ТСГ101

ТСГ101
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB showСписок идентификационных кодов PDB 1KPP, 1KPQ, 1M4P, 1M4Q, 1S1Q, 2F0R, 3IV1, 3OBQ, 3OBS, 3OBU, 3OBX, 3P9G, 3P9H, 4EJE, 4YC1, 4ZNY
Идентификаторы
Псевдонимы	TSG101 , TSG10, VPS23, предрасположенность к опухоли 101
Внешние идентификаторы	Опустить : 601387 ; МГИ : 106581 ; Гомологен : 4584 ; Генные карты : TSG101 ; ОМА : TSG101 — ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 11 (human) Band 11p15.1 Start 18,468,336 bp End 18,526,951 bp
showМестоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 7 (mouse) Band 7|7 B3 Start 46,538,697 bp End 46,569,717 bp
show экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in oocyte secondary oocyte gonad ganglionic eminence islet of Langerhans amniotic fluid gingival epithelium gastrocnemius muscle rectum parotid gland Top expressed in tail of embryo ganglionic eminence ventricular zone genital tubercle maxillary prominence mandibular prominence neural tube medial ganglionic eminence neural layer of retina muscle of thigh More reference expression data BioGPS More reference expression data
showГенная онтология Molecular function DNA binding protein homodimerization activity transcription corepressor activity calcium-dependent protein binding ubiquitin binding protein binding nuclear receptor coactivator activity virion binding ubiquitin protein ligase binding protein-containing complex binding Cellular component cytoplasm multivesicular body endosome late endosome membrane late endosome membrane plasma membrane early endosome nucleolus endosome membrane extracellular exosome ESCRT I complex nucleus cytosol host cell microtubule organizing center cytoskeleton early endosome membrane Flemming body Biological process intracellular transport of virus cell differentiation positive regulation of ubiquitin-dependent endocytosis regulation of extracellular exosome assembly viral budding via host ESCRT complex viral life cycle endosome to lysosome transport multivesicular body assembly protein monoubiquitination viral budding keratinocyte differentiation cell division endosomal transport autophagosome maturation regulation of cell growth protein transport ubiquitin-dependent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway regulation of MAP kinase activity positive regulation of exosomal secretion cell cycle regulation of growth negative regulation of transcription, DNA-templated negative regulation of cell population proliferation viral process exosomal secretion macroautophagy negative regulation of epidermal growth factor receptor signaling pathway negative regulation of epidermal growth factor-activated receptor activity transport extracellular transport positive regulation of nucleic acid-templated transcription Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 7251 22088 Вместе ENSG00000074319 ENSMUSG00000014402 ЮниПрот Q99816 Q61187 RefSeq (мРНК) НМ_006292 НМ_021884 НМ_001348088 НМ_001348089 RefSeq (белок) НП_006283 НП_068684 НП_001335017 НП_001335018 Местоположение (UCSC) Чр 11: 18.47 – 18.53 Мб Chr 7: 46,54 – 46,57 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Ген опухолевой предрасположенности 101 , также известный как TSG101 , представляет собой человеческий ген , который кодирует одноимённый клеточный белок.

Функция

Белок, кодируемый этим геном, принадлежит к группе очевидно неактивных гомологов убиквитин-конъюгирующих ферментов. Генный продукт содержит спиральный домен, который взаимодействует со статмином , цитозольным фосфопротеином, участвующим в онкогенезе. Белок может играть роль в росте и дифференцировке клеток и действовать как негативный регулятор роста. Стационарная экспрессия этого гена предрасположенности к опухоли in vitro, по-видимому, важна для поддержания стабильности генома и регуляции клеточного цикла. Мутации и альтернативный сплайсинг в этом гене часто встречаются при раке молочной железы и позволяют предположить, что дефекты возникают во время онкогенеза и/или прогрессирования рака молочной железы.

Основная роль TSG101 заключается в участии в пути ESCRT . Этот путь облегчает почкование с обратной топологией и образование мультивезикулярных телец (MVB), которые доставляют груз, предназначенный для деградации, в лизосомы. TSG101 распознает короткий линейный мотив UEV : P(T/S)AP через белковый домен субъединицы VPS23/TSG101. Сборкой комплекса ESCRT-I управляют C-концевой блок устойчивости (SB) VPS23, N-концевая половина VPS28 и C-концевая половина VPS37. Структура . в основном состоит из трех длинных параллельных спиральных шпилек, каждая из которых соответствует отдельной субъединице Дополнительные домены и мотивы , выходящие за пределы ядра, служат инструментами захвата для критических функций ESCRT-I.

Вирусный захват

TSG101 играет важную роль в патогенезе ВИЧ и других вирусов. В неинфицированных клетках TSG101 участвует в биогенезе мультивезикулярного тельца (МВТ). это предполагает, что ВИЧ может связывать TSG101, чтобы получить доступ к нижестоящему механизму, который катализирует отпочкование везикул MVB.

Взаимодействия

Было показано, что TSG101 взаимодействует с:

• ЭП300 ,
• ХГС ,
• ЛРСАМ1 ,
• П21 ,
• Р53 , и
• ВПС28 .

Ортолог, Vps23

Vps23_core
escrt-я ядро
Идентификаторы
Символ	Vps23_core
Пфам	PF09454
ИнтерПро	ИПР017916
показывать Доступные белковые структуры: Pfam   structures / ECOD   PDB RCSB PDB; PDBe; PDBj PDBsum structure summary

У людей ортолог vps23, содержащий компонент ESCRT-1, называется Tsg101. Мутации в Tsg-101 связаны с раком шейки матки, молочной железы, простаты и желудочно-кишечного тракта. В молекулярной биологии vps23 (вакуолярная сортировка белков) представляет собой белковый домен . Белки Vps являются компонентами ESCRT (эндосомальных сортировочных комплексов, необходимых для транспорта), которые необходимы для сортировки белков на ранних эндосомах. Точнее, vps23 является компонентом ESCRT-I. Комплексы ESCRT образуют механизм, управляющий сортировкой белков от эндосом к лизосомам . Комплексы ESCRT играют центральную роль в рецепторов подавлении , биогенезе лизосом и почковании ВИЧ.

Структура

Дрожжевой ESCRT-I состоит из трех белковых субъединиц: VPS23, VPS28 и VPS37. У людей ESCRT-I содержит TSG101, VPS28 и один из четырех потенциальных человеческого VPS37 гомологов .

См. также

• FGI-104 - ингибитор ESCRT , исследуемый как противовирусное средство широкого спектра действия.

Дальнейшее чтение

• Мацце FM, Дегрев Л. (2006). «Роль вирусных и клеточных белков в почковании вируса иммунодефицита человека». Акта Вирол . 50 (2): 75–85. ПМИД   16808324 .
• Фрид Э.О., Муланд А.Дж. (2006). «Клеточная биология ВИЧ-1 и других ретровирусов» . Ретровирусология . 3:77 . дои : 10.1186/1742-4690-3-77 . ПМЦ   1635732 . ПМИД   17083721 .
• Кунин Е.В., Абагян Р.А. (1997). «TSG101 может быть прототипом класса доминантно-негативных регуляторов убиквитина». Нат. Жене . 16 (4): 330–1. дои : 10.1038/ng0897-330 . ПМИД   9241264 . S2CID   36275138 .
• Штайнер П., Барнс Д.М., Харрис В.Х., Вайнберг Р.А. (1997). «Отсутствие перестроек в гене опухолевой предрасположенности TSG101 при раке молочной железы человека». Нат. Жене . 16 (4): 332–3. дои : 10.1038/ng0897-332 . ПМИД   9241265 . S2CID   20233125 .
• Ли MP, Feinberg AP (1997). «Аберрантный сплайсинг, но не мутации TSG101 при раке молочной железы человека». Рак Рез . 57 (15): 3131–4. ПМИД   9242438 .
• Гейтер С.А., Барски П., Бэтли С.Дж., Ли Л., де Фой К.А., Коэн С.Н., Пондер Б.А., Калдас С. (1997). «Аберрантный сплайсинг генов TSG101 и FHIT часто встречается при множественных злокачественных новообразованиях и в нормальных тканях и имитирует изменения, ранее описанные в опухолях». Онкоген . 15 (17): 2119–26. дои : 10.1038/sj.onc.1201591 . ПМИД   9366528 . S2CID   7819803 .
• Се В., Ли Л., Коэн С.Н. (1998). «Зависящая от клеточного цикла субклеточная локализация белка TSG101 и митотические и ядерные аномалии, связанные с дефицитом TSG101» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 95 (4): 1595–600. Бибкод : 1998PNAS...95.1595X . дои : 10.1073/pnas.95.4.1595 . ЧВК   19109 . ПМИД   9465061 .
• Вагнер К.У., Дириссо П., Рукер Э.Б., Робинсон Г.В., Хеннигхаузен Л. (1998). «Геномная архитектура и транскрипционная активация гена предрасположенности к опухолям мыши и человека TSG101: распространенные типы более коротких транскриптов являются настоящими альтернативными вариантами сплайсинга». Онкоген . 17 (21): 2761–70. дои : 10.1038/sj.onc.1202529 . ПМИД   9840940 . S2CID   29505462 .
• Сан З., Пан Дж., Хоуп В.Х., Коэн С.Н., Балк С.П. (1999). «Белок гена 101 предрасположенности к опухоли подавляет трансактивацию рецептора андрогена и взаимодействует с p300» . Рак . 86 (4): 689–96. doi : 10.1002/(SICI)1097-0142(19990815)86:4<689::AID-CNCR19>3.0.CO;2-P . ПМИД   10440698 . S2CID   26971556 .
• Хиттельман А.Б., Бураков Д., Иньигес-Луи Х.А., Фридман Л.П., Гарабедян М.Ю. (1999). «Дифференциальная регуляция активации транскрипции глюкокортикоидных рецепторов посредством AF-1-ассоциированных белков» . Я ЕСМЬ Дж . 18 (19): 5380–8. дои : 10.1093/emboj/18.19.5380 . ПМЦ   1171607 . ПМИД   10508170 .
• Раунтри М.Р., Бахман К.Е., Бэйлин С.Б. (2000). «DNMT1 связывает HDAC2 и новый корепрессор DMAP1, образуя комплекс в фокусах репликации». Нат. Жене . 25 (3): 269–77. дои : 10.1038/77023 . ПМИД   10888872 . S2CID   26149386 .
• Епископ Н., Вудман П. (2001). «TSG101/VPS23 млекопитающих и VPS28 млекопитающих взаимодействуют напрямую и рекрутируются в эндосомы, индуцированные VPS4» . Ж. Биол. Хим . 276 (15): 11735–42. дои : 10.1074/jbc.M009863200 . ПМИД   11134028 .
• Ли Л, Ляо Дж, Руланд Дж, Мак Т.В., Коэн С.Н. (2001). «Регуляторный контур TSG101/MDM2 модулирует деградацию MDM2 и контроль обратной связи MDM2/p53» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 98 (4): 1619–24. Бибкод : 2001PNAS...98.1619L . дои : 10.1073/pnas.98.4.1619 . ПМК   29306 . ПМИД   11172000 .
• ВерПланк Л., Буамр Ф., Лаграсса Т.Дж., Агреста Б., Киконього А., Лейс Дж., Картер К.А. (2001). «Tsg101, гомолог ферментов, конъюгирующих убиквитин (E2), связывает домен L в Pr55(Gag) ВИЧ типа 1» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 98 (14): 7724–9. Бибкод : 2001PNAS...98.7724V . дои : 10.1073/pnas.131059198 . ПМК   35409 . ПМИД   11427703 .
• Гаррус Дж.Э., фон Шведлер Великобритания, Порниллос О.В., Морхам С.Г., Завитц К.Х., Ван Х.Е., Веттштейн Д.А., Стрэй К.М., Коте М., Рич Р.Л., Мышка Д.Г., Сундквист В.И. (2001). «Tsg101 и вакуолярный путь сортировки белков необходимы для почкования ВИЧ-1» . Клетка . 107 (1): 55–65. дои : 10.1016/S0092-8674(01)00506-2 . ПМИД   11595185 . S2CID   18525780 .
• Мартин-Серрано Дж., Занг Т., Бениас П.Д. (2002). «ВИЧ-1 и вирус Эбола кодируют небольшие пептидные мотивы, которые привлекают Tsg101 к местам сборки частиц, чтобы облегчить выход». Нат. Мед . 7 (12): 1313–9. дои : 10.1038/nm1201-1313 . ПМИД   11726971 . S2CID   19655035 .
• Демиров Д.Г., Оно А, Оренштейн Ю.М., Фрид Э.О. (2002). «Сверхэкспрессия N-концевого домена TSG101 ингибирует отпочкование ВИЧ-1, блокируя функцию позднего домена» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (2): 955–60. Бибкод : 2002PNAS...99..955D . дои : 10.1073/pnas.032511899 . ПМЦ   117412 . ПМИД   11805336 .
• Беннетт Н.А., Паттилло Р.А., Лин Р.С., Се С.И., Мерфи Т., Лин Д. (2002). «Экспрессия TSG101 в гинекологических опухолях: связь с белками циклин D1, циклин E, p53 и p16». Клетка. Мол. Биол. (Шумный-ле-гранд) . 47 (7): 1187–93. ПМИД   11838966 .
• Бишоп Н., Хорман А., Вудман П. (2002). «Белки vps класса E млекопитающих распознают убиквитин и участвуют в удалении эндосомальных конъюгатов белок-убиквитин» . Дж. Клеточная Биол . 157 (1): 91–101. дои : 10.1083/jcb.200112080 . ПМК   2173266 . ПМИД   11916981 .