SLC22A4

SLC22A4
Идентификаторы
Псевдонимы	SLC22A4 , OCTN1, семейство растворенных носителей 22, член 4, DFNB60
Внешние идентификаторы	Опустить : 604190 ; МГИ : 1353479 ; Гомологен : 81701 ; Генные карты : SLC22A4 ; OMA : SLC22A4 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 5 (human)
End	132,344,190 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 11 (mouse)
End	53,918,916 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	bronchial epithelial cell; ; mucosa of paranasal sinus; ; right uterine tube; ; trabecular bone; ; nasal epithelium; ; blood; ; olfactory zone of nasal mucosa; ; bone marrow; ; epithelium of nasopharynx; ; monocyte;
	Top expressed in
	right kidney; ; lumbar subsegment of spinal cord; ; proximal tubule; ; fetal liver hematopoietic progenitor cell; ; granulocyte; ; lip; ; skin of external ear; ; human kidney; ; cerebellar cortex; ; jejunum;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	nucleotide binding; PDZ domain binding; transmembrane transporter activity; transporter activity; protein binding; carnitine transmembrane transporter activity; secondary active organic cation transmembrane transporter activity; quaternary ammonium group transmembrane transporter activity; ATP binding; symporter activity; organic anion transmembrane transporter activity;
Cellular component	integral component of membrane; membrane; plasma membrane; integral component of plasma membrane; apical plasma membrane; mitochondrion;
Biological process	body fluid secretion; sodium ion transport; quaternary ammonium group transport; ion transport; organic cation transport; carnitine transport; triglyceride metabolic process; carnitine metabolic process; cation transmembrane transport; ion transmembrane transport; carnitine transmembrane transport; transmembrane transport; organic anion transport;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	6583
	30805
	ENSG00000197208
	ENSMUSG00000020334
	Q9H015
	Q9Z306
	НМ_003059
	НМ_019687 ; НМ_001330304
	НП_003050
	НП_001317233 ; НП_062661
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Семейство растворенных носителей 22, член 4 , также известное как SLC22A4 человека , представляет собой ген ; кодируемый белок известен как эрготионеина переносчик . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция

Кодируемый белок представляет собой интегральный белок плазматической мембраны, содержащий 12 трансмембранных сегментов. Первым функциональным обозначением этого белка было OCTN1 («переносчик органических катионов, новый, тип 1»), но эффективность транспорта органических катионов (например, тетраэтиламмония ) очень низка. Эффективность транспорта карнитина также незначительна. Вместо этого белок отвечает за совместный транспорт ионов натрия и эрготионеина , который является антиоксидантом , в клетки. ^{[ 7 ]} Таким образом, более подходящим функциональным обозначением является ЭТТ («переносчик эрготионеина»). ^{[ 5 ]}

Взаимодействия

Было показано, что SLC22A4 взаимодействует с PDZK1 . ^{[ 8 ]}

См. также

Семейство растворенных носителей

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000197208 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020334 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Jump up to: ^а ^б Грюндеманн, Дирк; Хартманн, Лия; Флёгель, Свенья (май 2022 г.). «Переносчик эрготионеина (ЭТТ): субстраты и места расположения, инвентарь». Письма ФЭБС . 596 (10): 1252–1269. дои : 10.1002/1873-3468.14269 . ПМИД 34958679 . S2CID 245535600 .
^ «Ген Энтрез: семейство 22 растворенных носителей SLC22A4 (переносчик эрготионеина), член 4» .
^ Грюндеманн Д., Харлфингер С., Гольц С., Гертс А., Лазар А., Беркельс Р., Юнг Н., Рауберт А., Шёмиг Э. (апрель 2005 г.). «Открытие переносчика эрготионеина» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 102 (14): 5256–61. Бибкод : 2005PNAS..102.5256G . дои : 10.1073/pnas.0408624102 . ПМК 555966 . ПМИД 15795384 .
^ Гислер С.М., Прибанич С., Бачич Д., Форрер П., Гантенбейн А., Сабурин Л.А., Цудзи А., Чжао З.С., Мансер Э., Бибер Дж., Мурер Х. (ноябрь 2003 г.). «ПДЗК1: I. основной каркас в щеточных каймах проксимальных канальцевых клеток» . Почки Интернешнл . 64 (5): 1733–45. дои : 10.1046/j.1523-1755.2003.00266.x . ПМИД 14531806 .

Дальнейшее чтение

Сюань В., Ламхонва А.М., Либрах С., Джарви К., Тейн I (июнь 2003 г.). «Характеристика семейства переносчиков органических катионов/карнитина в сперме человека». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 306 (1): 121–8. дои : 10.1016/S0006-291X(03)00930-6 . ПМИД 12788076 .
Ямада Р., Токухиро С., Чанг Х., Ямамото К. (сентябрь 2004 г.). «SLC22A4 и RUNX1: идентификация генов, чувствительных к РА». Журнал молекулярной медицины . 82 (9): 558–64. дои : 10.1007/s00109-004-0547-y . ПМИД 15184985 . S2CID 9156168 .
Сильверберг М.С. (июнь 2006 г.). «OCTN: встанет ли настоящий ген IBD5?» . Всемирный журнал гастроэнтерологии . 12 (23): 3678–81. дои : 10.3748/wjg.v12.i23.3678 . ПМК 4087460 . ПМИД 16773684 .
Тамаи И, Ябуучи Х, Незу Дж, Сай Ю, Оку А, Симанэ М, Цудзи А (декабрь 1997 г.). «Клонирование и характеристика нового рН-зависимого переносчика органических катионов человека, OCTN1». Письма ФЭБС . 419 (1): 107–11. дои : 10.1016/S0014-5793(97)01441-5 . ПМИД 9426230 . S2CID 35546307 .
Мейер-Вентруп Ф., Карбах У., Горбулев В., Арндт П., Кепселл Х. (июль 1998 г.). «Мембранная локализация переносчика электрогенных катионов rOCT1 в печени крысы». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 248 (3): 673–8. дои : 10.1006/bbrc.1998.9034 . ПМИД 9703985 .
Ураками Ю, Окуда М, Масуда С, Сайто Х, Инуи К.И. (ноябрь 1998 г.). «Функциональные характеристики и мембранная локализация мультиспецифических переносчиков органических катионов крысы OCT1 и OCT2, опосредующих канальцевую секрецию катионных препаратов». Журнал фармакологии и экспериментальной терапии . 287 (2): 800–5. ПМИД 9808712 .
Ябуучи Х., Тамаи И., Незу Дж., Сакамото К., Оку А., Симанэ М., Сай Ю., Цудзи А. (май 1999 г.). «Новый мембранный транспортер OCTN1 опосредует многоспецифичный, двунаправленный и pH-зависимый транспорт органических катионов». Журнал фармакологии и экспериментальной терапии . 289 (2): 768–73. ПМИД 10215651 .
Алкорн Дж., Лу Х, Москва Дж.А., Макнамара П.Дж. (ноябрь 2002 г.). «Экспрессия гена-транспортера в эпителиальных клетках молочной железы лактирующего и нелактирующего человека с использованием полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией в реальном времени». Журнал фармакологии и экспериментальной терапии . 303 (2): 487–96. дои : 10.1124/jpet.102.038315 . ПМИД 12388627 . S2CID 16195525 .
Сайто С., Иида А., Секине А., Огава С., Каваучи С., Хигучи С., Накамура Ю. (2003). «Каталог 238 вариаций шести человеческих генов, кодирующих растворенные носители (hSLC) в японской популяции» . Журнал генетики человека . 47 (11): 576–84. дои : 10.1007/s100380200088 . ПМИД 12436193 .
Эрали С.А., Гамильтон Б.А., Нигам С.К. (январь 2003 г.). «Переносчики органических анионов и катионов встречаются в парах схожих и одинаково экспрессируемых генов». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 300 (2): 333–42. дои : 10.1016/S0006-291X(02)02853-X . ПМИД 12504088 .
Гислер С.М., Прибанич С., Бачич Д., Форрер П., Гантенбейн А., Сабурин Л.А., Цудзи А., Чжао З.С., Мансер Э., Бибер Дж., Мурер Х. (ноябрь 2003 г.). «ПДЗК1: I. основной каркас в щеточных каймах проксимальных канальцевых клеток» . Почки Интернешнл . 64 (5): 1733–45. дои : 10.1046/j.1523-1755.2003.00266.x . ПМИД 14531806 .
Токухиро С, Ямада Р, Чанг Х, Судзуки А, Коти Ю, Савада Т, Судзуки М, Нагасаки М, Оцуки М, Оно М, Фурукава Х, Нагасима М, Ёсино С, Мабути А, Секинэ А, Сайто С, Такахаши А , Цунода Т., Накамура Ю., Ямамото К. (декабрь 2003 г.). «Интронный SNP в сайте связывания RUNX1 SLC22A4, кодирующий переносчик органических катионов, связан с ревматоидным артритом». Природная генетика . 35 (4): 341–8. дои : 10.1038/ng1267 . ПМИД 14608356 . S2CID 21564858 .
Пельтекова В.Д., Винтл Р.Ф., Рубин Л.А., Амос С.И., Хуанг К., Гу Х, Ньюман Б., Ван Оэне М., Сескон Д., Гринберг Г., Гриффитс А.М., Сент-Джордж-Хислоп П.Х., Симинович К.А. (май 2004 г.). «Функциональные варианты генов-переносчиков катионов OCTN связаны с болезнью Крона» . Природная генетика . 36 (5): 471–5. дои : 10.1038/ng1339 . ПМИД 15107849 .
Кавасаки Ю, Като Ю, Сай Ю, Цудзи А (декабрь 2004 г.). «Функциональная характеристика однонуклеотидных полиморфизмов человеческого переносчика органических катионов OCTN1 в японской популяции». Журнал фармацевтических наук . 93 (12): 2920–6. дои : 10.1002/jps.20190 . ПМИД 15459889 .
Ньюман Б., Гу Х, Винтл Р., Сескон Д., Язданпанах М., Лю Х, Пельтекова В., Ван Оэне М., Амос К.И., Симинович К.А. (февраль 2005 г.). «Гаплотип риска в кластере генов 22A4/22A5 семейства растворенных носителей влияет на фенотипическое проявление болезни Крона» . Гастроэнтерология . 128 (2): 260–9. дои : 10.1053/j.gastro.2004.11.056 . ПМИД 15685536 .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

Эта мембранных белках статья о незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000197208 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020334 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[review2022-5] Jump up to: ^а ^б Грюндеманн, Дирк; Хартманн, Лия; Флёгель, Свенья (май 2022 г.). «Переносчик эрготионеина (ЭТТ): субстраты и места расположения, инвентарь». Письма ФЭБС . 596 (10): 1252–1269. дои : 10.1002/1873-3468.14269 . ПМИД 34958679 . S2CID 245535600 .

[entrez-6] «Ген Энтрез: семейство 22 растворенных носителей SLC22A4 (переносчик эрготионеина), член 4» .

[7] Грюндеманн Д., Харлфингер С., Гольц С., Гертс А., Лазар А., Беркельс Р., Юнг Н., Рауберт А., Шёмиг Э. (апрель 2005 г.). «Открытие переносчика эрготионеина» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 102 (14): 5256–61. Бибкод : 2005PNAS..102.5256G . дои : 10.1073/pnas.0408624102 . ПМК 555966 . ПМИД 15795384 .

[pmid14531806-8] Гислер С.М., Прибанич С., Бачич Д., Форрер П., Гантенбейн А., Сабурин Л.А., Цудзи А., Чжао З.С., Мансер Э., Бибер Дж., Мурер Х. (ноябрь 2003 г.). «ПДЗК1: I. основной каркас в щеточных каймах проксимальных канальцевых клеток» . Почки Интернешнл . 64 (5): 1733–45. дои : 10.1046/j.1523-1755.2003.00266.x . ПМИД 14531806 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]