АТФ6В1Г2
| АТФ6В1Г2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Псевдонимы | ATP6V1G2 , ATP6G, ATP6G2, NG38, VMA10, АТФаза H+, транспортирующая субъединицу G2 V1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Внешние идентификаторы | Опустить : 606853 ; МГИ : 1913487 ; Гомологен : 41518 ; Генные карты : ATP6V1G2 ; ОМА : ATP6V1G2 — ортологи | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Викиданные | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
V-типа протонной АТФазы Субъединица G 2 представляет собой фермент , который у человека кодируется ATP6V1G2 геном . [ 5 ] [ 6 ]
Этот ген кодирует компонент вакуолярной АТФазы (V-АТФазы), многосубъединичного фермента, который опосредует подкисление внутриклеточных компартментов эукариотических клеток. Закисление, зависимое от V-АТФазы, необходимо для таких внутриклеточных процессов, как сортировка белков , активация зимогена , рецептор-опосредованный эндоцитоз и синаптических везикул генерация протонного градиента . V-АТФаза состоит из цитозольного домена V1 и трансмембранного домена V0. Домен V1 состоит из трех субъединиц A и трех B, двух субъединиц G плюс субъединиц C, D, E, F и H. Домен V1 содержит каталитический сайт АТФ. Домен V0 состоит из пяти различных субъединиц: a, c, c', c с двойным штрихом и d.
Дополнительные изоформы многих белков субъединиц V1 и V0 кодируются множеством генов или альтернативно сплайсированных вариантов транскриптов. Этот кодируемый белок является одним из трех белков G-субъединицы домена V1. Ранее этот ген имел генные символы ATP6G и ATP6G2. Альтернативно были описаны варианты сплайсированных транскриптов, кодирующие разные изоформы. [ 6 ]
Субклеточное и тканевое распределение
[ редактировать ]ATP6V1G2 представляет собой субъединицу белка, который был идентифицирован в клеточных мембранах, включая внутриклеточные мембраны. К ним относятся лизосомы, вакуоли и мембраны везикул внутри клетки. [ 7 ]
ATP6V1G2 в основном обнаруживается в головном мозге, меньшее количество — в надпочечниках. [ 8 ] Фермент кодируется 4 экзонами. [ 8 ] Фермент выполняет три основные функции внутри клетки. Во-первых, АТФ гидролизуется этим ферментом. [ 8 ] Это означает, что АТФ расщепляется водой на АДФ и ион водорода. [ 9 ] Этот ион водорода служит энергией для запуска других процессов. [ 9 ] ATP6V1G2 также позволяет другим белкам связываться внутри клетки. [ 8 ] ATP6V1G2 также позволяет АТФазе работать, доставляя ионы водорода в клетку. [ 8 ]
Структура
[ редактировать ]ATP6V1G2 состоит из 118 аминокислот. [ 10 ] ATP6V1G2 может снижать pH определенных участков. [ 11 ]
Функция
[ редактировать ]Биохимические способности ATP6V1G2 участвуют в двух других процессах. [ 8 ] Первый включает управление аутофагией внутри клетки. [ 8 ] Второе — снижение рН везикул в синапсе. [ 8 ]
ATP6V1G2 — это специфическая часть фермента, гидролизующая АТФ как периферический белок. [ 12 ]
В мембране содержится около 45 000 белков ATP6V1G2, со «150 протонными насосами на» квадратный микрометр. [ 13 ]
ATP6V1G2 является субъединицей белка. [ 13 ] Он находится в эукариотических клетках. [ 13 ] Он перекачивает протоны. [ 13 ] Обычно он находится во внутренних плазматических мембранах. [ 13 ] Часть V1 белка «представляет собой АТФазу» и находится за пределами плазматической мембраны. [ 13 ] АТФ необходим для проникновения водорода в везикулу. [ 13 ] Часть V0 белка находится в плазматической мембране, а «субъединица» используется для определения изоформы белка. [ 13 ] Различные изоформы обнаруживаются в разных тканях млекопитающих. [ 13 ] Высвобождение V1 из V0 после того, как протоны вошли в везикулу и нейротрансмиттеры, позволяет домену V0 путешествовать вместе с везикулой, связываться с другим доменом V0 и переносить нейротрансмиттеры. [ 13 ]
Существует определенное количество субъединиц G2 и G1 белка. [ 14 ]
ATP6V1G2 выполняет важные функции, связанные с передачей нервных сигналов. [ 13 ] Подкисление внутренней части везикул с помощью ATP6V1G2 создает разницу в pH, необходимую для проникновения нейротрансмиттеров в везикулу. [ 13 ] Таким образом, ATP6V1G2 позволяет синтезировать нейротрансмиттеры в нервном пузырьке. [ 13 ]
Снижение pH в везикуле с помощью ATP6V1G2 важно для функции связывания везикул с белком SNARE и эндоцитоза. [ 13 ]
Активация нерва вызывает снижение pH в везикулах и повышение pH в клетке. [ 13 ]
Антипортеры кальция и водорода необходимы для ATP6V1G2 для подкисления внутренней части пузырька. [ 13 ] Кальций необходим для выхода из клетки, чтобы увеличить количество атомов водорода. [ 13 ] ATP6V1G2 снижает концентрацию протонов в клетке за счет связывания пузырьков с плазматической мембраной и снижения концентрации протонов. [ 13 ]
Функция ATP6V1G2 подготавливает везикулу к проникновению нейромедиаторов в везикулу, связыванию везикулы с плазматической мембраной и эндоцитозу везикулы. [ 13 ]
ВАТФаза помогает в процессе доставки нейротрансмиттеров в везикулу и связывании везикулы с синапсом. [ 14 ] Часть ATP6V1G2 вАТФазы обладает каталитической способностью. [ 14 ] ATP6V1G2 необходим для функционирования, однако в эксперименте по отключению гена на мышах при его отсутствии не было обнаружено никаких отклонений. [ 14 ] Уровень ATP6V1G1 повышался, когда ATP6V1G2 отсутствовал. [ 14 ] При отсутствии ATP6V1G2 мРНК больше не было. [ 14 ] Было получено больше ATP6V1G1 без увеличения транскрипции. [ 14 ]
ATP6V1G2 завершает процессы, связанные с перемещением веществ внутри клетки, а также через мембраны и перевариванием пищи. [ 14 ]
Функционирование вАТФазы необходимо для жизни. [ 14 ] Процессы вАТФазы позволяют иммунным клеткам удалять микроорганизмы с помощью макрофагов. [ 14 ] ВАТФаза также позволяет Т-клеткам и антигенам функционировать. [ 14 ] ВАТФаза также участвует в подкислении внеклеточной области «костных резорбирующих остеокластов» и «эпителиальных клеток в почках». [ 14 ]
ATP6V1G2 — это часть белка, которая соединяет компоненты белка V1 и V0 вместе. [ 14 ] ATP6V1G2 необходим для «энергетической связи» между V1 и V0, позволяя V1 и V0 присоединяться или отсоединяться. [ 14 ] G-компонент вАТФазы весит 13 кДа. [ 14 ] ATP6V1G2 обнаруживается в мозге. [ 14 ] Эксперимент по созданию нефункционального гена ATP6V1G2 на мышах не оказал никакого влияния на потомство. [ 14 ] ATP6V1G2 участвует в гидролизе АТФ. [ 14 ] ATP6V1G2 не смог заменить снижение Vma10, в то время как ATP6V1G1 смог. [ 14 ]
Клиническое значение
[ редактировать ]Дисфункция ATP6V1G2 приводит к различным нарушениям. [ 12 ] К ним могут относиться «синдром Нунан 9», «дистальный почечный тубулярный ацидоз» и «синдром Нунан 3». [ 12 ]
ATP6V1G2 может участвовать в аутоиммунных заболеваниях. [ 15 ] Активированные макрофаги создали больше ATP6V1G2. [ 15 ] Ген ATP6V1G2 находится в группе размером 122 т.п.н. в «локусе TNF». [ 15 ] Увеличение ATP6V1G2 не зависело от TNF. [ 15 ] мРНК определяет, сколько ATP6V1G2 вырабатывается активированным макрофагом. [ 15 ] ATP6V1G2 может быть результатом воспалительной реакции. [ 15 ] ATP6V1G2 участвует в «сортировке и деградации белков», «генерации секреторных гранул и эндоцитозе и, как известно, важен для дифференциации и функционирования воспалительных и иммунных клеток». [ 15 ] Такие факторы, как повышенное содержание соли, могут увеличить вАТФазу. [ 15 ] Нейтрофилы, «дегрануляция» и «фагоцитоз» протеинкиназы С увеличивают ватФазу. [ 15 ] Активность вАТФазы создает иммунный ответ против патогенов путем активации макрофагов. [ 15 ] Дендритным клеткам для созревания требуется вАТФаза. [ 15 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с ENSG00000234920, ENSG00000206445, ENSG00000230900, ENSG00000213760, ENSG00000234668, ENSG00000226850 GRCh38: Версия ансамбля 89: ENSG00000227587, ENSG00000234920, ENSG00000206445, ENSG00000230900, ENSG00000213760, ENSG00000234668, ENSG00000226850 – ансамбль , май 2017 г.
- ^ Jump up to: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024403 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Невилл М.Дж., Кэмпбелл Р.Д. (апрель 1999 г.). «Новый член суперсемейства Ig и субъединица V-АТФазы G входят в число предсказанных продуктов новых генов, близких к локусу TNF в MHC человека» . Журнал иммунологии . 162 (8): 4745–4754. дои : 10.4049/jimmunol.162.8.4745 . ПМИД 10202016 .
- ^ Jump up to: а б «Ген Энтреза: АТФаза ATP6V1G2, транспортирующая H+, лизосомальная 13 кДа, субъединица V1 G2» .
- ^ "Зарегистрироваться" . biocyc.org . Проверено 20 апреля 2023 г.
- ^ Jump up to: а б с д и ж г час «ATP6V1G2 АТФаза H+, транспортирующая субъединицу G2 V1 [Homo sapiens (человек)] - Ген - NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 20 апреля 2023 г.
- ^ Jump up to: а б «AmiGO 2: Подробности термина «Активность гидролиза АТФ» (GO:0016887)» . Консорциум онтологий генов . Проверено 20 апреля 2023 г.
- ^ «26 объектов (человека) — сеть взаимодействия STRING» . string-db.org . Проверено 25 апреля 2023 г.
- ^ «АТП6В1Г2» . www.nextprot.org . Проверено 25 апреля 2023 г.
- ^ Jump up to: а б с «Ген ATP6V1G2 — GeneCards | Белок VATG2 | Антитело VATG2» . www.genecards.org . Проверено 25 апреля 2023 г.
- ^ Jump up to: а б с д и ж г час я дж к л м н тот п д р с Табарес Л., Бетц Б. (декабрь 2010 г.). «Множественные функции везикулярного протонного насоса в нервных окончаниях» . Нейрон . 68 (6): 1020–1022. дои : 10.1016/j.neuron.2010.12.012 . ПМИД 21172605 .
- ^ Jump up to: а б с д и ж г час я дж к л м н тот п д р с Кавамура Н., Сун-Вада Г.Х., Вада Ю. (сентябрь 2015 г.). «Потеря субъединицы G2 протон-транспортирующей АТФазы вакуолярного типа приводит к активации субъединицы G1 в мозге» . Научные отчеты . 5 (1): 14027. Бибкод : 2015НатСР...514027К . дои : 10.1038/srep14027 . ПМЦ 4564858 . ПМИД 26353914 .
- ^ Jump up to: а б с д и ж г час я дж к Мевар Д., Марину И., Ли М.Э., Тиммс Дж.М., Килдинг Р., Тир, доктор медицинских наук и др. (декабрь 2006 г.). «Профили экспрессии генов, специфичные для гаплотипа, в кластере генов теломерного главного комплекса гистосовместимости и восприимчивость к аутоиммунным заболеваниям» . Гены и иммунитет . 7 (8): 625–631. дои : 10.1038/sj.gene.6364339 . ПМИД 16971954 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Финбоу М.Э., Харрисон М.А. (июнь 1997 г.). «Вакуолярная H+-АТФаза: универсальный протонный насос эукариот» . Биохимический журнал . 324 (Часть 3) (Часть 3): 697–712. дои : 10.1042/bj3240697 . ПМЦ 1218484 . ПМИД 9210392 .
- Стивенс Т.Х., Форгак М. (1998). «Структура, функции и регуляция вакуолярной (H +)-АТФазы». Ежегодный обзор клеточной биологии и биологии развития . 13 : 779–808. дои : 10.1146/annurev.cellbio.13.1.779 . ПМИД 9442887 .
- Нельсон Н., Харви В.Р. (апрель 1999 г.). «Протон-аденозинтрифосфатазы вакуоли и плазматической мембраны». Физиологические обзоры . 79 (2): 361–385. дои : 10.1152/physrev.1999.79.2.361 . ПМИД 10221984 . S2CID 1477911 .
- Форгач М (май 1999 г.). «Структура и свойства вакуольных (Н+)-АТФаз» . Журнал биологической химии . 274 (19): 12951–12954. дои : 10.1074/jbc.274.19.12951 . ПМИД 10224039 .
- Кейн ПМ (февраль 1999 г.). «Введение: V-АТФазы 1992–1998». Журнал биоэнергетики и биомембран . 31 (1): 3–5. дои : 10.1023/А:1001884227654 . ПМИД 10340843 .
- Вечорек Х., Браун Д., Гринштейн С., Эренфельд Дж., Харви В.Р. (август 1999 г.). «Энергизация плазматической мембраны животных протон-движущими V-АТФазами». Биоэссе . 21 (8): 637–648. doi : 10.1002/(SICI)1521-1878(199908)21:8<637::AID-BIES3>3.0.CO;2-W . ПМИД 10440860 . S2CID 23505139 .
- Ниши Т., Форгач М. (февраль 2002 г.). «Вакуолярные (H +)-АТФазы — самые универсальные протонные насосы в природе». Обзоры природы. Молекулярно-клеточная биология . 3 (2): 94–103. дои : 10.1038/nrm729 . ПМИД 11836511 . S2CID 21122465 .
- Кавасаки-Ниши С., Ниши Т., Форгак М. (июнь 2003 г.). «Транслокация протонов, обусловленная гидролизом АТФ в V-АТФазах». Письма ФЭБС . 545 (1): 76–85. дои : 10.1016/S0014-5793(03)00396-X . ПМИД 12788495 . S2CID 10507213 .
- Морель Н. (октябрь 2003 г.). «Высвобождение нейромедиатора: темная сторона вакуолярной-H+АТФазы» . Биология клетки . 95 (7): 453–457. дои : 10.1016/S0248-4900(03)00075-3 . ПМИД 14597263 . S2CID 17519696 .
- Смит А.Н., Бортвик К.Дж., Карет Ф.Е. (сентябрь 2002 г.). «Молекулярное клонирование и характеристика новых тканеспецифичных изоформ субъединиц вакуолярной H (+)-АТФазы C, G и d человека, а также их оценка при аутосомно-рецессивном дистальном почечном тубулярном ацидозе». Джин . 297 (1–2): 169–177. дои : 10.1016/S0378-1119(02)00884-3 . ПМИД 12384298 .
- Геварт К., Готалс М., Мартенс Л., Ван Дамм Дж., Стас А., Томас Г.Р., Вандекеркхове Дж. (май 2003 г.). «Изучение протеомов и анализ обработки белков путем масс-спектрометрической идентификации отсортированных N-концевых пептидов». Природная биотехнология . 21 (5): 566–569. дои : 10.1038/nbt810 . ПМИД 12665801 . S2CID 23783563 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- человека Местоположение генома ATP6V1G2 и ATP6V1G2 страница сведений о гене в браузере генома UCSC .