ВИПИ2

ВИПИ2
Идентификаторы
Псевдонимы	WIPI2 , ATG18B, Atg21, WIPI-2, CGI-50, повторяющийся домен WD, взаимодействующий с фосфоинозитидом 2, IDDSSA
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 609225 ; МГИ : 1923831 ; Гомологен : 90887 ; GeneCards : WIPI2 ; OMA : WIPI2 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 7 (human)
End	5,233,840 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 5 (mouse)
End	142,656,343 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	middle temporal gyrus; ; Brodmann area 23; ; nipple; ; olfactory bulb; ; beta cell; ; inferior ganglion of vagus nerve; ; ventral tegmental area; ; parotid gland; ; pons; ; endothelial cell;
	Top expressed in
	spermatocyte; ; lacrimal gland; ; right kidney; ; dorsomedial hypothalamic nucleus; ; morula; ; morula; ; dentate gyrus of hippocampal formation granule cell; ; superior frontal gyrus; ; vestibular membrane of cochlear duct; ; spermatid;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	phosphatidylinositol-5-phosphate binding; protein binding; phosphatidylinositol-3-phosphate binding; phosphatidylinositol-3,5-bisphosphate binding; lipid binding;
Cellular component	autophagosome; cytosol; phagophore assembly site membrane; membrane; phagophore assembly site; extrinsic component of membrane; nucleoplasm; protein-containing complex;
Biological process	autophagy; autophagosome maturation; macroautophagy; autophagosome assembly; autophagy of mitochondrion; protein lipidation; autophagy of nucleus; protein localization to phagophore assembly site; protein lipidation involved in autophagosome assembly; xenophagy; cellular response to starvation;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	26100
	74781
	ENSG00000157954
	ENSMUSG00000029578
	Q9Y4P8
	Q80W47
showНМ_001033518 ; НМ_001033519 ; НМ_001033520 ; НМ_001278299 ; НМ_015610 ;
	NM_016003
	НМ_178398
showНП_001028690 ; НП_001028691 ; НП_001028692 ; НП_001265228 ; НП_056425 ;
	NP_057087; NP_056425.1
	НП_848485
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок 2, взаимодействующий с фосфоинозитидами, повторяющегося домена WD, представляет собой белок , который у человека кодируется WIPI2 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция

Белки -повторы WD40 являются ключевыми компонентами многих важных биологических функций. Они регулируют сборку мультибелковых комплексов, представляя бета-пропеллерную платформу для одновременных и обратимых белок-белковых взаимодействий. Члены подсемейства WIPI повторяющихся белков WD40, такие как WIPI2, имеют структуру с 7 лопастями и содержат консервативный мотив для взаимодействия с фосфолипидами. ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

WIPI2 является гомологом Atg18 млекопитающих, а не Atg21, наряду с близкородственным белком WIPI1 . мРНК WIPI2 легко обнаруживается в нескольких широко используемых лабораторных клеточных линиях (HEK293A, HeLa, A431) и нескольких линиях раковых клеток, тогда как экспрессия WIPI1 ограничена раковыми клетками. ^{[ нужна ссылка ]} (но также обнаруживается во многих тканях человека).

Белки Atg регулируют аутофагию , которая представляет собой путь лизосомальной деградации, необходимый для поддержания здоровья клеток, выживания в периоды лишения питательных веществ, а также играет роль в развитии рака, нейродегенерации и иммунных реакций на широкий спектр патогенов. ^{[ 7 ]} WIPI2 рано рекрутируется в формирующуюся аутофагосому вместе с DFCP-1, ULK-1 и Atg16, где он положительно регулирует липидирование Atg8 (LC3). Это не относится к WIPI1. Показано, что игроки WIPI2 играют важную роль в регуляции лизосом.

См. также

Семейство белков WIPI

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000157954 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000029578 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Перейти обратно: ^а ^б Проикас-Сезанн Т., Уодделл С., Гаугель А., Фрики Т., Лупас А., Нордхейм А. (декабрь 2004 г.). «WIPI-1альфа (WIPI49), член нового семейства белков WIPI с 7 лопастями, аберрантно экспрессируется при раке человека и связан с аутофагией, вызванной голоданием». Онкоген . 23 (58): 9314–25. дои : 10.1038/sj.onc.1208331 . ПМИД 15602573 . S2CID 22642893 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: повторный домен WIPI2 WD, взаимодействующий с фосфоинозитидом 2» .
^ Орси А., Полсон Х.Э., Туз С.А. (декабрь 2009 г.). «События, связанные с торговлей мембранами, участвующие в аутофагии». Curr Opin Cell Biol . 22 (2): 150–6. дои : 10.1016/j.ceb.2009.11.013 . ПМИД 20036114 .

* Polson HE, de Lartigue J, Rigden DJ, Reedijk M, Urbé S, Clague MJ, Tooze SA (2010). "Mammalian Atg18 (WIPI2) localizes to omegasome-anchored phagophores and positively regulates LC3 lipidation". Autophagy. 6 (4): 506–22. doi:10.4161/auto.6.4.11863. PMID 20505359.

Дальнейшее чтение

Мерле А., Розенфельдер Х., Шупп И. и др. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году» . Нуклеиновые кислоты Рез . 34 (Проблема с базой данных): D415–8. дои : 10.1093/nar/gkj139 . ПМЦ 1347501 . ПМИД 16381901 .
Виман С., Арлт Д., Хубер В. и др. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики» . Геном Рез . 14 (10Б): 2136–44. дои : 10.1101/гр.2576704 . ПМК 528930 . ПМИД 15489336 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД 14702039 .
Хиллер Л.В., Фултон Р.С., Фултон Л.А. и др. (2003). «Последовательность ДНК 7-й хромосомы человека» . Природа . 424 (6945): 157–64. Бибкод : 2003Natur.424..157H . дои : 10.1038/nature01782 . ПМИД 12853948 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Симпсон Дж.К., Велленройтер Р., Пустка А. и др. (2001). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, выявленная с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК» . Представитель ЭМБО . 1 (3): 287–92. дои : 10.1093/embo-reports/kvd058 . ПМЦ 1083732 . ПМИД 11256614 .
Виманн С., Вейль Б., Велленройтер Р. и др. (2001). «К каталогу человеческих генов и белков: секвенирование и анализ 500 новых полных кДНК человека, кодирующих белки» . Геном Рез . 11 (3): 422–35. дои : 10.1101/gr.GR1547R . ПМК 311072 . ПМИД 11230166 .
Хартли Дж.Л., Темпл Г.Ф., Браш М.А. (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro» . Геном Рез . 10 (11): 1788–95. дои : 10.1101/гр.143000 . ПМК 310948 . ПМИД 11076863 .
Лай Ч., Чжоу С.И., Чан Л.И. и др. (2000). «Идентификация новых человеческих генов, эволюционно консервативных у Caenorhabditis elegans, с помощью сравнительной протеомики» . Геном Рез . 10 (5): 703–13. дои : 10.1101/гр.10.5.703 . ПМК 310876 . ПМИД 10810093 .
<Пожалуйста, добавьте первых недостающих авторов для заполнения метаданных.> (1999). «На пути к полной последовательности генома человека» . Геном Рез . 8 (11): 1097–108. дои : 10.1101/гр.8.11.1097 . ПМИД 9847074 .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 7 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000157954 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000029578 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid15602573-5] Перейти обратно: ^а ^б Проикас-Сезанн Т., Уодделл С., Гаугель А., Фрики Т., Лупас А., Нордхейм А. (декабрь 2004 г.). «WIPI-1альфа (WIPI49), член нового семейства белков WIPI с 7 лопастями, аберрантно экспрессируется при раке человека и связан с аутофагией, вызванной голоданием». Онкоген . 23 (58): 9314–25. дои : 10.1038/sj.onc.1208331 . ПМИД 15602573 . S2CID 22642893 .

[entrez-6] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: повторный домен WIPI2 WD, взаимодействующий с фосфоинозитидом 2» .

[pmid20036114-7] Орси А., Полсон Х.Э., Туз С.А. (декабрь 2009 г.). «События, связанные с торговлей мембранами, участвующие в аутофагии». Curr Opin Cell Biol . 22 (2): 150–6. дои : 10.1016/j.ceb.2009.11.013 . ПМИД 20036114 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]