IPR000201 ), охватывающий терминал и спейсер , домен RT, связанный с каждым другим обратной транскриптазы , и C-концевой домен ( InterPro : IPR001462 ), регулирующий активность РНКазы H.
Кроме того, полимеразы гепаднавируса содержат домен концевого белка (TP), который содержит остаток тирозина , который служит праймером для синтеза (-) цепи ДНК. [3]
Функция
[ редактировать ]Полимераза вируса гепатита B (HBV) представляет собой многофункциональный фермент , обладающий как РНК-зависимой, так и ДНК-зависимой полимеразной функцией, а также функцией РНКазы H. Он действует на прегеномную РНК HBV (пгРНК), вызывая ее обратную транскрипцию с образованием новой молекулы ркДНК внутри нового капсида. (У пгРНК есть еще одна функция — трансляция в вирусную полимеразу и основные белки ). [3]
Димеры корового белка HBV необходимы для упаковки комплекса пгРНК/полимераза. Затем, после того как вирусная полимераза связывается с сигналом упаковки (Hɛ), обнаруженным на 5'-конце пгРНК, они включаются в вирусный капсид. [3] [4]
Внутри капсида пгРНК подвергается обратной транскрипции, которая инициируется праймированием белка по остатку тирозина полимеразы HBV. Таким образом образуется (-) цепь ДНК. [4] В то же время матрица РНК разрушается под действием РНКазы H полимеразы. Короткая РНК длиной около 15–18 нуклеотидов на 5'-конце pgRNA (включая 5'-последовательность DR1) не разрушается и используется в качестве праймера для синтеза (+) цепи ДНК. [3]
Полученная RC-ДНК частично является двухцепочечной. (-) Нить ДНК длиннее длины генома, с ковалентно связанной полимеразой и избыточным лоскутом на 5'-конце. Однако синтез (+) цепи ДНК не завершен полимеразой, и существует разрыв до 3'-конца (+) цепи ДНК. [4]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Оно-Нита С.К., Като Н., Ширатори Ю., Масаки Т., Лан К.Х., Каррильо Ф.Дж., Омата М. (март 1999 г.). «Мотив YMDD в ДНК-полимеразе вируса гепатита В влияет на репликацию и устойчивость к ламивудину: исследование с помощью полноразмерной трансфекции вирусной ДНК in vitro» . Гепатология . 29 (3): 939–45. дои : 10.1002/hep.510290340 . ПМИД 10051501 .
- ^ Шоу Т., Мок С.С., Локарнини С.А. (ноябрь 1996 г.). «Ингибирование ДНК-полимеразы вируса гепатита В энантиомерами трифосфата пенцикловира и метаболическая основа селективного ингибирования репликации HBV пенцикловиром» . Гепатология . 24 (5): 996–1002. дои : 10.1002/hep.510240504 . ПМИД 8903366 .
- ^ Jump up to: а б с д Менендес-Ариас Л., Альварес М., Пачеко Б. (октябрь 2014 г.). «Нуклеозидные/нуклеотидные аналоги-ингибиторы полимеразы вируса гепатита В: механизм действия и устойчивость». Современное мнение в вирусологии . 8 : 1–9. дои : 10.1016/j.coviro.2014.04.005 . ПМИД 24814823 .
- ^ Jump up to: а б с Ян ХК, Као Дж. Х. (сентябрь 2014 г.). «Персистенция ковалентно замкнутой кольцевой ДНК вируса гепатита В в гепатоцитах: молекулярные механизмы и клиническое значение» . Новые микробы и инфекции . 3 (9): е64. дои : 10.1038/emi.2014.64 . ПМЦ 4185362 . ПМИД 26038757 .
 | Эта вирусе статья о незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |